More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3819 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3819  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  100 
 
 		 445 aa  928    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.081272  normal  0.267024 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7097  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  27.15 
 
 		 443 aa  188  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000373438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2667  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  30.07 
 
 		 442 aa  184  3e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.235578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3054  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  26.1 
 
 		 437 aa  179  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.613085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2666  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  29.44 
 
 		 423 aa  168  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.892577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3053  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  27.15 
 
 		 450 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1070  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  33.18 
 
 		 593 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0913  DNA mismatch repair protein MutS  32.43 
 
 		 882 aa  119  7.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0358  DNA mismatch repair protein MutS  35.1 
 
 		 918 aa  117  3e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.613152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0299  DNA mismatch repair protein MutS  34.91 
 
 		 873 aa  117  5e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.391446  normal  0.153174 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2469  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  34.43 
 
 		 626 aa  116  6.9999999999999995e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0156  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  33.79 
 
 		 586 aa  115  1.0000000000000001e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0730  DNA mismatch repair protein MutS  30.58 
 
 		 889 aa  114  5e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2027  MutS-like mismatch repair protein, ATPase  34.4 
 
 		 596 aa  113  8.000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  30.22 
 
 		 870 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0247  DNA mismatch repair protein MutS-like protein  33.48 
 
 		 601 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2226  DNA mismatch repair protein MutS  27.8 
 
 		 956 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.137389  normal  0.561287 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2411  MutS domain-containing protein  32.99 
 
 		 595 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.133991  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2123  MutS domain-containing protein  32.99 
 
 		 595 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0335  DNA mismatch repair protein MutS  30.81 
 
 		 815 aa  108  2e-22  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.213975  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0346  DNA mismatch repair protein MutS  32.11 
 
 		 823 aa  107  3e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0580477  normal  0.279118 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0260  DNA mismatch repair protein MutS  30.51 
 
 		 804 aa  107  3e-22  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.76262  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1486  DNA mismatch repair protein MutS  37.28 
 
 		 867 aa  107  3e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.387316  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0359  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  33.95 
 
 		 598 aa  107  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0553  DNA mismatch repair protein MutS  29.39 
 
 		 882 aa  108  3e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1887  DNA mismatch repair protein MutS  29.82 
 
 		 868 aa  107  4e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00463381  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0355  DNA mismatch repair protein MutS  35.57 
 
 		 910 aa  107  6e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0171458 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1466  DNA mismatch repair protein MutS  32.44 
 
 		 872 aa  107  6e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1181  DNA mismatch repair protein MutS  31.86 
 
 		 927 aa  106  8e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1113  DNA mismatch repair protein MutS  33.69 
 
 		 863 aa  105  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000302948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1077  DNA mismatch repair protein MutS  31.86 
 
 		 853 aa  105  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0458  DNA mismatch repair protein MutS  33.84 
 
 		 865 aa  104  3e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.143165  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1355  DNA mismatch repair protein MutS  30.34 
 
 		 872 aa  103  4e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.653089  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1332  DNA mismatch repair protein MutS  33.5 
 
 		 930 aa  104  4e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1381  DNA mismatch repair protein MutS  30.34 
 
 		 872 aa  103  4e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.640627  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0159  DNA mismatch repair protein MutS  30.86 
 
 		 910 aa  103  5e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0190  DNA mismatch repair protein MutS  32.52 
 
 		 820 aa  103  5e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1216  DNA mismatch repair protein MutS  34.86 
 
 		 903 aa  103  5e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0405457 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3226  DNA mismatch repair protein MutS  34.3 
 
 		 892 aa  103  6e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1510  DNA mismatch repair protein MutS  27.37 
 
 		 870 aa  103  8e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101093  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2421  DNA mismatch repair protein MutS  30.26 
 
 		 895 aa  102  9e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0142  DNA mismatch repair protein MutS  30.34 
 
 		 898 aa  102  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0147  DNA mismatch repair protein MutS  30.48 
 
 		 910 aa  102  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0824  DNA mismatch repair protein MutS  33.33 
 
 		 804 aa  102  1e-20  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3781  DNA mismatch repair protein MutS  30.26 
 
 		 892 aa  102  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0472636 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3803  DNA mismatch repair protein MutS  30.26 
 
 		 892 aa  102  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3618  DNA mismatch repair protein MutS  30.26 
 
 		 892 aa  102  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3510  DNA mismatch repair protein MutS  30.26 
 
 		 890 aa  102  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1001  DNA mismatch repair protein MutS  29.92 
 
 		 819 aa  101  2e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.280502  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1976  DNA mismatch repair protein MutS  34.18 
 
 		 904 aa  102  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0020973  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3905  DNA mismatch repair protein MutS  30.26 
 
 		 892 aa  102  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3816  DNA mismatch repair protein MutS  30.26 
 
 		 892 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3868  DNA mismatch repair protein MutS  30.26 
 
 		 890 aa  102  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0525  DNA mismatch repair protein MutS  29.05 
 
 		 881 aa  101  3e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.751671  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1769  DNA mismatch repair protein MutS  31.69 
 
 		 846 aa  101  3e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3595  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  38.22 
 
 		 607 aa  101  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0161652  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0008  DNA mismatch repair protein MutS  36.36 
 
 		 904 aa  100  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0434  DNA mismatch repair protein MutS  31.98 
 
 		 853 aa  100  4e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0558205  normal  0.0590484 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0614  DNA mismatch repair protein MutS  30.52 
 
 		 907 aa  100  4e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1104  MutS2 family protein  31.84 
 
 		 750 aa  100  4e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1478  DNA mismatch repair protein MutS  31.47 
 
 		 828 aa  100  5e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1169  DNA mismatch repair protein MutS  32.07 
 
 		 864 aa  100  5e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.29255 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2875  DNA mismatch repair protein MutS  35.6 
 
 		 879 aa  100  5e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.928835 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1115  DNA mismatch repair protein MutS  29.27 
 
 		 793 aa  100  5e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3540  DNA mismatch repair protein MutS  28.72 
 
 		 890 aa  100  6e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190608  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3541  DNA mismatch repair protein MutS  31.67 
 
 		 929 aa  100  6e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1202  DNA mismatch repair protein MutS  25.95 
 
 		 860 aa  100  6e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000170445  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2141  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  29.92 
 
 		 624 aa  100  7e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1431  DNA mismatch repair protein MutS  29.23 
 
 		 892 aa  100  7e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.964721 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0863  DNA mismatch repair protein MutS  30.34 
 
 		 873 aa  99.8  8e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.462297  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3528  DNA mismatch repair protein MutS  29.23 
 
 		 894 aa  100  8e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2791  DNA mismatch repair protein MutS  30.16 
 
 		 864 aa  99.8  9e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.494407 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0330  DNA mismatch repair protein MutS  28.24 
 
 		 917 aa  99  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2983  DNA mismatch repair protein MutS  29.41 
 
 		 864 aa  99.4  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.773158  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1768  DNA mismatch repair protein MutS  31.28 
 
 		 846 aa  99.4  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2381  DNA mismatch repair protein MutS  33.76 
 
 		 932 aa  99  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0423  DNA mismatch repair protein MutS  35.15 
 
 		 883 aa  99.8  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0948  DNA mismatch repair protein MutS  27.43 
 
 		 868 aa  99.8  1e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2380  DNA mismatch repair protein MutS  32.69 
 
 		 893 aa  99  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0412  DNA mismatch repair protein MutS  28.37 
 
 		 857 aa  99  1e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1243  DNA mismatch repair protein MutS  31.31 
 
 		 926 aa  98.6  2e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.32952  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0490  DNA mismatch repair protein MutS  30.83 
 
 		 888 aa  98.6  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0363  DNA mismatch repair protein MutS  30.92 
 
 		 882 aa  98.6  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4031  DNA mismatch repair protein MutS  30.16 
 
 		 881 aa  98.6  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.137829  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2761  DNA mismatch repair protein MutS  32.64 
 
 		 904 aa  99  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.572948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1698  DNA mismatch repair protein MutS  29.51 
 
 		 882 aa  98.2  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3599  DNA mismatch repair protein MutS  36.94 
 
 		 908 aa  97.8  3e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0656  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  32.41 
 
 		 604 aa  98.2  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3098  DNA mismatch repair protein MutS  29.9 
 
 		 855 aa  97.4  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.603568  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1611  DNA mismatch repair protein MutS  30.98 
 
 		 867 aa  97.4  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.749504  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0030  DNA mismatch repair protein MutS  30.74 
 
 		 915 aa  97.4  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000355609 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3114  DNA mismatch repair protein MutS  29.9 
 
 		 855 aa  97.4  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0090493 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2236  DNA mismatch repair protein  34.68 
 
 		 590 aa  97.8  4e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7101  DNA mismatch repair protein MutS  33.85 
 
 		 929 aa  97.8  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.743761  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7642  DNA mismatch repair protein MutS  30.12 
 
 		 910 aa  97.4  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.532158 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3030  DNA mismatch repair protein MutS  29.9 
 
 		 855 aa  97.4  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1950  DNA mismatch repair protein MutS  33.86 
 
 		 872 aa  97.1  5e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.998424  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3218  DNA mismatch repair protein MutS  29.9 
 
 		 855 aa  97.4  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.864156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0513  DNA mismatch repair protein MutS  30.8 
 
 		 907 aa  97.1  6e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1015  DNA mismatch repair protein MutS  28.46 
 
 		 793 aa  97.1  6e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>