More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2143 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1886  cytochrome c oxidase, subunit I  64.77 
 
 		 594 aa  713    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00704167 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3281  cytochrome c oxidase, subunit I  66.43 
 
 		 593 aa  781    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2081  cytochrome c oxidase, subunit I  66.67 
 
 		 607 aa  735    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1901  cytochrome c oxidase, subunit I  66.12 
 
 		 559 aa  697    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0984776  normal  0.277007 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5610  cytochrome-c oxidase  68.93 
 
 		 584 aa  783    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546277 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0989  cytochrome c oxidase, subunit I  68.96 
 
 		 596 aa  820    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1517  cytochrome c oxidase subunit I  71 
 
 		 572 aa  808    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0873125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16240  cytochrome c oxidase, subunit I  61.69 
 
 		 603 aa  726    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.0056616  normal  0.613337 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3704  cytochrome-c oxidase  69.75 
 
 		 581 aa  769    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.574025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6353  Cytochrome-c oxidase  67.17 
 
 		 557 aa  728    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0569681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2198  cytochrome c oxidase, subunit I  68.34 
 
 		 589 aa  781    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.552552  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2671  Cytochrome-c oxidase  69.58 
 
 		 554 aa  751    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.352805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1953  cytochrome c oxidase, subunit I  66.98 
 
 		 575 aa  725    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000175318 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14130  cytochrome c oxidase, subunit I  59.44 
 
 		 570 aa  658    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.341017  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5377  cytochrome-c oxidase  71.06 
 
 		 581 aa  766    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0881  cytochrome-c oxidase  68.61 
 
 		 560 aa  759    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1016  cytochrome-c oxidase  68.94 
 
 		 563 aa  759    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1695  cytochrome-c oxidase  67.33 
 
 		 570 aa  734    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.373959  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2082  cytochrome-c oxidase  69.76 
 
 		 581 aa  778    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.460505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3917  cytochrome c oxidase, subunit I  69 
 
 		 586 aa  756    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3501  cytochrome-c oxidase  67.64 
 
 		 582 aa  737    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.553433  normal  0.857188 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1094  cytochrome-c oxidase  73.01 
 
 		 644 aa  800    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.284884 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1290  cytochrome c oxidase, subunit I  67.04 
 
 		 564 aa  731    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.372246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1196  cytochrome-c oxidase  70.38 
 
 		 592 aa  784    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.843895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29310  cytochrome c oxidase, subunit I  65.75 
 
 		 594 aa  801    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.426648 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1452  cytochrome c oxidase, subunit I  65.62 
 
 		 583 aa  734    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0835225  normal  0.133355 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15640  cytochrome c oxidase, subunit I  67.6 
 
 		 595 aa  727    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.315417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3649  cytochrome c oxidase, subunit I  66.79 
 
 		 582 aa  761    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000010381  normal  0.149508 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2622  cytochrome c oxidase, subunit I  67.44 
 
 		 594 aa  800    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3449  cytochrome-c oxidase  69.02 
 
 		 582 aa  738    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.268774 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1833  cytochrome-c oxidase  67.99 
 
 		 576 aa  762    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.168312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2143  cytochrome-c oxidase  100 
 
 		 665 aa  1329    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0607375  normal  0.164651 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1668  cytochrome c oxidase, subunit I  66.26 
 
 		 580 aa  765    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.136706  normal  0.0936951 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2015  cytochrome c oxidase, subunit I  65.8 
 
 		 574 aa  735    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.466392  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1960  cytochrome c oxidase, subunit I  66.48 
 
 		 561 aa  723    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00322963  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0895  cytochrome c oxidase subunit I type  69.85 
 
 		 561 aa  771    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.822333  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1899  cytochrome-c oxidase  67.99 
 
 		 576 aa  762    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2009  cytochrome-c oxidase  70.63 
 
 		 571 aa  729    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2493  cytochrome-c oxidase  66.02 
 
 		 605 aa  755    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.526922  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3116  cytochrome-c oxidase  70.19 
 
 		 560 aa  759    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.605031 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3821  cytochrome-c oxidase  66.27 
 
 		 609 aa  775    Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00155592  normal  0.0385819 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1802  cytochrome c oxidase subunit I type  68.48 
 
 		 568 aa  748    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.115752 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5670  cytochrome-c oxidase  70.66 
 
 		 581 aa  766    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4277  cytochrome-c oxidase  69 
 
 		 580 aa  775    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.415183  normal  0.622872 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13059  cytochrome C oxidase subunit I ctaD  69.57 
 
 		 573 aa  770    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0726164 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1561  cytochrome c oxidase, subunit I  68.07 
 
 		 567 aa  727    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0534328  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3258  Cytochrome c oxidase subunit I type  66.24 
 
 		 588 aa  726    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.170322 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3077  cytochrome c oxidase, subunit I  67.88 
 
 		 561 aa  704    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0219994  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0983  cytochrome c oxidase subunit I type  70.17 
 
 		 585 aa  801    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.615245  decreased coverage  0.000770913 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3149  cytochrome c oxidase, subunit I  68.74 
 
 		 558 aa  761    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2295  cytochrome c oxidase subunit I type  92.35 
 
 		 666 aa  1159    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0269783 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1687  cytochrome c oxidase, subunit I  62.12 
 
 		 590 aa  753    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.418885  normal  0.0786402 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03470  cytochrome c oxidase, subunit I  64.17 
 
 		 588 aa  754    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3140  cytochrome-c oxidase  66.73 
 
 		 582 aa  749    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1852  cytochrome-c oxidase  67.99 
 
 		 576 aa  762    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3438  cytochrome-c oxidase  67.64 
 
 		 582 aa  737    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.386543  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5341  cytochrome-c oxidase  70.66 
 
 		 581 aa  766    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1931  cytochrome c oxidase, subunit I  67.26 
 
 		 560 aa  772    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.768884  normal  0.452055 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2818  cytochrome-c oxidase  69.57 
 
 		 581 aa  766    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3724  cytochrome c oxidase, subunit I  66 
 
 		 602 aa  784    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.189938  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12210  cytochrome c oxidase, subunit I  63.4 
 
 		 551 aa  711    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0161218  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2942  cytochrome c oxidase, subunit I  66.55 
 
 		 581 aa  793    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2216  cytochrome-c oxidase  65.28 
 
 		 575 aa  723    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00587232  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0490  cytochrome-c oxidase  72.16 
 
 		 589 aa  781    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.575526  normal  0.236102 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0957  cytochrome-c oxidase  70.4 
 
 		 570 aa  752    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.594307  normal  0.169668 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1349  cytochrome c oxidase, subunit I  68.61 
 
 		 585 aa  778    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.183517  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4865  cytochrome-c oxidase  68.26 
 
 		 567 aa  735    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1823  cytochrome c oxidase, subunit I  56.92 
 
 		 563 aa  573  1.0000000000000001e-162  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3557  cytochrome c oxidase subunit I type  47.3 
 
 		 641 aa  533  1e-150  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0739643 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2264  cytochrome-c oxidase  49.55 
 
 		 641 aa  529  1e-149  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0105  cytochrome c oxidase subunit I type  48.92 
 
 		 615 aa  522  1e-147  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1909  cytochrome c oxidase, subunit I  50.87 
 
 		 566 aa  520  1e-146  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1902  Cytochrome-c oxidase  47.36 
 
 		 638 aa  478  1e-133  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.96615  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0696  cytochrome c oxidase, subunit I  44.94 
 
 		 662 aa  476  1e-133  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0659  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit I  45.57 
 
 		 654 aa  467  9.999999999999999e-131  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0184  cytochrome-c oxidase  48.46 
 
 		 526 aa  465  9.999999999999999e-131  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.169622  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0459  cytochrome-c oxidase  45.77 
 
 		 671 aa  466  9.999999999999999e-131  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2184  cytochrome-c oxidase  45.96 
 
 		 679 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0453262 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1776  cytochrome-c oxidase  47.68 
 
 		 529 aa  462  1e-129  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.142128  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0080  putative cytochrome c oxidase subunit I  45.58 
 
 		 680 aa  464  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.150485  hitchhiker  0.00336295 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0512  Cytochrome-c oxidase  44.1 
 
 		 657 aa  464  1e-129  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.881127  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0590  cytochrome aa3 quinol oxidase subunit I  44.23 
 
 		 644 aa  462  9.999999999999999e-129  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2027  cytochrome c oxidase, subunit I  45.66 
 
 		 678 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000053383 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3522  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit I  44.85 
 
 		 648 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5490  cytochrome c oxidase, subunit I  44.64 
 
 		 669 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.164888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1856  cytochrome c oxidase, subunit I  47.71 
 
 		 623 aa  460  9.999999999999999e-129  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5243  cytochrome c oxidase, subunit I  47.17 
 
 		 637 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.407043  normal  0.600413 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3574  cytochrome c oxidase subunit I  45.49 
 
 		 564 aa  461  9.999999999999999e-129  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4793  cytochrome c oxidase, subunit I  44.91 
 
 		 874 aa  455  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.153175  normal  0.530231 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5827  cytochrome c oxidase, subunit I  44.54 
 
 		 635 aa  458  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0545  cytochrome c oxidase, subunit I  46.11 
 
 		 537 aa  457  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6175  cytochrome-c oxidase  46.39 
 
 		 535 aa  459  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3557  cytochrome-c oxidase  47.47 
 
 		 569 aa  457  1e-127  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0159482  normal  0.969865 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2763  cytochrome c oxidase, subunit I  46.3 
 
 		 535 aa  458  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.281014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0457  cytochrome c oxidase, subunit I  45.91 
 
 		 535 aa  456  1e-127  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2232  cytochrome-c oxidase  46.3 
 
 		 535 aa  458  1e-127  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3541  cytochrome c oxidase, subunit I  47.97 
 
 		 743 aa  456  1e-127  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2901  cytochrome-c oxidase  46.3 
 
 		 535 aa  458  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2846  cytochrome-c oxidase  46.3 
 
 		 535 aa  458  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.591708  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6538  cytochrome c oxidase, subunit I  41.86 
 
 		 879 aa  457  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>