More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2413 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_2413  cytochrome c oxidase subunit I  100 
 
 		 597 aa  1186    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3372  Cytochrome-c oxidase  61.94 
 
 		 582 aa  691    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0851676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3755  cytochrome c oxidase subunit I  67.92 
 
 		 590 aa  765    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3803  cytochrome c oxidase subunit I  64.41 
 
 		 590 aa  751    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0463  cytochrome c oxidase subunit I  63.59 
 
 		 583 aa  746    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0934  cytochrome c oxidase, subunit I  44.42 
 
 		 561 aa  460  9.999999999999999e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1575  cytochrome c oxidase subunit I  43.75 
 
 		 561 aa  458  1e-127  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.2486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2966  Cytochrome-c oxidase  42.37 
 
 		 559 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000678538 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1900  cytochrome c oxidase subunit I  42.06 
 
 		 549 aa  415  1e-114  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2384  cytochrome c oxidase subunit I  41.61 
 
 		 549 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1564  cytochrome c oxidase subunit I  41.08 
 
 		 561 aa  381  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2396  cytochrome c oxidase, subunit I  39.33 
 
 		 537 aa  378  1e-103  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.185995  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2020  cytochrome c oxidase subunit I  41.5 
 
 		 557 aa  369  1e-100  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.558934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1825  cytochrome c oxidase subunit I  40.88 
 
 		 560 aa  359  8e-98  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00349232  normal  0.170097 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0017  cytochrome c oxidase, subunit I  39.21 
 
 		 587 aa  357  3.9999999999999996e-97  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.164121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1949  cytochrome-c oxidase  39.38 
 
 		 560 aa  342  1e-92  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1403  cytochrome c oxidase, subunit I  33.76 
 
 		 541 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0622  cytochrome c oxidase subunit I  36.06 
 
 		 541 aa  307  3e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.996251  normal  0.159868 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5761  cytochrome c oxidase subunit I  34.39 
 
 		 541 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.942787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4078  putative cytochrome c oxidase, subunit I  35.5 
 
 		 541 aa  303  8.000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.652884  normal  0.25029 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0347  cytochrome c oxidase subunit I  36.11 
 
 		 541 aa  300  6e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1353  cytochrome c oxidase, subunit I  34.89 
 
 		 541 aa  294  3e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1359  cytochrome c oxidase, subunit I  34.89 
 
 		 541 aa  293  5e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2874  cytochrome C oxidase subunit 1  35.18 
 
 		 534 aa  291  3e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1492  cytochrome c oxidase subunit 1  35.11 
 
 		 534 aa  290  6e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.593595  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8117  cytochrome c oxidase subunit I  34.62 
 
 		 540 aa  289  9e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0510084  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0161  cytochrome c oxidase subunit I  28.86 
 
 		 570 aa  177  4e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0570  cytochrome-c oxidase  25.25 
 
 		 546 aa  124  7e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3140  Cytochrome-c oxidase  25.1 
 
 		 565 aa  103  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1026  cytochrome c oxidase subunit I  25.85 
 
 		 590 aa  100  6e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0178  cytochrome c oxidase, subunit I  25.25 
 
 		 559 aa  98.6  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.942874  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4299  cytochrome c oxidase, subunit I  24.51 
 
 		 555 aa  96.3  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00437809  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3659  cytochrome c oxidase  24.53 
 
 		 555 aa  95.9  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2167  Cytochrome-c oxidase  24.88 
 
 		 657 aa  95.9  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.760505 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0042  cytochrome c oxidase, subunit I  24.9 
 
 		 586 aa  96.3  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0382499  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3734  Cytochrome-c oxidase  24.88 
 
 		 657 aa  95.9  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2032  cytochrome c oxidase, subunit I  28.25 
 
 		 585 aa  95.9  2e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.329827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2267  cytochrome c oxidase, subunit I  23.3 
 
 		 589 aa  95.9  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2170  cytochrome c oxidase, subunit I  24.9 
 
 		 598 aa  95.5  3e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.535965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0184  cytochrome c oxidase subunit I  27.25 
 
 		 508 aa  95.1  3e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.194968 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5317  cytochrome c oxidase  25.06 
 
 		 554 aa  94.4  6e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2593  cytochrome c oxidase, subunit I  23.3 
 
 		 592 aa  94  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0650297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1875  Cytochrome-c oxidase  30.08 
 
 		 759 aa  93.2  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2426  cytochrome c oxidase subunit I type  22.89 
 
 		 592 aa  92.4  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.205306  normal  0.705056 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2475  cytochrome c oxidase, subunit I  23.66 
 
 		 591 aa  92.8  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2206  cytochrome c oxidase, subunit I  27.86 
 
 		 609 aa  92.8  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000000515262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3897  cytochrome c oxidase, subunit I  24.15 
 
 		 589 aa  91.7  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0727  cytochrome-c oxidase  24.74 
 
 		 588 aa  91.7  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3576  cytochrome c oxidase, subunit I  27.76 
 
 		 553 aa  91.3  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0128043 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0444  cytochrome c oxidase, subunit I  24.87 
 
 		 541 aa  90.5  8e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12641  cytochrome c oxidase subunit I  27.99 
 
 		 563 aa  90.5  8e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5129  cytochrome c oxidase, subunit I  23.52 
 
 		 590 aa  90.1  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.828431  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0095  cytochrome c oxidase, subunit I  26.33 
 
 		 638 aa  89.7  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0277  cytochrome-c oxidase  25.51 
 
 		 562 aa  90.1  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0513618 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4873  cytochrome c oxidase, subunit I  22.82 
 
 		 586 aa  89.4  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0999966 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3796  cytochrome c oxidase, subunit I  22.82 
 
 		 586 aa  89.4  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001446  cytochrome c oxidase polypeptide I  27.68 
 
 		 543 aa  88.2  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.523828  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1565  cytochrome C oxidase polypeptide I  22.96 
 
 		 586 aa  87.8  5e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6355  cytochrome c oxidase subunit I type  26.83 
 
 		 635 aa  87.8  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3956  cytochrome c oxidase subunit I  22.1 
 
 		 585 aa  87.8  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.134754 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06271  cytochrome c oxidase, subunit I  26.94 
 
 		 546 aa  87.4  6e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1937  cytochrome-c oxidase  22.93 
 
 		 529 aa  87.4  6e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.034289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0485  cytochrome c oxidase, subunit I  25.77 
 
 		 585 aa  87.4  6e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2348  cytochrome c oxidase, subunit I  25.71 
 
 		 638 aa  87  8e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05001  cytochrome c oxidase, subunit I  25.32 
 
 		 541 aa  87  8e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0124  cytochrome-c oxidase  25.9 
 
 		 536 aa  87  9e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04691  cytochrome c oxidase, subunit I  25.57 
 
 		 541 aa  86.7  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1212  cytochrome c oxidase, subunit I  24.86 
 
 		 587 aa  86.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5671  Cytochrome-c oxidase  23.76 
 
 		 627 aa  86.3  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3633  cytochrome-c oxidase  23.66 
 
 		 585 aa  86.3  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.769302  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2990  cytochrome c oxidase, subunit I  26.33 
 
 		 638 aa  86.3  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.155569  normal  0.0328949 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4000  cytochrome c oxidase subunit I type  26.55 
 
 		 534 aa  86.3  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3865  cytochrome-c oxidase  27.31 
 
 		 530 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0025  cytochrome c oxidase, subunit I  24.83 
 
 		 563 aa  85.9  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.785934 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3992  cytochrome c oxidase, subunit I  27.31 
 
 		 530 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1037  cytochrome c oxidase, subunit I  25.72 
 
 		 558 aa  85.1  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.107378 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0197  cytochrome-c oxidase  25.82 
 
 		 534 aa  84.7  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2359  cytochrome c oxidase, subunit I  23.15 
 
 		 591 aa  84.7  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.361035  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4245  cytochrome-c oxidase  26.91 
 
 		 532 aa  84.7  0.000000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.780618  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04012  cytochrome c oxidase, subunit I  26.45 
 
 		 537 aa  84.3  0.000000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1039  cytochrome c oxidase, subunit I  28.21 
 
 		 536 aa  84.3  0.000000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0980  cytochrome-c oxidase  26.73 
 
 		 562 aa  84.3  0.000000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0678468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0257  cytochrome-c oxidase  25.5 
 
 		 531 aa  84.3  0.000000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04421  cytochrome c oxidase, subunit I  25 
 
 		 552 aa  84.3  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0104  cytochrome c oxidase, subunit I  23.01 
 
 		 545 aa  84  0.000000000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2603  cytochrome-c oxidase  25.21 
 
 		 541 aa  84  0.000000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.240231 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3792  cytochrome-c oxidase  27.31 
 
 		 530 aa  84  0.000000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1778  cytochrome-c oxidase  25.9 
 
 		 590 aa  83.6  0.000000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.307573  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4607  cytochrome c oxidase, subunit I  27.31 
 
 		 530 aa  83.6  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05071  cytochrome c oxidase, subunit I  25.06 
 
 		 539 aa  83.2  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3470  Cytochrome-c oxidase  25.06 
 
 		 627 aa  83.2  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.127917 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3518  cytochrome-c oxidase  25.82 
 
 		 535 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5816  cytochrome c oxidase, subunit I  27.55 
 
 		 558 aa  83.6  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.099341  hitchhiker  0.00453601 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3643  cytochrome-c oxidase  25.93 
 
 		 534 aa  83.6  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2948  cytochrome c oxidase subunit I  27.42 
 
 		 511 aa  83.2  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.180624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3484  cytochrome-c oxidase  25.33 
 
 		 531 aa  83.6  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.139839 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0984  cytochrome c oxidase, subunit I  24.49 
 
 		 619 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0253  cytochrome c oxidase, subunit I  23.35 
 
 		 588 aa  82.4  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00642572 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3783  cytochrome-c oxidase  26.57 
 
 		 530 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0037  cytochrome-c oxidase  26.43 
 
 		 516 aa  82.4  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.857978 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>