More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0735 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_0735  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  100 
 
 		 496 aa  1002    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.19078  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2773  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  50.3 
 
 		 500 aa  466  9.999999999999999e-131  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.643007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1786  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  45.2 
 
 		 501 aa  434  1e-120  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00151585  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1829  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  45.2 
 
 		 501 aa  433  1e-120  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.181127  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2645  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  45.69 
 
 		 508 aa  395  1e-108  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.260435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1246  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  27.48 
 
 		 551 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0734  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  38.65 
 
 		 516 aa  111  3e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.013522  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2772  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  25.8 
 
 		 507 aa  97.1  6e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2646  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  32.59 
 
 		 524 aa  95.1  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.264695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1785  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  22.51 
 
 		 505 aa  94  6e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0257213  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1828  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  22.51 
 
 		 505 aa  94  6e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.338904  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3768  DNA mismatch repair protein MutS  34.68 
 
 		 968 aa  91.7  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1585  DNA mismatch repair protein MutS-like  30.43 
 
 		 547 aa  87  7e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3531  DNA mismatch repair protein MutS  31.53 
 
 		 1088 aa  86.3  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1537  DNA mismatch repair protein MutS  33.33 
 
 		 880 aa  83.6  0.000000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3734  DNA mismatch repair protein MutS  28.63 
 
 		 883 aa  83.2  0.000000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648477  decreased coverage  0.000000000582755 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18351  DNA mismatch repair protein MutS  23.75 
 
 		 913 aa  83.2  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18541  DNA mismatch repair protein MutS  24.92 
 
 		 913 aa  82  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0342  MutS family DNA mismatch repair protein  30.39 
 
 		 536 aa  82.4  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3706  DNA mismatch repair protein MutS  31.98 
 
 		 1085 aa  82  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0191943 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0842  DNA mismatch repair protein MutS  27.94 
 
 		 860 aa  81.6  0.00000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.899937  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1115  DNA mismatch repair protein MutS  34.44 
 
 		 793 aa  80.9  0.00000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3541  DNA mismatch repair protein MutS  31.56 
 
 		 929 aa  81.3  0.00000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0095  DNA mismatch repair protein MutS  28.81 
 
 		 891 aa  80.9  0.00000000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0480084 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34085  predicted protein  31.21 
 
 		 1007 aa  80.1  0.00000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.297969  normal  0.623648 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1166  MutS2 family protein  30.65 
 
 		 761 aa  79.3  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.690197  normal  0.0205926 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1015  DNA mismatch repair protein MutS  33.77 
 
 		 793 aa  79.3  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1358  DNA mismatch repair protein MutS  27.68 
 
 		 910 aa  79.3  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.476923  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1171  DNA mismatch repair protein MutS  27.68 
 
 		 910 aa  79.3  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0081  DNA mismatch repair protein MutS  30.84 
 
 		 905 aa  78.6  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.294772  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18351  DNA mismatch repair protein MutS  24.41 
 
 		 914 aa  79  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1332  DNA mismatch repair protein MutS  28.29 
 
 		 930 aa  78.2  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1599  DNA mismatch repair protein MutS  30.37 
 
 		 875 aa  78.2  0.0000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0913  DNA mismatch repair protein MutS  32.97 
 
 		 882 aa  77.4  0.0000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1145  DNA mismatch repair protein MutS  30.21 
 
 		 872 aa  77  0.0000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2226  DNA mismatch repair protein MutS  34.71 
 
 		 956 aa  77  0.0000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.137389  normal  0.561287 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2983  DNA mismatch repair protein MutS  25.41 
 
 		 864 aa  77  0.0000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.773158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2655  DNA mismatch repair protein MutS  31.65 
 
 		 876 aa  76.6  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.607224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1711  MutS2 family protein  26.45 
 
 		 801 aa  76.6  0.0000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000187694  normal  0.426303 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1737  DNA mismatch repair protein MutS  23.08 
 
 		 913 aa  76.6  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0169322  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1887  DNA mismatch repair protein MutS  33.93 
 
 		 868 aa  76.6  0.0000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00463381  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  35.25 
 
 		 871 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0516  DNA mismatch repair protein MutS  26.24 
 
 		 886 aa  76.3  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.544146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1896  DNA mismatch repair protein MutS  30.65 
 
 		 872 aa  76.6  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0824451  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1723  DNA mismatch repair protein MutS  29.66 
 
 		 855 aa  75.5  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1495  DNA mismatch repair protein MutS  28.72 
 
 		 900 aa  75.5  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0078  DNA mismatch repair protein MutS  35.66 
 
 		 903 aa  75.5  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.167909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1104  MutS2 family protein  29.21 
 
 		 750 aa  75.9  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1760  DNA mismatch repair protein MutS  31.22 
 
 		 870 aa  75.1  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1437  DNA mismatch repair protein MutS  31.22 
 
 		 870 aa  75.1  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.787998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1033  DNA mismatch repair protein MutS  29.65 
 
 		 872 aa  74.7  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.256802  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0412  DNA mismatch repair protein MutS  26.57 
 
 		 857 aa  75.1  0.000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0458  DNA mismatch repair protein MutS  33.59 
 
 		 865 aa  74.7  0.000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.143165  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1704  DNA mismatch repair protein MutS  27.46 
 
 		 887 aa  74.3  0.000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.470624  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2125  DNA mismatch repair protein MutS  33.33 
 
 		 897 aa  74.7  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0565829  normal  0.043993 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38640  DNA mismatch repair protein MutS  30.91 
 
 		 855 aa  74.3  0.000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.477357  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1542  DNA mismatch repair protein MutS  27.19 
 
 		 898 aa  73.6  0.000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.883963  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0247  DNA mismatch repair protein MutS  33.8 
 
 		 1058 aa  73.6  0.000000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  32.47 
 
 		 872 aa  73.6  0.000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1179  DNA mismatch repair protein MutS  30.72 
 
 		 880 aa  73.6  0.000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809456 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4152  DNA mismatch repair protein MutS  31.52 
 
 		 857 aa  73.6  0.000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.121513 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1134  DNA mismatch repair protein MutS  30.98 
 
 		 860 aa  73.6  0.000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2326  DNA mismatch repair protein MutS  32.22 
 
 		 925 aa  73.6  0.000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.160487 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0974  DNA mismatch repair protein  32.37 
 
 		 859 aa  73.2  0.000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0035  DNA mismatch repair protein MutS  34.93 
 
 		 921 aa  72.8  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.892203 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4058  DNA mismatch repair protein MutS  26.74 
 
 		 855 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.374775  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1437  DNA mismatch repair protein MutS  29.72 
 
 		 905 aa  73.2  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.402439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2842  DNA mismatch repair protein MutS  33.52 
 
 		 870 aa  72.8  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.147304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1064  DNA mismatch repair protein MutS  25.93 
 
 		 870 aa  73.2  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  28.35 
 
 		 870 aa  72  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1626  DNA mismatch repair protein MutS  30.72 
 
 		 857 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.262432  normal  0.25405 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2101  DNA mismatch repair protein MutS  27.78 
 
 		 858 aa  72  0.00000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1376  DNA mismatch repair protein MutS  30.72 
 
 		 859 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2282  DNA mismatch repair protein MutS-like  29.44 
 
 		 547 aa  72.4  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0553  DNA mismatch repair protein MutS  32.86 
 
 		 882 aa  72.4  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1519  DNA mismatch repair protein MutS  35.46 
 
 		 855 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11670  DNA mismatch repair protein MutS  29.86 
 
 		 896 aa  71.6  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.199521  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0837  DNA mismatch repair protein MutS  33.33 
 
 		 878 aa  71.6  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.624644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4050  DNA mismatch repair protein MutS  30.12 
 
 		 857 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.593835  hitchhiker  0.000000000609956 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17500  DNA mismatch repair protein MutS  35.46 
 
 		 855 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0730  DNA mismatch repair protein MutS  28.64 
 
 		 889 aa  71.6  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1216  DNA mismatch repair protein MutS  30.34 
 
 		 903 aa  71.2  0.00000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0405457 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1381  DNA mismatch repair protein MutS  32.14 
 
 		 862 aa  71.2  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1373  MutS2 family protein  26.59 
 
 		 784 aa  71.2  0.00000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1709  DNA mismatch repair protein MutS  32.37 
 
 		 871 aa  71.2  0.00000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1576  DNA mismatch repair protein MutS  31.54 
 
 		 854 aa  71.2  0.00000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1001  DNA mismatch repair protein MutS  26.57 
 
 		 819 aa  71.2  0.00000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.280502  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4078  DNA mismatch repair protein MutS  32.89 
 
 		 928 aa  70.9  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.980246  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0260  DNA mismatch repair protein MutS  29.34 
 
 		 804 aa  70.9  0.00000000005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.76262  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1950  DNA mismatch repair protein MutS  26.77 
 
 		 872 aa  70.9  0.00000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.998424  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0299  DNA mismatch repair protein MutS  29.51 
 
 		 873 aa  70.5  0.00000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.391446  normal  0.153174 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05155  putative DNA mismatch repair protein MutS  27.8 
 
 		 869 aa  70.5  0.00000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1004  DNA mismatch repair protein MutS  28.19 
 
 		 817 aa  70.1  0.00000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1246  DNA mismatch repair protein MutS  29.56 
 
 		 856 aa  70.1  0.00000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000830859 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1218  DNA mismatch repair protein MutS  30.93 
 
 		 875 aa  70.1  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.318661  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1611  DNA mismatch repair protein MutS  29.09 
 
 		 867 aa  69.7  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.749504  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1151  DNA mismatch repair protein MutS  31.35 
 
 		 882 aa  69.3  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.75556  normal  0.534383 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4891  MutS2 family protein  28.81 
 
 		 806 aa  69.7  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1519  DNA mismatch repair protein MutS  32.88 
 
 		 854 aa  69.7  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00861946  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0824  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  30.11 
 
 		 792 aa  69.3  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>