More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3438 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_14130  cytochrome c oxidase, subunit I  64.71 
 
 
570 aa  735    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.341017  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2942  cytochrome c oxidase, subunit I  82.94 
 
 
581 aa  961    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5377  cytochrome-c oxidase  92.21 
 
 
581 aa  1001    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1668  cytochrome c oxidase, subunit I  71.61 
 
 
580 aa  813    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.136706  normal  0.0936951 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1196  cytochrome-c oxidase  89.72 
 
 
592 aa  1019    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.843895  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1802  cytochrome c oxidase subunit I type  68.65 
 
 
568 aa  778    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.115752 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3917  cytochrome c oxidase, subunit I  70.93 
 
 
586 aa  827    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3258  Cytochrome c oxidase subunit I type  66.21 
 
 
588 aa  789    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.170322 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0881  cytochrome-c oxidase  70.19 
 
 
560 aa  790    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1016  cytochrome-c oxidase  70.6 
 
 
563 aa  790    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1695  cytochrome-c oxidase  67.48 
 
 
570 aa  781    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.373959  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3449  cytochrome-c oxidase  99.48 
 
 
582 aa  1165    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.268774 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5610  cytochrome-c oxidase  89.89 
 
 
584 aa  1017    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.546277 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3704  cytochrome-c oxidase  90.75 
 
 
581 aa  999    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.574025  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13059  cytochrome C oxidase subunit I ctaD  87.21 
 
 
573 aa  998    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0726164 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2081  cytochrome c oxidase, subunit I  66.28 
 
 
607 aa  792    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1517  cytochrome c oxidase subunit I  69.72 
 
 
572 aa  840    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0873125  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1953  cytochrome c oxidase, subunit I  69.23 
 
 
575 aa  796    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000175318 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1452  cytochrome c oxidase, subunit I  69.16 
 
 
583 aa  795    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0835225  normal  0.133355 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3724  cytochrome c oxidase, subunit I  74.43 
 
 
602 aa  877    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.189938  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3281  cytochrome c oxidase, subunit I  81.83 
 
 
593 aa  973    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1931  cytochrome c oxidase, subunit I  68.21 
 
 
560 aa  800    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.768884  normal  0.452055 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1901  cytochrome c oxidase, subunit I  67.35 
 
 
559 aa  730    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0984776  normal  0.277007 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1833  cytochrome-c oxidase  93.84 
 
 
576 aa  1043    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.168312  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3649  cytochrome c oxidase, subunit I  72.26 
 
 
582 aa  863    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000010381  normal  0.149508 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3077  cytochrome c oxidase, subunit I  69.76 
 
 
561 aa  750    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0219994  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2671  Cytochrome-c oxidase  73.38 
 
 
554 aa  802    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.352805  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2009  cytochrome-c oxidase  67.32 
 
 
571 aa  751    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2493  cytochrome-c oxidase  64.66 
 
 
605 aa  759    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.526922  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3116  cytochrome-c oxidase  70.4 
 
 
560 aa  807    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.605031 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3821  cytochrome-c oxidase  71.92 
 
 
609 aa  797    Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00155592  normal  0.0385819 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03470  cytochrome c oxidase, subunit I  73.21 
 
 
588 aa  856    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2082  cytochrome-c oxidase  90.04 
 
 
581 aa  1020    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.460505  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0895  cytochrome c oxidase subunit I type  69.13 
 
 
561 aa  791    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.822333  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0983  cytochrome c oxidase subunit I type  73.44 
 
 
585 aa  805    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.615245  decreased coverage  0.000770913 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2198  cytochrome c oxidase, subunit I  76.56 
 
 
589 aa  893    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.552552  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1290  cytochrome c oxidase, subunit I  65.14 
 
 
564 aa  751    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.372246  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1349  cytochrome c oxidase, subunit I  70.64 
 
 
585 aa  842    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.183517  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3149  cytochrome c oxidase, subunit I  70.38 
 
 
558 aa  805    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16240  cytochrome c oxidase, subunit I  67.6 
 
 
603 aa  753    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.0056616  normal  0.613337 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3501  cytochrome-c oxidase  100 
 
 
582 aa  1169    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.553433  normal  0.857188 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1899  cytochrome-c oxidase  93.84 
 
 
576 aa  1043    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1886  cytochrome c oxidase, subunit I  63.88 
 
 
594 aa  779    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00704167 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2015  cytochrome c oxidase, subunit I  67.93 
 
 
574 aa  791    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.466392  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1094  cytochrome-c oxidase  73.99 
 
 
644 aa  805    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.284884 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12210  cytochrome c oxidase, subunit I  67.17 
 
 
551 aa  763    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0161218  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29310  cytochrome c oxidase, subunit I  77.3 
 
 
594 aa  912    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.426648 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2622  cytochrome c oxidase, subunit I  79.97 
 
 
594 aa  968    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1852  cytochrome-c oxidase  93.84 
 
 
576 aa  1043    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3438  cytochrome-c oxidase  100 
 
 
582 aa  1169    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.386543  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1561  cytochrome c oxidase, subunit I  68.35 
 
 
567 aa  774    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0534328  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2818  cytochrome-c oxidase  91.3 
 
 
581 aa  996    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2295  cytochrome c oxidase subunit I type  67.09 
 
 
666 aa  725    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0269783 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4277  cytochrome-c oxidase  89.14 
 
 
580 aa  1032    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.415183  normal  0.622872 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0989  cytochrome c oxidase, subunit I  79.32 
 
 
596 aa  933    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1960  cytochrome c oxidase, subunit I  67.89 
 
 
561 aa  755    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00322963  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2143  cytochrome-c oxidase  64.84 
 
 
665 aa  744    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0607375  normal  0.164651 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6353  Cytochrome-c oxidase  71.62 
 
 
557 aa  791    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0569681  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2216  cytochrome-c oxidase  71.64 
 
 
575 aa  799    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00587232  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15640  cytochrome c oxidase, subunit I  71.2 
 
 
595 aa  795    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.315417  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5341  cytochrome-c oxidase  90.75 
 
 
581 aa  998    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0490  cytochrome-c oxidase  69.09 
 
 
589 aa  800    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.575526  normal  0.236102 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0957  cytochrome-c oxidase  73.76 
 
 
570 aa  779    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.594307  normal  0.169668 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1687  cytochrome c oxidase, subunit I  73.88 
 
 
590 aa  893    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.418885  normal  0.0786402 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4865  cytochrome-c oxidase  70.62 
 
 
567 aa  803    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3140  cytochrome-c oxidase  69.98 
 
 
582 aa  818    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5670  cytochrome-c oxidase  90.75 
 
 
581 aa  998    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1823  cytochrome c oxidase, subunit I  55.35 
 
 
563 aa  607  9.999999999999999e-173  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3557  cytochrome c oxidase subunit I type  51 
 
 
641 aa  541  1e-153  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0739643 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2264  cytochrome-c oxidase  50.45 
 
 
641 aa  538  1e-151  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0105  cytochrome c oxidase subunit I type  50.87 
 
 
615 aa  526  1e-148  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1909  cytochrome c oxidase, subunit I  51.22 
 
 
566 aa  528  1e-148  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2645  cytochrome c oxidase subunit I type  49.9 
 
 
620 aa  502  1e-141  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.260433  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3990  cytochrome c oxidase, subunit I  48.06 
 
 
611 aa  496  1e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.819255  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3855  cytochrome c oxidase subunit I  48.06 
 
 
620 aa  496  1e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4153  cytochrome c oxidase subunit I  48.06 
 
 
611 aa  496  1e-139  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4061  cytochrome c oxidase, subunit I  48.06 
 
 
620 aa  496  1e-139  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3686  cytochrome c oxidase, subunit I  47.87 
 
 
620 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3703  cytochrome c oxidase, subunit I  47.87 
 
 
620 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1194  cytochrome c oxidase, subunit I  47.87 
 
 
620 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4045  cytochrome c oxidase, subunit I  47.87 
 
 
620 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.505439  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3958  cytochrome c oxidase, subunit I  47.87 
 
 
620 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1856  cytochrome c oxidase, subunit I  48.2 
 
 
623 aa  489  1e-137  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3140  Cytochrome-c oxidase  47.76 
 
 
565 aa  483  1e-135  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1212  cytochrome c oxidase, subunit I  49.25 
 
 
587 aa  479  1e-134  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0178  cytochrome c oxidase, subunit I  45.02 
 
 
559 aa  479  1e-134  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.942874  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0659  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit I  48.34 
 
 
654 aa  479  1e-134  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1902  Cytochrome-c oxidase  48.44 
 
 
638 aa  481  1e-134  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.96615  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3769  cytochrome c oxidase subunit I type  47.96 
 
 
620 aa  477  1e-133  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3522  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit I  47.06 
 
 
648 aa  476  1e-133  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1776  cytochrome-c oxidase  49.51 
 
 
529 aa  477  1e-133  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.142128  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2850  cytochrome c oxidase, subunit I  48.63 
 
 
535 aa  474  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0457  cytochrome c oxidase, subunit I  48.43 
 
 
535 aa  472  1e-132  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0444  cytochrome c oxidase, subunit I  46.63 
 
 
541 aa  473  1e-132  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0184  cytochrome-c oxidase  49.12 
 
 
526 aa  473  1e-132  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.169622  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0427  cytochrome c oxidase, subunit I  48.82 
 
 
535 aa  474  1e-132  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0545  cytochrome c oxidase, subunit I  48.82 
 
 
537 aa  473  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0512  Cytochrome-c oxidase  45.2 
 
 
657 aa  473  1e-132  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.881127  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0490  cytochrome c oxidase, subunit I  48.63 
 
 
535 aa  474  1e-132  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.428765  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04991  cytochrome c oxidase, subunit I  46.68 
 
 
546 aa  473  1e-132  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.217716 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>