More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0895 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_2015  cytochrome c oxidase, subunit I  67.68 
 
 
574 aa  784    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.466392  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3140  cytochrome-c oxidase  70.24 
 
 
582 aa  795    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5377  cytochrome-c oxidase  70.08 
 
 
581 aa  769    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6353  Cytochrome-c oxidase  69.9 
 
 
557 aa  764    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0569681  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15640  cytochrome c oxidase, subunit I  70.73 
 
 
595 aa  773    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.315417  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2818  cytochrome-c oxidase  70.27 
 
 
581 aa  769    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4865  cytochrome-c oxidase  71.35 
 
 
567 aa  772    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1452  cytochrome c oxidase, subunit I  67.46 
 
 
583 aa  772    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0835225  normal  0.133355 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3724  cytochrome c oxidase, subunit I  70.71 
 
 
602 aa  780    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.189938  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29310  cytochrome c oxidase, subunit I  71.05 
 
 
594 aa  805    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.426648 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3917  cytochrome c oxidase, subunit I  71.62 
 
 
586 aa  769    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1349  cytochrome c oxidase, subunit I  70.88 
 
 
585 aa  781    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.183517  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14130  cytochrome c oxidase, subunit I  65.07 
 
 
570 aa  697    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.341017  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0881  cytochrome-c oxidase  66.85 
 
 
560 aa  753    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1016  cytochrome-c oxidase  67.58 
 
 
563 aa  759    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1695  cytochrome-c oxidase  68.11 
 
 
570 aa  727    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.373959  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3281  cytochrome c oxidase, subunit I  70.33 
 
 
593 aa  791    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5341  cytochrome-c oxidase  70.08 
 
 
581 aa  768    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3077  cytochrome c oxidase, subunit I  69.88 
 
 
561 aa  724    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0219994  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1290  cytochrome c oxidase, subunit I  66 
 
 
564 aa  751    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.372246  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1668  cytochrome c oxidase, subunit I  69.06 
 
 
580 aa  790    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.136706  normal  0.0936951 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0895  cytochrome c oxidase subunit I type  100 
 
 
561 aa  1127    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.822333  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2942  cytochrome c oxidase, subunit I  70.13 
 
 
581 aa  794    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1802  cytochrome c oxidase subunit I type  78.23 
 
 
568 aa  900    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.115752 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1901  cytochrome c oxidase, subunit I  67.1 
 
 
559 aa  730    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0984776  normal  0.277007 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5610  cytochrome-c oxidase  69.51 
 
 
584 aa  769    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.546277 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1899  cytochrome-c oxidase  68.94 
 
 
576 aa  763    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3649  cytochrome c oxidase, subunit I  71.11 
 
 
582 aa  793    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000010381  normal  0.149508 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1561  cytochrome c oxidase, subunit I  68.15 
 
 
567 aa  757    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0534328  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2671  Cytochrome-c oxidase  69.96 
 
 
554 aa  782    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.352805  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2622  cytochrome c oxidase, subunit I  72.25 
 
 
594 aa  810    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1960  cytochrome c oxidase, subunit I  66.54 
 
 
561 aa  732    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00322963  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2009  cytochrome-c oxidase  76.47 
 
 
571 aa  857    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2493  cytochrome-c oxidase  72.74 
 
 
605 aa  791    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.526922  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3116  cytochrome-c oxidase  82.74 
 
 
560 aa  953    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.605031 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3821  cytochrome-c oxidase  83.1 
 
 
609 aa  964    Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00155592  normal  0.0385819 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3501  cytochrome-c oxidase  69.13 
 
 
582 aa  748    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.553433  normal  0.857188 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0983  cytochrome c oxidase subunit I type  70.75 
 
 
585 aa  775    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.615245  decreased coverage  0.000770913 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3449  cytochrome-c oxidase  68.94 
 
 
582 aa  747    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.268774 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13059  cytochrome C oxidase subunit I ctaD  67.84 
 
 
573 aa  768    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0726164 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1953  cytochrome c oxidase, subunit I  67.77 
 
 
575 aa  760    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000175318 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16240  cytochrome c oxidase, subunit I  64.32 
 
 
603 aa  732    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.0056616  normal  0.613337 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1833  cytochrome-c oxidase  68.94 
 
 
576 aa  763    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.168312  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03470  cytochrome c oxidase, subunit I  70.55 
 
 
588 aa  782    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1517  cytochrome c oxidase subunit I  72.25 
 
 
572 aa  800    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0873125  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1196  cytochrome-c oxidase  70.64 
 
 
592 aa  779    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.843895  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5670  cytochrome-c oxidase  70.08 
 
 
581 aa  768    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1687  cytochrome c oxidase, subunit I  67.72 
 
 
590 aa  775    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.418885  normal  0.0786402 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1094  cytochrome-c oxidase  71.73 
 
 
644 aa  775    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.284884 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3258  Cytochrome c oxidase subunit I type  67.5 
 
 
588 aa  761    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.170322 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12210  cytochrome c oxidase, subunit I  68.7 
 
 
551 aa  764    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0161218  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2143  cytochrome-c oxidase  69.85 
 
 
665 aa  733    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0607375  normal  0.164651 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1931  cytochrome c oxidase, subunit I  69.06 
 
 
560 aa  773    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.768884  normal  0.452055 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1852  cytochrome-c oxidase  68.94 
 
 
576 aa  763    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3438  cytochrome-c oxidase  69.13 
 
 
582 aa  748    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.386543  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2081  cytochrome c oxidase, subunit I  69.85 
 
 
607 aa  773    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2082  cytochrome-c oxidase  69.51 
 
 
581 aa  779    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.460505  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2295  cytochrome c oxidase subunit I type  70.04 
 
 
666 aa  713    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0269783 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4277  cytochrome-c oxidase  69.51 
 
 
580 aa  776    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.415183  normal  0.622872 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3149  cytochrome c oxidase, subunit I  69 
 
 
558 aa  768    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1886  cytochrome c oxidase, subunit I  65.47 
 
 
594 aa  750    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00704167 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2216  cytochrome-c oxidase  69.71 
 
 
575 aa  762    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00587232  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0989  cytochrome c oxidase, subunit I  72.85 
 
 
596 aa  815    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0490  cytochrome-c oxidase  71.51 
 
 
589 aa  796    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.575526  normal  0.236102 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0957  cytochrome-c oxidase  73.21 
 
 
570 aa  769    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.594307  normal  0.169668 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2198  cytochrome c oxidase, subunit I  69.7 
 
 
589 aa  801    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.552552  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3704  cytochrome-c oxidase  70.08 
 
 
581 aa  767    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.574025  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1823  cytochrome c oxidase, subunit I  54.63 
 
 
563 aa  607  9.999999999999999e-173  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0105  cytochrome c oxidase subunit I type  49.55 
 
 
615 aa  537  1e-151  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3557  cytochrome c oxidase subunit I type  49.73 
 
 
641 aa  535  1e-151  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0739643 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1909  cytochrome c oxidase, subunit I  50 
 
 
566 aa  532  1e-150  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2264  cytochrome-c oxidase  51.3 
 
 
641 aa  535  1e-150  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0696  cytochrome c oxidase, subunit I  47.35 
 
 
662 aa  491  1e-137  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0363  cytochrome C oxidase polypeptide I  46.1 
 
 
534 aa  482  1e-135  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1902  Cytochrome-c oxidase  47.55 
 
 
638 aa  483  1e-135  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.96615  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3576  cytochrome c oxidase, subunit I  46.45 
 
 
553 aa  484  1e-135  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0128043 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5317  cytochrome c oxidase  45.87 
 
 
554 aa  483  1e-135  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1776  cytochrome-c oxidase  47.18 
 
 
529 aa  484  1e-135  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.142128  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1856  cytochrome c oxidase, subunit I  49.41 
 
 
623 aa  480  1e-134  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0219  cytochrome c oxidase, subunit I  46.1 
 
 
534 aa  481  1e-134  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.886427 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4072  cytochrome c oxidase, subunit I  48.56 
 
 
560 aa  479  1e-134  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0238  cytochrome c oxidase, subunit I  46.1 
 
 
534 aa  481  1e-134  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0213097 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2645  cytochrome c oxidase subunit I type  49.51 
 
 
620 aa  481  1e-134  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.260433  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2071  cytochrome c oxidase, subunit I  46.8 
 
 
661 aa  479  1e-134  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.619356 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1212  cytochrome c oxidase, subunit I  49.8 
 
 
587 aa  477  1e-133  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0568  cytochrome c oxidase, subunit I  47.24 
 
 
555 aa  476  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0177  cytochrome c oxidase, subunit I  45.4 
 
 
540 aa  475  1e-133  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0585  cytochrome c oxidase, subunit I  47.24 
 
 
555 aa  476  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3990  cytochrome c oxidase, subunit I  48.74 
 
 
611 aa  472  1e-132  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.819255  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3855  cytochrome c oxidase subunit I  48.54 
 
 
620 aa  472  1e-132  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4153  cytochrome c oxidase subunit I  48.54 
 
 
611 aa  472  1e-132  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0184  cytochrome-c oxidase  47.77 
 
 
526 aa  474  1e-132  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.169622  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5243  cytochrome c oxidase, subunit I  47.63 
 
 
637 aa  472  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.407043  normal  0.600413 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4061  cytochrome c oxidase, subunit I  48.74 
 
 
620 aa  472  1e-132  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0262  cytochrome c oxidase subunit I  47.25 
 
 
536 aa  474  1e-132  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3686  cytochrome c oxidase, subunit I  48.35 
 
 
620 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0326  cytochrome c oxidase subunit I  44.95 
 
 
526 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.283481  normal  0.0134906 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1423  cytochrome c oxidase, subunit I  46.25 
 
 
535 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0490  cytochrome c oxidase, subunit I  46.25 
 
 
535 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.428765  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0427  cytochrome c oxidase, subunit I  46.44 
 
 
535 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>