More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1829 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1829  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  100 
 
 		 501 aa  1033    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.181127  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1786  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  99.8 
 
 		 501 aa  1033    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00151585  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0735  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  45.2 
 
 		 496 aa  426  1e-118  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.19078  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2773  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  46.31 
 
 		 500 aa  427  1e-118  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.643007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2645  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  39.36 
 
 		 508 aa  335  1e-90  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.260435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1246  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  28.19 
 
 		 551 aa  160  7e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0734  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  26.35 
 
 		 516 aa  129  2.0000000000000002e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.013522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2646  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  24.28 
 
 		 524 aa  117  5e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.264695  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2772  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  26.6 
 
 		 507 aa  103  8e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1785  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  25.15 
 
 		 505 aa  101  4e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0257213  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1828  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  25.11 
 
 		 505 aa  100  7e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.338904  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1585  DNA mismatch repair protein MutS-like  32.04 
 
 		 547 aa  90.9  5e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0342  MutS family DNA mismatch repair protein  29.61 
 
 		 536 aa  82  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2284  DNA mismatch repair protein MutS  34.38 
 
 		 897 aa  78.6  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.339354  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0516  DNA mismatch repair protein MutS  28.64 
 
 		 886 aa  78.2  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.544146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0412  DNA mismatch repair protein MutS  27.94 
 
 		 857 aa  78.6  0.0000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0974  DNA mismatch repair protein  28.49 
 
 		 859 aa  77.4  0.0000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2347  DNA mismatch repair protein MutS  25 
 
 		 860 aa  77  0.0000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.836402  normal  0.482784 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7097  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  24.69 
 
 		 443 aa  76.3  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000373438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1015  DNA mismatch repair protein MutS  31.66 
 
 		 793 aa  75.9  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0767  DNA mismatch repair protein MutS  28.12 
 
 		 863 aa  75.5  0.000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2247  DNA mismatch repair protein MutS  25.89 
 
 		 882 aa  75.9  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0873729  normal  0.14084 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1250  DNA mismatch repair protein MutS  29.26 
 
 		 823 aa  75.1  0.000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.297858  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2655  DNA mismatch repair protein MutS  28.04 
 
 		 876 aa  75.1  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.607224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1115  DNA mismatch repair protein MutS  31.12 
 
 		 793 aa  75.1  0.000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1358  DNA mismatch repair protein MutS  28.82 
 
 		 910 aa  74.7  0.000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.476923  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1171  DNA mismatch repair protein MutS  28.82 
 
 		 910 aa  74.7  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1381  DNA mismatch repair protein MutS  28.05 
 
 		 862 aa  74.3  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2761  DNA mismatch repair protein MutS  29.29 
 
 		 904 aa  74.3  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.572948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2879  DNA mismatch repair protein MutS  29.35 
 
 		 880 aa  73.9  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0008  DNA mismatch repair protein MutS  29.5 
 
 		 904 aa  73.9  0.000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1145  DNA mismatch repair protein MutS  24.4 
 
 		 872 aa  73.9  0.000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2381  DNA mismatch repair protein MutS  27.89 
 
 		 932 aa  73.6  0.000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0147  DNA mismatch repair protein MutS  28.57 
 
 		 856 aa  73.6  0.000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.692226  normal  0.372979 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0030  DNA mismatch repair protein MutS  27.98 
 
 		 915 aa  73.2  0.000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000355609 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01700  conserved hypothetical protein  27.92 
 
 		 1057 aa  73.2  0.00000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1332  DNA mismatch repair protein MutS  26.41 
 
 		 930 aa  72.8  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0081  DNA mismatch repair protein MutS  26.73 
 
 		 905 aa  72.8  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.294772  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4050  DNA mismatch repair protein MutS  31.11 
 
 		 857 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.593835  hitchhiker  0.000000000609956 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0935  DNA mismatch repair protein MutS  26.46 
 
 		 874 aa  72.8  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_002950  PG0095  DNA mismatch repair protein MutS  31.65 
 
 		 891 aa  72  0.00000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0480084 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3706  DNA mismatch repair protein MutS  24.3 
 
 		 1085 aa  72  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0191943 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3293  DNA mismatch repair protein MutS  28.57 
 
 		 858 aa  72.4  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0310827  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2386  DNA mismatch repair protein MutS  24.4 
 
 		 872 aa  72  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.143678  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0730  DNA mismatch repair protein MutS  28.65 
 
 		 889 aa  72  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2735  DNA mismatch repair protein MutS  24.45 
 
 		 850 aa  72  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3768  DNA mismatch repair protein MutS  26.84 
 
 		 968 aa  72.4  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0174  DNA mismatch repair protein MutS  27.33 
 
 		 820 aa  71.6  0.00000000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1626  DNA mismatch repair protein MutS  30.37 
 
 		 857 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.262432  normal  0.25405 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1064  DNA mismatch repair protein MutS  24.18 
 
 		 870 aa  71.6  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1134  DNA mismatch repair protein MutS  27.17 
 
 		 860 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1218  DNA mismatch repair protein MutS  28.57 
 
 		 875 aa  71.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.318661  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3541  DNA mismatch repair protein MutS  25.24 
 
 		 929 aa  72  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00881  DNA mismatch repair protein MutS  31.72 
 
 		 927 aa  71.6  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0543692 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4152  DNA mismatch repair protein MutS  30.37 
 
 		 857 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.121513 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1179  DNA mismatch repair protein MutS  27.17 
 
 		 880 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809456 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1500  DNA mismatch repair protein MutS  28.57 
 
 		 863 aa  71.2  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3734  DNA mismatch repair protein MutS  31.62 
 
 		 883 aa  71.2  0.00000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648477  decreased coverage  0.000000000582755 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3186  DNA mismatch repair protein MutS  27.66 
 
 		 854 aa  71.2  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0251089 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1887  DNA mismatch repair protein MutS  29.71 
 
 		 868 aa  71.2  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00463381  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0824  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  30.07 
 
 		 792 aa  71.2  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3815  DNA mismatch repair protein MutS  31.45 
 
 		 907 aa  71.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.548974 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  25.24 
 
 		 871 aa  70.9  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1519  DNA mismatch repair protein MutS  30 
 
 		 854 aa  70.9  0.00000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00861946  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0538  MutS2 family protein  28.26 
 
 		 791 aa  70.9  0.00000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00387352  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1466  DNA mismatch repair protein MutS  25.49 
 
 		 872 aa  70.9  0.00000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4078  DNA mismatch repair protein MutS  29.92 
 
 		 928 aa  70.9  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.980246  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2515  DNA mismatch repair protein MutS  30.65 
 
 		 885 aa  70.5  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3531  DNA mismatch repair protein MutS  24.53 
 
 		 1088 aa  70.9  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0299  DNA mismatch repair protein MutS  29.17 
 
 		 873 aa  70.9  0.00000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.391446  normal  0.153174 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4058  DNA mismatch repair protein MutS  29.63 
 
 		 855 aa  70.5  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.374775  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2125  DNA mismatch repair protein MutS  25.84 
 
 		 897 aa  70.5  0.00000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0565829  normal  0.043993 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38640  DNA mismatch repair protein MutS  30.37 
 
 		 855 aa  70.5  0.00000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.477357  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3226  DNA mismatch repair protein MutS  25.82 
 
 		 892 aa  70.5  0.00000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40782  predicted protein  27.7 
 
 		 1113 aa  70.5  0.00000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.119207  normal  0.227387 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1004  DNA mismatch repair protein MutS  32.59 
 
 		 817 aa  70.5  0.00000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1611  DNA mismatch repair protein MutS  26.09 
 
 		 867 aa  70.5  0.00000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.749504  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05155  putative DNA mismatch repair protein MutS  27.88 
 
 		 869 aa  70.1  0.00000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0159  DNA mismatch repair protein MutS  26.29 
 
 		 910 aa  70.1  0.00000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1883  DNA mismatch repair protein MutS  26.37 
 
 		 858 aa  70.1  0.00000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.245146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1376  DNA mismatch repair protein MutS  29.63 
 
 		 859 aa  70.1  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1336  MutS2 family protein  29.01 
 
 		 781 aa  70.1  0.00000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1169  DNA mismatch repair protein MutS  26.57 
 
 		 864 aa  70.1  0.00000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.29255 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3053  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  29.82 
 
 		 450 aa  70.1  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1537  DNA mismatch repair protein MutS  27.86 
 
 		 880 aa  70.1  0.00000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0842  DNA mismatch repair protein MutS  27.72 
 
 		 860 aa  69.7  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.899937  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1216  DNA mismatch repair protein MutS  28.06 
 
 		 903 aa  69.7  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0405457 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1900  DNA mismatch repair protein MutS  25.82 
 
 		 868 aa  70.1  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.419193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1159  DNA mismatch repair protein MutS  29.41 
 
 		 850 aa  69.7  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0179722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1373  MutS2 family protein  29.95 
 
 		 784 aa  69.7  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2234  DNA mismatch repair protein MutS  30.2 
 
 		 894 aa  69.3  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.282824  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1477  DNA mismatch repair protein MutS  30.22 
 
 		 857 aa  69.7  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.480331  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1925  DNA mismatch repair protein MutS  32.85 
 
 		 865 aa  69.7  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0834  DNA mismatch repair protein MutS  30.47 
 
 		 884 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.63588 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0978  DNA mismatch repair protein MutS  30.47 
 
 		 884 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2632  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  31.25 
 
 		 784 aa  68.6  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0176007  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0147  DNA mismatch repair protein MutS  24.77 
 
 		 910 aa  68.9  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1339  DNA mismatch repair protein MutS  29.58 
 
 		 896 aa  68.9  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.742998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1111  DNA mismatch repair protein MutS  30.43 
 
 		 922 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.88674  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0670  DNA mismatch repair protein MutS  30.99 
 
 		 902 aa  69.3  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.48055  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>