More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_05001 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4072  cytochrome c oxidase, subunit I  60.63 
 
 
560 aa  679    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05071  cytochrome c oxidase, subunit I  95.18 
 
 
539 aa  1045    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1776  cytochrome c oxidase, subunit I  88.62 
 
 
546 aa  983    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0568  cytochrome c oxidase, subunit I  60.57 
 
 
555 aa  673    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04991  cytochrome c oxidase, subunit I  88.43 
 
 
546 aa  983    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.217716 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06411  cytochrome c oxidase, subunit I  85.42 
 
 
558 aa  952    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.113459 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0447  cytochrome c oxidase, subunit I  60.23 
 
 
559 aa  643    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.130684 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0529  cytochrome c oxidase, subunit I  59.93 
 
 
575 aa  667    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1755  cytochrome-c oxidase  85.19 
 
 
556 aa  949    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.900369  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0607  cytochrome-c oxidase  86.33 
 
 
555 aa  952    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04691  cytochrome c oxidase, subunit I  98.89 
 
 
541 aa  1078    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0444  cytochrome c oxidase, subunit I  97.41 
 
 
541 aa  1067    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2603  cytochrome-c oxidase  66.73 
 
 
541 aa  758    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.240231 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1212  cytochrome c oxidase, subunit I  62.22 
 
 
587 aa  704    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0585  cytochrome c oxidase, subunit I  60.57 
 
 
555 aa  673    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04421  cytochrome c oxidase, subunit I  87.27 
 
 
552 aa  973    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2640  cytochrome c oxidase subunit I  59.25 
 
 
548 aa  663    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05001  cytochrome c oxidase, subunit I  100 
 
 
541 aa  1089    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3574  cytochrome c oxidase subunit I  60.38 
 
 
564 aa  661    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1778  cytochrome-c oxidase  58.77 
 
 
590 aa  665    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.307573  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3957  cytochrome c oxidase, subunit I  59.42 
 
 
553 aa  630  1e-179  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0277  cytochrome-c oxidase  53.53 
 
 
562 aa  599  1e-170  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0513618 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0178  cytochrome c oxidase, subunit I  52.8 
 
 
559 aa  591  1e-167  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.942874  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3659  cytochrome c oxidase  51.48 
 
 
555 aa  589  1e-167  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3140  Cytochrome-c oxidase  51.57 
 
 
565 aa  585  1e-166  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4299  cytochrome c oxidase, subunit I  52.47 
 
 
555 aa  583  1.0000000000000001e-165  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00437809  normal 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5317  cytochrome c oxidase  50.28 
 
 
554 aa  558  1e-157  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3576  cytochrome c oxidase, subunit I  50.19 
 
 
553 aa  550  1e-155  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0128043 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1902  Cytochrome-c oxidase  48.5 
 
 
638 aa  531  1e-150  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.96615  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0980  cytochrome-c oxidase  50.57 
 
 
562 aa  527  1e-148  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0678468  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12641  cytochrome c oxidase subunit I  51.75 
 
 
563 aa  514  1e-144  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0105  cytochrome c oxidase subunit I type  49.32 
 
 
615 aa  505  9.999999999999999e-143  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0363  cytochrome C oxidase polypeptide I  47.71 
 
 
534 aa  474  1e-132  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1521  cytochrome c oxidase, subunit I  45.12 
 
 
552 aa  473  1e-132  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.999426  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0989  cytochrome c oxidase, subunit I  47.16 
 
 
596 aa  469  1.0000000000000001e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1823  cytochrome c oxidase, subunit I  45.09 
 
 
563 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0545  cytochrome c oxidase, subunit I  46.76 
 
 
537 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4170  cytochrome-c oxidase  46.76 
 
 
537 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.751334 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2198  cytochrome c oxidase, subunit I  47.85 
 
 
589 aa  467  9.999999999999999e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.552552  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1687  cytochrome c oxidase, subunit I  45.2 
 
 
590 aa  463  1e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.418885  normal  0.0786402 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3196  cytochrome c oxidase, subunit I  45.3 
 
 
535 aa  464  1e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1423  cytochrome c oxidase, subunit I  45.3 
 
 
535 aa  464  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2857  cytochrome c oxidase, subunit I  46.72 
 
 
535 aa  465  1e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.978045  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0508  cytochrome c oxidase, subunit I  45.3 
 
 
535 aa  464  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0673  cytochrome c oxidase polypeptide I  45.3 
 
 
535 aa  464  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0425547  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1245  cytochrome c oxidase  44.77 
 
 
535 aa  462  1e-129  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6175  cytochrome-c oxidase  46.72 
 
 
535 aa  463  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0427  cytochrome c oxidase, subunit I  45.11 
 
 
535 aa  464  1e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2850  cytochrome c oxidase, subunit I  45.3 
 
 
535 aa  464  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0457  cytochrome c oxidase, subunit I  45.3 
 
 
535 aa  465  1e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0169  cytochrome c oxidase, subunit I  45.3 
 
 
535 aa  462  1e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.98257  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1909  cytochrome c oxidase, subunit I  47.29 
 
 
566 aa  462  1e-129  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0490  cytochrome c oxidase, subunit I  45.3 
 
 
535 aa  464  1e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.428765  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2232  cytochrome-c oxidase  46.53 
 
 
535 aa  463  1e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2763  cytochrome c oxidase, subunit I  46.53 
 
 
535 aa  463  1e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.281014  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0895  cytochrome c oxidase subunit I type  46.2 
 
 
561 aa  463  1e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.822333  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0277  cytochrome c oxidase, subunit I  46.56 
 
 
537 aa  464  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2901  cytochrome-c oxidase  46.72 
 
 
535 aa  464  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3281  cytochrome c oxidase, subunit I  44.98 
 
 
593 aa  462  1e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2846  cytochrome-c oxidase  46.72 
 
 
535 aa  465  1e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.591708  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3140  cytochrome-c oxidase  47.24 
 
 
582 aa  464  1e-129  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3557  cytochrome c oxidase subunit I type  46.34 
 
 
641 aa  461  9.999999999999999e-129  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0739643 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2264  cytochrome-c oxidase  46.69 
 
 
641 aa  462  9.999999999999999e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2957  Cytochrome-c oxidase  42.78 
 
 
585 aa  459  9.999999999999999e-129  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1886  cytochrome c oxidase, subunit I  47.94 
 
 
594 aa  461  9.999999999999999e-129  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00704167 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0219  cytochrome c oxidase, subunit I  47.71 
 
 
534 aa  459  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.886427 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2942  cytochrome c oxidase, subunit I  44.32 
 
 
581 aa  459  9.999999999999999e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03470  cytochrome c oxidase, subunit I  44.63 
 
 
588 aa  457  1e-127  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0238  cytochrome c oxidase, subunit I  47.33 
 
 
534 aa  458  1e-127  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0213097 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01010  cytochrome c oxidase, subunit I  45.4 
 
 
530 aa  455  1e-127  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.113343  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1452  cytochrome c oxidase, subunit I  47.31 
 
 
583 aa  456  1e-127  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0835225  normal  0.133355 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3649  cytochrome c oxidase, subunit I  45.91 
 
 
582 aa  457  1e-127  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000010381  normal  0.149508 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2622  cytochrome c oxidase, subunit I  45.11 
 
 
594 aa  457  1e-127  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4277  cytochrome-c oxidase  46.08 
 
 
580 aa  456  1e-127  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.415183  normal  0.622872 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0262  cytochrome c oxidase subunit I  46.78 
 
 
536 aa  458  1e-127  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29310  cytochrome c oxidase, subunit I  44.22 
 
 
594 aa  456  1e-127  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.426648 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0408  cytochrome-c oxidase  43.39 
 
 
542 aa  457  1e-127  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1517  cytochrome c oxidase subunit I  44.82 
 
 
572 aa  457  1e-127  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0873125  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4436  cytochrome-c oxidase  44.16 
 
 
545 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0196071  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6353  Cytochrome-c oxidase  48.8 
 
 
557 aa  452  1.0000000000000001e-126  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0569681  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0143  cytochrome-c oxidase  46.84 
 
 
527 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0880  cytochrome c oxidase, subunit I  45.78 
 
 
541 aa  451  1e-125  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3855  cytochrome c oxidase subunit I  46.83 
 
 
620 aa  449  1e-125  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3686  cytochrome c oxidase, subunit I  47.02 
 
 
620 aa  450  1e-125  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3703  cytochrome c oxidase, subunit I  47.02 
 
 
620 aa  450  1e-125  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0261  cytochrome c oxidase, subunit I  45.08 
 
 
542 aa  450  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.043486  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0326  cytochrome c oxidase subunit I  44.15 
 
 
526 aa  451  1e-125  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.283481  normal  0.0134906 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1939  cytochrome-c oxidase  45.45 
 
 
543 aa  449  1e-125  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0346979  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2420  cytochrome c oxidase, subunit I  44.59 
 
 
556 aa  451  1e-125  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.040842  normal  0.534979 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1776  cytochrome-c oxidase  47.57 
 
 
529 aa  449  1e-125  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.142128  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4391  cytochrome c oxidase, subunit I  45.33 
 
 
543 aa  450  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2493  cytochrome-c oxidase  46.04 
 
 
605 aa  449  1e-125  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.526922  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4061  cytochrome c oxidase, subunit I  46.83 
 
 
620 aa  449  1e-125  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1196  cytochrome-c oxidase  45.17 
 
 
592 aa  451  1e-125  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.843895  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2082  cytochrome-c oxidase  45.17 
 
 
581 aa  452  1e-125  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.460505  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1246  cytochrome-c oxidase  45.53 
 
 
544 aa  450  1e-125  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.871742  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5947  cytochrome c oxidase, subunit I  44.17 
 
 
554 aa  450  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2348  cytochrome c oxidase, subunit I  45.08 
 
 
542 aa  450  1e-125  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.056683  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4045  cytochrome c oxidase, subunit I  47.02 
 
 
620 aa  449  1e-125  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.505439  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0257  cytochrome-c oxidase  44.4 
 
 
531 aa  451  1e-125  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>