More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1778 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4072  cytochrome c oxidase, subunit I  60.63 
 
 
560 aa  702    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04421  cytochrome c oxidase, subunit I  58.66 
 
 
552 aa  663    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1776  cytochrome c oxidase, subunit I  58.67 
 
 
546 aa  671    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0447  cytochrome c oxidase, subunit I  75.63 
 
 
559 aa  856    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.130684 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0529  cytochrome c oxidase, subunit I  64.76 
 
 
575 aa  748    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4299  cytochrome c oxidase, subunit I  55.27 
 
 
555 aa  636    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00437809  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1755  cytochrome-c oxidase  59.11 
 
 
556 aa  660    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.900369  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0607  cytochrome-c oxidase  59.55 
 
 
555 aa  664    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0444  cytochrome c oxidase, subunit I  58.4 
 
 
541 aa  665    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2603  cytochrome-c oxidase  63.53 
 
 
541 aa  731    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.240231 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06411  cytochrome c oxidase, subunit I  56.73 
 
 
558 aa  664    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.113459 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3957  cytochrome c oxidase, subunit I  74.85 
 
 
553 aa  828    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04991  cytochrome c oxidase, subunit I  58.67 
 
 
546 aa  671    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.217716 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05001  cytochrome c oxidase, subunit I  58.77 
 
 
541 aa  667    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3574  cytochrome c oxidase subunit I  63.69 
 
 
564 aa  741    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05071  cytochrome c oxidase, subunit I  58.13 
 
 
539 aa  658    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1778  cytochrome-c oxidase  100 
 
 
590 aa  1191    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.307573  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0585  cytochrome c oxidase, subunit I  63.58 
 
 
555 aa  711    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04691  cytochrome c oxidase, subunit I  58.77 
 
 
541 aa  666    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2640  cytochrome c oxidase subunit I  78.62 
 
 
548 aa  882    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1212  cytochrome c oxidase, subunit I  58.33 
 
 
587 aa  722    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0568  cytochrome c oxidase, subunit I  63.58 
 
 
555 aa  711    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3659  cytochrome c oxidase  53.2 
 
 
555 aa  625  1e-178  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3140  Cytochrome-c oxidase  55.05 
 
 
565 aa  627  1e-178  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0277  cytochrome-c oxidase  54.63 
 
 
562 aa  624  1e-177  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0513618 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0178  cytochrome c oxidase, subunit I  54.2 
 
 
559 aa  620  1e-176  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.942874  n/a   
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5317  cytochrome c oxidase  53.97 
 
 
554 aa  609  1e-173  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3576  cytochrome c oxidase, subunit I  53.36 
 
 
553 aa  595  1e-169  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0128043 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1902  Cytochrome-c oxidase  51.5 
 
 
638 aa  546  1e-154  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.96615  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0980  cytochrome-c oxidase  50.74 
 
 
562 aa  546  1e-154  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0678468  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12641  cytochrome c oxidase subunit I  51.47 
 
 
563 aa  520  1e-146  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0408  cytochrome-c oxidase  47.43 
 
 
542 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0105  cytochrome c oxidase subunit I type  46.11 
 
 
615 aa  491  1e-137  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2264  cytochrome-c oxidase  51.19 
 
 
641 aa  485  1e-136  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3643  cytochrome-c oxidase  49.62 
 
 
534 aa  488  1e-136  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3557  cytochrome c oxidase subunit I type  50.6 
 
 
641 aa  485  1e-135  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0739643 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4788  cytochrome-c oxidase  48.02 
 
 
540 aa  479  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1909  cytochrome c oxidase, subunit I  49.1 
 
 
566 aa  480  1e-134  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1823  cytochrome c oxidase, subunit I  45.2 
 
 
563 aa  478  1e-133  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3262  cytochrome c oxidase, subunit I  49.03 
 
 
542 aa  475  1e-133  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1521  cytochrome c oxidase, subunit I  47.23 
 
 
552 aa  478  1e-133  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.999426  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0900  cytochrome c oxidase, subunit I  48.75 
 
 
541 aa  475  1e-133  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0552276  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2348  cytochrome c oxidase, subunit I  47.64 
 
 
542 aa  476  1e-133  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.056683  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3586  cytochrome c oxidase, subunit I  49.03 
 
 
542 aa  475  1e-133  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.962782  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3458  cytochrome c oxidase, subunit I  48.83 
 
 
542 aa  473  1e-132  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0261  cytochrome c oxidase, subunit I  48.18 
 
 
542 aa  474  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.043486  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0032  cytochrome c oxidase, subunit I  48.73 
 
 
542 aa  473  1e-132  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.616804 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0025  cytochrome c oxidase, subunit I  45.31 
 
 
563 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.785934 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5947  cytochrome c oxidase, subunit I  44.9 
 
 
554 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0670  cytochrome c oxidase subunit I type  49.23 
 
 
535 aa  470  1.0000000000000001e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.154602  normal  0.969161 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0223  cytochrome c oxidase, subunit I  45.17 
 
 
563 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.109955  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0224  cytochrome c oxidase, subunit I  49.9 
 
 
539 aa  468  9.999999999999999e-131  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0762  cytochrome c oxidase, subunit I  49.9 
 
 
539 aa  468  9.999999999999999e-131  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.73829  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0167  cytochrome c oxidase, subunit I  44.97 
 
 
563 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.357082  normal  0.0110936 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0256  cytochrome-c oxidase  50.29 
 
 
537 aa  466  9.999999999999999e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.262463  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3462  cytochrome-c oxidase  50.29 
 
 
537 aa  466  9.999999999999999e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4647  cytochrome c oxidase subunit I type  48.28 
 
 
540 aa  468  9.999999999999999e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.608702  normal  0.13111 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1687  cytochrome c oxidase, subunit I  45.12 
 
 
590 aa  463  1e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.418885  normal  0.0786402 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0363  cytochrome C oxidase polypeptide I  46.12 
 
 
534 aa  459  9.999999999999999e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1245  cytochrome c oxidase  44.31 
 
 
535 aa  460  9.999999999999999e-129  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4587  cytochrome-c oxidase  48.75 
 
 
541 aa  462  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0148874  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1517  cytochrome c oxidase subunit I  44.48 
 
 
572 aa  460  9.999999999999999e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0873125  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2995  cytochrome-c oxidase  43.59 
 
 
544 aa  461  9.999999999999999e-129  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0459294 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0829  cytochrome c oxidase, subunit I  47.08 
 
 
537 aa  459  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.12188  normal  0.348177 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0277  cytochrome c oxidase, subunit I  46.08 
 
 
537 aa  456  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0177  cytochrome c oxidase, subunit I  46.44 
 
 
540 aa  457  1e-127  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0729  cytochrome c oxidase, subunit I  44.53 
 
 
555 aa  456  1e-127  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.484854  normal  0.0785351 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3990  cytochrome c oxidase, subunit I  43.76 
 
 
564 aa  452  1.0000000000000001e-126  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.74194  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2850  cytochrome c oxidase, subunit I  44.78 
 
 
535 aa  455  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3196  cytochrome c oxidase, subunit I  44.78 
 
 
535 aa  455  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0169  cytochrome c oxidase, subunit I  44.78 
 
 
535 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.98257  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0457  cytochrome c oxidase, subunit I  44.97 
 
 
535 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1587  cytochrome c oxidase, subunit I  43.44 
 
 
548 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1423  cytochrome c oxidase, subunit I  44.78 
 
 
535 aa  455  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0326  cytochrome c oxidase subunit I  47.01 
 
 
526 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.283481  normal  0.0134906 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0673  cytochrome c oxidase polypeptide I  44.78 
 
 
535 aa  455  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0425547  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2198  cytochrome c oxidase, subunit I  48.63 
 
 
589 aa  454  1.0000000000000001e-126  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.552552  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0427  cytochrome c oxidase, subunit I  44.4 
 
 
535 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0545  cytochrome c oxidase, subunit I  46.46 
 
 
537 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1041  cytochrome c oxidase subunit I  46.87 
 
 
559 aa  455  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.286412  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0490  cytochrome c oxidase, subunit I  44.78 
 
 
535 aa  455  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.428765  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4170  cytochrome-c oxidase  46.27 
 
 
537 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.751334 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3518  cytochrome-c oxidase  43.98 
 
 
535 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0815  cytochrome-c oxidase  48.37 
 
 
541 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0856305  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0508  cytochrome c oxidase, subunit I  44.78 
 
 
535 aa  455  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2857  cytochrome c oxidase, subunit I  45.86 
 
 
535 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.978045  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1238  cytochrome c oxidase, subunit I  45.45 
 
 
554 aa  455  1.0000000000000001e-126  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.28366 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2763  cytochrome c oxidase, subunit I  45.7 
 
 
535 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.281014  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0197  cytochrome-c oxidase  46.93 
 
 
534 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2622  cytochrome c oxidase, subunit I  42.81 
 
 
594 aa  453  1.0000000000000001e-126  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2901  cytochrome-c oxidase  45.89 
 
 
535 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3281  cytochrome c oxidase, subunit I  43.21 
 
 
593 aa  453  1.0000000000000001e-126  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2846  cytochrome-c oxidase  45.86 
 
 
535 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.591708  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4113  cytochrome c oxidase, subunit I  44.44 
 
 
531 aa  450  1e-125  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4181  cytochrome c oxidase subunit I type  44.44 
 
 
530 aa  449  1e-125  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0827  cytochrome c oxidase, subunit I  44.47 
 
 
540 aa  450  1e-125  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.541437  normal  0.274424 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4312  cytochrome c oxidase, subunit I  44.44 
 
 
530 aa  449  1e-125  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0895  cytochrome c oxidase subunit I type  47.06 
 
 
561 aa  450  1e-125  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.822333  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0622  cytochrome c oxidase, subunit I  46.52 
 
 
519 aa  449  1e-125  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000132617  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0153  cytochrome-c oxidase  44.44 
 
 
530 aa  449  1e-125  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>