More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2772 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_2772  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  100 
 
 
507 aa  1033    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0734  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  51.58 
 
 
516 aa  495  1e-139  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.013522  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1785  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  46.38 
 
 
505 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0257213  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1828  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  46.38 
 
 
505 aa  451  1e-125  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.338904  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2646  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  45.05 
 
 
524 aa  407  1.0000000000000001e-112  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.264695  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1246  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  26.65 
 
 
551 aa  143  7e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2773  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  32.88 
 
 
500 aa  111  3e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.643007  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2645  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  29.08 
 
 
508 aa  105  3e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.260435  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1786  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  26.6 
 
 
501 aa  103  7e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00151585  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1829  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  26.6 
 
 
501 aa  103  9e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.181127  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0735  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  30 
 
 
496 aa  93.2  9e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.19078  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0964  DNA mismatch repair protein MutS  30.07 
 
 
854 aa  91.3  4e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0854968  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1585  DNA mismatch repair protein MutS-like  29.36 
 
 
547 aa  88.6  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3142  DNA mismatch repair protein MutS  30.62 
 
 
852 aa  88.2  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1202  DNA mismatch repair protein MutS  27.37 
 
 
860 aa  87.4  5e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000170445  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2957  DNA mismatch repair protein MutS  29.79 
 
 
854 aa  87.8  5e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1437  DNA mismatch repair protein MutS  30.88 
 
 
870 aa  87  7e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.787998  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1760  DNA mismatch repair protein MutS  30.88 
 
 
870 aa  87  7e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1125  DNA mismatch repair protein MutS  28.19 
 
 
861 aa  87  7e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3337  DNA mismatch repair protein MutS  29.79 
 
 
854 aa  86.7  9e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_52173  muts-like protein 5  34.06 
 
 
376 aa  86.3  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4137  DNA mismatch repair protein MutS  29.08 
 
 
872 aa  86.3  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.757749  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3431  DNA mismatch repair protein MutS  28.19 
 
 
856 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1256  DNA mismatch repair protein MutS  31.16 
 
 
887 aa  86.3  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.280018  hitchhiker  0.00178613 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1104  MutS2 family protein  31.61 
 
 
750 aa  86.3  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2791  DNA mismatch repair protein MutS  32.94 
 
 
864 aa  86.7  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.494407 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2748  DNA mismatch repair protein MutS  27.85 
 
 
856 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2282  DNA mismatch repair protein MutS-like  34.03 
 
 
547 aa  85.5  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3127  DNA mismatch repair protein MutS  27.52 
 
 
856 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.407005  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1124  DNA mismatch repair protein MutS  28.19 
 
 
861 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2347  DNA mismatch repair protein MutS  27.43 
 
 
860 aa  85.1  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.836402  normal  0.482784 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1194  DNA mismatch repair protein MutS  26.69 
 
 
859 aa  85.1  0.000000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0956  DNA mismatch repair protein MutS  30.23 
 
 
851 aa  85.1  0.000000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0974  DNA mismatch repair protein  29.76 
 
 
859 aa  85.1  0.000000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0632  DNA mismatch repair protein MutS  29.45 
 
 
855 aa  84.7  0.000000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0530533  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1246  DNA mismatch repair protein MutS  27.52 
 
 
856 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000000830859 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1594  DNA mismatch repair protein MutS  28.47 
 
 
871 aa  84.3  0.000000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0845017  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3292  DNA mismatch repair protein MutS  30.43 
 
 
851 aa  84.7  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2095  DNA mismatch repair protein MutS  27.84 
 
 
903 aa  84.3  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3424  DNA mismatch repair protein MutS  30.04 
 
 
851 aa  84  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3270  DNA mismatch repair protein MutS  27.18 
 
 
856 aa  84  0.000000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.820026  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0621  DNA mismatch repair protein MutS  29.92 
 
 
859 aa  83.6  0.000000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.947929  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3118  DNA mismatch repair protein MutS  27.52 
 
 
856 aa  84  0.000000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03515  DNA mismatch repair protein MutS  29.45 
 
 
853 aa  83.2  0.000000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1195  DNA mismatch repair protein MutS  27.85 
 
 
861 aa  83.2  0.000000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0833  DNA mismatch repair protein MutS  30 
 
 
851 aa  83.6  0.000000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0278286 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3734  DNA mismatch repair protein MutS  31.9 
 
 
883 aa  83.2  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648477  decreased coverage  0.000000000582755 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2761  DNA mismatch repair protein MutS  32.09 
 
 
904 aa  83.2  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.572948  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3218  DNA mismatch repair protein MutS  29 
 
 
855 aa  82  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.864156  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1033  DNA mismatch repair protein MutS  27.65 
 
 
872 aa  82  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.256802  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002517  DNA mismatch repair protein MutS  27.31 
 
 
853 aa  82.4  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.919799  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0063  DNA mismatch repair protein MutS  29.45 
 
 
862 aa  82.4  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0342  MutS family DNA mismatch repair protein  32.12 
 
 
536 aa  81.6  0.00000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3059  DNA mismatch repair protein MutS  29 
 
 
855 aa  81.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.725135 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3098  DNA mismatch repair protein MutS  29 
 
 
855 aa  81.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.603568  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3030  DNA mismatch repair protein MutS  29 
 
 
855 aa  81.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3293  DNA mismatch repair protein MutS  30.93 
 
 
858 aa  81.6  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0310827  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3114  DNA mismatch repair protein MutS  29 
 
 
855 aa  81.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0090493 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1359  DNA mismatch repair protein MutS  29.59 
 
 
870 aa  81.3  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.219365  normal  0.0149931 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1832  DNA mismatch repair protein MutS  29.85 
 
 
882 aa  81.3  0.00000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3337  DNA mismatch repair protein MutS  30.81 
 
 
864 aa  81.3  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1015  DNA mismatch repair protein MutS  25.86 
 
 
793 aa  81.3  0.00000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1166  MutS2 family protein  31.32 
 
 
761 aa  80.9  0.00000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.690197  normal  0.0205926 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1900  DNA mismatch repair protein MutS  28.23 
 
 
868 aa  80.9  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.419193  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3211  DNA mismatch repair protein MutS  29 
 
 
853 aa  80.9  0.00000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.864311  normal  0.594165 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3768  DNA mismatch repair protein MutS  29.38 
 
 
968 aa  80.9  0.00000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0993  DNA mismatch repair protein MutS  34.03 
 
 
882 aa  80.5  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0273389  normal  0.417331 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1159  DNA mismatch repair protein MutS  30.39 
 
 
850 aa  80.5  0.00000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0179722  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0837  DNA mismatch repair protein MutS  28.63 
 
 
878 aa  80.1  0.00000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.624644  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1089  DNA mismatch repair protein MutS  34.03 
 
 
882 aa  80.1  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4552  DNA mismatch repair protein MutS  32.35 
 
 
871 aa  80.1  0.00000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1075  DNA mismatch repair protein MutS  32.49 
 
 
916 aa  80.1  0.00000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.835373  normal  0.410772 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1332  DNA mismatch repair protein MutS  35.4 
 
 
930 aa  79.7  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1599  DNA mismatch repair protein MutS  26.79 
 
 
875 aa  80.1  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1486  DNA mismatch repair protein MutS  30.71 
 
 
867 aa  79.7  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.387316  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1896  DNA mismatch repair protein MutS  28.96 
 
 
872 aa  79.3  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0824451  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0621  DNA mismatch repair protein MutS  35.16 
 
 
905 aa  79.3  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.720679  normal  0.722964 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1883  DNA mismatch repair protein MutS  26.69 
 
 
858 aa  79  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.245146  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0553  DNA mismatch repair protein MutS  29.91 
 
 
882 aa  79  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2274  DNA mismatch repair protein MutS  27.86 
 
 
911 aa  78.2  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.103313 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1496  DNA mismatch repair protein MutS  31.79 
 
 
869 aa  78.6  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.241092  hitchhiker  0.0000395311 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1542  DNA mismatch repair protein MutS  26.14 
 
 
898 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.883963  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3383  DNA mismatch repair protein MutS  24.92 
 
 
856 aa  78.2  0.0000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.130934  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38640  DNA mismatch repair protein MutS  29.39 
 
 
855 aa  78.2  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.477357  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01479  DNA-binding protein of the mitochondria (Eurofung)  34.64 
 
 
924 aa  77.8  0.0000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1181  DNA mismatch repair protein MutS  30.81 
 
 
927 aa  77.8  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3341  DNA mismatch repair protein MutS  28.01 
 
 
858 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.285192  unclonable  0.0000000411572 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0614  DNA mismatch repair protein MutS  28.47 
 
 
907 aa  77.8  0.0000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1709  DNA mismatch repair protein MutS  25.85 
 
 
871 aa  77.8  0.0000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1381  DNA mismatch repair protein MutS  27.82 
 
 
862 aa  77.8  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1115  DNA mismatch repair protein MutS  25.17 
 
 
793 aa  78.2  0.0000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1657  DNA mismatch repair protein MutS  35.06 
 
 
868 aa  77.8  0.0000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0913  DNA mismatch repair protein MutS  30.97 
 
 
882 aa  77.4  0.0000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1769  DNA mismatch repair protein MutS  30.67 
 
 
846 aa  77  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1299  DNA mismatch repair protein MutS  27.04 
 
 
859 aa  77.4  0.0000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.537227  hitchhiker  0.00000000408163 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03081  DNA mismatch repair protein(MutS)  26.78 
 
 
863 aa  77  0.0000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0525  DNA mismatch repair protein MutS  29.39 
 
 
881 aa  77  0.0000000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.751671  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1076  DNA mismatch repair protein MutS  31.61 
 
 
884 aa  76.6  0.0000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1317  DNA mismatch repair protein MutS  28.76 
 
 
873 aa  76.3  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0784135  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1500  DNA mismatch repair protein MutS  29.49 
 
 
863 aa  76.3  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>