More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2198 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2622  cytochrome c oxidase, subunit I  75.97 
 
 		 594 aa  921    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5377  cytochrome-c oxidase  80.51 
 
 		 581 aa  885    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2198  cytochrome c oxidase, subunit I  100 
 
 		 589 aa  1175    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.552552  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3077  cytochrome c oxidase, subunit I  68.31 
 
 		 561 aa  739    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0219994  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4277  cytochrome-c oxidase  79.42 
 
 		 580 aa  894    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.415183  normal  0.622872 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1094  cytochrome-c oxidase  72.39 
 
 		 644 aa  800    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.284884 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1517  cytochrome c oxidase subunit I  72.2 
 
 		 572 aa  843    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0873125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2818  cytochrome-c oxidase  80.14 
 
 		 581 aa  881    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1196  cytochrome-c oxidase  78.67 
 
 		 592 aa  891    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.843895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2671  Cytochrome-c oxidase  71.79 
 
 		 554 aa  801    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.352805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0881  cytochrome-c oxidase  70.82 
 
 		 560 aa  786    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1016  cytochrome-c oxidase  70.28 
 
 		 563 aa  778    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1695  cytochrome-c oxidase  68.07 
 
 		 570 aa  747    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.373959  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1931  cytochrome c oxidase, subunit I  67.61 
 
 		 560 aa  798    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.768884  normal  0.452055 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1668  cytochrome c oxidase, subunit I  67.83 
 
 		 580 aa  800    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.136706  normal  0.0936951 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2082  cytochrome-c oxidase  78.89 
 
 		 581 aa  897    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.460505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0989  cytochrome c oxidase, subunit I  80.51 
 
 		 596 aa  963    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13059  cytochrome C oxidase subunit I ctaD  78.35 
 
 		 573 aa  891    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0726164 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12210  cytochrome c oxidase, subunit I  67.49 
 
 		 551 aa  761    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0161218  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5610  cytochrome-c oxidase  77.7 
 
 		 584 aa  894    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546277 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3724  cytochrome c oxidase, subunit I  76.36 
 
 		 602 aa  914    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.189938  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1901  cytochrome c oxidase, subunit I  66.55 
 
 		 559 aa  723    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0984776  normal  0.277007 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1290  cytochrome c oxidase, subunit I  65.9 
 
 		 564 aa  744    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.372246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3704  cytochrome-c oxidase  80.32 
 
 		 581 aa  885    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.574025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5341  cytochrome-c oxidase  79.61 
 
 		 581 aa  882    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3149  cytochrome c oxidase, subunit I  72.05 
 
 		 558 aa  795    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14130  cytochrome c oxidase, subunit I  65.24 
 
 		 570 aa  721    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.341017  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3649  cytochrome c oxidase, subunit I  78.67 
 
 		 582 aa  910    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000010381  normal  0.149508 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2009  cytochrome-c oxidase  70.73 
 
 		 571 aa  765    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2493  cytochrome-c oxidase  65.19 
 
 		 605 aa  767    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.526922  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3116  cytochrome-c oxidase  72.34 
 
 		 560 aa  803    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.605031 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3821  cytochrome-c oxidase  69.42 
 
 		 609 aa  809    Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00155592  normal  0.0385819 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6353  Cytochrome-c oxidase  68.12 
 
 		 557 aa  766    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0569681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3258  Cytochrome c oxidase subunit I type  68.83 
 
 		 588 aa  778    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.170322 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3501  cytochrome-c oxidase  76.56 
 
 		 582 aa  858    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.553433  normal  0.857188 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1687  cytochrome c oxidase, subunit I  76.44 
 
 		 590 aa  897    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.418885  normal  0.0786402 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3449  cytochrome-c oxidase  76.74 
 
 		 582 aa  860    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.268774 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3917  cytochrome c oxidase, subunit I  71.67 
 
 		 586 aa  839    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1886  cytochrome c oxidase, subunit I  64.95 
 
 		 594 aa  773    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00704167 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1561  cytochrome c oxidase, subunit I  67.88 
 
 		 567 aa  764    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0534328  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1960  cytochrome c oxidase, subunit I  68.21 
 
 		 561 aa  751    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00322963  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03470  cytochrome c oxidase, subunit I  73.12 
 
 		 588 aa  873    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1953  cytochrome c oxidase, subunit I  71.14 
 
 		 575 aa  791    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000175318 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1899  cytochrome-c oxidase  77.66 
 
 		 576 aa  879    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5670  cytochrome-c oxidase  79.61 
 
 		 581 aa  882    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2081  cytochrome c oxidase, subunit I  68.17 
 
 		 607 aa  776    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1833  cytochrome-c oxidase  77.66 
 
 		 576 aa  879    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.168312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15640  cytochrome c oxidase, subunit I  66 
 
 		 595 aa  784    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.315417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2143  cytochrome-c oxidase  68.34 
 
 		 665 aa  761    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0607375  normal  0.164651 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3140  cytochrome-c oxidase  69.89 
 
 		 582 aa  801    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1452  cytochrome c oxidase, subunit I  69.27 
 
 		 583 aa  778    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0835225  normal  0.133355 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2015  cytochrome c oxidase, subunit I  68.33 
 
 		 574 aa  777    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.466392  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1852  cytochrome-c oxidase  77.66 
 
 		 576 aa  879    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3438  cytochrome-c oxidase  76.56 
 
 		 582 aa  858    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.386543  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29310  cytochrome c oxidase, subunit I  74.16 
 
 		 594 aa  922    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.426648 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3281  cytochrome c oxidase, subunit I  76.82 
 
 		 593 aa  915    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1802  cytochrome c oxidase subunit I type  71.61 
 
 		 568 aa  793    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.115752 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0895  cytochrome c oxidase subunit I type  69.7 
 
 		 561 aa  811    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.822333  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16240  cytochrome c oxidase, subunit I  66.29 
 
 		 603 aa  748    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.0056616  normal  0.613337 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2216  cytochrome-c oxidase  71.69 
 
 		 575 aa  798    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00587232  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0983  cytochrome c oxidase subunit I type  72.39 
 
 		 585 aa  805    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.615245  decreased coverage  0.000770913 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2295  cytochrome c oxidase subunit I type  66.78 
 
 		 666 aa  741    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0269783 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0490  cytochrome-c oxidase  70.2 
 
 		 589 aa  795    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.575526  normal  0.236102 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0957  cytochrome-c oxidase  72.45 
 
 		 570 aa  774    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.594307  normal  0.169668 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2942  cytochrome c oxidase, subunit I  79.11 
 
 		 581 aa  913    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1349  cytochrome c oxidase, subunit I  71.79 
 
 		 585 aa  845    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.183517  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4865  cytochrome-c oxidase  72.88 
 
 		 567 aa  779    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1823  cytochrome c oxidase, subunit I  59.08 
 
 		 563 aa  617  1e-175  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3557  cytochrome c oxidase subunit I type  49.74 
 
 		 641 aa  538  9.999999999999999e-153  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0739643 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1909  cytochrome c oxidase, subunit I  51.53 
 
 		 566 aa  538  9.999999999999999e-153  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2264  cytochrome-c oxidase  50.43 
 
 		 641 aa  535  1e-151  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0105  cytochrome c oxidase subunit I type  52.13 
 
 		 615 aa  531  1e-149  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3140  Cytochrome-c oxidase  49.51 
 
 		 565 aa  496  1e-139  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2645  cytochrome c oxidase subunit I type  48.85 
 
 		 620 aa  496  1e-139  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.260433  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3990  cytochrome c oxidase, subunit I  48.46 
 
 		 611 aa  489  1e-137  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.819255  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3855  cytochrome c oxidase subunit I  48.09 
 
 		 620 aa  490  1e-137  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4061  cytochrome c oxidase, subunit I  48.09 
 
 		 620 aa  490  1e-137  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0178  cytochrome c oxidase, subunit I  46.88 
 
 		 559 aa  488  1e-137  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.942874  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4153  cytochrome c oxidase subunit I  48.46 
 
 		 611 aa  489  1e-137  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1194  cytochrome c oxidase, subunit I  47.9 
 
 		 620 aa  488  1e-136  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1856  cytochrome c oxidase, subunit I  49.81 
 
 		 623 aa  488  1e-136  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4045  cytochrome c oxidase, subunit I  47.9 
 
 		 620 aa  488  1e-136  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.505439  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3686  cytochrome c oxidase, subunit I  47.9 
 
 		 620 aa  488  1e-136  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3703  cytochrome c oxidase, subunit I  47.9 
 
 		 620 aa  488  1e-136  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0529  cytochrome c oxidase, subunit I  46.44 
 
 		 575 aa  488  1e-136  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3958  cytochrome c oxidase, subunit I  47.9 
 
 		 620 aa  488  1e-136  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3574  cytochrome c oxidase subunit I  49.8 
 
 		 564 aa  483  1e-135  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0459  cytochrome-c oxidase  46.75 
 
 		 671 aa  483  1e-135  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1902  Cytochrome-c oxidase  48.92 
 
 		 638 aa  483  1e-135  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.96615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0277  cytochrome-c oxidase  46.73 
 
 		 562 aa  483  1e-135  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0513618 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4072  cytochrome c oxidase, subunit I  49.63 
 
 		 560 aa  479  1e-134  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3659  cytochrome c oxidase  46.35 
 
 		 555 aa  476  1e-133  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3576  cytochrome c oxidase, subunit I  48.56 
 
 		 553 aa  477  1e-133  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0128043 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4299  cytochrome c oxidase, subunit I  46.93 
 
 		 555 aa  477  1e-133  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00437809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06411  cytochrome c oxidase, subunit I  47.06 
 
 		 558 aa  476  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.113459 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2603  cytochrome-c oxidase  50 
 
 		 541 aa  478  1e-133  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.240231 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5317  cytochrome c oxidase  47.22 
 
 		 554 aa  478  1e-133  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3769  cytochrome c oxidase subunit I type  48.09 
 
 		 620 aa  475  1e-133  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2184  cytochrome-c oxidase  46.41 
 
 		 679 aa  477  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0453262 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5490  cytochrome c oxidase, subunit I  45.03 
 
 		 669 aa  478  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.164888  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>