More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1785 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1828  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  99.6 
 
 		 505 aa  1029    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.338904  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1785  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  100 
 
 		 505 aa  1034    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0257213  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2772  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  46.38 
 
 		 507 aa  452  1.0000000000000001e-126  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0734  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  45.29 
 
 		 516 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.013522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2646  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  42.39 
 
 		 524 aa  386  1e-106  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.264695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1246  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  26.13 
 
 		 551 aa  147  3e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2773  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  30.47 
 
 		 500 aa  113  7.000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.643007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1786  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  25.11 
 
 		 501 aa  101  3e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00151585  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1829  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  25.11 
 
 		 501 aa  101  3e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.181127  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2645  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  31.34 
 
 		 508 aa  93.2  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.260435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0735  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  27.24 
 
 		 496 aa  91.7  3e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.19078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0008  DNA mismatch repair protein MutS  28.14 
 
 		 848 aa  89  2e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1115  DNA mismatch repair protein MutS  26.98 
 
 		 793 aa  88.6  3e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1181  DNA mismatch repair protein MutS  28.82 
 
 		 886 aa  87.8  4e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.690734 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1015  DNA mismatch repair protein MutS  26.98 
 
 		 793 aa  88.2  4e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1697  DNA mismatch repair protein MutS  28.38 
 
 		 873 aa  87.4  5e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.189946  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2761  DNA mismatch repair protein MutS  29.1 
 
 		 904 aa  87.4  5e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.572948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1486  DNA mismatch repair protein MutS  27.78 
 
 		 867 aa  87.4  5e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.387316  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1104  MutS2 family protein  27.64 
 
 		 750 aa  87.8  5e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2743  DNA mismatch repair protein MutS  27.24 
 
 		 868 aa  86.7  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1166  MutS2 family protein  26.6 
 
 		 761 aa  85.1  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.690197  normal  0.0205926 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0299  DNA mismatch repair protein MutS  26.85 
 
 		 873 aa  85.1  0.000000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.391446  normal  0.153174 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0974  DNA mismatch repair protein  27.39 
 
 		 859 aa  84.7  0.000000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1332  DNA mismatch repair protein MutS  28.57 
 
 		 930 aa  83.6  0.000000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1356  MutS2 family protein  28.4 
 
 		 794 aa  83.6  0.000000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1496  DNA mismatch repair protein MutS  27.13 
 
 		 869 aa  83.2  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.241092  hitchhiker  0.0000395311 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1737  DNA mismatch repair protein MutS  26.04 
 
 		 913 aa  82.4  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0169322  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2791  DNA mismatch repair protein MutS  29.79 
 
 		 864 aa  82.4  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.494407 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  26.03 
 
 		 870 aa  82.4  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4078  DNA mismatch repair protein MutS  29.08 
 
 		 928 aa  80.9  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.980246  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0273  DNA mismatch repair protein MutS  26.13 
 
 		 1040 aa  80.9  0.00000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.601662 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1611  DNA mismatch repair protein MutS  26.6 
 
 		 867 aa  80.5  0.00000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.749504  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18351  DNA mismatch repair protein MutS  26.42 
 
 		 913 aa  80.1  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4891  MutS2 family protein  27.78 
 
 		 806 aa  79.3  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1181  DNA mismatch repair protein MutS  24.79 
 
 		 927 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_52173  muts-like protein 5  33.33 
 
 		 376 aa  79.3  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1896  DNA mismatch repair protein MutS  26.73 
 
 		 872 aa  79.7  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0824451  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2842  DNA mismatch repair protein MutS  27.27 
 
 		 870 aa  79  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.147304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2798  MutS2 family protein  26.29 
 
 		 783 aa  79  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0247  DNA mismatch repair protein MutS  26.15 
 
 		 1058 aa  79.3  0.0000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2347  DNA mismatch repair protein MutS  24 
 
 		 860 aa  79  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.836402  normal  0.482784 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1433  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  25.51 
 
 		 648 aa  79  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00229473  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1412  MutS2 family protein  26.53 
 
 		 783 aa  79  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.29197e-17 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1113  DNA mismatch repair protein MutS  27.03 
 
 		 863 aa  78.6  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000302948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0653  DNA mismatch repair protein MutS  25.55 
 
 		 881 aa  78.6  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2381  DNA mismatch repair protein MutS  26.24 
 
 		 932 aa  78.2  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18351  DNA mismatch repair protein MutS  25.52 
 
 		 914 aa  78.2  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1001  DNA mismatch repair protein MutS  28.34 
 
 		 819 aa  78.2  0.0000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.280502  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1250  DNA mismatch repair protein MutS  26.6 
 
 		 823 aa  78.2  0.0000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.297858  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA07480  DNA mismatch repair protein MSH2, putative  33.33 
 
 		 965 aa  78.2  0.0000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.271772  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2935  MutS2 family protein  26.92 
 
 		 788 aa  77.8  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0999  Smr protein/MutS2  27.84 
 
 		 769 aa  77.8  0.0000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1031  DNA mismatch repair protein MutS  29.41 
 
 		 851 aa  77.8  0.0000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18541  DNA mismatch repair protein MutS  25.52 
 
 		 913 aa  77.4  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1004  DNA mismatch repair protein MutS  26.63 
 
 		 817 aa  77.8  0.0000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0919  DNA mismatch repair protein MutS  25.11 
 
 		 863 aa  77.8  0.0000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2974  MutS 2 protein  27.22 
 
 		 785 aa  77.8  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1033  DNA mismatch repair protein MutS  27.52 
 
 		 872 aa  77.4  0.0000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.256802  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1077  DNA mismatch repair protein MutS  28.04 
 
 		 853 aa  76.3  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1542  DNA mismatch repair protein MutS  23.68 
 
 		 898 aa  76.6  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.883963  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1887  DNA mismatch repair protein MutS  26.9 
 
 		 868 aa  76.6  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00463381  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0081  DNA mismatch repair protein MutS  25.35 
 
 		 905 aa  75.9  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.294772  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1256  DNA mismatch repair protein MutS  25.71 
 
 		 887 aa  76.3  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.280018  hitchhiker  0.00178613 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1466  DNA mismatch repair protein MutS  26.29 
 
 		 872 aa  76.3  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59113  predicted protein  25.39 
 
 		 910 aa  76.3  0.000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3224  DNA mismatch repair protein MutS  26.46 
 
 		 895 aa  75.5  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1689  Smr protein/MutS2  25.81 
 
 		 793 aa  75.5  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.123598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2782  MutS2 family protein  25.93 
 
 		 785 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.798995  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2052  DNA mismatch repair protein MutS  26.43 
 
 		 890 aa  75.5  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.292542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2282  DNA mismatch repair protein MutS-like  24.58 
 
 		 547 aa  75.5  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1002  DNA mismatch repair protein  26.83 
 
 		 858 aa  75.5  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1809  MutS family DNA structure-specific ATPase  25.1 
 
 		 776 aa  75.9  0.000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.284001  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0412  DNA mismatch repair protein MutS  25.13 
 
 		 857 aa  75.5  0.000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1202  DNA mismatch repair protein MutS  25.6 
 
 		 860 aa  75.5  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000170445  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1029  DNA mismatch repair protein MutS  27.64 
 
 		 858 aa  75.1  0.000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0324603  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3431  DNA mismatch repair protein MutS  23.66 
 
 		 856 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1159  DNA mismatch repair protein MutS  26.58 
 
 		 850 aa  74.7  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0179722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3270  DNA mismatch repair protein MutS  24.11 
 
 		 856 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.820026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0538  MutS2 family protein  26.26 
 
 		 791 aa  74.7  0.000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00387352  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4057  DNA mismatch repair protein MutS  27.85 
 
 		 891 aa  74.7  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.101447  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2274  DNA mismatch repair protein MutS  25.45 
 
 		 911 aa  74.7  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.103313 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10621  DNA mismatch repair protein Msh2, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G09850)  30.41 
 
 		 945 aa  74.7  0.000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0553  DNA mismatch repair protein MutS  26.07 
 
 		 882 aa  74.7  0.000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0913  DNA mismatch repair protein MutS  24.57 
 
 		 882 aa  74.7  0.000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2247  DNA mismatch repair protein MutS  25.76 
 
 		 882 aa  74.7  0.000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0873729  normal  0.14084 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0335  DNA mismatch repair protein MutS  24.49 
 
 		 815 aa  74.7  0.000000000004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.213975  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1218  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  24.08 
 
 		 654 aa  74.7  0.000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.215011  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0837  DNA mismatch repair protein MutS  27.66 
 
 		 878 aa  74.7  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.624644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1599  DNA mismatch repair protein MutS  29.03 
 
 		 875 aa  74.3  0.000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2284  DNA mismatch repair protein MutS  31.43 
 
 		 897 aa  74.3  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.339354  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2519  DNA mismatch repair protein MutS  26.26 
 
 		 840 aa  74.3  0.000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.521925  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0174  DNA mismatch repair protein MutS  30.14 
 
 		 820 aa  74.3  0.000000000005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0632  DNA mismatch repair protein MutS  23.63 
 
 		 855 aa  74.3  0.000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0530533  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3751  DNA mismatch repair protein MutS  27.9 
 
 		 855 aa  74.3  0.000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1284  DNA mismatch repair protein MutS  26.84 
 
 		 896 aa  74.3  0.000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3118  DNA mismatch repair protein MutS  23.66 
 
 		 856 aa  74.3  0.000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1339  DNA mismatch repair protein MutS  27.04 
 
 		 896 aa  74.3  0.000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.742998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4031  DNA mismatch repair protein MutS  24.92 
 
 		 881 aa  74.3  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.137829  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1171  DNA mismatch repair protein MutS  22.62 
 
 		 910 aa  74.3  0.000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1477  DNA mismatch repair protein MutS  26.46 
 
 		 857 aa  74.3  0.000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.480331  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>