More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3557 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_0105  cytochrome c oxidase subunit I type  58.66 
 
 		 615 aa  743    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3557  cytochrome c oxidase subunit I type  100 
 
 		 641 aa  1272    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0739643 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2264  cytochrome-c oxidase  94.54 
 
 		 641 aa  1186    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2071  cytochrome c oxidase, subunit I  50.89 
 
 		 661 aa  610  1e-173  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.619356 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1909  cytochrome c oxidase, subunit I  56.77 
 
 		 566 aa  605  9.999999999999999e-173  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5490  cytochrome c oxidase, subunit I  47.87 
 
 		 669 aa  591  1e-167  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.164888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0459  cytochrome-c oxidase  49.4 
 
 		 671 aa  588  1e-167  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3541  cytochrome c oxidase, subunit I  58.19 
 
 		 743 aa  586  1e-166  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4061  cytochrome c oxidase, subunit I  50.95 
 
 		 620 aa  585  1e-166  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3990  cytochrome c oxidase, subunit I  50.95 
 
 		 611 aa  584  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.819255  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3855  cytochrome c oxidase subunit I  50.78 
 
 		 620 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1194  cytochrome c oxidase, subunit I  50.6 
 
 		 620 aa  582  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4045  cytochrome c oxidase, subunit I  50.6 
 
 		 620 aa  582  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.505439  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0944  cytochrome C oxidase subunit I  53.46 
 
 		 950 aa  585  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.358792  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0770  cytochrome c oxidase, subunit I/subunit III  53.46 
 
 		 962 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0306921  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0782  cytochrome c oxidase, subunit III:cytochrome c oxidase, subunit I  53.27 
 
 		 974 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2027  cytochrome c oxidase, subunit I  48.55 
 
 		 678 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000053383 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3686  cytochrome c oxidase, subunit I  50.6 
 
 		 620 aa  581  1e-164  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3703  cytochrome c oxidase, subunit I  50.6 
 
 		 620 aa  581  1e-164  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4153  cytochrome c oxidase subunit I  50.78 
 
 		 611 aa  581  1e-164  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3958  cytochrome c oxidase, subunit I  50.6 
 
 		 620 aa  581  1e-164  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6287  cytochrome c oxidase, subunit I  50.17 
 
 		 879 aa  579  1e-164  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.171761  normal  0.0477153 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1293  cytochrome c oxidase, subunit I  50 
 
 		 879 aa  579  1e-164  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6573  cytochrome c oxidase, subunit I  50.17 
 
 		 882 aa  579  1e-164  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0983225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6538  cytochrome c oxidase, subunit I  50 
 
 		 879 aa  579  1e-164  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3380  cytochrome c oxidase, subunit I  47.95 
 
 		 650 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5501  cytochrome c oxidase, subunit I  49.65 
 
 		 876 aa  578  1.0000000000000001e-163  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0931338 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1856  cytochrome c oxidase, subunit I  50.51 
 
 		 623 aa  576  1.0000000000000001e-163  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2645  cytochrome c oxidase subunit I type  49.83 
 
 		 620 aa  575  1.0000000000000001e-163  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.260433  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2184  cytochrome-c oxidase  47.39 
 
 		 679 aa  578  1.0000000000000001e-163  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0453262 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0080  putative cytochrome c oxidase subunit I  48.54 
 
 		 680 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.150485  hitchhiker  0.00336295 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6145  cytochrome c oxidase, subunit I  53.45 
 
 		 1004 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.564835  normal  0.440203 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6355  cytochrome c oxidase subunit I type  52.5 
 
 		 635 aa  574  1.0000000000000001e-162  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0696  cytochrome c oxidase, subunit I  47.45 
 
 		 662 aa  571  1e-161  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0095  cytochrome c oxidase, subunit I  51.72 
 
 		 638 aa  562  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2990  cytochrome c oxidase, subunit I  52.11 
 
 		 638 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.155569  normal  0.0328949 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0984  cytochrome c oxidase, subunit I  50.42 
 
 		 619 aa  561  1e-158  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2348  cytochrome c oxidase, subunit I  51.72 
 
 		 638 aa  559  1e-158  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3769  cytochrome c oxidase subunit I type  50.95 
 
 		 620 aa  561  1e-158  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3522  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit I  47.6 
 
 		 648 aa  556  1e-157  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0659  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit I  48.63 
 
 		 654 aa  552  1e-156  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4793  cytochrome c oxidase, subunit I  46.52 
 
 		 874 aa  553  1e-156  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.153175  normal  0.530231 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0590  cytochrome aa3 quinol oxidase subunit I  45.65 
 
 		 644 aa  550  1e-155  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0168  putative cytochrome c oxidase subunit I  46.38 
 
 		 877 aa  548  1e-155  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.606404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2622  cytochrome c oxidase, subunit I  49.82 
 
 		 594 aa  546  1e-154  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5827  cytochrome c oxidase, subunit I  50.87 
 
 		 635 aa  548  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1196  cytochrome-c oxidase  53.41 
 
 		 592 aa  548  1e-154  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.843895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0895  cytochrome c oxidase subunit I type  49.73 
 
 		 561 aa  546  1e-154  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.822333  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5243  cytochrome c oxidase, subunit I  50.39 
 
 		 637 aa  547  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.407043  normal  0.600413 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0989  cytochrome c oxidase, subunit I  52.49 
 
 		 596 aa  545  1e-154  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5610  cytochrome-c oxidase  52.64 
 
 		 584 aa  548  1e-154  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546277 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2198  cytochrome c oxidase, subunit I  49.74 
 
 		 589 aa  543  1e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.552552  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1448  cytochrome-c oxidase  45.58 
 
 		 631 aa  542  1e-153  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0923755 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3281  cytochrome c oxidase, subunit I  49.19 
 
 		 593 aa  543  1e-153  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2942  cytochrome c oxidase, subunit I  51.53 
 
 		 581 aa  544  1e-153  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3891  cytochrome c oxidase subunit I type  47.38 
 
 		 853 aa  540  9.999999999999999e-153  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.561544  normal  0.116226 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2082  cytochrome-c oxidase  52.31 
 
 		 581 aa  537  1e-151  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.460505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1094  cytochrome-c oxidase  49.82 
 
 		 644 aa  536  1e-151  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.284884 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4277  cytochrome-c oxidase  51.76 
 
 		 580 aa  536  1e-151  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.415183  normal  0.622872 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0983  cytochrome c oxidase subunit I type  49.74 
 
 		 585 aa  537  1e-151  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.615245  decreased coverage  0.000770913 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1886  cytochrome c oxidase, subunit I  49.47 
 
 		 594 aa  535  1e-151  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00704167 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5341  cytochrome-c oxidase  52.67 
 
 		 581 aa  533  1e-150  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5377  cytochrome-c oxidase  52.5 
 
 		 581 aa  535  1e-150  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2493  cytochrome-c oxidase  52.23 
 
 		 605 aa  533  1e-150  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.526922  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29310  cytochrome c oxidase, subunit I  51.34 
 
 		 594 aa  535  1e-150  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.426648 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1517  cytochrome c oxidase subunit I  50.19 
 
 		 572 aa  532  1e-150  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0873125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1452  cytochrome c oxidase, subunit I  49.19 
 
 		 583 aa  533  1e-150  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0835225  normal  0.133355 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2818  cytochrome-c oxidase  52.5 
 
 		 581 aa  532  1e-150  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5670  cytochrome-c oxidase  52.67 
 
 		 581 aa  533  1e-150  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3704  cytochrome-c oxidase  52.31 
 
 		 581 aa  531  1e-149  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.574025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6353  Cytochrome-c oxidase  52.28 
 
 		 557 aa  531  1e-149  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0569681  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0668  quinol oxidase subunit I  45.19 
 
 		 647 aa  529  1e-149  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0612  quinol oxidase, subunit 1 (cytochrome c oxidase, subunit I)  45.19 
 
 		 647 aa  529  1e-149  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0613  quinol oxidase, subunit 1 (cytochrome c oxidase, subunit I)  45.19 
 
 		 647 aa  529  1e-149  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.666796  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4601  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit I  45.19 
 
 		 644 aa  531  1e-149  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.070169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0881  cytochrome-c oxidase  49.64 
 
 		 560 aa  530  1e-149  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0617  cytochrome aa3 quinol oxidase subunit I  45.19 
 
 		 644 aa  531  1e-149  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0702  quinol oxidase subunit I  45.19 
 
 		 644 aa  529  1e-149  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0829  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit I  45.19 
 
 		 644 aa  529  1e-149  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0757  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit I  45.19 
 
 		 644 aa  529  1e-149  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00253783 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0771  quinol oxidase, subunit I  45.02 
 
 		 644 aa  528  1e-148  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.314385  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03470  cytochrome c oxidase, subunit I  50.38 
 
 		 588 aa  525  1e-148  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1668  cytochrome c oxidase, subunit I  49.05 
 
 		 580 aa  526  1e-148  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.136706  normal  0.0936951 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1931  cytochrome c oxidase, subunit I  49.82 
 
 		 560 aa  525  1e-148  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.768884  normal  0.452055 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3649  cytochrome c oxidase, subunit I  49.1 
 
 		 582 aa  526  1e-148  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000010381  normal  0.149508 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3821  cytochrome-c oxidase  48.92 
 
 		 609 aa  526  1e-148  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00155592  normal  0.0385819 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0736  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit I  45.19 
 
 		 644 aa  528  1e-148  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.283518  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1852  cytochrome-c oxidase  52.1 
 
 		 576 aa  527  1e-148  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1833  cytochrome-c oxidase  52.1 
 
 		 576 aa  527  1e-148  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.168312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3724  cytochrome c oxidase, subunit I  50.09 
 
 		 602 aa  526  1e-148  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.189938  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3140  cytochrome-c oxidase  49.32 
 
 		 582 aa  527  1e-148  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1899  cytochrome-c oxidase  52.1 
 
 		 576 aa  527  1e-148  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1802  cytochrome c oxidase subunit I type  49.01 
 
 		 568 aa  522  1e-147  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.115752 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3917  cytochrome c oxidase, subunit I  51.42 
 
 		 586 aa  522  1e-147  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3449  cytochrome-c oxidase  50.82 
 
 		 582 aa  522  1e-147  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.268774 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3116  cytochrome-c oxidase  48.65 
 
 		 560 aa  523  1e-147  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.605031 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3438  cytochrome-c oxidase  51 
 
 		 582 aa  524  1e-147  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.386543  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0490  cytochrome-c oxidase  52 
 
 		 589 aa  524  1e-147  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.575526  normal  0.236102 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4865  cytochrome-c oxidase  50.83 
 
 		 567 aa  523  1e-147  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3501  cytochrome-c oxidase  51 
 
 		 582 aa  524  1e-147  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.553433  normal  0.857188 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>