More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3631 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_1024  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  67.34 
 
 		 664 aa  841    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.318391  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3631  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  100 
 
 		 694 aa  1338    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1006  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  67.51 
 
 		 688 aa  844    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2604  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  65.95 
 
 		 665 aa  773    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0194376  normal  0.689485 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2063  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  80 
 
 		 739 aa  1077    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1044  hypothetical protein  37.19 
 
 		 719 aa  384  1e-105  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1334  DNA mismatch repair protein MutS-like protein  33.7 
 
 		 700 aa  360  5e-98  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000127118  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1046  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  36.7 
 
 		 678 aa  313  7.999999999999999e-84  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0558977  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2660  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  36.67 
 
 		 595 aa  147  5e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2432  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  33.77 
 
 		 589 aa  135  3e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00495271 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1501  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  36.64 
 
 		 618 aa  127  5e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0551  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  34.98 
 
 		 583 aa  126  1e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.27881  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1162  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  43.18 
 
 		 641 aa  124  6e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.906748  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1450  MutS2 family protein  25.61 
 
 		 818 aa  80.9  0.00000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3819  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  30 
 
 		 445 aa  77.8  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.081272  normal  0.267024 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1470  MutS2 family protein  25.82 
 
 		 792 aa  76.6  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.471316  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05680  MutS2 family protein  25.25 
 
 		 791 aa  75.5  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4299  MutS2 family protein  29.56 
 
 		 812 aa  73.2  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2226  DNA mismatch repair protein MutS  32.5 
 
 		 956 aa  72.8  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.137389  normal  0.561287 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1014  MutS2 family protein  26.76 
 
 		 793 aa  73.2  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0625051  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2054  DNA mismatch repair protein MutS-like  28.16 
 
 		 771 aa  70.1  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2390  MutS2 family protein  32.26 
 
 		 786 aa  67.8  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0786061  normal  0.328409 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2935  MutS2 family protein  28.35 
 
 		 788 aa  67.8  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0935  MutS2 family protein  29.41 
 
 		 785 aa  67.4  0.0000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0899  MutS2 family protein  28.5 
 
 		 789 aa  66.6  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.461302  normal  0.733658 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1373  MutS2 family protein  32.62 
 
 		 784 aa  65.9  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0342  MutS family DNA mismatch repair protein  31.29 
 
 		 536 aa  64.7  0.000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2046  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  24.19 
 
 		 791 aa  64.7  0.000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3655  MutS2 family protein  23.08 
 
 		 780 aa  64.3  0.000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0062  MutS2 family protein  25.08 
 
 		 826 aa  63.5  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.21825  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1809  MutS family DNA structure-specific ATPase  27.45 
 
 		 776 aa  63.9  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.284001  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0727  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  25 
 
 		 782 aa  62.8  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1203  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  25.78 
 
 		 782 aa  62.8  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1225  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  25.78 
 
 		 782 aa  62.8  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2380  DNA mismatch repair protein MutS  27.05 
 
 		 893 aa  62  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1412  MutS2 family protein  28.86 
 
 		 783 aa  62.4  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.29197e-17 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34085  predicted protein  33.85 
 
 		 1007 aa  62  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.297969  normal  0.623648 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1638  MutS2 family protein  26.52 
 
 		 782 aa  61.2  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00924497  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1466  DNA mismatch repair protein MutS  27.57 
 
 		 872 aa  61.2  0.00000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4891  MutS2 family protein  25.15 
 
 		 806 aa  61.2  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1457  Smr protein/MutS2  32.99 
 
 		 805 aa  60.8  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1336  MutS2 family protein  26.94 
 
 		 781 aa  60.5  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1308  MutS2 family protein  23.55 
 
 		 778 aa  60.5  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2782  MutS2 family protein  26.27 
 
 		 785 aa  60.5  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.798995  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1104  MutS2 family protein  26.86 
 
 		 750 aa  59.3  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0545  MutS2 family protein  31.16 
 
 		 775 aa  59.3  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.807648  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2798  MutS2 family protein  29.22 
 
 		 783 aa  59.7  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0330  DNA mismatch repair protein MutS  27.54 
 
 		 917 aa  60.1  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1152  MutS2 family protein  25.84 
 
 		 757 aa  59.3  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4649  DNA mismatch repair protein MutS  32.3 
 
 		 916 aa  58.9  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.427089 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1897  MutS2 family protein  27.98 
 
 		 767 aa  58.9  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.557227  normal  0.0324553 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2422  DNA mismatch repair protein MutS-like  35.71 
 
 		 796 aa  58.9  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1108  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  29.89 
 
 		 782 aa  58.9  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0684525  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0999  Smr protein/MutS2  25.22 
 
 		 769 aa  58.9  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4282  DNA mismatch repair protein MutS  32.3 
 
 		 916 aa  58.5  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1441  Smr protein/MutS2  36.31 
 
 		 796 aa  58.2  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1536  Smr protein/MutS2  36.31 
 
 		 796 aa  58.2  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0843088  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0784  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  29.86 
 
 		 529 aa  58.2  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0624  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  28.16 
 
 		 977 aa  57.8  0.0000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.400029  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0299  MutS2 family protein  33.79 
 
 		 803 aa  57.8  0.0000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1813  MutS2 family protein  24.21 
 
 		 796 aa  57.4  0.0000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.553679  normal  0.572275 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0204  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  22.59 
 
 		 475 aa  57.4  0.0000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0913  DNA mismatch repair protein MutS  30.68 
 
 		 882 aa  57  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3186  DNA mismatch repair protein MutS  26.61 
 
 		 854 aa  57  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0251089 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0153  MutS2 family protein  21.93 
 
 		 796 aa  57  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.323958  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1181  DNA mismatch repair protein MutS  25.52 
 
 		 927 aa  57  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47730  predicted protein  27.78 
 
 		 1085 aa  57.4  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2095  DNA mismatch repair protein MutS  25.89 
 
 		 903 aa  56.6  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0653  DNA mismatch repair protein MutS  27.11 
 
 		 881 aa  56.6  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1619  DNA mismatch repair protein MutS  27.99 
 
 		 897 aa  56.6  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.510747 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0614  DNA mismatch repair protein MutS  26.92 
 
 		 907 aa  55.5  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4031  DNA mismatch repair protein MutS  31.68 
 
 		 881 aa  55.8  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.137829  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1166  MutS2 family protein  35.83 
 
 		 761 aa  55.5  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.690197  normal  0.0205926 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1368  Smr protein/MutS2  25 
 
 		 771 aa  55.8  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.453399 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1950  DNA mismatch repair protein MutS  25.06 
 
 		 872 aa  55.5  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.998424  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1433  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  27.42 
 
 		 648 aa  55.1  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00229473  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0299  DNA mismatch repair protein MutS  29.45 
 
 		 873 aa  54.7  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.391446  normal  0.153174 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1159  DNA mismatch repair protein MutS  27.23 
 
 		 850 aa  55.1  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0179722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0209  DNA mismatch repair protein MutS  27.75 
 
 		 877 aa  55.1  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.784326 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1493  MutS2 family protein  30 
 
 		 757 aa  55.1  0.000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2284  DNA mismatch repair protein MutS  29.89 
 
 		 897 aa  54.7  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.339354  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1541  MutS2 family protein  30 
 
 		 757 aa  55.1  0.000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0528  DNA mismatch repair protein MutS  29.78 
 
 		 911 aa  54.7  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0799066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1250  DNA mismatch repair protein MutS  22.58 
 
 		 823 aa  54.7  0.000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.297858  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1519  DNA mismatch repair protein MutS  25.93 
 
 		 854 aa  54.7  0.000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00861946  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7642  DNA mismatch repair protein MutS  29.21 
 
 		 910 aa  54.7  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.532158 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0268  Smr protein/MutS2  27.7 
 
 		 805 aa  54.3  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0912246 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1642  MutS2 family protein  23.38 
 
 		 787 aa  54.3  0.000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000590377  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1124  DNA mismatch repair protein MutS  24.29 
 
 		 861 aa  54.3  0.000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3431  DNA mismatch repair protein MutS  24.29 
 
 		 856 aa  53.9  0.000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1496  DNA mismatch repair protein MutS  23.37 
 
 		 869 aa  53.5  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.241092  hitchhiker  0.0000395311 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1083  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  22.57 
 
 		 447 aa  53.5  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2875  DNA mismatch repair protein MutS  26.42 
 
 		 879 aa  53.9  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.928835 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0063  DNA mismatch repair protein MutS  25.1 
 
 		 862 aa  53.9  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5711  MutS2 family protein  25.68 
 
 		 824 aa  53.5  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2748  DNA mismatch repair protein MutS  23.93 
 
 		 856 aa  53.5  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3422  DNA mismatch repair protein MutS  27.5 
 
 		 880 aa  53.9  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0998408  normal  0.0667766 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3270  DNA mismatch repair protein MutS  24.29 
 
 		 856 aa  53.1  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.820026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1519  DNA mismatch repair protein MutS  27.14 
 
 		 855 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0214  DNA mismatch repair protein MutS  25.62 
 
 		 851 aa  53.1  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.250019 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>