More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2604 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_2604  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  100 
 
 		 665 aa  1272    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0194376  normal  0.689485 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3631  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  65.95 
 
 		 694 aa  805    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2063  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  62.85 
 
 		 739 aa  806    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1006  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  66.76 
 
 		 688 aa  798    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1024  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  65.68 
 
 		 664 aa  793    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.318391  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1044  hypothetical protein  35.4 
 
 		 719 aa  360  6e-98  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1334  DNA mismatch repair protein MutS-like protein  33.47 
 
 		 700 aa  337  3.9999999999999995e-91  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000127118  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1046  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  34.96 
 
 		 678 aa  291  3e-77  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0558977  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2660  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  34.47 
 
 		 595 aa  141  3e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2432  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  34.93 
 
 		 589 aa  130  1.0000000000000001e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00495271 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1501  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  36.44 
 
 		 618 aa  128  4.0000000000000003e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0551  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  35.34 
 
 		 583 aa  127  9e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.27881  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1162  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  31.7 
 
 		 641 aa  127  9e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.906748  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1470  MutS2 family protein  23.72 
 
 		 792 aa  88.2  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.471316  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0062  MutS2 family protein  27.17 
 
 		 826 aa  78.2  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.21825  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2390  MutS2 family protein  28.86 
 
 		 786 aa  77  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0786061  normal  0.328409 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1450  MutS2 family protein  28.07 
 
 		 818 aa  75.9  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1014  MutS2 family protein  24.69 
 
 		 793 aa  76.3  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0625051  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3655  MutS2 family protein  25.91 
 
 		 780 aa  76.6  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05680  MutS2 family protein  31.65 
 
 		 791 aa  74.7  0.000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2054  DNA mismatch repair protein MutS-like  28.48 
 
 		 771 aa  73.9  0.000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2935  MutS2 family protein  30.7 
 
 		 788 aa  73.2  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0330  DNA mismatch repair protein MutS  30.45 
 
 		 917 aa  72.4  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1457  Smr protein/MutS2  34.57 
 
 		 805 aa  72.4  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1412  MutS2 family protein  32.3 
 
 		 783 aa  70.1  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.29197e-17 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1638  MutS2 family protein  26.1 
 
 		 782 aa  67.4  0.0000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00924497  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4299  MutS2 family protein  28.04 
 
 		 812 aa  67.4  0.0000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2226  DNA mismatch repair protein MutS  31.22 
 
 		 956 aa  67  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.137389  normal  0.561287 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0545  MutS2 family protein  31.44 
 
 		 775 aa  66.2  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.807648  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2798  MutS2 family protein  30.35 
 
 		 783 aa  65.9  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1541  MutS2 family protein  29.47 
 
 		 757 aa  65.5  0.000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34085  predicted protein  29.29 
 
 		 1007 aa  65.5  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.297969  normal  0.623648 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1710  MutS2 family protein  27.61 
 
 		 820 aa  65.1  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.261707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1493  MutS2 family protein  29.47 
 
 		 757 aa  65.1  0.000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2422  DNA mismatch repair protein MutS-like  35.14 
 
 		 796 aa  65.1  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1308  MutS2 family protein  27.68 
 
 		 778 aa  64.7  0.000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2782  MutS2 family protein  28.57 
 
 		 785 aa  64.7  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.798995  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1441  Smr protein/MutS2  34.83 
 
 		 796 aa  64.3  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2632  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  25.08 
 
 		 784 aa  64.3  0.000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0176007  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0935  MutS2 family protein  33.61 
 
 		 785 aa  64.3  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1536  Smr protein/MutS2  34.83 
 
 		 796 aa  63.9  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0843088  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1642  MutS2 family protein  25 
 
 		 787 aa  63.5  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000590377  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2974  MutS 2 protein  28.14 
 
 		 785 aa  63.5  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4891  MutS2 family protein  26.17 
 
 		 806 aa  62.4  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0899  MutS2 family protein  30.6 
 
 		 789 aa  63.2  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.461302  normal  0.733658 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0299  MutS2 family protein  34.85 
 
 		 803 aa  63.2  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03749  DNA mismatch repair protein msh3 (MutS protein homolog 3) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B6T1]  27.45 
 
 		 1091 aa  62  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.642565  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0547  MutS2 family protein  27.85 
 
 		 792 aa  62  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0204  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  21.63 
 
 		 475 aa  62.4  0.00000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1225  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  24.37 
 
 		 782 aa  61.6  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0268  Smr protein/MutS2  25.62 
 
 		 805 aa  61.6  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0912246 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1203  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  24.37 
 
 		 782 aa  61.6  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0195  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  27.69 
 
 		 446 aa  61.2  0.00000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1373  MutS2 family protein  29.22 
 
 		 784 aa  61.2  0.00000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1897  MutS2 family protein  30.81 
 
 		 767 aa  60.8  0.00000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.557227  normal  0.0324553 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0824  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  27.69 
 
 		 792 aa  60.8  0.00000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0335  DNA mismatch repair protein MutS  28.72 
 
 		 815 aa  60.5  0.00000009  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.213975  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1166  MutS2 family protein  36.97 
 
 		 761 aa  60.1  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.690197  normal  0.0205926 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2046  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  25.48 
 
 		 791 aa  60.1  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2459  Smr protein/MutS2  27.19 
 
 		 765 aa  59.3  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.215696  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1083  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  24.41 
 
 		 447 aa  59.7  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1332  DNA mismatch repair protein MutS  30.14 
 
 		 930 aa  59.7  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1218  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  28.11 
 
 		 654 aa  59.3  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.215011  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1368  Smr protein/MutS2  26.9 
 
 		 771 aa  59.3  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.453399 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0209  DNA mismatch repair protein MutS  26.36 
 
 		 877 aa  58.5  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.784326 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0999  Smr protein/MutS2  24.66 
 
 		 769 aa  58.2  0.0000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37894  predicted protein  30.39 
 
 		 502 aa  58.2  0.0000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.525832 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1433  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  31.21 
 
 		 648 aa  58.2  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00229473  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0730  MutS2 family protein  26.29 
 
 		 804 aa  58.2  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5711  MutS2 family protein  26.27 
 
 		 824 aa  57.8  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1031  DNA mismatch repair protein MutS  28.11 
 
 		 851 aa  57.8  0.0000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0621  DNA mismatch repair protein MutS  30.54 
 
 		 905 aa  57.8  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.720679  normal  0.722964 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2920  Smr protein/MutS2  27.23 
 
 		 792 aa  57.8  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000870196 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5060  MutS2 family protein  28.25 
 
 		 802 aa  57.8  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.766824  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0727  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  23.21 
 
 		 782 aa  57.4  0.0000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1689  Smr protein/MutS2  28.57 
 
 		 793 aa  57.4  0.0000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.123598  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1072  MutS family protein  31.91 
 
 		 463 aa  57  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.6736 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1829  Smr protein/MutS2  27.57 
 
 		 804 aa  57  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.401294 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0434  DNA mismatch repair protein MutS  26.59 
 
 		 853 aa  56.6  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0558205  normal  0.0590484 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49314  predicted protein  29.02 
 
 		 916 aa  57  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0725595  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2648  DNA-mismatch repair protein  25.31 
 
 		 797 aa  56.6  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.270427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1104  MutS2 family protein  28.16 
 
 		 750 aa  56.2  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1336  MutS2 family protein  26.58 
 
 		 781 aa  56.2  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1077  DNA mismatch repair protein MutS  22.43 
 
 		 853 aa  55.5  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01550  conserved hypothetical protein  26.96 
 
 		 1191 aa  55.5  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2199  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  24.79 
 
 		 633 aa  55.8  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.402475  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0230  MutS2 family protein  30 
 
 		 789 aa  55.8  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000337666  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0153  MutS2 family protein  24.21 
 
 		 796 aa  55.8  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.323958  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0342  MutS family DNA mismatch repair protein  33.33 
 
 		 536 aa  55.1  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2135  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  26.88 
 
 		 786 aa  54.7  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1847  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  26.88 
 
 		 786 aa  54.7  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1576  DNA mismatch repair protein MutS  27.2 
 
 		 854 aa  55.1  0.000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1496  DNA mismatch repair protein MutS  26.22 
 
 		 869 aa  54.7  0.000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.241092  hitchhiker  0.0000395311 
 
 
-
 
NC_002978  WD0190  DNA mismatch repair protein MutS  25.2 
 
 		 820 aa  54.7  0.000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1486  DNA mismatch repair protein MutS  28.64 
 
 		 867 aa  54.7  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.387316  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4014  MutS2 family protein  28.68 
 
 		 828 aa  54.7  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.301308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1711  MutS2 family protein  26.21 
 
 		 801 aa  54.3  0.000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000187694  normal  0.426303 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3466  DNA mismatch repair protein MutS  29.2 
 
 		 877 aa  54.3  0.000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7097  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  24.3 
 
 		 443 aa  53.9  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000373438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1478  DNA mismatch repair protein MutS  23.79 
 
 		 828 aa  54.3  0.000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>