More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1452 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_2295  cytochrome c oxidase subunit I type  64.34 
 
 
666 aa  678    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0269783 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3149  cytochrome c oxidase, subunit I  74.6 
 
 
558 aa  851    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0895  cytochrome c oxidase subunit I type  67.46 
 
 
561 aa  772    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.822333  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03470  cytochrome c oxidase, subunit I  63.29 
 
 
588 aa  745    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2671  Cytochrome-c oxidase  75.47 
 
 
554 aa  819    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.352805  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1802  cytochrome c oxidase subunit I type  69.22 
 
 
568 aa  749    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.115752 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5341  cytochrome-c oxidase  70.32 
 
 
581 aa  775    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1668  cytochrome c oxidase, subunit I  76.07 
 
 
580 aa  846    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.136706  normal  0.0936951 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5377  cytochrome-c oxidase  70.3 
 
 
581 aa  777    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1953  cytochrome c oxidase, subunit I  82.94 
 
 
575 aa  930    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000175318 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0989  cytochrome c oxidase, subunit I  67.96 
 
 
596 aa  808    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2198  cytochrome c oxidase, subunit I  69.27 
 
 
589 aa  768    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.552552  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29310  cytochrome c oxidase, subunit I  69.66 
 
 
594 aa  783    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.426648 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0881  cytochrome-c oxidase  73.53 
 
 
560 aa  800    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1016  cytochrome-c oxidase  76.5 
 
 
563 aa  828    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1695  cytochrome-c oxidase  66.78 
 
 
570 aa  770    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.373959  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1517  cytochrome c oxidase subunit I  65.47 
 
 
572 aa  758    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0873125  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4277  cytochrome-c oxidase  68.98 
 
 
580 aa  783    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.415183  normal  0.622872 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1687  cytochrome c oxidase, subunit I  65.1 
 
 
590 aa  765    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.418885  normal  0.0786402 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3449  cytochrome-c oxidase  69.34 
 
 
582 aa  753    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.268774 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1960  cytochrome c oxidase, subunit I  71.51 
 
 
561 aa  785    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00322963  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2622  cytochrome c oxidase, subunit I  69 
 
 
594 aa  803    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13059  cytochrome C oxidase subunit I ctaD  71.35 
 
 
573 aa  768    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0726164 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3140  cytochrome-c oxidase  70.35 
 
 
582 aa  825    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1561  cytochrome c oxidase, subunit I  70.89 
 
 
567 aa  804    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0534328  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6353  Cytochrome-c oxidase  73.11 
 
 
557 aa  820    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0569681  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1899  cytochrome-c oxidase  70.36 
 
 
576 aa  771    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15640  cytochrome c oxidase, subunit I  85.71 
 
 
595 aa  1007    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.315417  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2143  cytochrome-c oxidase  65.62 
 
 
665 aa  697    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0607375  normal  0.164651 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2942  cytochrome c oxidase, subunit I  68.89 
 
 
581 aa  803    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1094  cytochrome-c oxidase  65.84 
 
 
644 aa  733    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.284884 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1901  cytochrome c oxidase, subunit I  70.17 
 
 
559 aa  756    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0984776  normal  0.277007 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3649  cytochrome c oxidase, subunit I  66.48 
 
 
582 aa  750    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000010381  normal  0.149508 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2009  cytochrome-c oxidase  69.19 
 
 
571 aa  746    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2493  cytochrome-c oxidase  63.65 
 
 
605 aa  737    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.526922  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3116  cytochrome-c oxidase  70.75 
 
 
560 aa  766    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.605031 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3821  cytochrome-c oxidase  67.14 
 
 
609 aa  768    Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00155592  normal  0.0385819 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5610  cytochrome-c oxidase  68.4 
 
 
584 aa  776    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.546277 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0983  cytochrome c oxidase subunit I type  65.12 
 
 
585 aa  734    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.615245  decreased coverage  0.000770913 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3917  cytochrome c oxidase, subunit I  66.55 
 
 
586 aa  750    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5670  cytochrome-c oxidase  70.32 
 
 
581 aa  775    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3724  cytochrome c oxidase, subunit I  69.89 
 
 
602 aa  766    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.189938  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3281  cytochrome c oxidase, subunit I  67.95 
 
 
593 aa  797    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4865  cytochrome-c oxidase  73.67 
 
 
567 aa  805    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2081  cytochrome c oxidase, subunit I  81.13 
 
 
607 aa  961    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3077  cytochrome c oxidase, subunit I  76.55 
 
 
561 aa  813    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0219994  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1931  cytochrome c oxidase, subunit I  75.75 
 
 
560 aa  845    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.768884  normal  0.452055 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1290  cytochrome c oxidase, subunit I  70.63 
 
 
564 aa  775    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.372246  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12210  cytochrome c oxidase, subunit I  81.51 
 
 
551 aa  907    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0161218  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14130  cytochrome c oxidase, subunit I  74.44 
 
 
570 aa  804    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.341017  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3258  Cytochrome c oxidase subunit I type  76.33 
 
 
588 aa  884    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.170322 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2818  cytochrome-c oxidase  70.32 
 
 
581 aa  776    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1452  cytochrome c oxidase, subunit I  100 
 
 
583 aa  1177    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0835225  normal  0.133355 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2015  cytochrome c oxidase, subunit I  86.32 
 
 
574 aa  993    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.466392  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1852  cytochrome-c oxidase  70.36 
 
 
576 aa  771    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3438  cytochrome-c oxidase  69.16 
 
 
582 aa  751    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.386543  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1196  cytochrome-c oxidase  67.8 
 
 
592 aa  775    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.843895  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1833  cytochrome-c oxidase  70.36 
 
 
576 aa  771    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.168312  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2082  cytochrome-c oxidase  70.13 
 
 
581 aa  789    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.460505  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1886  cytochrome c oxidase, subunit I  75.83 
 
 
594 aa  899    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00704167 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16240  cytochrome c oxidase, subunit I  71.45 
 
 
603 aa  848    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.0056616  normal  0.613337 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3501  cytochrome-c oxidase  69.16 
 
 
582 aa  751    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.553433  normal  0.857188 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1349  cytochrome c oxidase, subunit I  69.29 
 
 
585 aa  745    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.183517  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2216  cytochrome-c oxidase  82.05 
 
 
575 aa  922    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00587232  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3704  cytochrome-c oxidase  70.32 
 
 
581 aa  775    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.574025  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0490  cytochrome-c oxidase  69.84 
 
 
589 aa  805    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.575526  normal  0.236102 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0957  cytochrome-c oxidase  73.67 
 
 
570 aa  773    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.594307  normal  0.169668 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1823  cytochrome c oxidase, subunit I  56.53 
 
 
563 aa  605  9.999999999999999e-173  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0105  cytochrome c oxidase subunit I type  53.05 
 
 
615 aa  541  9.999999999999999e-153  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2264  cytochrome-c oxidase  49.37 
 
 
641 aa  524  1e-147  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3557  cytochrome c oxidase subunit I type  49.19 
 
 
641 aa  521  1e-146  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0739643 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3855  cytochrome c oxidase subunit I  49.73 
 
 
620 aa  512  1e-144  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4061  cytochrome c oxidase, subunit I  49.73 
 
 
620 aa  512  1e-144  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1856  cytochrome c oxidase, subunit I  50.81 
 
 
623 aa  513  1e-144  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1909  cytochrome c oxidase, subunit I  49.54 
 
 
566 aa  513  1e-144  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1194  cytochrome c oxidase, subunit I  49.55 
 
 
620 aa  510  1e-143  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3686  cytochrome c oxidase, subunit I  49.55 
 
 
620 aa  510  1e-143  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3703  cytochrome c oxidase, subunit I  49.55 
 
 
620 aa  510  1e-143  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4045  cytochrome c oxidase, subunit I  49.55 
 
 
620 aa  510  1e-143  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.505439  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3958  cytochrome c oxidase, subunit I  49.55 
 
 
620 aa  510  1e-143  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2645  cytochrome c oxidase subunit I type  51.99 
 
 
620 aa  510  1e-143  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.260433  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3990  cytochrome c oxidase, subunit I  49.82 
 
 
611 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.819255  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4153  cytochrome c oxidase subunit I  49.82 
 
 
611 aa  508  9.999999999999999e-143  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3769  cytochrome c oxidase subunit I type  49.73 
 
 
620 aa  491  1e-137  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3196  cytochrome c oxidase, subunit I  49.51 
 
 
535 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0673  cytochrome c oxidase polypeptide I  49.51 
 
 
535 aa  483  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0425547  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0427  cytochrome c oxidase, subunit I  49.71 
 
 
535 aa  483  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0729  cytochrome c oxidase, subunit I  49.25 
 
 
555 aa  484  1e-135  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.484854  normal  0.0785351 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1423  cytochrome c oxidase, subunit I  49.51 
 
 
535 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2850  cytochrome c oxidase, subunit I  49.51 
 
 
535 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0490  cytochrome c oxidase, subunit I  49.51 
 
 
535 aa  483  1e-135  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.428765  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0508  cytochrome c oxidase, subunit I  49.51 
 
 
535 aa  483  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2763  cytochrome c oxidase, subunit I  49.71 
 
 
535 aa  480  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.281014  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6175  cytochrome-c oxidase  49.61 
 
 
535 aa  480  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0457  cytochrome c oxidase, subunit I  49.51 
 
 
535 aa  480  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1776  cytochrome-c oxidase  48.64 
 
 
529 aa  479  1e-134  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.142128  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2232  cytochrome-c oxidase  49.51 
 
 
535 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2901  cytochrome-c oxidase  49.51 
 
 
535 aa  479  1e-134  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2846  cytochrome-c oxidase  49.51 
 
 
535 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.591708  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2857  cytochrome c oxidase, subunit I  49.51 
 
 
535 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.978045  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>