More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2773 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_2773  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  100 
 
 		 500 aa  1024    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.643007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0735  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  50.3 
 
 		 496 aa  452  1.0000000000000001e-126  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.19078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1829  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  46.59 
 
 		 501 aa  427  1e-118  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.181127  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1786  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  46.59 
 
 		 501 aa  427  1e-118  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00151585  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2645  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  45.88 
 
 		 508 aa  424  1e-117  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.260435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1246  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  26.19 
 
 		 551 aa  151  3e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0734  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  38.24 
 
 		 516 aa  129  2.0000000000000002e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.013522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2646  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  32.3 
 
 		 524 aa  116  6.9999999999999995e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.264695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1785  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  30.47 
 
 		 505 aa  113  7.000000000000001e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0257213  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1828  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  29.31 
 
 		 505 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.338904  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2772  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  32.88 
 
 		 507 aa  111  3e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0095  DNA mismatch repair protein MutS  28.69 
 
 		 891 aa  84.3  0.000000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0480084 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0899  MutS2 family protein  29.12 
 
 		 789 aa  84.3  0.000000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.461302  normal  0.733658 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1166  MutS2 family protein  33.33 
 
 		 761 aa  82  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.690197  normal  0.0205926 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49314  predicted protein  32.39 
 
 		 916 aa  80.9  0.00000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0725595  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1585  DNA mismatch repair protein MutS-like  26.79 
 
 		 547 aa  79.7  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0342  MutS family DNA mismatch repair protein  29.76 
 
 		 536 aa  79  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1216  DNA mismatch repair protein MutS  31.91 
 
 		 903 aa  79  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0405457 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3768  DNA mismatch repair protein MutS  29.41 
 
 		 968 aa  79  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2282  DNA mismatch repair protein MutS-like  28.19 
 
 		 547 aa  78.2  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1723  DNA mismatch repair protein MutS  23.26 
 
 		 855 aa  75.9  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1381  DNA mismatch repair protein MutS  28.67 
 
 		 862 aa  75.9  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1887  DNA mismatch repair protein MutS  32.61 
 
 		 868 aa  75.5  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00463381  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2386  DNA mismatch repair protein MutS  30.41 
 
 		 872 aa  73.9  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.143678  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4891  MutS2 family protein  30.34 
 
 		 806 aa  73.6  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2247  DNA mismatch repair protein MutS  31.5 
 
 		 882 aa  73.2  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0873729  normal  0.14084 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1542  DNA mismatch repair protein MutS  25.97 
 
 		 898 aa  73.2  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.883963  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0974  DNA mismatch repair protein  32.88 
 
 		 859 aa  73.2  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1104  MutS2 family protein  28.89 
 
 		 750 aa  72.4  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1519  DNA mismatch repair protein MutS  31.45 
 
 		 854 aa  72  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00861946  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3186  DNA mismatch repair protein MutS  31.45 
 
 		 854 aa  72.4  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0251089 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3815  DNA mismatch repair protein MutS  32.03 
 
 		 907 aa  72.4  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.548974 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1169  DNA mismatch repair protein MutS  31.21 
 
 		 864 aa  72.4  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.29255 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0730  DNA mismatch repair protein MutS  28.51 
 
 		 889 aa  72.4  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01708  protein required for mismatch repair in mitosis and meiosis (Eurofung)  26.32 
 
 		 1186 aa  71.6  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1115  DNA mismatch repair protein MutS  32.39 
 
 		 793 aa  71.6  0.00000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2226  DNA mismatch repair protein MutS  29.03 
 
 		 956 aa  71.6  0.00000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.137389  normal  0.561287 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0913  DNA mismatch repair protein MutS  29.59 
 
 		 882 aa  71.6  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0935  DNA mismatch repair protein MutS  29.5 
 
 		 874 aa  71.6  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2515  DNA mismatch repair protein MutS  30.77 
 
 		 885 aa  72  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0545  MutS2 family protein  31.62 
 
 		 775 aa  71.6  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.807648  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2983  DNA mismatch repair protein MutS  28.8 
 
 		 864 aa  71.2  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.773158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1332  DNA mismatch repair protein MutS  30.5 
 
 		 930 aa  71.2  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0299  DNA mismatch repair protein MutS  27.73 
 
 		 873 aa  70.9  0.00000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.391446  normal  0.153174 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0335  DNA mismatch repair protein MutS  27.09 
 
 		 815 aa  70.5  0.00000000006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.213975  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1015  DNA mismatch repair protein MutS  31.69 
 
 		 793 aa  70.5  0.00000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3226  DNA mismatch repair protein MutS  26.29 
 
 		 892 aa  70.5  0.00000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0538  MutS2 family protein  30.37 
 
 		 791 aa  70.1  0.00000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00387352  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1900  DNA mismatch repair protein MutS  28.77 
 
 		 868 aa  70.1  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.419193  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  29.93 
 
 		 871 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1510  DNA mismatch repair protein MutS  24.3 
 
 		 870 aa  69.7  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101093  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45661  muts-like protein 4  24.09 
 
 		 1191 aa  69.7  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1913  DNA mismatch repair protein MutS  25.33 
 
 		 893 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.396246  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3706  DNA mismatch repair protein MutS  28.92 
 
 		 1085 aa  69.7  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0191943 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05155  putative DNA mismatch repair protein MutS  27.1 
 
 		 869 aa  69.7  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1029  DNA mismatch repair protein MutS  27.96 
 
 		 858 aa  69.3  0.0000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0324603  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40782  predicted protein  25.88 
 
 		 1113 aa  68.9  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.119207  normal  0.227387 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0081  DNA mismatch repair protein MutS  29.14 
 
 		 905 aa  69.3  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.294772  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1002  DNA mismatch repair protein  26.88 
 
 		 858 aa  68.9  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1284  DNA mismatch repair protein MutS  29.61 
 
 		 896 aa  68.9  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00881  DNA mismatch repair protein MutS  30.99 
 
 		 927 aa  68.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0543692 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18351  DNA mismatch repair protein MutS  25.13 
 
 		 914 aa  68.6  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1031  DNA mismatch repair protein MutS  26.44 
 
 		 851 aa  68.6  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3531  DNA mismatch repair protein MutS  27.71 
 
 		 1088 aa  68.6  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2495  DNA mismatch repair protein MutS  27.13 
 
 		 869 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2935  MutS2 family protein  32.37 
 
 		 788 aa  68.2  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1317  DNA mismatch repair protein MutS  30.66 
 
 		 873 aa  68.2  0.0000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0784135  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03515  DNA mismatch repair protein MutS  24.56 
 
 		 853 aa  68.2  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0330  DNA mismatch repair protein MutS  28.18 
 
 		 917 aa  68.6  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02590  mismatch repair-related protein, putative  26.29 
 
 		 1205 aa  67.8  0.0000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.102659  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1495  DNA mismatch repair protein MutS  24.75 
 
 		 900 aa  67.8  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4078  DNA mismatch repair protein MutS  30.47 
 
 		 928 aa  67.8  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.980246  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3224  DNA mismatch repair protein MutS  29.7 
 
 		 895 aa  67.8  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1064  DNA mismatch repair protein MutS  27.84 
 
 		 870 aa  68.2  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1500  DNA mismatch repair protein MutS  26.67 
 
 		 863 aa  68.2  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2125  MutS2 family protein  31.08 
 
 		 776 aa  68.2  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0426  mismatch repair ATPase  27.62 
 
 		 791 aa  67.8  0.0000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00172781  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1219  DNA mismatch repair protein MutS  27.57 
 
 		 858 aa  67.8  0.0000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.34292  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2734  DNA mismatch repair protein MutS  28.72 
 
 		 888 aa  67.8  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3368  DNA mismatch repair protein MutS  29.63 
 
 		 888 aa  67.4  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.583963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2735  DNA mismatch repair protein MutS  30.43 
 
 		 850 aa  67.8  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1737  MutS family DNA structure-specific ATPase  31.82 
 
 		 783 aa  67.4  0.0000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03749  DNA mismatch repair protein msh3 (MutS protein homolog 3) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B6T1]  27.97 
 
 		 1091 aa  67  0.0000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.642565  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1719  MutS2 family protein  29.41 
 
 		 779 aa  67  0.0000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1611  DNA mismatch repair protein MutS  28.47 
 
 		 867 aa  67  0.0000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.749504  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1126  DNA mismatch repair protein MutS  28.47 
 
 		 881 aa  67  0.0000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0124737  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2347  DNA mismatch repair protein MutS  29.41 
 
 		 860 aa  67  0.0000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.836402  normal  0.482784 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  29.93 
 
 		 872 aa  67  0.0000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1537  DNA mismatch repair protein MutS  28.57 
 
 		 880 aa  66.6  0.0000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1671  DNA mismatch repair protein MutS  24.89 
 
 		 891 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.207117  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  23.56 
 
 		 870 aa  66.6  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2691  DNA mismatch repair protein MutS  24.89 
 
 		 938 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0407651  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2173  DNA mismatch repair protein MutS  24.89 
 
 		 939 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.01775  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1496  DNA mismatch repair protein MutS  25.87 
 
 		 869 aa  66.2  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.241092  hitchhiker  0.0000395311 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0824  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  31.34 
 
 		 792 aa  66.2  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0834  DNA mismatch repair protein MutS  30.16 
 
 		 884 aa  66.2  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.63588 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0978  DNA mismatch repair protein MutS  30.16 
 
 		 884 aa  66.2  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3337  DNA mismatch repair protein MutS  24.56 
 
 		 864 aa  66.2  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1446  DNA mismatch repair protein MutS  24.89 
 
 		 939 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.350724  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2743  DNA mismatch repair protein MutS  27.78 
 
 		 868 aa  66.2  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>