More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1755 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014248  Aazo_3574  cytochrome c oxidase subunit I  60.63 
 
 
564 aa  672    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04421  cytochrome c oxidase, subunit I  85.3 
 
 
552 aa  971    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0568  cytochrome c oxidase, subunit I  60.51 
 
 
555 aa  675    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04691  cytochrome c oxidase, subunit I  84.69 
 
 
541 aa  949    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1776  cytochrome c oxidase, subunit I  88.22 
 
 
546 aa  979    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05001  cytochrome c oxidase, subunit I  85.19 
 
 
541 aa  949    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0447  cytochrome c oxidase, subunit I  59.29 
 
 
559 aa  644    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.130684 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0529  cytochrome c oxidase, subunit I  61.31 
 
 
575 aa  677    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1755  cytochrome-c oxidase  100 
 
 
556 aa  1115    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.900369  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0607  cytochrome-c oxidase  93.71 
 
 
555 aa  1060    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0444  cytochrome c oxidase, subunit I  84.63 
 
 
541 aa  944    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2603  cytochrome-c oxidase  67.85 
 
 
541 aa  753    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.240231 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4072  cytochrome c oxidase, subunit I  58.96 
 
 
560 aa  675    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0585  cytochrome c oxidase, subunit I  60.51 
 
 
555 aa  675    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05071  cytochrome c oxidase, subunit I  85.36 
 
 
539 aa  938    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04991  cytochrome c oxidase, subunit I  86.84 
 
 
546 aa  978    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.217716 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06411  cytochrome c oxidase, subunit I  88.18 
 
 
558 aa  997    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.113459 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1778  cytochrome-c oxidase  59.11 
 
 
590 aa  660    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.307573  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1212  cytochrome c oxidase, subunit I  63.74 
 
 
587 aa  706    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2640  cytochrome c oxidase subunit I  61.39 
 
 
548 aa  663    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3957  cytochrome c oxidase, subunit I  59.11 
 
 
553 aa  624  1e-177  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0277  cytochrome-c oxidase  52.45 
 
 
562 aa  574  1.0000000000000001e-162  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0513618 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0178  cytochrome c oxidase, subunit I  50.45 
 
 
559 aa  570  1e-161  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.942874  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3140  Cytochrome-c oxidase  50.27 
 
 
565 aa  568  1e-161  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4299  cytochrome c oxidase, subunit I  52.1 
 
 
555 aa  567  1e-160  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00437809  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3659  cytochrome c oxidase  51.63 
 
 
555 aa  568  1e-160  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5317  cytochrome c oxidase  50.84 
 
 
554 aa  552  1e-156  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3576  cytochrome c oxidase, subunit I  51.62 
 
 
553 aa  543  1e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0128043 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1902  Cytochrome-c oxidase  50.38 
 
 
638 aa  531  1e-149  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.96615  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0980  cytochrome-c oxidase  50.86 
 
 
562 aa  521  1e-146  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0678468  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12641  cytochrome c oxidase subunit I  50.28 
 
 
563 aa  500  1e-140  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0105  cytochrome c oxidase subunit I type  47.97 
 
 
615 aa  485  1e-136  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03470  cytochrome c oxidase, subunit I  47.56 
 
 
588 aa  477  1e-133  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0989  cytochrome c oxidase, subunit I  48.46 
 
 
596 aa  472  1e-132  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29310  cytochrome c oxidase, subunit I  46.88 
 
 
594 aa  471  1.0000000000000001e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.426648 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3281  cytochrome c oxidase, subunit I  46.41 
 
 
593 aa  469  1.0000000000000001e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1886  cytochrome c oxidase, subunit I  47.42 
 
 
594 aa  470  1.0000000000000001e-131  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00704167 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2942  cytochrome c oxidase, subunit I  47.29 
 
 
581 aa  469  1.0000000000000001e-131  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2198  cytochrome c oxidase, subunit I  47.85 
 
 
589 aa  470  1.0000000000000001e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.552552  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0363  cytochrome C oxidase polypeptide I  48.84 
 
 
534 aa  468  9.999999999999999e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3196  cytochrome c oxidase, subunit I  47.94 
 
 
535 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2264  cytochrome-c oxidase  48.74 
 
 
641 aa  466  9.999999999999999e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0169  cytochrome c oxidase, subunit I  47.94 
 
 
535 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.98257  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0673  cytochrome c oxidase polypeptide I  47.94 
 
 
535 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0425547  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2850  cytochrome c oxidase, subunit I  47.94 
 
 
535 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0427  cytochrome c oxidase, subunit I  47.74 
 
 
535 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0490  cytochrome c oxidase, subunit I  47.94 
 
 
535 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.428765  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1423  cytochrome c oxidase, subunit I  47.94 
 
 
535 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0508  cytochrome c oxidase, subunit I  47.94 
 
 
535 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2622  cytochrome c oxidase, subunit I  46.38 
 
 
594 aa  468  9.999999999999999e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3557  cytochrome c oxidase subunit I type  48.35 
 
 
641 aa  468  9.999999999999999e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0739643 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3140  cytochrome-c oxidase  47.36 
 
 
582 aa  466  9.999999999999999e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0881  cytochrome-c oxidase  45.6 
 
 
560 aa  464  1e-129  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0895  cytochrome c oxidase subunit I type  46 
 
 
561 aa  464  1e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.822333  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4170  cytochrome-c oxidase  47.94 
 
 
537 aa  464  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.751334 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1561  cytochrome c oxidase, subunit I  47.13 
 
 
567 aa  464  1e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0534328  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2763  cytochrome c oxidase, subunit I  47.54 
 
 
535 aa  462  1e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.281014  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1823  cytochrome c oxidase, subunit I  46.94 
 
 
563 aa  464  1e-129  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1452  cytochrome c oxidase, subunit I  47.23 
 
 
583 aa  460  9.999999999999999e-129  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0835225  normal  0.133355 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1521  cytochrome c oxidase, subunit I  44 
 
 
552 aa  460  9.999999999999999e-129  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.999426  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1517  cytochrome c oxidase subunit I  44.25 
 
 
572 aa  460  9.999999999999999e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0873125  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0545  cytochrome c oxidase, subunit I  47.54 
 
 
537 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2857  cytochrome c oxidase, subunit I  47.35 
 
 
535 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.978045  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1245  cytochrome c oxidase  45.76 
 
 
535 aa  460  9.999999999999999e-129  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6175  cytochrome-c oxidase  47.54 
 
 
535 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0457  cytochrome c oxidase, subunit I  47.15 
 
 
535 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2232  cytochrome-c oxidase  47.15 
 
 
535 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1687  cytochrome c oxidase, subunit I  45.26 
 
 
590 aa  459  9.999999999999999e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.418885  normal  0.0786402 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4277  cytochrome-c oxidase  46.32 
 
 
580 aa  460  9.999999999999999e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.415183  normal  0.622872 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5610  cytochrome-c oxidase  46.99 
 
 
584 aa  460  9.999999999999999e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.546277 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2901  cytochrome-c oxidase  47.35 
 
 
535 aa  462  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2846  cytochrome-c oxidase  47.35 
 
 
535 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.591708  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01010  cytochrome c oxidase, subunit I  45.9 
 
 
530 aa  456  1e-127  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.113343  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1196  cytochrome-c oxidase  47.67 
 
 
592 aa  457  1e-127  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.843895  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3649  cytochrome c oxidase, subunit I  44.82 
 
 
582 aa  456  1e-127  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000010381  normal  0.149508 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4391  cytochrome c oxidase, subunit I  47.05 
 
 
543 aa  455  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4436  cytochrome-c oxidase  44.97 
 
 
545 aa  456  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0196071  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6353  Cytochrome-c oxidase  46.73 
 
 
557 aa  457  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0569681  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0277  cytochrome c oxidase, subunit I  47.35 
 
 
537 aa  458  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1931  cytochrome c oxidase, subunit I  46.01 
 
 
560 aa  458  1e-127  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.768884  normal  0.452055 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2082  cytochrome-c oxidase  48.2 
 
 
581 aa  456  1e-127  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.460505  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0408  cytochrome-c oxidase  43.44 
 
 
542 aa  455  1e-127  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0262  cytochrome c oxidase subunit I  47.56 
 
 
536 aa  457  1e-127  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2818  cytochrome-c oxidase  46.76 
 
 
581 aa  456  1e-127  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2671  Cytochrome-c oxidase  47.41 
 
 
554 aa  458  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.352805  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3704  cytochrome-c oxidase  48.04 
 
 
581 aa  453  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.574025  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1016  cytochrome-c oxidase  45.59 
 
 
563 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0326  cytochrome c oxidase subunit I  46.6 
 
 
526 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.283481  normal  0.0134906 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2015  cytochrome c oxidase, subunit I  46.56 
 
 
574 aa  452  1.0000000000000001e-126  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.466392  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2081  cytochrome c oxidase, subunit I  47.7 
 
 
607 aa  455  1.0000000000000001e-126  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2957  Cytochrome-c oxidase  43.19 
 
 
585 aa  454  1.0000000000000001e-126  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1909  cytochrome c oxidase, subunit I  47.28 
 
 
566 aa  454  1.0000000000000001e-126  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1381  cytochrome-c oxidase  47.83 
 
 
543 aa  452  1.0000000000000001e-126  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.442131  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1668  cytochrome c oxidase, subunit I  44.62 
 
 
580 aa  452  1.0000000000000001e-126  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.136706  normal  0.0936951 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0223  cytochrome c oxidase, subunit I  45.28 
 
 
563 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.109955  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3906  cytochrome-c oxidase  47.08 
 
 
547 aa  452  1.0000000000000001e-126  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.701239  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5377  cytochrome-c oxidase  47.62 
 
 
581 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5341  cytochrome-c oxidase  48.39 
 
 
581 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15640  cytochrome c oxidase, subunit I  48.08 
 
 
595 aa  455  1.0000000000000001e-126  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.315417  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5670  cytochrome-c oxidase  48.39 
 
 
581 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>