More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1501 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2432  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  60.83 
 
 		 589 aa  639    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00495271 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1501  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  100 
 
 		 618 aa  1187    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1162  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  54.64 
 
 		 641 aa  627  1e-178  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.906748  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2660  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  58.84 
 
 		 595 aa  608  9.999999999999999e-173  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0551  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  58.9 
 
 		 583 aa  596  1e-169  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.27881  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1046  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  36.25 
 
 		 678 aa  164  3e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0558977  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1334  DNA mismatch repair protein MutS-like protein  38.34 
 
 		 700 aa  150  5e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000127118  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1024  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  34.31 
 
 		 664 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.318391  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1044  hypothetical protein  36.47 
 
 		 719 aa  147  7.0000000000000006e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1006  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  34.33 
 
 		 688 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3631  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  33.84 
 
 		 694 aa  128  3e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2063  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  39.7 
 
 		 739 aa  122  1.9999999999999998e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1500  DNA mismatch repair protein MutS  22.39 
 
 		 863 aa  73.9  0.000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1594  DNA mismatch repair protein MutS  34.38 
 
 		 871 aa  69.3  0.0000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0845017  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1308  MutS2 family protein  26.19 
 
 		 778 aa  69.3  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0230  MutS2 family protein  27.78 
 
 		 789 aa  68.9  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000337666  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1104  MutS2 family protein  30.34 
 
 		 750 aa  68.6  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2390  MutS2 family protein  27.39 
 
 		 786 aa  66.2  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0786061  normal  0.328409 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_6754  predicted protein  34.76 
 
 		 209 aa  65.9  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2159  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  37.24 
 
 		 522 aa  64.7  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1373  MutS2 family protein  29.84 
 
 		 784 aa  64.7  0.000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2935  MutS2 family protein  31.47 
 
 		 788 aa  63.5  0.000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1486  DNA mismatch repair protein MutS  33.33 
 
 		 867 aa  63.5  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.387316  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1470  MutS2 family protein  25.61 
 
 		 792 aa  62.4  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.471316  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002517  DNA mismatch repair protein MutS  29.49 
 
 		 853 aa  62.8  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.919799  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1014  MutS2 family protein  24.53 
 
 		 793 aa  62.4  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0625051  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1336  MutS2 family protein  25.73 
 
 		 781 aa  62  0.00000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03515  DNA mismatch repair protein MutS  29.28 
 
 		 853 aa  62  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1166  MutS2 family protein  33.33 
 
 		 761 aa  61.6  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.690197  normal  0.0205926 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1015  DNA mismatch repair protein MutS  23.44 
 
 		 793 aa  61.2  0.00000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4299  MutS2 family protein  26.25 
 
 		 812 aa  61.2  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1004  DNA mismatch repair protein MutS  22.92 
 
 		 817 aa  61.2  0.00000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11670  DNA mismatch repair protein MutS  23.74 
 
 		 896 aa  61.2  0.00000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.199521  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02583  DNA mismatch repair protein  27.06 
 
 		 853 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.858461  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0955  DNA mismatch repair protein MutS  27.06 
 
 		 853 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02548  hypothetical protein  27.06 
 
 		 853 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.766489  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2871  DNA mismatch repair protein MutS  27.06 
 
 		 853 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03081  DNA mismatch repair protein(MutS)  25.21 
 
 		 863 aa  60.5  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3986  DNA mismatch repair protein MutS  27.06 
 
 		 853 aa  60.1  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.724345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3030  DNA mismatch repair protein MutS  27.06 
 
 		 860 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0979  DNA mismatch repair protein MutS  27.06 
 
 		 853 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.462533 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1108  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  26.17 
 
 		 782 aa  59.7  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0684525  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1181  DNA mismatch repair protein MutS  23.72 
 
 		 927 aa  60.5  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2860  DNA mismatch repair protein MutS  27.06 
 
 		 853 aa  59.7  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2046  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  26.4 
 
 		 791 aa  59.7  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3143  DNA mismatch repair protein MutS  27.49 
 
 		 853 aa  59.3  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3383  DNA mismatch repair protein MutS  24.87 
 
 		 856 aa  58.9  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.130934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1115  DNA mismatch repair protein MutS  21.93 
 
 		 793 aa  58.9  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  26.84 
 
 		 871 aa  58.9  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0063  DNA mismatch repair protein MutS  29.03 
 
 		 862 aa  58.9  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0730  DNA mismatch repair protein MutS  24.11 
 
 		 889 aa  58.9  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0195  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  31.51 
 
 		 446 aa  58.2  0.0000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0621  DNA mismatch repair protein MutS  29.67 
 
 		 859 aa  57.8  0.0000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.947929  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1638  MutS2 family protein  24.14 
 
 		 782 aa  58.2  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00924497  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2226  DNA mismatch repair protein MutS  30.77 
 
 		 956 aa  57.8  0.0000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.137389  normal  0.561287 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2651  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  30.56 
 
 		 798 aa  57.4  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.530364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2459  Smr protein/MutS2  31.41 
 
 		 765 aa  57.4  0.0000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.215696  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0268  Smr protein/MutS2  27.95 
 
 		 805 aa  57.4  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0912246 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1599  DNA mismatch repair protein MutS  28.63 
 
 		 875 aa  57.4  0.0000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0335  DNA mismatch repair protein MutS  32.65 
 
 		 815 aa  57.4  0.0000008  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.213975  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2648  DNA-mismatch repair protein  25.38 
 
 		 797 aa  57.4  0.0000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.270427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0611  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  24.25 
 
 		 796 aa  57  0.0000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.651644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1717  MutS family ATPase  24.9 
 
 		 800 aa  57  0.0000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0948  DNA mismatch repair protein MutS  21.89 
 
 		 868 aa  57  0.0000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1520  DNA mismatch repair protein MutS  27.07 
 
 		 848 aa  56.6  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0784  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  35.16 
 
 		 529 aa  56.6  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4380  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  26.6 
 
 		 786 aa  56.6  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2199  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  26.13 
 
 		 633 aa  56.6  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.402475  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4678  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  27.09 
 
 		 786 aa  56.2  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0381928  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1925  DNA mismatch repair protein MutS  32.65 
 
 		 865 aa  55.8  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4447  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  27.09 
 
 		 786 aa  55.8  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4285  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  27.09 
 
 		 786 aa  56.2  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4296  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  27.09 
 
 		 786 aa  56.2  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3114  DNA mismatch repair protein MutS  27.27 
 
 		 855 aa  56.2  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0090493 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4662  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  26.6 
 
 		 786 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0676128  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1510  DNA mismatch repair protein MutS  29.31 
 
 		 870 aa  56.2  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101093  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3030  DNA mismatch repair protein MutS  27.27 
 
 		 855 aa  56.2  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0767  DNA mismatch repair protein MutS  24.13 
 
 		 863 aa  55.8  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4794  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  27.09 
 
 		 786 aa  55.8  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.167233  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0576  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  26.6 
 
 		 786 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.613341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2017  DNA mismatch repair protein MutS  27.4 
 
 		 1014 aa  56.2  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3218  DNA mismatch repair protein MutS  27.27 
 
 		 855 aa  56.2  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.864156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0330  DNA mismatch repair protein MutS  29.33 
 
 		 917 aa  55.8  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4665  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  27.09 
 
 		 786 aa  56.2  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000565535 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0734  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  47.83 
 
 		 516 aa  55.8  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.013522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3098  DNA mismatch repair protein MutS  27.27 
 
 		 855 aa  56.2  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.603568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1356  MutS2 family protein  26.26 
 
 		 794 aa  55.5  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3515  putative MutS family protein  24.23 
 
 		 633 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3211  DNA mismatch repair protein MutS  26.11 
 
 		 853 aa  54.7  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.864311  normal  0.594165 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0621  DNA mismatch repair protein MutS  38.58 
 
 		 905 aa  55.1  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.720679  normal  0.722964 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0538  MutS2 family protein  26.4 
 
 		 791 aa  55.1  0.000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00387352  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3059  DNA mismatch repair protein MutS  26.82 
 
 		 855 aa  55.1  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.725135 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0516  DNA mismatch repair protein MutS  30.17 
 
 		 886 aa  55.1  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.544146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4031  DNA mismatch repair protein MutS  31.63 
 
 		 881 aa  54.7  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.137829  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1077  DNA mismatch repair protein MutS  24.51 
 
 		 853 aa  55.1  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4678  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  26.11 
 
 		 786 aa  54.7  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000221381  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0346  DNA mismatch repair protein MutS  34.38 
 
 		 823 aa  54.7  0.000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0580477  normal  0.279118 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3499  MutS family protein, putative  25.51 
 
 		 633 aa  54.7  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.969005  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3205  DNA mismatch repair protein  25.51 
 
 		 633 aa  54.7  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.148048  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0299  DNA mismatch repair protein MutS  31.09 
 
 		 873 aa  54.7  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.391446  normal  0.153174 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>