205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_1162 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2432  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  60.22 
 
 
589 aa  663    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  hitchhiker  0.00495271 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1162  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  100 
 
 
641 aa  1247    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.906748  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2660  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  77.69 
 
 
595 aa  900    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1501  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  54.94 
 
 
618 aa  615  1e-175  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0551  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  58.35 
 
 
583 aa  616  1e-175  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.27881  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1044  hypothetical protein  27.94 
 
 
719 aa  147  5e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1024  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  48.09 
 
 
664 aa  145  2e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.318391  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1046  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  41.94 
 
 
678 aa  144  5e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0558977  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3631  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  32.75 
 
 
694 aa  132  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1334  DNA mismatch repair protein MutS-like protein  30.86 
 
 
700 aa  131  3e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000127118  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1006  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  31.32 
 
 
688 aa  129  2.0000000000000002e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2063  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  44.77 
 
 
739 aa  128  4.0000000000000003e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2604  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  31.7 
 
 
665 aa  111  5e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0194376  normal  0.689485 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_53969  predicted protein  29.27 
 
 
1423 aa  58.2  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0273  DNA mismatch repair protein MutS  24.16 
 
 
1040 aa  57.8  0.0000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.601662 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2935  MutS2 family protein  34.29 
 
 
788 aa  57.8  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1785  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  33.33 
 
 
505 aa  57.4  0.0000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0257213  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1828  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  33.33 
 
 
505 aa  56.6  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.338904  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2380  DNA mismatch repair protein MutS  35.07 
 
 
893 aa  56.2  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0935  MutS2 family protein  29.63 
 
 
785 aa  55.8  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3819  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  37.23 
 
 
445 aa  55.5  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.081272  normal  0.267024 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1166  MutS2 family protein  32.2 
 
 
761 aa  55.1  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.690197  normal  0.0205926 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0547  MutS2 family protein  31.29 
 
 
792 aa  55.1  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3337  DNA mismatch repair protein MutS  29.75 
 
 
864 aa  54.7  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0734  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  47.76 
 
 
516 aa  55.1  0.000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.013522  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1308  MutS2 family protein  30.33 
 
 
778 aa  54.7  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2603  DNA mismatch repair protein MutS  22.1 
 
 
891 aa  54.3  0.000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2974  MutS 2 protein  33.33 
 
 
785 aa  54.7  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0342  MutS family DNA mismatch repair protein  34.43 
 
 
536 aa  53.9  0.000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4299  MutS2 family protein  31.58 
 
 
812 aa  53.9  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2054  DNA mismatch repair protein MutS-like  29.41 
 
 
771 aa  53.1  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1104  MutS2 family protein  33.33 
 
 
750 aa  53.5  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2390  MutS2 family protein  29.61 
 
 
786 aa  53.1  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0786061  normal  0.328409 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2159  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  31.51 
 
 
522 aa  53.5  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0330  DNA mismatch repair protein MutS  40.45 
 
 
917 aa  53.1  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01708  protein required for mismatch repair in mitosis and meiosis (Eurofung)  33.82 
 
 
1186 aa  52  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2772  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  34.38 
 
 
507 aa  52  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0204  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  29.85 
 
 
475 aa  52  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0767  DNA mismatch repair protein MutS  32.87 
 
 
863 aa  52.4  0.00003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1619  DNA mismatch repair protein MutS  38.2 
 
 
897 aa  51.6  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.510747 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2648  DNA-mismatch repair protein  25.73 
 
 
797 aa  51.6  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.270427  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1359  DNA mismatch repair protein MutS  29.11 
 
 
870 aa  51.2  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.219365  normal  0.0149931 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1083  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  25.18 
 
 
447 aa  51.6  0.00005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1925  DNA mismatch repair protein MutS  31.47 
 
 
865 aa  51.2  0.00006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1412  MutS2 family protein  30.47 
 
 
783 aa  51.2  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.29197e-17 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2274  DNA mismatch repair protein MutS  29.07 
 
 
911 aa  50.8  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.103313 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1356  MutS2 family protein  33.59 
 
 
794 aa  50.8  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0899  MutS2 family protein  33.6 
 
 
789 aa  50.4  0.00009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.461302  normal  0.733658 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1373  MutS2 family protein  30.29 
 
 
784 aa  50.8  0.00009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0247  DNA mismatch repair protein MutS  22.91 
 
 
1058 aa  50.1  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2459  Smr protein/MutS2  30.71 
 
 
765 aa  50.1  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.215696  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1070  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  26.14 
 
 
593 aa  49.3  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0335  DNA mismatch repair protein MutS  29.65 
 
 
815 aa  49.3  0.0002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.213975  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1832  DNA mismatch repair protein MutS  28.24 
 
 
882 aa  49.3  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0730  MutS2 family protein  29.66 
 
 
804 aa  49.7  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0062  MutS2 family protein  22.22 
 
 
826 aa  49.3  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.21825  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3431  DNA mismatch repair protein MutS  40.68 
 
 
856 aa  48.9  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2798  MutS2 family protein  29.69 
 
 
783 aa  48.9  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4014  MutS2 family protein  28.03 
 
 
828 aa  48.9  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.301308  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0195  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  24.46 
 
 
446 aa  48.9  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2983  DNA mismatch repair protein MutS  37.17 
 
 
864 aa  48.9  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.773158  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2957  DNA mismatch repair protein MutS  39.62 
 
 
854 aa  48.5  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05680  MutS2 family protein  29.75 
 
 
791 aa  48.5  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2842  DNA mismatch repair protein MutS  42.03 
 
 
870 aa  48.5  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.147304  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2646  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  44.44 
 
 
524 aa  48.5  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.264695  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0913  DNA mismatch repair protein MutS  50 
 
 
882 aa  48.5  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1920  MutS2 family protein  22.93 
 
 
760 aa  48.5  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.380002  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0734  MutS2 family protein  30.71 
 
 
780 aa  48.1  0.0004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.11062  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5060  MutS2 family protein  26.55 
 
 
802 aa  48.1  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.766824  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3424  DNA mismatch repair protein MutS  40 
 
 
851 aa  48.1  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0458  MutS family ATPase  25.61 
 
 
795 aa  48.1  0.0005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2748  DNA mismatch repair protein MutS  40.68 
 
 
856 aa  48.1  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2052  DNA mismatch repair protein MutS  43.48 
 
 
890 aa  47.8  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.292542  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0299  MutS2 family protein  29.37 
 
 
803 aa  47.8  0.0006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1500  DNA mismatch repair protein MutS  20.52 
 
 
863 aa  47.8  0.0007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0545  MutS2 family protein  33.07 
 
 
775 aa  47.8  0.0007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.807648  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1246  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  31.85 
 
 
551 aa  47.8  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1181  DNA mismatch repair protein MutS  32.1 
 
 
927 aa  47.4  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05155  putative DNA mismatch repair protein MutS  32.74 
 
 
869 aa  47.4  0.0008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3142  DNA mismatch repair protein MutS  41.07 
 
 
852 aa  47.4  0.0008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0384  MutS2 family protein  26.4 
 
 
840 aa  47.4  0.0009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0299  DNA mismatch repair protein MutS  49.09 
 
 
873 aa  47.4  0.0009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.391446  normal  0.153174 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1737  MutS family DNA structure-specific ATPase  32 
 
 
783 aa  47.4  0.0009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2913  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  25.19 
 
 
721 aa  47.4  0.0009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00104872  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0095  DNA mismatch repair protein MutS  33.04 
 
 
891 aa  47  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0480084 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1585  DNA mismatch repair protein MutS-like  38 
 
 
547 aa  47  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0147  DNA mismatch repair protein MutS  39.13 
 
 
856 aa  47  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.692226  normal  0.372979 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3422  DNA mismatch repair protein MutS  31.11 
 
 
880 aa  47  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0998408  normal  0.0667766 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0730  DNA mismatch repair protein MutS  23.53 
 
 
889 aa  47.4  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1045  DNA mismatch repair protein MutS  42.37 
 
 
854 aa  47  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.493253 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3383  DNA mismatch repair protein MutS  39.29 
 
 
856 aa  47  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.130934  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1368  Smr protein/MutS2  29.92 
 
 
771 aa  46.6  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.453399 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1166  DNA mismatch repair protein MutS  44.68 
 
 
863 aa  47  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01536  DNA mismatch repair protein MutS  44.68 
 
 
851 aa  47  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1723  DNA mismatch repair protein MutS  31.58 
 
 
855 aa  47  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1599  DNA mismatch repair protein MutS  29.73 
 
 
875 aa  46.6  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3292  DNA mismatch repair protein MutS  38.33 
 
 
851 aa  46.6  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1897  MutS2 family protein  30.19 
 
 
767 aa  47.4  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.557227  normal  0.0324553 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0964  DNA mismatch repair protein MutS  38.33 
 
 
854 aa  47  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0854968  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0956  DNA mismatch repair protein MutS  38.33 
 
 
851 aa  46.6  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>