More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0980 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3140  Cytochrome-c oxidase  68.55 
 
 
565 aa  777    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0178  cytochrome c oxidase, subunit I  67.33 
 
 
559 aa  776    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.942874  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3576  cytochrome c oxidase, subunit I  56.61 
 
 
553 aa  637    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0128043 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4299  cytochrome c oxidase, subunit I  66.18 
 
 
555 aa  762    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00437809  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0980  cytochrome-c oxidase  100 
 
 
562 aa  1120    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0678468  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12641  cytochrome c oxidase subunit I  82.38 
 
 
563 aa  895    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3659  cytochrome c oxidase  66.23 
 
 
555 aa  753    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0277  cytochrome-c oxidase  66.54 
 
 
562 aa  767    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0513618 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5317  cytochrome c oxidase  59.12 
 
 
554 aa  658    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2603  cytochrome-c oxidase  54.78 
 
 
541 aa  594  1e-168  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.240231 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1212  cytochrome c oxidase, subunit I  54.6 
 
 
587 aa  592  1e-168  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0568  cytochrome c oxidase, subunit I  54.24 
 
 
555 aa  584  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0585  cytochrome c oxidase, subunit I  54.24 
 
 
555 aa  584  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4072  cytochrome c oxidase, subunit I  52.8 
 
 
560 aa  579  1e-164  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3574  cytochrome c oxidase subunit I  50.62 
 
 
564 aa  575  1.0000000000000001e-163  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0529  cytochrome c oxidase, subunit I  51.66 
 
 
575 aa  570  1e-161  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0447  cytochrome c oxidase, subunit I  52.43 
 
 
559 aa  563  1.0000000000000001e-159  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.130684 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2640  cytochrome c oxidase subunit I  51.18 
 
 
548 aa  560  1e-158  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1778  cytochrome-c oxidase  50.74 
 
 
590 aa  561  1e-158  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.307573  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0607  cytochrome-c oxidase  51.43 
 
 
555 aa  542  1e-153  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3957  cytochrome c oxidase, subunit I  52.1 
 
 
553 aa  544  1e-153  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06411  cytochrome c oxidase, subunit I  49.82 
 
 
558 aa  544  1e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.113459 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0444  cytochrome c oxidase, subunit I  50.38 
 
 
541 aa  539  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04691  cytochrome c oxidase, subunit I  50.76 
 
 
541 aa  540  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05071  cytochrome c oxidase, subunit I  50 
 
 
539 aa  540  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05001  cytochrome c oxidase, subunit I  50.57 
 
 
541 aa  541  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1776  cytochrome c oxidase, subunit I  49.72 
 
 
546 aa  535  1e-150  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04421  cytochrome c oxidase, subunit I  50 
 
 
552 aa  534  1e-150  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04991  cytochrome c oxidase, subunit I  49.72 
 
 
546 aa  534  1e-150  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.217716 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1755  cytochrome-c oxidase  50.86 
 
 
556 aa  533  1e-150  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.900369  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1902  Cytochrome-c oxidase  49.26 
 
 
638 aa  532  1e-150  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.96615  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0326  cytochrome c oxidase subunit I  47.49 
 
 
526 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.283481  normal  0.0134906 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0277  cytochrome c oxidase, subunit I  48.46 
 
 
537 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2198  cytochrome c oxidase, subunit I  46.95 
 
 
589 aa  462  1e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.552552  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3196  cytochrome c oxidase, subunit I  48.08 
 
 
535 aa  462  1e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2622  cytochrome c oxidase, subunit I  46.03 
 
 
594 aa  465  1e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0673  cytochrome c oxidase polypeptide I  48.08 
 
 
535 aa  462  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0425547  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1423  cytochrome c oxidase, subunit I  48.08 
 
 
535 aa  462  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0427  cytochrome c oxidase, subunit I  48.08 
 
 
535 aa  462  1e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2850  cytochrome c oxidase, subunit I  48.08 
 
 
535 aa  462  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1687  cytochrome c oxidase, subunit I  45.41 
 
 
590 aa  463  1e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.418885  normal  0.0786402 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0490  cytochrome c oxidase, subunit I  48.08 
 
 
535 aa  462  1e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.428765  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4170  cytochrome-c oxidase  47.88 
 
 
537 aa  462  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.751334 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0508  cytochrome c oxidase, subunit I  48.08 
 
 
535 aa  462  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0105  cytochrome c oxidase subunit I type  45.92 
 
 
615 aa  465  1e-129  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2857  cytochrome c oxidase, subunit I  47.77 
 
 
535 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.978045  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6175  cytochrome-c oxidase  47.77 
 
 
535 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2015  cytochrome c oxidase, subunit I  46.59 
 
 
574 aa  460  9.999999999999999e-129  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.466392  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1776  cytochrome-c oxidase  47.52 
 
 
529 aa  459  9.999999999999999e-129  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.142128  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0545  cytochrome c oxidase, subunit I  47.31 
 
 
537 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2232  cytochrome-c oxidase  47.77 
 
 
535 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0457  cytochrome c oxidase, subunit I  47.77 
 
 
535 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0169  cytochrome c oxidase, subunit I  47.88 
 
 
535 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.98257  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2901  cytochrome-c oxidase  47.77 
 
 
535 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2763  cytochrome c oxidase, subunit I  47.96 
 
 
535 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.281014  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2846  cytochrome-c oxidase  47.77 
 
 
535 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.591708  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0104  cytochrome c oxidase, subunit I  47.31 
 
 
529 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0543399  normal  0.340951 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0120  cytochrome c oxidase, subunit I  47.5 
 
 
529 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3649  cytochrome c oxidase, subunit I  45.64 
 
 
582 aa  457  1e-127  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000010381  normal  0.149508 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4391  cytochrome c oxidase, subunit I  46.21 
 
 
543 aa  455  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1886  cytochrome c oxidase, subunit I  45.99 
 
 
594 aa  456  1e-127  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00704167 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0294  cytochrome-c oxidase  47.49 
 
 
526 aa  456  1e-127  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00647712  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0123  cytochrome c oxidase, subunit I  47.6 
 
 
529 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0363  cytochrome C oxidase polypeptide I  47.27 
 
 
534 aa  455  1.0000000000000001e-126  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03470  cytochrome c oxidase, subunit I  45.09 
 
 
588 aa  455  1.0000000000000001e-126  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0118  cytochrome c oxidase, subunit I  47.4 
 
 
529 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0122351 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0181  cytochrome c oxidase subunit I  47.31 
 
 
530 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0989  cytochrome c oxidase, subunit I  45.44 
 
 
596 aa  455  1.0000000000000001e-126  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1246  cytochrome-c oxidase  47 
 
 
544 aa  455  1.0000000000000001e-126  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.871742  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1909  cytochrome c oxidase, subunit I  45.05 
 
 
566 aa  453  1.0000000000000001e-126  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3281  cytochrome c oxidase, subunit I  45.57 
 
 
593 aa  453  1.0000000000000001e-126  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1517  cytochrome c oxidase subunit I  44.88 
 
 
572 aa  454  1.0000000000000001e-126  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0873125  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2942  cytochrome c oxidase, subunit I  45.05 
 
 
581 aa  452  1.0000000000000001e-126  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01300  cytochrome c oxidase, subunit I  47.5 
 
 
530 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.324911  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1452  cytochrome c oxidase, subunit I  44.56 
 
 
583 aa  454  1.0000000000000001e-126  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0835225  normal  0.133355 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15640  cytochrome c oxidase, subunit I  44.78 
 
 
595 aa  451  1e-125  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.315417  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0078  cytochrome-c oxidase  46.91 
 
 
530 aa  452  1e-125  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2493  cytochrome-c oxidase  45.13 
 
 
605 aa  449  1e-125  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.526922  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1681  cytochrome-c oxidase  47.17 
 
 
539 aa  450  1e-125  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.793322  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3140  cytochrome-c oxidase  46.33 
 
 
582 aa  451  1e-125  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3536  cytochrome-c oxidase  45.9 
 
 
544 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2859  cytochrome c oxidase, subunit I  45.51 
 
 
544 aa  445  1.0000000000000001e-124  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.605233  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0124  cytochrome-c oxidase  45.99 
 
 
536 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0881  cytochrome-c oxidase  45.06 
 
 
560 aa  448  1.0000000000000001e-124  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1016  cytochrome-c oxidase  46.07 
 
 
563 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0219  cytochrome c oxidase, subunit I  47.07 
 
 
534 aa  448  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.886427 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0037  cytochrome-c oxidase  45.42 
 
 
516 aa  448  1.0000000000000001e-124  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.857978 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0879  cytochrome-c oxidase  46.6 
 
 
544 aa  445  1.0000000000000001e-124  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1668  cytochrome c oxidase, subunit I  44.46 
 
 
580 aa  446  1.0000000000000001e-124  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.136706  normal  0.0936951 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1675  cytochrome c oxidase, subunit I  45.42 
 
 
556 aa  447  1.0000000000000001e-124  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29310  cytochrome c oxidase, subunit I  45.08 
 
 
594 aa  446  1.0000000000000001e-124  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.426648 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1381  cytochrome-c oxidase  45.99 
 
 
543 aa  447  1.0000000000000001e-124  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.442131  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0895  cytochrome c oxidase subunit I type  45.32 
 
 
561 aa  447  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.822333  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0238  cytochrome c oxidase, subunit I  46.88 
 
 
534 aa  448  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0213097 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1823  cytochrome c oxidase, subunit I  43.56 
 
 
563 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0177  cytochrome c oxidase, subunit I  44.34 
 
 
540 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3180  cytochrome-c oxidase  46.08 
 
 
539 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.462772  normal  0.644585 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3906  cytochrome-c oxidase  45.51 
 
 
547 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.701239  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0235  cytochrome c oxidase, subunit I  46.22 
 
 
540 aa  444  1e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4113  cytochrome c oxidase, subunit I  44.23 
 
 
531 aa  444  1e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>