More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A2282 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A2282  DNA mismatch repair protein MutS-like  100 
 
 		 547 aa  1126    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1585  DNA mismatch repair protein MutS-like  46.53 
 
 		 547 aa  496  1e-139  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0342  MutS family DNA mismatch repair protein  48.31 
 
 		 536 aa  488  1e-137  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2380  DNA mismatch repair protein MutS  31.25 
 
 		 893 aa  120  7.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0837  DNA mismatch repair protein MutS  35.61 
 
 		 878 aa  119  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.624644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1104  MutS2 family protein  31.18 
 
 		 750 aa  115  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1925  DNA mismatch repair protein MutS  33.48 
 
 		 865 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0553  DNA mismatch repair protein MutS  33.64 
 
 		 882 aa  115  3e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  32.89 
 
 		 870 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3422  DNA mismatch repair protein MutS  36.08 
 
 		 880 aa  114  5e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0998408  normal  0.0667766 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1500  DNA mismatch repair protein MutS  32.99 
 
 		 863 aa  113  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1697  DNA mismatch repair protein MutS  35.86 
 
 		 873 aa  111  3e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.189946  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0330  DNA mismatch repair protein MutS  33.17 
 
 		 917 aa  110  7.000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1317  DNA mismatch repair protein MutS  36 
 
 		 873 aa  110  7.000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0784135  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1115  DNA mismatch repair protein MutS  31.33 
 
 		 793 aa  109  1e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  35.27 
 
 		 872 aa  109  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1887  DNA mismatch repair protein MutS  33.68 
 
 		 868 aa  109  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00463381  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2743  DNA mismatch repair protein MutS  30.54 
 
 		 868 aa  108  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1510  DNA mismatch repair protein MutS  31.84 
 
 		 870 aa  109  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101093  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0412  DNA mismatch repair protein MutS  29.2 
 
 		 857 aa  108  3e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0458  DNA mismatch repair protein MutS  36.14 
 
 		 865 aa  108  3e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.143165  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1015  DNA mismatch repair protein MutS  31.08 
 
 		 793 aa  107  5e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1896  DNA mismatch repair protein MutS  36 
 
 		 872 aa  107  6e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0824451  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1466  DNA mismatch repair protein MutS  33.94 
 
 		 872 aa  106  9e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03749  DNA mismatch repair protein msh3 (MutS protein homolog 3) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B6T1]  35.2 
 
 		 1091 aa  106  1e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.642565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1033  DNA mismatch repair protein MutS  34.69 
 
 		 872 aa  106  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.256802  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1486  DNA mismatch repair protein MutS  31.55 
 
 		 867 aa  106  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.387316  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0538  MutS2 family protein  33.47 
 
 		 791 aa  106  1e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00387352  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1376  DNA mismatch repair protein MutS  36.77 
 
 		 859 aa  105  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1134  DNA mismatch repair protein MutS  33.64 
 
 		 860 aa  105  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1900  DNA mismatch repair protein MutS  30.59 
 
 		 868 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.419193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0355  DNA mismatch repair protein MutS  31.23 
 
 		 910 aa  105  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0171458 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3768  DNA mismatch repair protein MutS  34.78 
 
 		 968 aa  105  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4058  DNA mismatch repair protein MutS  36.13 
 
 		 855 aa  105  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.374775  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1256  DNA mismatch repair protein MutS  35.35 
 
 		 887 aa  104  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.280018  hitchhiker  0.00178613 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1542  DNA mismatch repair protein MutS  33.66 
 
 		 898 aa  105  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.883963  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01708  protein required for mismatch repair in mitosis and meiosis (Eurofung)  27.71 
 
 		 1186 aa  104  4e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3706  DNA mismatch repair protein MutS  32.5 
 
 		 1085 aa  104  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0191943 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0525  DNA mismatch repair protein MutS  31.98 
 
 		 881 aa  104  4e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.751671  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1113  DNA mismatch repair protein MutS  29.69 
 
 		 863 aa  104  4e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000302948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1599  DNA mismatch repair protein MutS  35.54 
 
 		 875 aa  104  4e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0948  DNA mismatch repair protein MutS  28.16 
 
 		 868 aa  104  4e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1166  MutS2 family protein  36.26 
 
 		 761 aa  104  5e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.690197  normal  0.0205926 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0730  DNA mismatch repair protein MutS  34.5 
 
 		 889 aa  104  5e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38640  DNA mismatch repair protein MutS  36.08 
 
 		 855 aa  103  6e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.477357  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1976  DNA mismatch repair protein MutS  30.04 
 
 		 904 aa  103  6e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0020973  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1126  DNA mismatch repair protein MutS  32.99 
 
 		 881 aa  103  6e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0124737  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2125  MutS2 family protein  35.47 
 
 		 776 aa  103  6e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1626  DNA mismatch repair protein MutS  36.13 
 
 		 857 aa  103  7e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.262432  normal  0.25405 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4152  DNA mismatch repair protein MutS  36.13 
 
 		 857 aa  103  7e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.121513 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1145  DNA mismatch repair protein MutS  33.8 
 
 		 872 aa  103  7e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1437  DNA mismatch repair protein MutS  29.02 
 
 		 905 aa  103  8e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.402439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2386  DNA mismatch repair protein MutS  33.01 
 
 		 872 aa  103  9e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.143678  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  33.49 
 
 		 871 aa  103  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1250  DNA mismatch repair protein MutS  27.91 
 
 		 823 aa  103  1e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.297858  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0153  MutS2 family protein  33.64 
 
 		 796 aa  103  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.323958  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1437  DNA mismatch repair protein MutS  35.26 
 
 		 870 aa  102  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.787998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1760  DNA mismatch repair protein MutS  35.26 
 
 		 870 aa  102  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3224  DNA mismatch repair protein MutS  34.55 
 
 		 895 aa  103  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1339  DNA mismatch repair protein MutS  30.97 
 
 		 896 aa  102  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.742998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1381  DNA mismatch repair protein MutS  34.15 
 
 		 862 aa  102  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0516  DNA mismatch repair protein MutS  33.33 
 
 		 886 aa  102  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.544146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3531  DNA mismatch repair protein MutS  31.63 
 
 		 1088 aa  102  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4050  DNA mismatch repair protein MutS  35.48 
 
 		 857 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.593835  hitchhiker  0.000000000609956 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1179  DNA mismatch repair protein MutS  36.13 
 
 		 880 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809456 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0119  DNA mismatch repair protein MutS  33.51 
 
 		 931 aa  102  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.893903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2095  DNA mismatch repair protein MutS  31.68 
 
 		 903 aa  102  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1477  DNA mismatch repair protein MutS  31.53 
 
 		 857 aa  102  2e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.480331  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1077  DNA mismatch repair protein MutS  29.47 
 
 		 853 aa  102  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1202  DNA mismatch repair protein MutS  30.1 
 
 		 860 aa  101  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000170445  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1709  DNA mismatch repair protein MutS  35.26 
 
 		 871 aa  101  3e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2495  DNA mismatch repair protein MutS  34.16 
 
 		 869 aa  102  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0335  DNA mismatch repair protein MutS  29.41 
 
 		 815 aa  102  3e-20  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.213975  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2791  DNA mismatch repair protein MutS  33.33 
 
 		 864 aa  102  3e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.494407 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2983  DNA mismatch repair protein MutS  34.33 
 
 		 864 aa  101  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.773158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0346  DNA mismatch repair protein MutS  31.86 
 
 		 823 aa  100  5e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0580477  normal  0.279118 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2421  DNA mismatch repair protein MutS  29.15 
 
 		 895 aa  100  5e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4057  DNA mismatch repair protein MutS  32.21 
 
 		 891 aa  100  5e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.101447  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3540  DNA mismatch repair protein MutS  29.15 
 
 		 890 aa  100  6e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190608  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1495  DNA mismatch repair protein MutS  26.69 
 
 		 900 aa  100  6e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1246  DNA mismatch repair protein MutS  31.34 
 
 		 856 aa  100  6e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000830859 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3341  DNA mismatch repair protein MutS  33.12 
 
 		 858 aa  100  6e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.285192  unclonable  0.0000000411572 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05155  putative DNA mismatch repair protein MutS  31.58 
 
 		 869 aa  100  6e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10621  DNA mismatch repair protein Msh2, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G09850)  32.02 
 
 		 945 aa  100  7e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3803  DNA mismatch repair protein MutS  29.15 
 
 		 892 aa  100  7e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3528  DNA mismatch repair protein MutS  29.15 
 
 		 894 aa  100  7e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0767  DNA mismatch repair protein MutS  30.39 
 
 		 863 aa  100  7e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1737  DNA mismatch repair protein MutS  29.15 
 
 		 913 aa  100  7e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0169322  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18351  DNA mismatch repair protein MutS  28.24 
 
 		 914 aa  100  7e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1704  DNA mismatch repair protein MutS  30.1 
 
 		 887 aa  100  7e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.470624  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81012  Mismatch repair ATPase MSH6 (MutS family)  31.07 
 
 		 1212 aa  100  7e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0833152 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1332  DNA mismatch repair protein MutS  32.56 
 
 		 930 aa  100  7e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1431  DNA mismatch repair protein MutS  29.15 
 
 		 892 aa  100  7e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.964721 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18351  DNA mismatch repair protein MutS  27.14 
 
 		 913 aa  100  7e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3816  DNA mismatch repair protein MutS  29.15 
 
 		 892 aa  100  7e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3118  DNA mismatch repair protein MutS  31.34 
 
 		 856 aa  100  7e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3618  DNA mismatch repair protein MutS  29.15 
 
 		 892 aa  100  8e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3905  DNA mismatch repair protein MutS  29.15 
 
 		 892 aa  100  8e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1045  DNA mismatch repair protein MutS  35.29 
 
 		 854 aa  100  8e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.493253 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3868  DNA mismatch repair protein MutS  29.15 
 
 		 890 aa  100  8e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>