More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_7097 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_7097  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  100 
 
 		 443 aa  909    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000373438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3053  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  30.87 
 
 		 450 aa  213  3.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2666  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  30.27 
 
 		 423 aa  209  7e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.892577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2667  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  28.05 
 
 		 442 aa  193  4e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.235578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3819  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  27.15 
 
 		 445 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.081272  normal  0.267024 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3054  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  28.54 
 
 		 437 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.613085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1070  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  28.29 
 
 		 593 aa  119  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04875  DNA mismatch repair protein mutS  28.74 
 
 		 601 aa  110  7.000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2469  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  29.2 
 
 		 626 aa  107  6e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3218  DNA mismatch repair protein MutS  27.12 
 
 		 855 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.864156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3098  DNA mismatch repair protein MutS  27.12 
 
 		 855 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.603568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0156  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  24.74 
 
 		 586 aa  105  2e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3114  DNA mismatch repair protein MutS  27.12 
 
 		 855 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0090493 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3030  DNA mismatch repair protein MutS  27.12 
 
 		 855 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4137  DNA mismatch repair protein MutS  27.2 
 
 		 872 aa  104  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.757749  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0834  DNA mismatch repair protein MutS  30.61 
 
 		 884 aa  104  3e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.63588 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0978  DNA mismatch repair protein MutS  30.61 
 
 		 884 aa  104  3e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3059  DNA mismatch repair protein MutS  26.69 
 
 		 855 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.725135 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3211  DNA mismatch repair protein MutS  27.12 
 
 		 853 aa  104  4e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.864311  normal  0.594165 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3424  DNA mismatch repair protein MutS  25.7 
 
 		 851 aa  103  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3292  DNA mismatch repair protein MutS  25.7 
 
 		 851 aa  103  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1768  DNA mismatch repair protein MutS  27.5 
 
 		 846 aa  103  7e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3341  DNA mismatch repair protein MutS  26.99 
 
 		 858 aa  103  7e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.285192  unclonable  0.0000000411572 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3734  DNA mismatch repair protein MutS  30.65 
 
 		 883 aa  102  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648477  decreased coverage  0.000000000582755 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2957  DNA mismatch repair protein MutS  26.1 
 
 		 854 aa  102  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3142  DNA mismatch repair protein MutS  26.1 
 
 		 852 aa  102  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1115  DNA mismatch repair protein MutS  27.76 
 
 		 793 aa  102  1e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02583  DNA mismatch repair protein  26.69 
 
 		 853 aa  102  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.858461  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0955  DNA mismatch repair protein MutS  26.69 
 
 		 853 aa  102  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2424  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  32.81 
 
 		 594 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.720949  normal  0.166887 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3030  DNA mismatch repair protein MutS  26.69 
 
 		 860 aa  102  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0979  DNA mismatch repair protein MutS  26.69 
 
 		 853 aa  102  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.462533 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2871  DNA mismatch repair protein MutS  26.69 
 
 		 853 aa  102  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1004  DNA mismatch repair protein MutS  26.51 
 
 		 817 aa  101  2e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2085  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  31.35 
 
 		 536 aa  102  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00891152  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0956  DNA mismatch repair protein MutS  25.3 
 
 		 851 aa  101  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2122  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  31.35 
 
 		 536 aa  102  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0365547  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3143  DNA mismatch repair protein MutS  26.69 
 
 		 853 aa  102  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2860  DNA mismatch repair protein MutS  26.69 
 
 		 853 aa  102  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3986  DNA mismatch repair protein MutS  26.69 
 
 		 853 aa  102  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.724345  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02548  hypothetical protein  26.69 
 
 		 853 aa  102  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.766489  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1769  DNA mismatch repair protein MutS  26.67 
 
 		 846 aa  101  3e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0833  DNA mismatch repair protein MutS  25.42 
 
 		 851 aa  101  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0278286 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1015  DNA mismatch repair protein MutS  31.15 
 
 		 793 aa  100  5e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0964  DNA mismatch repair protein MutS  25.32 
 
 		 854 aa  100  7e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0854968  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2547  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  29.29 
 
 		 597 aa  99.4  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0988  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  26.36 
 
 		 615 aa  99.4  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.928875  normal  0.94372 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2087  DNA mismatch repair protein MutS  29.8 
 
 		 874 aa  99.4  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104539  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2451  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  29.29 
 
 		 597 aa  99.4  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.412357  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2236  DNA mismatch repair protein  31.71 
 
 		 590 aa  99  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1250  DNA mismatch repair protein MutS  25 
 
 		 823 aa  98.6  2e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.297858  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0576  DNA mismatch repair protein MutS  26.72 
 
 		 854 aa  98.2  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0274453  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1159  DNA mismatch repair protein MutS  26.83 
 
 		 850 aa  99  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0179722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0653  DNA mismatch repair protein MutS  29.14 
 
 		 881 aa  99  2e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1520  DNA mismatch repair protein MutS  25.93 
 
 		 848 aa  97.8  3e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1976  DNA mismatch repair protein MutS  27.54 
 
 		 904 aa  97.8  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0020973  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1214  DNA mismatch repair protein MutS  27.62 
 
 		 855 aa  97.4  5e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2226  DNA mismatch repair protein MutS  26.09 
 
 		 956 aa  97.1  5e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.137389  normal  0.561287 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0886  MutS domain-containing protein  28.05 
 
 		 557 aa  97.1  5e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.437767  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0063  DNA mismatch repair protein MutS  28.71 
 
 		 862 aa  97.1  6e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2027  MutS-like mismatch repair protein, ATPase  31.09 
 
 		 596 aa  97.1  6e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2791  DNA mismatch repair protein MutS  23.08 
 
 		 864 aa  96.7  8e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.494407 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0299  DNA mismatch repair protein MutS  25.56 
 
 		 873 aa  96.7  8e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.391446  normal  0.153174 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01708  protein required for mismatch repair in mitosis and meiosis (Eurofung)  29.39 
 
 		 1186 aa  96.3  9e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07480  DNA mismatch repair protein MSH2, putative  28.33 
 
 		 965 aa  96.3  9e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.271772  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2141  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  29.41 
 
 		 624 aa  96.3  9e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3337  DNA mismatch repair protein MutS  24.89 
 
 		 854 aa  96.3  9e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1061  DNA mismatch repair protein MutS  27.16 
 
 		 861 aa  96.3  9e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3595  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  30.68 
 
 		 607 aa  96.3  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0161652  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0919  DNA mismatch repair protein MutS  27.11 
 
 		 863 aa  96.3  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3293  DNA mismatch repair protein MutS  23.08 
 
 		 858 aa  95.9  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0310827  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2612  DNA mismatch repair protein MutS  26.18 
 
 		 939 aa  95.1  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3145  DNA mismatch repair protein MutS  26.18 
 
 		 939 aa  95.1  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1671  DNA mismatch repair protein MutS  26.18 
 
 		 891 aa  95.1  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.207117  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2691  DNA mismatch repair protein MutS  26.18 
 
 		 938 aa  95.1  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0407651  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1446  DNA mismatch repair protein MutS  26.18 
 
 		 939 aa  95.1  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.350724  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2173  DNA mismatch repair protein MutS  26.18 
 
 		 939 aa  95.1  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.01775  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3541  DNA mismatch repair protein MutS  28.78 
 
 		 929 aa  95.1  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2559  DNA mismatch repair protein MutS  26.18 
 
 		 891 aa  95.1  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1256  DNA mismatch repair protein MutS  27.67 
 
 		 887 aa  95.5  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.280018  hitchhiker  0.00178613 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002517  DNA mismatch repair protein MutS  28.8 
 
 		 853 aa  95.1  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.919799  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2380  DNA mismatch repair protein MutS  26.86 
 
 		 893 aa  95.5  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1485  DNA mismatch repair protein MutS  26.58 
 
 		 878 aa  95.1  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2709  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  27.83 
 
 		 590 aa  94.7  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0186895  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1104  MutS2 family protein  30.66 
 
 		 750 aa  94.7  3e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1299  DNA mismatch repair protein MutS  25.22 
 
 		 859 aa  94.7  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.537227  hitchhiker  0.00000000408163 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0434  DNA mismatch repair protein MutS  28.5 
 
 		 853 aa  94.7  3e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0558205  normal  0.0590484 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1202  DNA mismatch repair protein MutS  24.29 
 
 		 860 aa  94.4  4e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000170445  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1282  DNA mismatch repair protein MutS  26.75 
 
 		 862 aa  94.4  4e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0913  DNA mismatch repair protein MutS  27.51 
 
 		 882 aa  94.4  4e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1001  DNA mismatch repair protein MutS  24.81 
 
 		 819 aa  94  5e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.280502  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0359  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  26.84 
 
 		 598 aa  94  5e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2234  DNA mismatch repair protein MutS  27.21 
 
 		 894 aa  93.6  6e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.282824  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0209  DNA mismatch repair protein MutS  25.73 
 
 		 877 aa  93.6  6e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.784326 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2157  DNA mismatch repair protein MutS  26.98 
 
 		 882 aa  93.6  6e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.404203  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0553  DNA mismatch repair protein MutS  26.05 
 
 		 882 aa  93.2  7e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38640  DNA mismatch repair protein MutS  29.82 
 
 		 855 aa  93.6  7e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.477357  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1113  DNA mismatch repair protein MutS  30.69 
 
 		 863 aa  93.6  7e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000302948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1698  DNA mismatch repair protein MutS  26.98 
 
 		 882 aa  93.2  8e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2247  DNA mismatch repair protein MutS  26.98 
 
 		 882 aa  93.2  8e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.136567  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>