More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2009 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009339  Mflv_5341  cytochrome-c oxidase  69.51 
 
 		 581 aa  764    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1833  cytochrome-c oxidase  66.55 
 
 		 576 aa  753    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.168312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1899  cytochrome-c oxidase  66.55 
 
 		 576 aa  753    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2081  cytochrome c oxidase, subunit I  68.79 
 
 		 607 aa  771    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2015  cytochrome c oxidase, subunit I  68.27 
 
 		 574 aa  776    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.466392  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29310  cytochrome c oxidase, subunit I  70.62 
 
 		 594 aa  807    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.426648 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1452  cytochrome c oxidase, subunit I  69.19 
 
 		 583 aa  776    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0835225  normal  0.133355 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0881  cytochrome-c oxidase  65.99 
 
 		 560 aa  748    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1016  cytochrome-c oxidase  69.01 
 
 		 563 aa  746    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1695  cytochrome-c oxidase  70.38 
 
 		 570 aa  735    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.373959  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3281  cytochrome c oxidase, subunit I  69.57 
 
 		 593 aa  797    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2198  cytochrome c oxidase, subunit I  71.35 
 
 		 589 aa  780    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.552552  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3724  cytochrome c oxidase, subunit I  71.91 
 
 		 602 aa  775    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.189938  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3077  cytochrome c oxidase, subunit I  71.05 
 
 		 561 aa  741    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0219994  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6353  Cytochrome-c oxidase  66.37 
 
 		 557 aa  755    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0569681  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12210  cytochrome c oxidase, subunit I  68.17 
 
 		 551 aa  756    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0161218  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2295  cytochrome c oxidase subunit I type  70.63 
 
 		 666 aa  703    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0269783 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03470  cytochrome c oxidase, subunit I  66.91 
 
 		 588 aa  754    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2082  cytochrome-c oxidase  69.12 
 
 		 581 aa  773    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.460505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13059  cytochrome C oxidase subunit I ctaD  66.2 
 
 		 573 aa  759    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0726164 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3917  cytochrome c oxidase, subunit I  70.08 
 
 		 586 aa  747    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1290  cytochrome c oxidase, subunit I  68.83 
 
 		 564 aa  743    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.372246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14130  cytochrome c oxidase, subunit I  64.98 
 
 		 570 aa  710    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.341017  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0989  cytochrome c oxidase, subunit I  70.13 
 
 		 596 aa  820    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1931  cytochrome c oxidase, subunit I  68.46 
 
 		 560 aa  761    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.768884  normal  0.452055 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3649  cytochrome c oxidase, subunit I  69.68 
 
 		 582 aa  772    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000010381  normal  0.149508 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3149  cytochrome c oxidase, subunit I  70.02 
 
 		 558 aa  781    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0983  cytochrome c oxidase subunit I type  66.96 
 
 		 585 aa  756    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.615245  decreased coverage  0.000770913 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2009  cytochrome-c oxidase  100 
 
 		 571 aa  1143    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2493  cytochrome-c oxidase  67.55 
 
 		 605 aa  767    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.526922  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3116  cytochrome-c oxidase  80.6 
 
 		 560 aa  919    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.605031 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3821  cytochrome-c oxidase  78.12 
 
 		 609 aa  902    Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00155592  normal  0.0385819 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15640  cytochrome c oxidase, subunit I  70.36 
 
 		 595 aa  776    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.315417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3449  cytochrome-c oxidase  67.32 
 
 		 582 aa  739    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.268774 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1901  cytochrome c oxidase, subunit I  64.81 
 
 		 559 aa  706    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0984776  normal  0.277007 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1960  cytochrome c oxidase, subunit I  68.27 
 
 		 561 aa  739    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00322963  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1196  cytochrome-c oxidase  70.2 
 
 		 592 aa  770    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.843895  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1886  cytochrome c oxidase, subunit I  63.78 
 
 		 594 aa  725    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00704167 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2818  cytochrome-c oxidase  70.4 
 
 		 581 aa  770    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1687  cytochrome c oxidase, subunit I  66.07 
 
 		 590 aa  773    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.418885  normal  0.0786402 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1668  cytochrome c oxidase, subunit I  68.81 
 
 		 580 aa  771    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.136706  normal  0.0936951 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2942  cytochrome c oxidase, subunit I  65.38 
 
 		 581 aa  786    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4277  cytochrome-c oxidase  69.12 
 
 		 580 aa  773    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.415183  normal  0.622872 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5377  cytochrome-c oxidase  70.04 
 
 		 581 aa  766    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5610  cytochrome-c oxidase  69.1 
 
 		 584 aa  767    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546277 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3704  cytochrome-c oxidase  69.51 
 
 		 581 aa  764    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.574025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3501  cytochrome-c oxidase  67.32 
 
 		 582 aa  739    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.553433  normal  0.857188 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2671  Cytochrome-c oxidase  73.16 
 
 		 554 aa  787    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.352805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5670  cytochrome-c oxidase  69.51 
 
 		 581 aa  764    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1094  cytochrome-c oxidase  70.15 
 
 		 644 aa  752    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.284884 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1349  cytochrome c oxidase, subunit I  68.92 
 
 		 585 aa  748    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.183517  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1852  cytochrome-c oxidase  66.55 
 
 		 576 aa  753    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3438  cytochrome-c oxidase  67.32 
 
 		 582 aa  739    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.386543  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16240  cytochrome c oxidase, subunit I  64.49 
 
 		 603 aa  721    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.0056616  normal  0.613337 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1517  cytochrome c oxidase subunit I  69.6 
 
 		 572 aa  785    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0873125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0895  cytochrome c oxidase subunit I type  76.47 
 
 		 561 aa  887    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.822333  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2622  cytochrome c oxidase, subunit I  74.13 
 
 		 594 aa  813    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1802  cytochrome c oxidase subunit I type  83.3 
 
 		 568 aa  938    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.115752 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2143  cytochrome-c oxidase  70.63 
 
 		 665 aa  719    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0607375  normal  0.164651 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2216  cytochrome-c oxidase  69.02 
 
 		 575 aa  770    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00587232  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1561  cytochrome c oxidase, subunit I  68.27 
 
 		 567 aa  741    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0534328  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3258  Cytochrome c oxidase subunit I type  69.15 
 
 		 588 aa  755    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.170322 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0490  cytochrome-c oxidase  70.15 
 
 		 589 aa  767    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.575526  normal  0.236102 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0957  cytochrome-c oxidase  70.45 
 
 		 570 aa  741    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.594307  normal  0.169668 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1953  cytochrome c oxidase, subunit I  69.16 
 
 		 575 aa  766    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000175318 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4865  cytochrome-c oxidase  69.79 
 
 		 567 aa  744    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3140  cytochrome-c oxidase  68.12 
 
 		 582 aa  775    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1823  cytochrome c oxidase, subunit I  54.14 
 
 		 563 aa  587  1e-166  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3557  cytochrome c oxidase subunit I type  48.84 
 
 		 641 aa  517  1.0000000000000001e-145  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0739643 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0105  cytochrome c oxidase subunit I type  47.11 
 
 		 615 aa  512  1e-144  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2264  cytochrome-c oxidase  48.75 
 
 		 641 aa  510  1e-143  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1909  cytochrome c oxidase, subunit I  49.44 
 
 		 566 aa  505  9.999999999999999e-143  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2645  cytochrome c oxidase subunit I type  48.36 
 
 		 620 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.260433  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0585  cytochrome c oxidase, subunit I  46.95 
 
 		 555 aa  467  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0568  cytochrome c oxidase, subunit I  46.95 
 
 		 555 aa  467  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2850  cytochrome c oxidase, subunit I  46.58 
 
 		 535 aa  463  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4072  cytochrome c oxidase, subunit I  46.74 
 
 		 560 aa  463  1e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3196  cytochrome c oxidase, subunit I  46.58 
 
 		 535 aa  463  1e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0457  cytochrome c oxidase, subunit I  46.58 
 
 		 535 aa  462  1e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0673  cytochrome c oxidase polypeptide I  46.58 
 
 		 535 aa  463  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0425547  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1423  cytochrome c oxidase, subunit I  46.58 
 
 		 535 aa  463  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0427  cytochrome c oxidase, subunit I  46.77 
 
 		 535 aa  463  1e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0490  cytochrome c oxidase, subunit I  46.58 
 
 		 535 aa  463  1e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.428765  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1856  cytochrome c oxidase, subunit I  46.17 
 
 		 623 aa  462  1e-129  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0508  cytochrome c oxidase, subunit I  46.58 
 
 		 535 aa  463  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3855  cytochrome c oxidase subunit I  45.6 
 
 		 620 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0169  cytochrome c oxidase, subunit I  46.4 
 
 		 535 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.98257  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2071  cytochrome c oxidase, subunit I  45.18 
 
 		 661 aa  459  9.999999999999999e-129  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.619356 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0879  cytochrome-c oxidase  47.87 
 
 		 544 aa  460  9.999999999999999e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4153  cytochrome c oxidase subunit I  45.6 
 
 		 611 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4170  cytochrome-c oxidase  45.93 
 
 		 537 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.751334 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0545  cytochrome c oxidase, subunit I  45.93 
 
 		 537 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0729  cytochrome c oxidase, subunit I  45.37 
 
 		 555 aa  459  9.999999999999999e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.484854  normal  0.0785351 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4045  cytochrome c oxidase, subunit I  45.4 
 
 		 620 aa  455  1e-127  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.505439  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3990  cytochrome c oxidase, subunit I  45.59 
 
 		 611 aa  457  1e-127  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.819255  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3686  cytochrome c oxidase, subunit I  45.42 
 
 		 620 aa  458  1e-127  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3958  cytochrome c oxidase, subunit I  45.42 
 
 		 620 aa  458  1e-127  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3703  cytochrome c oxidase, subunit I  45.42 
 
 		 620 aa  458  1e-127  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1194  cytochrome c oxidase, subunit I  45.4 
 
 		 620 aa  455  1e-127  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0277  cytochrome c oxidase, subunit I  45.93 
 
 		 537 aa  457  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>