More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0734 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_0734  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  100 
 
 		 516 aa  1031    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.013522  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2772  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  51.58 
 
 		 507 aa  495  1e-139  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1785  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  45.29 
 
 		 505 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0257213  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1828  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  45.1 
 
 		 505 aa  444  1e-123  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.338904  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2646  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  44.51 
 
 		 524 aa  397  1e-109  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.264695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1246  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  33.46 
 
 		 551 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1786  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  26.35 
 
 		 501 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00151585  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1829  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  26.35 
 
 		 501 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.181127  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2773  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  38.24 
 
 		 500 aa  129  2.0000000000000002e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.643007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2645  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  37.11 
 
 		 508 aa  112  1.0000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.260435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0735  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  38.65 
 
 		 496 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.19078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2282  DNA mismatch repair protein MutS-like  31.2 
 
 		 547 aa  86.7  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1697  DNA mismatch repair protein MutS  28.89 
 
 		 873 aa  85.9  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.189946  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1181  DNA mismatch repair protein MutS  31.98 
 
 		 927 aa  84  0.000000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1033  DNA mismatch repair protein MutS  28.38 
 
 		 872 aa  84  0.000000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.256802  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0081  DNA mismatch repair protein MutS  29.71 
 
 		 905 aa  83.2  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.294772  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1256  DNA mismatch repair protein MutS  27.93 
 
 		 887 aa  82.4  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.280018  hitchhiker  0.00178613 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2347  DNA mismatch repair protein MutS  28.05 
 
 		 860 aa  81.6  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.836402  normal  0.482784 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1134  DNA mismatch repair protein MutS  32.46 
 
 		 860 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2761  DNA mismatch repair protein MutS  32.64 
 
 		 904 aa  81.6  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.572948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0913  DNA mismatch repair protein MutS  32.26 
 
 		 882 aa  80.9  0.00000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38640  DNA mismatch repair protein MutS  34.81 
 
 		 855 aa  80.1  0.00000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.477357  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1626  DNA mismatch repair protein MutS  35.56 
 
 		 857 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.262432  normal  0.25405 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0964  DNA mismatch repair protein MutS  28.38 
 
 		 854 aa  79  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0854968  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0553  DNA mismatch repair protein MutS  33.51 
 
 		 882 aa  78.6  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1976  DNA mismatch repair protein MutS  30.87 
 
 		 904 aa  79.3  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0020973  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2247  DNA mismatch repair protein MutS  28.94 
 
 		 882 aa  79.3  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0873729  normal  0.14084 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4152  DNA mismatch repair protein MutS  35.56 
 
 		 857 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.121513 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1166  MutS2 family protein  32.8 
 
 		 761 aa  79  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.690197  normal  0.0205926 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1485  DNA mismatch repair protein MutS  38.74 
 
 		 878 aa  79  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1104  MutS2 family protein  31.12 
 
 		 750 aa  79  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1179  DNA mismatch repair protein MutS  35.56 
 
 		 880 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809456 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0299  DNA mismatch repair protein MutS  31.22 
 
 		 873 aa  78.2  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.391446  normal  0.153174 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3768  DNA mismatch repair protein MutS  29.21 
 
 		 968 aa  78.6  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4050  DNA mismatch repair protein MutS  34.81 
 
 		 857 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.593835  hitchhiker  0.000000000609956 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1077  DNA mismatch repair protein MutS  21.46 
 
 		 853 aa  78.6  0.0000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1925  DNA mismatch repair protein MutS  24.52 
 
 		 865 aa  78.2  0.0000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2791  DNA mismatch repair protein MutS  35.71 
 
 		 864 aa  77.8  0.0000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.494407 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1896  DNA mismatch repair protein MutS  27.19 
 
 		 872 aa  78.2  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0824451  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3186  DNA mismatch repair protein MutS  28.42 
 
 		 854 aa  77  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0251089 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0837  DNA mismatch repair protein MutS  27.51 
 
 		 878 aa  77  0.0000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.624644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_52173  muts-like protein 5  31.51 
 
 		 376 aa  77  0.0000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1594  DNA mismatch repair protein MutS  29.57 
 
 		 871 aa  76.6  0.0000000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0845017  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3337  DNA mismatch repair protein MutS  27.95 
 
 		 854 aa  76.6  0.0000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2386  DNA mismatch repair protein MutS  29.28 
 
 		 872 aa  76.6  0.0000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.143678  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0412  DNA mismatch repair protein MutS  27.78 
 
 		 857 aa  76.6  0.0000000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2515  DNA mismatch repair protein MutS  35.07 
 
 		 885 aa  76.6  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0632  DNA mismatch repair protein MutS  26.34 
 
 		 855 aa  76.3  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0530533  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0342  MutS family DNA mismatch repair protein  33.95 
 
 		 536 aa  76.6  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1376  DNA mismatch repair protein MutS  34.81 
 
 		 859 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1519  DNA mismatch repair protein MutS  28.35 
 
 		 854 aa  75.9  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00861946  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2957  DNA mismatch repair protein MutS  29.9 
 
 		 854 aa  75.5  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0335  DNA mismatch repair protein MutS  28.19 
 
 		 815 aa  75.9  0.000000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.213975  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2381  DNA mismatch repair protein MutS  27.22 
 
 		 932 aa  75.9  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03515  DNA mismatch repair protein MutS  26.79 
 
 		 853 aa  75.5  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4058  DNA mismatch repair protein MutS  34.07 
 
 		 855 aa  75.1  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.374775  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1832  DNA mismatch repair protein MutS  29.8 
 
 		 882 aa  74.7  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1299  DNA mismatch repair protein MutS  25.29 
 
 		 914 aa  74.3  0.000000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.141225  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1437  DNA mismatch repair protein MutS  27.47 
 
 		 905 aa  74.7  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.402439  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2495  DNA mismatch repair protein MutS  25.36 
 
 		 869 aa  74.7  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1113  DNA mismatch repair protein MutS  32.65 
 
 		 863 aa  74.7  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000302948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1332  DNA mismatch repair protein MutS  31.25 
 
 		 930 aa  74.3  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2842  DNA mismatch repair protein MutS  31.54 
 
 		 870 aa  74.7  0.000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.147304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0833  DNA mismatch repair protein MutS  28.65 
 
 		 851 aa  74.7  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0278286 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1500  DNA mismatch repair protein MutS  27.64 
 
 		 863 aa  74.3  0.000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002517  DNA mismatch repair protein MutS  26.79 
 
 		 853 aa  74.3  0.000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.919799  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0078  DNA mismatch repair protein MutS  31.21 
 
 		 903 aa  74.3  0.000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.167909  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0119  DNA mismatch repair protein MutS  32.28 
 
 		 931 aa  74.3  0.000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.893903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2380  DNA mismatch repair protein MutS  31.36 
 
 		 893 aa  73.9  0.000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1486  DNA mismatch repair protein MutS  29.9 
 
 		 867 aa  74.3  0.000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.387316  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3142  DNA mismatch repair protein MutS  29.38 
 
 		 852 aa  73.9  0.000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0355  DNA mismatch repair protein MutS  33.1 
 
 		 910 aa  73.9  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0171458 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1519  DNA mismatch repair protein MutS  37.84 
 
 		 855 aa  73.9  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0159  DNA mismatch repair protein MutS  28.45 
 
 		 910 aa  73.9  0.000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1194  DNA mismatch repair protein MutS  27.23 
 
 		 859 aa  73.9  0.000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3815  DNA mismatch repair protein MutS  29.08 
 
 		 907 aa  73.9  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.548974 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0363  DNA mismatch repair protein MutS  28.36 
 
 		 882 aa  73.9  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17500  DNA mismatch repair protein MutS  37.84 
 
 		 855 aa  73.6  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1115  DNA mismatch repair protein MutS  27.17 
 
 		 793 aa  73.6  0.000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4137  DNA mismatch repair protein MutS  28.72 
 
 		 872 aa  73.2  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.757749  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0147  DNA mismatch repair protein MutS  29.29 
 
 		 910 aa  73.2  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1002  DNA mismatch repair protein  28.89 
 
 		 858 aa  72.8  0.00000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3734  DNA mismatch repair protein MutS  30.87 
 
 		 883 aa  72.8  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648477  decreased coverage  0.000000000582755 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1585  DNA mismatch repair protein MutS-like  35.71 
 
 		 547 aa  73.2  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1913  DNA mismatch repair protein MutS  35 
 
 		 893 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.396246  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0834  DNA mismatch repair protein MutS  26.58 
 
 		 884 aa  73.2  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.63588 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0978  DNA mismatch repair protein MutS  26.58 
 
 		 884 aa  73.2  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3218  DNA mismatch repair protein MutS  27.6 
 
 		 855 aa  72.8  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.864156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1709  DNA mismatch repair protein MutS  27.17 
 
 		 871 aa  73.2  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0621  DNA mismatch repair protein MutS  29.41 
 
 		 859 aa  72.8  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.947929  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4282  DNA mismatch repair protein MutS  34.62 
 
 		 916 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0956  DNA mismatch repair protein MutS  26.75 
 
 		 851 aa  73.2  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3021  DNA mismatch repair protein MutS  36.77 
 
 		 897 aa  72.8  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1015  DNA mismatch repair protein MutS  27.17 
 
 		 793 aa  72.8  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1181  DNA mismatch repair protein MutS  30.46 
 
 		 886 aa  72.4  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.690734 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3431  DNA mismatch repair protein MutS  29.38 
 
 		 856 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1159  DNA mismatch repair protein MutS  30.13 
 
 		 850 aa  72.8  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0179722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4649  DNA mismatch repair protein MutS  33.12 
 
 		 916 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.427089 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1207  DNA mismatch repair protein MutS  32.17 
 
 		 862 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2734  DNA mismatch repair protein MutS  25.63 
 
 		 888 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>