More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1585 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1585  DNA mismatch repair protein MutS-like  100 
 
 		 547 aa  1116    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0342  MutS family DNA mismatch repair protein  54.27 
 
 		 536 aa  595  1e-169  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2282  DNA mismatch repair protein MutS-like  46.53 
 
 		 547 aa  496  1e-139  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18541  DNA mismatch repair protein MutS  30.38 
 
 		 913 aa  117  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1077  DNA mismatch repair protein MutS  24.53 
 
 		 853 aa  117  5e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18351  DNA mismatch repair protein MutS  30.27 
 
 		 913 aa  116  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1737  DNA mismatch repair protein MutS  28.57 
 
 		 913 aa  113  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0169322  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1104  MutS2 family protein  30.68 
 
 		 750 aa  111  4.0000000000000004e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0837  DNA mismatch repair protein MutS  31.54 
 
 		 878 aa  111  4.0000000000000004e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.624644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1887  DNA mismatch repair protein MutS  26.16 
 
 		 868 aa  110  5e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00463381  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  30.22 
 
 		 871 aa  109  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  31 
 
 		 872 aa  108  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18351  DNA mismatch repair protein MutS  28.29 
 
 		 914 aa  108  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1709  DNA mismatch repair protein MutS  30.95 
 
 		 871 aa  107  4e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0730  DNA mismatch repair protein MutS  29.62 
 
 		 889 aa  107  8e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1246  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  31.35 
 
 		 551 aa  105  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2226  DNA mismatch repair protein MutS  22.3 
 
 		 956 aa  105  3e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.137389  normal  0.561287 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3768  DNA mismatch repair protein MutS  32.3 
 
 		 968 aa  105  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1500  DNA mismatch repair protein MutS  28.02 
 
 		 863 aa  105  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2386  DNA mismatch repair protein MutS  30.62 
 
 		 872 aa  104  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.143678  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0008  DNA mismatch repair protein MutS  32.52 
 
 		 904 aa  104  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1896  DNA mismatch repair protein MutS  28.81 
 
 		 872 aa  104  5e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0824451  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1599  DNA mismatch repair protein MutS  29.73 
 
 		 875 aa  103  6e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03749  DNA mismatch repair protein msh3 (MutS protein homolog 3) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B6T1]  33.33 
 
 		 1091 aa  102  1e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.642565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1925  DNA mismatch repair protein MutS  29.69 
 
 		 865 aa  103  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0355  DNA mismatch repair protein MutS  30.73 
 
 		 910 aa  102  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0171458 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1510  DNA mismatch repair protein MutS  28.68 
 
 		 870 aa  102  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101093  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0458  DNA mismatch repair protein MutS  28.69 
 
 		 865 aa  102  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.143165  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0824  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  34.63 
 
 		 792 aa  101  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1542  DNA mismatch repair protein MutS  31.96 
 
 		 898 aa  101  4e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.883963  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1900  DNA mismatch repair protein MutS  28.62 
 
 		 868 aa  100  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.419193  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01708  protein required for mismatch repair in mitosis and meiosis (Eurofung)  27.11 
 
 		 1186 aa  100  6e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0081  DNA mismatch repair protein MutS  29.57 
 
 		 905 aa  100  6e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.294772  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1477  DNA mismatch repair protein MutS  27.78 
 
 		 857 aa  100  6e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.480331  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2125  DNA mismatch repair protein MutS  30.77 
 
 		 897 aa  100  7e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0565829  normal  0.043993 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1033  DNA mismatch repair protein MutS  29.64 
 
 		 872 aa  100  8e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.256802  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1437  DNA mismatch repair protein MutS  33.75 
 
 		 905 aa  100  8e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.402439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2247  DNA mismatch repair protein MutS  29.82 
 
 		 882 aa  100  9e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0873729  normal  0.14084 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1126  DNA mismatch repair protein MutS  28.9 
 
 		 881 aa  99.8  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0124737  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0078  DNA mismatch repair protein MutS  29.72 
 
 		 903 aa  99.8  1e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.167909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0553  DNA mismatch repair protein MutS  35.51 
 
 		 882 aa  99.8  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10621  DNA mismatch repair protein Msh2, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G09850)  30.45 
 
 		 945 aa  99.4  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  28.06 
 
 		 870 aa  99.4  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2125  MutS2 family protein  32.02 
 
 		 776 aa  99.4  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4057  DNA mismatch repair protein MutS  29.52 
 
 		 891 aa  98.6  3e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.101447  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1145  DNA mismatch repair protein MutS  30.68 
 
 		 872 aa  98.2  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1697  DNA mismatch repair protein MutS  29.41 
 
 		 873 aa  98.6  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.189946  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3422  DNA mismatch repair protein MutS  33.12 
 
 		 880 aa  97.8  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0998408  normal  0.0667766 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1317  DNA mismatch repair protein MutS  29.91 
 
 		 873 aa  98.2  4e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0784135  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1169  DNA mismatch repair protein MutS  29.13 
 
 		 864 aa  98.2  4e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.29255 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0767  DNA mismatch repair protein MutS  31.95 
 
 		 863 aa  98.2  4e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3021  DNA mismatch repair protein MutS  25.56 
 
 		 897 aa  97.8  5e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01479  DNA-binding protein of the mitochondria (Eurofung)  33.68 
 
 		 924 aa  97.4  6e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1113  DNA mismatch repair protein MutS  29.64 
 
 		 863 aa  97.4  6e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000302948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81012  Mismatch repair ATPase MSH6 (MutS family)  29.49 
 
 		 1212 aa  97.4  6e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0833152 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0346  DNA mismatch repair protein MutS  28.23 
 
 		 823 aa  97.1  7e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0580477  normal  0.279118 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1166  MutS2 family protein  32.97 
 
 		 761 aa  97.1  8e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.690197  normal  0.0205926 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0358  DNA mismatch repair protein MutS  28.46 
 
 		 918 aa  95.9  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.613152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00881  DNA mismatch repair protein MutS  25.87 
 
 		 927 aa  96.3  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0543692 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3734  DNA mismatch repair protein MutS  29.45 
 
 		 883 aa  95.5  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648477  decreased coverage  0.000000000582755 
 
 
-
 
NC_002950  PG0095  DNA mismatch repair protein MutS  27.51 
 
 		 891 aa  95.5  2e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0480084 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2381  DNA mismatch repair protein MutS  31.9 
 
 		 932 aa  95.5  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3751  DNA mismatch repair protein MutS  27.55 
 
 		 855 aa  95.9  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11670  DNA mismatch repair protein MutS  33.5 
 
 		 896 aa  95.1  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.199521  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3531  DNA mismatch repair protein MutS  31.82 
 
 		 1088 aa  94.7  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1381  DNA mismatch repair protein MutS  27.35 
 
 		 862 aa  94.4  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2380  DNA mismatch repair protein MutS  28.08 
 
 		 893 aa  94.7  4e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1760  DNA mismatch repair protein MutS  28.17 
 
 		 870 aa  94.4  5e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1495  DNA mismatch repair protein MutS  26.14 
 
 		 900 aa  94.4  5e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1437  DNA mismatch repair protein MutS  28.17 
 
 		 870 aa  94.4  5e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.787998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4078  DNA mismatch repair protein MutS  29.17 
 
 		 928 aa  94  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.980246  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1976  DNA mismatch repair protein MutS  31.14 
 
 		 904 aa  94  6e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0020973  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0147  DNA mismatch repair protein MutS  29.86 
 
 		 856 aa  94  6e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.692226  normal  0.372979 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0516  DNA mismatch repair protein MutS  29.11 
 
 		 886 aa  93.6  7e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.544146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3706  DNA mismatch repair protein MutS  31.82 
 
 		 1085 aa  94  7e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0191943 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1717  MutS family ATPase  31.02 
 
 		 800 aa  94  7e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1216  DNA mismatch repair protein MutS  29.91 
 
 		 903 aa  93.6  8e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0405457 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1115  DNA mismatch repair protein MutS  27.17 
 
 		 793 aa  93.2  1e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2983  DNA mismatch repair protein MutS  30.18 
 
 		 864 aa  93.2  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.773158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0214  DNA mismatch repair protein MutS  29.31 
 
 		 851 aa  93.2  1e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.250019 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0824  DNA mismatch repair protein MutS  27.31 
 
 		 804 aa  92.8  1e-17  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21131  DNA mismatch repair protein MutS  27.4 
 
 		 926 aa  93.2  1e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0652427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1704  DNA mismatch repair protein MutS  27.67 
 
 		 887 aa  92.8  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.470624  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1015  DNA mismatch repair protein MutS  27.64 
 
 		 793 aa  92.8  1e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1284  DNA mismatch repair protein MutS  31.61 
 
 		 896 aa  92  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1243  DNA mismatch repair protein MutS  28.16 
 
 		 926 aa  92.4  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.32952  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1950  DNA mismatch repair protein MutS  27.48 
 
 		 872 aa  92.8  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.998424  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2735  DNA mismatch repair protein MutS  29.3 
 
 		 850 aa  92.4  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2791  DNA mismatch repair protein MutS  29.21 
 
 		 864 aa  92  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.494407 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2632  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  32.85 
 
 		 784 aa  92.8  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0176007  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2743  DNA mismatch repair protein MutS  27.24 
 
 		 868 aa  92  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1181  DNA mismatch repair protein MutS  27.95 
 
 		 927 aa  92  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1064  DNA mismatch repair protein MutS  26.52 
 
 		 870 aa  92.4  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1332  DNA mismatch repair protein MutS  27.62 
 
 		 930 aa  91.7  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0538  MutS2 family protein  30.16 
 
 		 791 aa  91.7  3e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00387352  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0330  DNA mismatch repair protein MutS  30.88 
 
 		 917 aa  91.7  3e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0899  MutS2 family protein  28.96 
 
 		 789 aa  92  3e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.461302  normal  0.733658 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0292  DNA mismatch repair protein MutS  33.13 
 
 		 784 aa  92  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.518405  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1786  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  32.04 
 
 		 501 aa  90.5  6e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00151585  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1883  DNA mismatch repair protein MutS  29.32 
 
 		 858 aa  90.5  6e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.245146  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>