More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0551 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_0551  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  100 
 
 		 583 aa  1120    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.27881  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2432  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  66.38 
 
 		 589 aa  689    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00495271 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1162  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  58.13 
 
 		 641 aa  642    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.906748  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2660  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  63.56 
 
 		 595 aa  626  1e-178  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1501  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  59.22 
 
 		 618 aa  609  1e-173  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1024  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  37.21 
 
 		 664 aa  162  2e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.318391  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1334  DNA mismatch repair protein MutS-like protein  39.91 
 
 		 700 aa  157  7e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000127118  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1044  hypothetical protein  37.04 
 
 		 719 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1046  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  36.51 
 
 		 678 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0558977  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1006  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  34.08 
 
 		 688 aa  137  4e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2063  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  42.41 
 
 		 739 aa  127  7e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3631  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  35.62 
 
 		 694 aa  125  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2604  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  36.15 
 
 		 665 aa  116  1.0000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0194376  normal  0.689485 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0767  DNA mismatch repair protein MutS  25.21 
 
 		 863 aa  67.4  0.0000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1166  MutS2 family protein  35.03 
 
 		 761 aa  66.6  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.690197  normal  0.0205926 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1218  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  21.75 
 
 		 654 aa  65.5  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.215011  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2390  MutS2 family protein  27.97 
 
 		 786 aa  64.3  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0786061  normal  0.328409 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2935  MutS2 family protein  26.23 
 
 		 788 aa  63.2  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0342  MutS family DNA mismatch repair protein  33.83 
 
 		 536 aa  62.4  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05320  meiotic recombination-related protein, putative  29.67 
 
 		 937 aa  62.4  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1104  MutS2 family protein  33.71 
 
 		 750 aa  62.8  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0547  MutS2 family protein  24.58 
 
 		 792 aa  61.6  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0863  DNA mismatch repair protein MutS  24.16 
 
 		 873 aa  61.2  0.00000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.462297  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1786  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  30.95 
 
 		 501 aa  60.8  0.00000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00151585  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1829  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  30.95 
 
 		 501 aa  60.8  0.00000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.181127  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0268  Smr protein/MutS2  28.35 
 
 		 805 aa  60.5  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0912246 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01479  DNA-binding protein of the mitochondria (Eurofung)  25.69 
 
 		 924 aa  59.7  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0727  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  26.74 
 
 		 782 aa  60.1  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1077  DNA mismatch repair protein MutS  22.75 
 
 		 853 aa  59.7  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1373  MutS2 family protein  27.62 
 
 		 784 aa  59.3  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1585  DNA mismatch repair protein MutS-like  31.62 
 
 		 547 aa  58.9  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2282  DNA mismatch repair protein MutS-like  33.74 
 
 		 547 aa  58.9  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0195  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  30.33 
 
 		 446 aa  59.3  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85730  predicted protein  22.89 
 
 		 871 aa  58.9  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.144196 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0734  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  54.9 
 
 		 516 aa  58.5  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.013522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0335  DNA mismatch repair protein MutS  51.52 
 
 		 815 aa  58.5  0.0000004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.213975  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0935  MutS2 family protein  27.64 
 
 		 785 aa  58.2  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4299  MutS2 family protein  27.76 
 
 		 812 aa  57.8  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1368  Smr protein/MutS2  30.39 
 
 		 771 aa  57.8  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.453399 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1317  DNA mismatch repair protein MutS  27.03 
 
 		 873 aa  57.4  0.0000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0784135  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5060  MutS2 family protein  29.21 
 
 		 802 aa  57.4  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.766824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0204  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  32.31 
 
 		 475 aa  57.4  0.0000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1638  MutS2 family protein  26.36 
 
 		 782 aa  57.4  0.0000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00924497  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1500  DNA mismatch repair protein MutS  31.37 
 
 		 863 aa  57  0.0000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1925  DNA mismatch repair protein MutS  34.27 
 
 		 865 aa  57  0.0000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3819  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  25.99 
 
 		 445 aa  56.2  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.081272  normal  0.267024 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0214  DNA mismatch repair protein MutS  25.79 
 
 		 851 aa  55.5  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.250019 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1356  MutS2 family protein  29.1 
 
 		 794 aa  56.2  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2773  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  28.89 
 
 		 500 aa  55.8  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.643007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1723  DNA mismatch repair protein MutS  32.64 
 
 		 855 aa  55.5  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_6754  predicted protein  29.11 
 
 		 209 aa  55.8  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0030  DNA mismatch repair protein MutS  29.85 
 
 		 915 aa  55.8  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000355609 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3531  DNA mismatch repair protein MutS  32.58 
 
 		 1088 aa  55.1  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1181  DNA mismatch repair protein MutS  29.38 
 
 		 927 aa  54.7  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05155  putative DNA mismatch repair protein MutS  32.35 
 
 		 869 aa  54.7  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0837  DNA mismatch repair protein MutS  24.5 
 
 		 878 aa  55.1  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.624644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2159  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  32.68 
 
 		 522 aa  54.7  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0366  DNA mismatch repair protein MutS  28.4 
 
 		 914 aa  54.7  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0942134  normal  0.39879 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3655  MutS2 family protein  23.71 
 
 		 780 aa  54.3  0.000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2031  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  22.88 
 
 		 723 aa  54.3  0.000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1717  MutS family ATPase  25.69 
 
 		 800 aa  54.3  0.000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1478  DNA mismatch repair protein MutS  25.97 
 
 		 828 aa  54.3  0.000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2780  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  24.49 
 
 		 705 aa  54.3  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383732 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3768  DNA mismatch repair protein MutS  33.59 
 
 		 968 aa  53.9  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2782  MutS2 family protein  25.93 
 
 		 785 aa  54.3  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.798995  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3706  DNA mismatch repair protein MutS  31.82 
 
 		 1085 aa  53.9  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0191943 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0209  DNA mismatch repair protein MutS  34.04 
 
 		 877 aa  53.9  0.000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.784326 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1897  MutS2 family protein  27.6 
 
 		 767 aa  53.9  0.000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.557227  normal  0.0324553 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0299  DNA mismatch repair protein MutS  33.33 
 
 		 873 aa  53.9  0.000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.391446  normal  0.153174 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1785  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  45.1 
 
 		 505 aa  53.1  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0257213  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1510  DNA mismatch repair protein MutS  27.67 
 
 		 870 aa  53.1  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101093  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1470  MutS2 family protein  23.93 
 
 		 792 aa  53.5  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.471316  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1976  DNA mismatch repair protein MutS  25.09 
 
 		 904 aa  53.5  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0020973  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1015  DNA mismatch repair protein MutS  25.89 
 
 		 793 aa  53.1  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2421  DNA mismatch repair protein MutS  24.66 
 
 		 895 aa  53.1  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2648  DNA-mismatch repair protein  27.21 
 
 		 797 aa  53.5  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.270427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1828  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  46 
 
 		 505 aa  53.1  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.338904  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1308  MutS2 family protein  25.52 
 
 		 778 aa  53.5  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1486  DNA mismatch repair protein MutS  33.09 
 
 		 867 aa  53.1  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.387316  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2920  Smr protein/MutS2  27.07 
 
 		 792 aa  53.5  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000870196 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59113  predicted protein  23.32 
 
 		 910 aa  53.5  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7097  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  21.92 
 
 		 443 aa  53.5  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000373438  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  27.39 
 
 		 871 aa  52.8  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0384  MutS2 family protein  28.8 
 
 		 840 aa  52.8  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4078  DNA mismatch repair protein MutS  29.61 
 
 		 928 aa  52.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.980246  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4447  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  24.68 
 
 		 786 aa  52.4  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4285  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  24.68 
 
 		 786 aa  52.4  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4296  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  24.68 
 
 		 786 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2459  Smr protein/MutS2  26.58 
 
 		 765 aa  52.8  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.215696  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4794  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  24.68 
 
 		 786 aa  52.4  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.167233  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4665  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  24.68 
 
 		 786 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000565535 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1711  MutS2 family protein  26.34 
 
 		 801 aa  52.8  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000187694  normal  0.426303 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1599  DNA mismatch repair protein MutS  30.52 
 
 		 875 aa  52.4  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1083  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  21.2 
 
 		 447 aa  52.8  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0899  MutS2 family protein  32.37 
 
 		 789 aa  52.8  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.461302  normal  0.733658 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0355  DNA mismatch repair protein MutS  30.64 
 
 		 910 aa  52.8  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0171458 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1737  MutS family DNA structure-specific ATPase  36 
 
 		 783 aa  52.4  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1437  DNA mismatch repair protein MutS  29.26 
 
 		 905 aa  52.4  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.402439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1697  DNA mismatch repair protein MutS  29.69 
 
 		 873 aa  52.8  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.189946  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0553  DNA mismatch repair protein MutS  36.08 
 
 		 882 aa  53.1  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>