More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2645 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2645  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  100 
 
 		 508 aa  1023    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.260435  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2773  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  45.88 
 
 		 500 aa  439  9.999999999999999e-123  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.643007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0735  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  45.69 
 
 		 496 aa  395  1e-109  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.19078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1829  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  39.36 
 
 		 501 aa  345  2e-93  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.181127  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1786  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  39.16 
 
 		 501 aa  344  2e-93  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00151585  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1246  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  28.51 
 
 		 551 aa  156  7e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0734  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  28.88 
 
 		 516 aa  114  3e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.013522  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2772  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  29.08 
 
 		 507 aa  104  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2646  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  31.9 
 
 		 524 aa  100  5e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.264695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1828  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  25.18 
 
 		 505 aa  98.6  3e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.338904  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1785  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  24.94 
 
 		 505 aa  95.1  3e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0257213  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3768  DNA mismatch repair protein MutS  32.37 
 
 		 968 aa  79.7  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1104  MutS2 family protein  31.3 
 
 		 750 aa  79.3  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3337  DNA mismatch repair protein MutS  27.57 
 
 		 864 aa  75.5  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0538  MutS2 family protein  29.89 
 
 		 791 aa  75.1  0.000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00387352  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1166  MutS2 family protein  27.91 
 
 		 761 aa  74.3  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.690197  normal  0.0205926 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4891  MutS2 family protein  28.19 
 
 		 806 aa  74.3  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1115  DNA mismatch repair protein MutS  30.32 
 
 		 793 aa  74.3  0.000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1015  DNA mismatch repair protein MutS  30.32 
 
 		 793 aa  74.3  0.000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2125  MutS2 family protein  31.21 
 
 		 776 aa  73.2  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  27.61 
 
 		 871 aa  72  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0095  DNA mismatch repair protein MutS  29.28 
 
 		 891 aa  72.4  0.00000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0480084 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0247  DNA mismatch repair protein MutS  29.13 
 
 		 1058 aa  72  0.00000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0230  MutS2 family protein  30.3 
 
 		 789 aa  72.8  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000337666  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2791  DNA mismatch repair protein MutS  28.67 
 
 		 864 aa  71.6  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.494407 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3706  DNA mismatch repair protein MutS  25.85 
 
 		 1085 aa  71.6  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0191943 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3531  DNA mismatch repair protein MutS  26.27 
 
 		 1088 aa  71.6  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0458  MutS family ATPase  31.82 
 
 		 795 aa  71.6  0.00000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1585  DNA mismatch repair protein MutS-like  27.68 
 
 		 547 aa  71.2  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  29.22 
 
 		 872 aa  71.2  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1896  DNA mismatch repair protein MutS  27.59 
 
 		 872 aa  70.9  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0824451  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1159  DNA mismatch repair protein MutS  28.79 
 
 		 850 aa  71.2  0.00000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0179722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1611  DNA mismatch repair protein MutS  27.74 
 
 		 867 aa  70.5  0.00000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.749504  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2735  DNA mismatch repair protein MutS  27.63 
 
 		 850 aa  70.5  0.00000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18351  DNA mismatch repair protein MutS  26.9 
 
 		 913 aa  70.1  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1887  DNA mismatch repair protein MutS  30.47 
 
 		 868 aa  70.1  0.00000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00463381  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0035  DNA mismatch repair protein MutS  30.3 
 
 		 921 aa  69.7  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.892203 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1381  DNA mismatch repair protein MutS  29.65 
 
 		 862 aa  69.7  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3541  DNA mismatch repair protein MutS  30 
 
 		 929 aa  69.7  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49314  predicted protein  31.03 
 
 		 916 aa  69.3  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0725595  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1832  DNA mismatch repair protein MutS  27.4 
 
 		 882 aa  69.7  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0214  DNA mismatch repair protein MutS  28.99 
 
 		 851 aa  69.7  0.0000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.250019 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0273  DNA mismatch repair protein MutS  28.35 
 
 		 1040 aa  69.3  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.601662 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2274  DNA mismatch repair protein MutS  28.07 
 
 		 911 aa  69.7  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.103313 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0913  DNA mismatch repair protein MutS  28.48 
 
 		 882 aa  69.3  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0299  DNA mismatch repair protein MutS  24.85 
 
 		 873 aa  69.7  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.391446  normal  0.153174 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18351  DNA mismatch repair protein MutS  22.5 
 
 		 914 aa  69.7  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1216  DNA mismatch repair protein MutS  30.37 
 
 		 903 aa  68.6  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0405457 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18541  DNA mismatch repair protein MutS  26.9 
 
 		 913 aa  68.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0342  MutS family DNA mismatch repair protein  28.14 
 
 		 536 aa  68.9  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3226  DNA mismatch repair protein MutS  26.98 
 
 		 892 aa  68.9  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00881  DNA mismatch repair protein MutS  25.45 
 
 		 927 aa  68.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0543692 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0621  DNA mismatch repair protein MutS  31.48 
 
 		 905 aa  68.6  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.720679  normal  0.722964 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2390  MutS2 family protein  29.09 
 
 		 786 aa  68.6  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0786061  normal  0.328409 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0553  DNA mismatch repair protein MutS  27.21 
 
 		 882 aa  67.4  0.0000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2282  DNA mismatch repair protein MutS-like  27.27 
 
 		 547 aa  67.8  0.0000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3021  DNA mismatch repair protein MutS  27.68 
 
 		 897 aa  67.8  0.0000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1437  DNA mismatch repair protein MutS  27.48 
 
 		 905 aa  67.4  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.402439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0260  DNA mismatch repair protein MutS  26.11 
 
 		 804 aa  67  0.0000000007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.76262  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0730  DNA mismatch repair protein MutS  27.78 
 
 		 889 aa  67.4  0.0000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1704  DNA mismatch repair protein MutS  30.71 
 
 		 887 aa  67  0.0000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.470624  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2842  DNA mismatch repair protein MutS  26.32 
 
 		 870 aa  66.6  0.0000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.147304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1466  DNA mismatch repair protein MutS  24.88 
 
 		 872 aa  66.6  0.0000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  27.34 
 
 		 870 aa  66.6  0.0000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1500  DNA mismatch repair protein MutS  23.31 
 
 		 863 aa  66.6  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1737  DNA mismatch repair protein MutS  24.07 
 
 		 913 aa  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0169322  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1711  MutS2 family protein  28.38 
 
 		 801 aa  66.2  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000187694  normal  0.426303 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0335  DNA mismatch repair protein MutS  28.79 
 
 		 815 aa  66.6  0.000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.213975  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0824  DNA mismatch repair protein MutS  26.92 
 
 		 804 aa  66.6  0.000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1126  DNA mismatch repair protein MutS  27.12 
 
 		 881 aa  66.2  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0124737  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1359  DNA mismatch repair protein MutS  26.06 
 
 		 870 aa  66.6  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.219365  normal  0.0149931 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1542  DNA mismatch repair protein MutS  30.14 
 
 		 898 aa  66.6  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.883963  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1717  MutS family ATPase  28.47 
 
 		 800 aa  66.2  0.000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1709  DNA mismatch repair protein MutS  25.52 
 
 		 871 aa  66.2  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1031  DNA mismatch repair protein MutS  27.48 
 
 		 851 aa  65.5  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1064  DNA mismatch repair protein MutS  27.59 
 
 		 870 aa  65.5  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1181  DNA mismatch repair protein MutS  27.35 
 
 		 886 aa  65.5  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.690734 
 
 
-
 
NC_004310  BR0147  DNA mismatch repair protein MutS  30.12 
 
 		 910 aa  65.5  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1243  DNA mismatch repair protein MutS  28.48 
 
 		 926 aa  65.5  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.32952  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1495  DNA mismatch repair protein MutS  30.4 
 
 		 900 aa  65.5  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1332  DNA mismatch repair protein MutS  31.4 
 
 		 930 aa  65.5  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4799  DNA mismatch repair protein MutS  29.63 
 
 		 896 aa  65.9  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.720607 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03515  DNA mismatch repair protein MutS  24.78 
 
 		 853 aa  65.9  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1256  DNA mismatch repair protein MutS  25 
 
 		 887 aa  65.9  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.280018  hitchhiker  0.00178613 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0142  DNA mismatch repair protein MutS  30.12 
 
 		 898 aa  65.5  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0899  MutS2 family protein  26.72 
 
 		 789 aa  65.5  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.461302  normal  0.733658 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0824  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  30.48 
 
 		 792 aa  65.9  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1169  DNA mismatch repair protein MutS  31.11 
 
 		 864 aa  65.5  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.29255 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1437  DNA mismatch repair protein MutS  24.52 
 
 		 870 aa  65.5  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.787998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11670  DNA mismatch repair protein MutS  27.69 
 
 		 896 aa  65.1  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.199521  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1760  DNA mismatch repair protein MutS  24.52 
 
 		 870 aa  65.5  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1033  DNA mismatch repair protein MutS  26.21 
 
 		 872 aa  64.7  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.256802  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3118  DNA mismatch repair protein MutS  26.81 
 
 		 856 aa  65.1  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0008  DNA mismatch repair protein MutS  29.63 
 
 		 904 aa  65.1  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1599  DNA mismatch repair protein MutS  26.76 
 
 		 875 aa  65.1  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4649  DNA mismatch repair protein MutS  29.3 
 
 		 916 aa  64.3  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.427089 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1186  DNA mismatch repair protein MutS  27.14 
 
 		 884 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296401 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2380  DNA mismatch repair protein MutS  29.41 
 
 		 893 aa  64.7  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1263  DNA mismatch repair protein MutS  29.75 
 
 		 919 aa  64.7  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0902404 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4282  DNA mismatch repair protein MutS  29.01 
 
 		 916 aa  64.7  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>