More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2957 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2957  Cytochrome-c oxidase  100 
 
 		 585 aa  1181    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0295  Cytochrome-c oxidase  47.98 
 
 		 629 aa  546  1e-154  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00055862  hitchhiker  0.00186796 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2206  cytochrome c oxidase, subunit I  47.6 
 
 		 609 aa  531  1e-150  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000000515262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1641  cytochrome-c oxidase  46.92 
 
 		 600 aa  526  1e-148  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  unclonable  0.00000000172632  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01280  Cytochrome-c oxidase  45.56 
 
 		 608 aa  515  1.0000000000000001e-145  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6950  Cytochrome-c oxidase  46.01 
 
 		 616 aa  512  1e-144  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.910069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5671  Cytochrome-c oxidase  44.65 
 
 		 627 aa  512  1e-144  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3470  Cytochrome-c oxidase  45.86 
 
 		 627 aa  509  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.127917 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2167  Cytochrome-c oxidase  45.74 
 
 		 657 aa  500  1e-140  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.760505 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3734  Cytochrome-c oxidase  45.66 
 
 		 657 aa  498  1e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1212  cytochrome c oxidase, subunit I  46.74 
 
 		 587 aa  496  1e-139  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0522  Cytochrome-c oxidase  45.69 
 
 		 610 aa  495  9.999999999999999e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000527837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0438  cytochrome-c oxidase  43.74 
 
 		 595 aa  481  1e-134  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.118932 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0529  cytochrome c oxidase, subunit I  44.86 
 
 		 575 aa  476  1e-133  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2603  cytochrome-c oxidase  44.7 
 
 		 541 aa  477  1e-133  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.240231 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4072  cytochrome c oxidase, subunit I  45.16 
 
 		 560 aa  474  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0568  cytochrome c oxidase, subunit I  42.02 
 
 		 555 aa  471  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0727  cytochrome-c oxidase  43.53 
 
 		 588 aa  469  1.0000000000000001e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2475  cytochrome c oxidase, subunit I  42.83 
 
 		 591 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0585  cytochrome c oxidase, subunit I  42.02 
 
 		 555 aa  471  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0253  cytochrome c oxidase, subunit I  44.48 
 
 		 588 aa  469  1.0000000000000001e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00642572 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1902  Cytochrome-c oxidase  43.79 
 
 		 638 aa  465  9.999999999999999e-131  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.96615  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3574  cytochrome c oxidase subunit I  43.01 
 
 		 564 aa  466  9.999999999999999e-131  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2861  cytochrome-c oxidase  44.5 
 
 		 596 aa  467  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.480216  normal  0.0169225 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3796  cytochrome c oxidase, subunit I  43.72 
 
 		 586 aa  460  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4873  cytochrome c oxidase, subunit I  43.72 
 
 		 586 aa  460  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0999966 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04991  cytochrome c oxidase, subunit I  42.88 
 
 		 546 aa  460  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.217716 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05001  cytochrome c oxidase, subunit I  42.78 
 
 		 541 aa  459  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04691  cytochrome c oxidase, subunit I  43.19 
 
 		 541 aa  461  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2359  cytochrome c oxidase, subunit I  42.78 
 
 		 591 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.361035  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3897  cytochrome c oxidase, subunit I  42.86 
 
 		 589 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05071  cytochrome c oxidase, subunit I  43.37 
 
 		 539 aa  459  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2344  cytochrome c oxidase, subunit I  42.62 
 
 		 584 aa  457  1e-127  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.250818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1776  cytochrome c oxidase, subunit I  42.7 
 
 		 546 aa  458  1e-127  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3633  cytochrome-c oxidase  42.43 
 
 		 585 aa  457  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.769302  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2426  cytochrome c oxidase subunit I type  42.66 
 
 		 592 aa  456  1e-127  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.205306  normal  0.705056 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3956  cytochrome c oxidase subunit I  42.71 
 
 		 585 aa  457  1e-127  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.134754 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1565  cytochrome C oxidase polypeptide I  42.91 
 
 		 586 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1755  cytochrome-c oxidase  43.19 
 
 		 556 aa  454  1.0000000000000001e-126  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.900369  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0444  cytochrome c oxidase, subunit I  42.78 
 
 		 541 aa  455  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2640  cytochrome c oxidase subunit I  42.83 
 
 		 548 aa  452  1.0000000000000001e-126  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5129  cytochrome c oxidase, subunit I  42.66 
 
 		 590 aa  451  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.828431  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04421  cytochrome c oxidase, subunit I  41.81 
 
 		 552 aa  450  1e-125  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06411  cytochrome c oxidase, subunit I  42.07 
 
 		 558 aa  449  1e-125  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.113459 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0447  cytochrome c oxidase, subunit I  42.81 
 
 		 559 aa  450  1e-125  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.130684 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3957  cytochrome c oxidase, subunit I  42.26 
 
 		 553 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2267  cytochrome c oxidase, subunit I  42.61 
 
 		 589 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2593  cytochrome c oxidase, subunit I  42.61 
 
 		 592 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0650297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1778  cytochrome-c oxidase  41.74 
 
 		 590 aa  447  1.0000000000000001e-124  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.307573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6210  cytochrome-c oxidase  41.99 
 
 		 586 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7361  cytochrome-c oxidase  42.01 
 
 		 586 aa  443  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0277  cytochrome-c oxidase  42.68 
 
 		 562 aa  442  1e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0513618 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0607  cytochrome-c oxidase  41.91 
 
 		 555 aa  441  9.999999999999999e-123  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5937  cytochrome c oxidase, subunit I  42.14 
 
 		 586 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0105  cytochrome c oxidase subunit I type  41.33 
 
 		 615 aa  439  9.999999999999999e-123  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0178  cytochrome c oxidase, subunit I  42.53 
 
 		 559 aa  429  1e-119  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.942874  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4299  cytochrome c oxidase, subunit I  42.98 
 
 		 555 aa  431  1e-119  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00437809  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3659  cytochrome c oxidase  42.11 
 
 		 555 aa  430  1e-119  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0326  cytochrome c oxidase subunit I  44.3 
 
 		 526 aa  426  1e-118  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.283481  normal  0.0134906 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3140  Cytochrome-c oxidase  41.18 
 
 		 565 aa  427  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0408  cytochrome-c oxidase  42.37 
 
 		 542 aa  428  1e-118  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0879  cytochrome-c oxidase  44.28 
 
 		 544 aa  426  1e-118  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5317  cytochrome c oxidase  40.97 
 
 		 554 aa  423  1e-117  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0249  cytochrome c oxidase, subunit I  41.53 
 
 		 541 aa  423  1e-117  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0038308  hitchhiker  0.00422313 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1823  cytochrome c oxidase, subunit I  41.74 
 
 		 563 aa  422  1e-117  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0363  cytochrome C oxidase polypeptide I  44.04 
 
 		 534 aa  419  1e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1587  cytochrome c oxidase, subunit I  40.18 
 
 		 548 aa  419  1e-116  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1381  cytochrome-c oxidase  44 
 
 		 543 aa  419  1e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.442131  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4391  cytochrome c oxidase, subunit I  43.27 
 
 		 543 aa  421  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1521  cytochrome c oxidase, subunit I  41.04 
 
 		 552 aa  416  9.999999999999999e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.999426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3180  cytochrome-c oxidase  43.65 
 
 		 539 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.462772  normal  0.644585 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2859  cytochrome c oxidase, subunit I  43.96 
 
 		 544 aa  418  9.999999999999999e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.605233  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1245  cytochrome c oxidase  40.44 
 
 		 535 aa  416  9.999999999999999e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1644  cytochrome c oxidase, subunit I  43.96 
 
 		 535 aa  417  9.999999999999999e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.336541  normal  0.908171 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0025  cytochrome c oxidase, subunit I  39.14 
 
 		 563 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.785934 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0536  cytochrome c oxidase, subunit I  42.21 
 
 		 541 aa  418  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.091525 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4587  cytochrome-c oxidase  41.64 
 
 		 541 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0148874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1681  cytochrome-c oxidase  43.22 
 
 		 539 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.793322  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0262  cytochrome c oxidase subunit I  44.91 
 
 		 536 aa  416  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3906  cytochrome-c oxidase  43.59 
 
 		 547 aa  418  9.999999999999999e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.701239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0223  cytochrome c oxidase, subunit I  38.72 
 
 		 563 aa  413  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.109955  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0301  cytochrome c oxidase, subunit I  40.48 
 
 		 516 aa  414  1e-114  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.249737  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0167  cytochrome c oxidase, subunit I  38.72 
 
 		 563 aa  414  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.357082  normal  0.0110936 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0277  cytochrome c oxidase, subunit I  43.14 
 
 		 537 aa  413  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3536  cytochrome-c oxidase  43.41 
 
 		 544 aa  414  1e-114  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3576  cytochrome c oxidase, subunit I  41.65 
 
 		 553 aa  415  1e-114  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0128043 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1593  cytochrome c oxidase polypeptide I  42.7 
 
 		 531 aa  413  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.195458  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0137  cytochrome c oxidase, subunit I  42.7 
 
 		 531 aa  413  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0112  cytochrome c oxidase, subunit I  42.7 
 
 		 524 aa  412  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1246  cytochrome-c oxidase  43.38 
 
 		 544 aa  414  1e-114  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.871742  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0238  cytochrome c oxidase, subunit I  43.45 
 
 		 534 aa  414  1e-114  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0213097 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0219  cytochrome c oxidase, subunit I  43.63 
 
 		 534 aa  414  1e-114  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.886427 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1939  cytochrome-c oxidase  43.41 
 
 		 543 aa  415  1e-114  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0346979  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3557  cytochrome-c oxidase  44.61 
 
 		 569 aa  415  1e-114  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0159482  normal  0.969865 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0043  cytochrome c oxidase, subunit I  40.76 
 
 		 539 aa  414  1e-114  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0900  cytochrome c oxidase, subunit I  40.36 
 
 		 541 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0552276  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1675  cytochrome c oxidase, subunit I  43.22 
 
 		 556 aa  411  1e-113  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0459  cytochrome-c oxidase  41.74 
 
 		 671 aa  410  1e-113  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0427  cytochrome c oxidase, subunit I  43.53 
 
 		 535 aa  410  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0622  cytochrome c oxidase, subunit I  40.54 
 
 		 519 aa  411  1e-113  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000132617  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>