More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1070 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1070  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  100 
 
 		 593 aa  1231    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2709  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  33.67 
 
 		 590 aa  346  6e-94  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0186895  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0156  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  36.35 
 
 		 586 aa  344  2e-93  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2236  DNA mismatch repair protein  33.56 
 
 		 590 aa  340  2.9999999999999998e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04875  DNA mismatch repair protein mutS  34.23 
 
 		 601 aa  335  2e-90  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3595  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  33.89 
 
 		 607 aa  330  6e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0161652  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2469  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  33.39 
 
 		 626 aa  317  5e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0359  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  32.38 
 
 		 598 aa  313  3.9999999999999997e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1114  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  31.16 
 
 		 605 aa  302  1e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2141  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  32.67 
 
 		 624 aa  295  1e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2027  MutS-like mismatch repair protein, ATPase  31.19 
 
 		 596 aa  284  3.0000000000000004e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5542  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  32.2 
 
 		 610 aa  282  9e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0656  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  31.9 
 
 		 604 aa  281  2e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2411  MutS domain-containing protein  31.43 
 
 		 595 aa  277  3e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.133991  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2123  MutS domain-containing protein  31.43 
 
 		 595 aa  277  3e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0247  DNA mismatch repair protein MutS-like protein  30.51 
 
 		 601 aa  275  2.0000000000000002e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4132  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  35.32 
 
 		 610 aa  262  1e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.300253 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0988  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  31.37 
 
 		 615 aa  258  2e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.928875  normal  0.94372 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3182  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  29.53 
 
 		 618 aa  247  3e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2547  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  30.93 
 
 		 597 aa  218  2e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2424  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  30.43 
 
 		 594 aa  207  4e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.720949  normal  0.166887 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1406  DNA mismatch repair protein MutS-like  30.62 
 
 		 597 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2451  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  33.96 
 
 		 597 aa  183  8.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.412357  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0562  DNA mismatch repair protein MutS-like  37.82 
 
 		 243 aa  162  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2122  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  24.18 
 
 		 536 aa  141  3.9999999999999997e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0365547  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2085  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  24.18 
 
 		 536 aa  141  3.9999999999999997e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00891152  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0886  MutS domain-containing protein  25.81 
 
 		 557 aa  141  3.9999999999999997e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.437767  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1660  MutS family protein  33.2 
 
 		 538 aa  134  3.9999999999999996e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0221998  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1160  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  30.3 
 
 		 554 aa  130  8.000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0706  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  31.29 
 
 		 438 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.574952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0305  MutS domain-containing protein  24.57 
 
 		 521 aa  120  4.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.667577  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0300  MutS domain-containing protein  23.75 
 
 		 521 aa  120  7e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3819  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  33.18 
 
 		 445 aa  120  9e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.081272  normal  0.267024 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7097  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  28.29 
 
 		 443 aa  119  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000373438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2383  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  28.57 
 
 		 558 aa  117  7.999999999999999e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.356876  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0552  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  27.73 
 
 		 555 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2666  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  23.89 
 
 		 423 aa  108  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.892577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2667  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  26.1 
 
 		 442 aa  108  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.235578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0622  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  41.96 
 
 		 112 aa  107  6e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000499338  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1115  DNA mismatch repair protein MutS  32.2 
 
 		 793 aa  105  2e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1015  DNA mismatch repair protein MutS  32.74 
 
 		 793 aa  103  1e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0330  DNA mismatch repair protein MutS  30.6 
 
 		 917 aa  100  7e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3054  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  24.39 
 
 		 437 aa  100  8e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.613085  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  31.22 
 
 		 871 aa  90.9  6e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0834  DNA mismatch repair protein MutS  31.58 
 
 		 884 aa  90.1  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.63588 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0978  DNA mismatch repair protein MutS  31.58 
 
 		 884 aa  90.1  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10621  DNA mismatch repair protein Msh2, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G09850)  33.01 
 
 		 945 aa  88.2  4e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2380  DNA mismatch repair protein MutS  28.62 
 
 		 893 aa  87.4  6e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3768  DNA mismatch repair protein MutS  31.1 
 
 		 968 aa  87.4  6e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3053  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  23.6 
 
 		 450 aa  87.4  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1520  DNA mismatch repair protein MutS  31.28 
 
 		 848 aa  87.4  7e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2284  DNA mismatch repair protein MutS  31.71 
 
 		 897 aa  87  8e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.339354  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3706  DNA mismatch repair protein MutS  31.58 
 
 		 1085 aa  87  8e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0191943 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1250  DNA mismatch repair protein MutS  30.8 
 
 		 823 aa  86.7  0.000000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.297858  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3531  DNA mismatch repair protein MutS  31.14 
 
 		 1088 aa  86.3  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1768  DNA mismatch repair protein MutS  28.46 
 
 		 846 aa  84.7  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2226  DNA mismatch repair protein MutS  30.32 
 
 		 956 aa  84  0.000000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.137389  normal  0.561287 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1004  DNA mismatch repair protein MutS  28.33 
 
 		 817 aa  83.6  0.000000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4078  DNA mismatch repair protein MutS  30.09 
 
 		 928 aa  84  0.000000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.980246  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA07480  DNA mismatch repair protein MSH2, putative  30.04 
 
 		 965 aa  83.6  0.000000000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.271772  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0063  DNA mismatch repair protein MutS  31.18 
 
 		 862 aa  83.2  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0948  DNA mismatch repair protein MutS  28.87 
 
 		 868 aa  83.6  0.00000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1214  DNA mismatch repair protein MutS  28.46 
 
 		 855 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03515  DNA mismatch repair protein MutS  29.23 
 
 		 853 aa  83.2  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3383  DNA mismatch repair protein MutS  27.9 
 
 		 856 aa  83.6  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.130934  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1769  DNA mismatch repair protein MutS  28.06 
 
 		 846 aa  82.4  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0247  DNA mismatch repair protein MutS  30.86 
 
 		 1058 aa  82.4  0.00000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0653  DNA mismatch repair protein MutS  28.14 
 
 		 881 aa  82.8  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1202  DNA mismatch repair protein MutS  27.16 
 
 		 860 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000170445  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0986  DNA mismatch repair protein MutS  27.66 
 
 		 871 aa  82  0.00000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1282  DNA mismatch repair protein MutS  30.24 
 
 		 862 aa  82  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2107  DNA mismatch repair protein MutS  30.88 
 
 		 885 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.069343 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5394  DNA mismatch repair protein MutS  30.88 
 
 		 885 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.597717  normal  0.74748 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1001  DNA mismatch repair protein MutS  27.46 
 
 		 819 aa  82  0.00000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.280502  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5989  DNA mismatch repair protein MutS  30.88 
 
 		 885 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1358  DNA mismatch repair protein MutS  30.61 
 
 		 910 aa  82  0.00000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.476923  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1171  DNA mismatch repair protein MutS  30.61 
 
 		 910 aa  81.6  0.00000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0005  DNA mismatch repair protein MutS  29.78 
 
 		 856 aa  82  0.00000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2124  DNA mismatch repair protein MutS  30.3 
 
 		 886 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1611  DNA mismatch repair protein MutS  31.03 
 
 		 867 aa  81.6  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.749504  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2088  DNA mismatch repair protein MutS  30.88 
 
 		 885 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1998  DNA mismatch repair protein MutS  30.3 
 
 		 885 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000368418 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1045  DNA mismatch repair protein MutS  29.02 
 
 		 854 aa  82  0.00000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.493253 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0730  DNA mismatch repair protein MutS  30.37 
 
 		 889 aa  81.3  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3142  DNA mismatch repair protein MutS  29.31 
 
 		 852 aa  81.3  0.00000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1207  DNA mismatch repair protein MutS  31.25 
 
 		 862 aa  81.3  0.00000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1542  DNA mismatch repair protein MutS  30.25 
 
 		 898 aa  80.9  0.00000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.883963  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1124  DNA mismatch repair protein MutS  25.55 
 
 		 861 aa  80.9  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0879  DNA mismatch repair protein MutS  27.66 
 
 		 859 aa  80.9  0.00000000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2957  DNA mismatch repair protein MutS  28.88 
 
 		 854 aa  80.9  0.00000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1704  DNA mismatch repair protein MutS  28.95 
 
 		 887 aa  80.5  0.00000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.470624  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002517  DNA mismatch repair protein MutS  28.85 
 
 		 853 aa  80.5  0.00000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.919799  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3431  DNA mismatch repair protein MutS  28.45 
 
 		 856 aa  80.5  0.00000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1495  DNA mismatch repair protein MutS  29.79 
 
 		 900 aa  80.5  0.00000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  31.58 
 
 		 870 aa  80.5  0.00000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0214  DNA mismatch repair protein MutS  29.36 
 
 		 851 aa  80.5  0.00000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.250019 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1186  DNA mismatch repair protein MutS  30.88 
 
 		 884 aa  80.5  0.00000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296401 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2421  DNA mismatch repair protein MutS  28.81 
 
 		 895 aa  80.5  0.00000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3734  DNA mismatch repair protein MutS  28.45 
 
 		 883 aa  80.1  0.00000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648477  decreased coverage  0.000000000582755 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0621  DNA mismatch repair protein MutS  29.67 
 
 		 859 aa  80.1  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.947929  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>