More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_B0178 on replicon NC_007410
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008817  P9515_12641  cytochrome c oxidase subunit I  65.11 
 
 
563 aa  700    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0178  cytochrome c oxidase, subunit I  100 
 
 
559 aa  1120    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.942874  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3576  cytochrome c oxidase, subunit I  62.27 
 
 
553 aa  726    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0128043 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4299  cytochrome c oxidase, subunit I  83.06 
 
 
555 aa  949    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00437809  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0585  cytochrome c oxidase, subunit I  56 
 
 
555 aa  638    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0980  cytochrome-c oxidase  67.33 
 
 
562 aa  763    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0678468  normal 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5317  cytochrome c oxidase  62.78 
 
 
554 aa  726    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3659  cytochrome c oxidase  83.39 
 
 
555 aa  957    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0568  cytochrome c oxidase, subunit I  56 
 
 
555 aa  638    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3140  Cytochrome-c oxidase  83.21 
 
 
565 aa  947    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0277  cytochrome-c oxidase  80.97 
 
 
562 aa  949    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0513618 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1212  cytochrome c oxidase, subunit I  56.2 
 
 
587 aa  629  1e-179  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0529  cytochrome c oxidase, subunit I  54.5 
 
 
575 aa  622  1e-177  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4072  cytochrome c oxidase, subunit I  55.68 
 
 
560 aa  619  1e-176  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1778  cytochrome-c oxidase  54.2 
 
 
590 aa  620  1e-176  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.307573  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3574  cytochrome c oxidase subunit I  54.11 
 
 
564 aa  615  1e-175  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0447  cytochrome c oxidase, subunit I  54.91 
 
 
559 aa  612  9.999999999999999e-175  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.130684 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2603  cytochrome-c oxidase  54.66 
 
 
541 aa  614  9.999999999999999e-175  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.240231 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2640  cytochrome c oxidase subunit I  54 
 
 
548 aa  613  9.999999999999999e-175  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0444  cytochrome c oxidase, subunit I  52.8 
 
 
541 aa  592  1e-168  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1776  cytochrome c oxidase, subunit I  51.91 
 
 
546 aa  588  1e-167  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06411  cytochrome c oxidase, subunit I  51.53 
 
 
558 aa  590  1e-167  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.113459 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05001  cytochrome c oxidase, subunit I  52.8 
 
 
541 aa  591  1e-167  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04691  cytochrome c oxidase, subunit I  52.8 
 
 
541 aa  590  1e-167  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05071  cytochrome c oxidase, subunit I  51.95 
 
 
539 aa  585  1e-166  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04991  cytochrome c oxidase, subunit I  51.72 
 
 
546 aa  587  1e-166  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.217716 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3957  cytochrome c oxidase, subunit I  54.49 
 
 
553 aa  583  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0607  cytochrome-c oxidase  50.82 
 
 
555 aa  575  1.0000000000000001e-163  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04421  cytochrome c oxidase, subunit I  50.74 
 
 
552 aa  573  1.0000000000000001e-162  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1755  cytochrome-c oxidase  50.45 
 
 
556 aa  570  1e-161  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.900369  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1902  Cytochrome-c oxidase  51.78 
 
 
638 aa  566  1e-160  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.96615  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0105  cytochrome c oxidase subunit I type  48.3 
 
 
615 aa  499  1e-140  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1886  cytochrome c oxidase, subunit I  48.49 
 
 
594 aa  494  9.999999999999999e-139  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00704167 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0989  cytochrome c oxidase, subunit I  48.82 
 
 
596 aa  490  1e-137  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0881  cytochrome-c oxidase  47.5 
 
 
560 aa  487  1e-136  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29310  cytochrome c oxidase, subunit I  47.26 
 
 
594 aa  483  1e-135  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.426648 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2198  cytochrome c oxidase, subunit I  46.88 
 
 
589 aa  485  1e-135  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.552552  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2622  cytochrome c oxidase, subunit I  44.42 
 
 
594 aa  484  1e-135  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2942  cytochrome c oxidase, subunit I  45.6 
 
 
581 aa  480  1e-134  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1909  cytochrome c oxidase, subunit I  45.47 
 
 
566 aa  480  1e-134  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3281  cytochrome c oxidase, subunit I  43.42 
 
 
593 aa  475  1e-133  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3557  cytochrome c oxidase subunit I type  48.27 
 
 
641 aa  472  1e-132  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0739643 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1517  cytochrome c oxidase subunit I  45.94 
 
 
572 aa  473  1e-132  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0873125  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3140  cytochrome-c oxidase  46.42 
 
 
582 aa  474  1e-132  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2493  cytochrome-c oxidase  45.39 
 
 
605 aa  475  1e-132  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.526922  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03470  cytochrome c oxidase, subunit I  45.94 
 
 
588 aa  473  1e-132  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2015  cytochrome c oxidase, subunit I  47.19 
 
 
574 aa  474  1e-132  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.466392  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1687  cytochrome c oxidase, subunit I  46.31 
 
 
590 aa  474  1e-132  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.418885  normal  0.0786402 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15640  cytochrome c oxidase, subunit I  47.94 
 
 
595 aa  472  1e-132  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.315417  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0408  cytochrome-c oxidase  43.81 
 
 
542 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3724  cytochrome c oxidase, subunit I  44.32 
 
 
602 aa  471  1.0000000000000001e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.189938  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2671  Cytochrome-c oxidase  46.83 
 
 
554 aa  468  1.0000000000000001e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.352805  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4277  cytochrome-c oxidase  46.52 
 
 
580 aa  470  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.415183  normal  0.622872 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1452  cytochrome c oxidase, subunit I  46.99 
 
 
583 aa  470  1.0000000000000001e-131  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0835225  normal  0.133355 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3649  cytochrome c oxidase, subunit I  45.85 
 
 
582 aa  470  1.0000000000000001e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000010381  normal  0.149508 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2082  cytochrome-c oxidase  46.52 
 
 
581 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.460505  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1668  cytochrome c oxidase, subunit I  44.67 
 
 
580 aa  466  9.999999999999999e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.136706  normal  0.0936951 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1016  cytochrome-c oxidase  47 
 
 
563 aa  468  9.999999999999999e-131  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1196  cytochrome-c oxidase  47.27 
 
 
592 aa  467  9.999999999999999e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.843895  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2264  cytochrome-c oxidase  47.95 
 
 
641 aa  466  9.999999999999999e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0895  cytochrome c oxidase subunit I type  44.1 
 
 
561 aa  468  9.999999999999999e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.822333  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0277  cytochrome c oxidase, subunit I  46.67 
 
 
537 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1823  cytochrome c oxidase, subunit I  46.12 
 
 
563 aa  467  9.999999999999999e-131  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2081  cytochrome c oxidase, subunit I  47.54 
 
 
607 aa  465  9.999999999999999e-131  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1960  cytochrome c oxidase, subunit I  46.78 
 
 
561 aa  465  9.999999999999999e-131  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00322963  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0490  cytochrome-c oxidase  47.45 
 
 
589 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.575526  normal  0.236102 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5341  cytochrome-c oxidase  46.7 
 
 
581 aa  462  1e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1833  cytochrome-c oxidase  46.18 
 
 
576 aa  464  1e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.168312  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1899  cytochrome-c oxidase  46.18 
 
 
576 aa  464  1e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5670  cytochrome-c oxidase  46.7 
 
 
581 aa  462  1e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16240  cytochrome c oxidase, subunit I  45.9 
 
 
603 aa  464  1e-129  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.0056616  normal  0.613337 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5610  cytochrome-c oxidase  46.7 
 
 
584 aa  462  1e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.546277 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0545  cytochrome c oxidase, subunit I  46.1 
 
 
537 aa  462  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4170  cytochrome-c oxidase  46.1 
 
 
537 aa  462  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.751334 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1852  cytochrome-c oxidase  46.18 
 
 
576 aa  464  1e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0124  cytochrome-c oxidase  46.72 
 
 
536 aa  462  9.999999999999999e-129  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6353  Cytochrome-c oxidase  44.54 
 
 
557 aa  459  9.999999999999999e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0569681  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2818  cytochrome-c oxidase  46.7 
 
 
581 aa  461  9.999999999999999e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0037  cytochrome-c oxidase  45.45 
 
 
516 aa  458  9.999999999999999e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.857978 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3704  cytochrome-c oxidase  46.52 
 
 
581 aa  461  9.999999999999999e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.574025  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3258  Cytochrome c oxidase subunit I type  46.54 
 
 
588 aa  461  9.999999999999999e-129  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.170322 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0457  cytochrome c oxidase, subunit I  45.71 
 
 
535 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5377  cytochrome-c oxidase  46.52 
 
 
581 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0177  cytochrome c oxidase, subunit I  46.43 
 
 
540 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3196  cytochrome c oxidase, subunit I  45.33 
 
 
535 aa  456  1e-127  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0153  cytochrome-c oxidase  45.22 
 
 
530 aa  456  1e-127  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0490  cytochrome c oxidase, subunit I  45.33 
 
 
535 aa  456  1e-127  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.428765  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2716  cytochrome c oxidase, subunit I CyoB  46.05 
 
 
534 aa  455  1e-127  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.308543 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0063  cytochrome-c oxidase  46.27 
 
 
527 aa  455  1e-127  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1423  cytochrome c oxidase, subunit I  45.33 
 
 
535 aa  456  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0326  cytochrome c oxidase subunit I  45.49 
 
 
526 aa  456  1e-127  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.283481  normal  0.0134906 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06271  cytochrome c oxidase, subunit I  46.62 
 
 
546 aa  455  1e-127  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1561  cytochrome c oxidase, subunit I  45.95 
 
 
567 aa  457  1e-127  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0534328  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0427  cytochrome c oxidase, subunit I  45.52 
 
 
535 aa  458  1e-127  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4113  cytochrome c oxidase, subunit I  45.22 
 
 
531 aa  456  1e-127  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2850  cytochrome c oxidase, subunit I  45.33 
 
 
535 aa  456  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0123  cytochrome c oxidase, subunit I  46.73 
 
 
529 aa  458  1e-127  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0294  cytochrome-c oxidase  46.17 
 
 
526 aa  457  1e-127  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00647712  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3484  cytochrome-c oxidase  45.49 
 
 
531 aa  457  1e-127  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.139839 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0957  cytochrome-c oxidase  47.65 
 
 
570 aa  456  1e-127  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.594307  normal  0.169668 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>