More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1044 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1044  hypothetical protein  100 
 
 		 719 aa  1446    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1334  DNA mismatch repair protein MutS-like protein  51.57 
 
 		 700 aa  721    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000127118  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1046  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  37.37 
 
 		 678 aa  393  1e-108  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0558977  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2063  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  36.79 
 
 		 739 aa  382  1e-104  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1024  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  36.26 
 
 		 664 aa  379  1e-103  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.318391  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3631  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  37.86 
 
 		 694 aa  369  1e-100  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1006  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  34.74 
 
 		 688 aa  357  5e-97  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2604  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  35.4 
 
 		 665 aa  335  2e-90  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0194376  normal  0.689485 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2660  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  37.37 
 
 		 595 aa  176  1.9999999999999998e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2432  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  38.3 
 
 		 589 aa  154  7e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00495271 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0551  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  38.72 
 
 		 583 aa  151  5e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.27881  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1501  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  36.47 
 
 		 618 aa  147  7.0000000000000006e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1162  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  28.13 
 
 		 641 aa  146  1e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.906748  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0653  DNA mismatch repair protein MutS  26.17 
 
 		 881 aa  70.1  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1214  DNA mismatch repair protein MutS  25.45 
 
 		 855 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1619  DNA mismatch repair protein MutS  25.54 
 
 		 897 aa  67.4  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.510747 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0576  DNA mismatch repair protein MutS  25.7 
 
 		 854 aa  66.2  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0274453  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3337  DNA mismatch repair protein MutS  24.78 
 
 		 864 aa  65.1  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2935  MutS2 family protein  28.45 
 
 		 788 aa  64.3  0.000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2798  MutS2 family protein  31.4 
 
 		 783 aa  63.5  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3263  DNA mismatch repair protein MutS  21.4 
 
 		 889 aa  62.8  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2782  MutS2 family protein  27.16 
 
 		 785 aa  62  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.798995  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4552  DNA mismatch repair protein MutS  24.66 
 
 		 871 aa  61.6  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1594  DNA mismatch repair protein MutS  26 
 
 		 871 aa  60.8  0.00000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0845017  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1412  MutS2 family protein  30.43 
 
 		 783 aa  60.1  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.29197e-17 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3655  MutS2 family protein  27.37 
 
 		 780 aa  59.3  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02590  mismatch repair-related protein, putative  33.08 
 
 		 1205 aa  57.8  0.0000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.102659  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1925  DNA mismatch repair protein MutS  26.38 
 
 		 865 aa  57.8  0.0000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1207  DNA mismatch repair protein MutS  23.33 
 
 		 862 aa  57.8  0.0000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0525  DNA mismatch repair protein MutS  24.18 
 
 		 881 aa  57.4  0.0000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.751671  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3431  DNA mismatch repair protein MutS  23.08 
 
 		 856 aa  57.8  0.0000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0986  DNA mismatch repair protein MutS  22.91 
 
 		 871 aa  57  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3211  DNA mismatch repair protein MutS  24.88 
 
 		 853 aa  56.6  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.864311  normal  0.594165 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1832  DNA mismatch repair protein MutS  23.9 
 
 		 882 aa  56.6  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2046  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  26.6 
 
 		 791 aa  57  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0879  DNA mismatch repair protein MutS  22.91 
 
 		 859 aa  57.4  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1125  DNA mismatch repair protein MutS  22.77 
 
 		 861 aa  57  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03749  DNA mismatch repair protein msh3 (MutS protein homolog 3) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B6T1]  26.72 
 
 		 1091 aa  56.2  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.642565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3143  DNA mismatch repair protein MutS  23.92 
 
 		 853 aa  56.2  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1282  DNA mismatch repair protein MutS  24.04 
 
 		 862 aa  56.2  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2974  MutS 2 protein  25.75 
 
 		 785 aa  56.2  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05680  MutS2 family protein  24.54 
 
 		 791 aa  56.6  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1083  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  24.12 
 
 		 447 aa  56.6  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2087  DNA mismatch repair protein MutS  24.88 
 
 		 874 aa  56.6  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104539  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02583  DNA mismatch repair protein  23.92 
 
 		 853 aa  55.5  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.858461  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0955  DNA mismatch repair protein MutS  23.92 
 
 		 853 aa  55.5  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3030  DNA mismatch repair protein MutS  23.92 
 
 		 860 aa  55.8  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0979  DNA mismatch repair protein MutS  23.92 
 
 		 853 aa  55.5  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.462533 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2871  DNA mismatch repair protein MutS  23.92 
 
 		 853 aa  55.5  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2860  DNA mismatch repair protein MutS  23.92 
 
 		 853 aa  55.5  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02548  hypothetical protein  23.92 
 
 		 853 aa  55.5  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.766489  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1486  DNA mismatch repair protein MutS  27.83 
 
 		 867 aa  55.5  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.387316  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1124  DNA mismatch repair protein MutS  22.77 
 
 		 861 aa  55.5  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1478  DNA mismatch repair protein MutS  22.65 
 
 		 828 aa  55.8  0.000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3986  DNA mismatch repair protein MutS  23.92 
 
 		 853 aa  55.5  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.724345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1373  MutS2 family protein  25.77 
 
 		 784 aa  55.5  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0547  MutS2 family protein  24.89 
 
 		 792 aa  55.5  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2603  DNA mismatch repair protein MutS  24.71 
 
 		 891 aa  55.5  0.000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0330  DNA mismatch repair protein MutS  27.14 
 
 		 917 aa  55.1  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0204  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  23.48 
 
 		 475 aa  55.1  0.000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0784  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  24.42 
 
 		 529 aa  55.1  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1216  DNA mismatch repair protein MutS  28.67 
 
 		 903 aa  55.5  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0405457 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0734  MutS2 family protein  27.87 
 
 		 780 aa  55.1  0.000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.11062  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05320  meiotic recombination-related protein, putative  22.43 
 
 		 937 aa  55.1  0.000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0335  DNA mismatch repair protein MutS  23.51 
 
 		 815 aa  54.7  0.000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.213975  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1076  DNA mismatch repair protein MutS  23.27 
 
 		 884 aa  54.7  0.000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3270  DNA mismatch repair protein MutS  23.32 
 
 		 856 aa  54.7  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.820026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3706  DNA mismatch repair protein MutS  22.75 
 
 		 1085 aa  54.7  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0191943 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4891  MutS2 family protein  24.24 
 
 		 806 aa  54.7  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0342  MutS family DNA mismatch repair protein  28.5 
 
 		 536 aa  54.7  0.000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0935  MutS2 family protein  28.46 
 
 		 785 aa  54.7  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3531  DNA mismatch repair protein MutS  22.5 
 
 		 1088 aa  54.7  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2347  DNA mismatch repair protein MutS  26.37 
 
 		 860 aa  54.7  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.836402  normal  0.482784 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1146  DNA mismatch repair protein MutS  22.12 
 
 		 858 aa  54.7  0.000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1045  DNA mismatch repair protein MutS  23.45 
 
 		 854 aa  54.7  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.493253 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0063  DNA mismatch repair protein MutS  23.89 
 
 		 862 aa  54.3  0.000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1238  DNA mismatch repair protein MutS  21.66 
 
 		 858 aa  54.3  0.000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3127  DNA mismatch repair protein MutS  22.42 
 
 		 856 aa  54.3  0.000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.407005  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1500  DNA mismatch repair protein MutS  24.2 
 
 		 863 aa  53.5  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1466  DNA mismatch repair protein MutS  27.54 
 
 		 872 aa  53.9  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  23.94 
 
 		 870 aa  53.5  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3142  DNA mismatch repair protein MutS  26.01 
 
 		 852 aa  53.9  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2274  DNA mismatch repair protein MutS  23.76 
 
 		 911 aa  53.9  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.103313 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2125  DNA mismatch repair protein MutS  27.33 
 
 		 897 aa  53.9  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0565829  normal  0.043993 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0621  DNA mismatch repair protein MutS  26.67 
 
 		 859 aa  53.9  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.947929  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1194  DNA mismatch repair protein MutS  23.32 
 
 		 859 aa  53.9  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3118  DNA mismatch repair protein MutS  22.42 
 
 		 856 aa  53.9  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1299  DNA mismatch repair protein MutS  24.35 
 
 		 859 aa  53.5  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.537227  hitchhiker  0.00000000408163 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1061  DNA mismatch repair protein MutS  21.33 
 
 		 861 aa  53.5  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0195  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  28.76 
 
 		 446 aa  53.5  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3030  DNA mismatch repair protein MutS  23.44 
 
 		 855 aa  53.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3424  DNA mismatch repair protein MutS  24.78 
 
 		 851 aa  53.1  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3218  DNA mismatch repair protein MutS  23.44 
 
 		 855 aa  53.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.864156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2390  MutS2 family protein  25.74 
 
 		 786 aa  52.8  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0786061  normal  0.328409 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1768  DNA mismatch repair protein MutS  24.62 
 
 		 846 aa  52.8  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3098  DNA mismatch repair protein MutS  23.44 
 
 		 855 aa  53.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.603568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3059  DNA mismatch repair protein MutS  27.21 
 
 		 855 aa  52.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.725135 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3383  DNA mismatch repair protein MutS  25.39 
 
 		 856 aa  52.8  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.130934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2052  DNA mismatch repair protein MutS  24.71 
 
 		 890 aa  53.1  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.292542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1359  DNA mismatch repair protein MutS  24.74 
 
 		 870 aa  53.1  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.219365  normal  0.0149931 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>