More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2603 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_06411  cytochrome c oxidase, subunit I  66.73 
 
 
558 aa  752    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.113459 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05071  cytochrome c oxidase, subunit I  66.48 
 
 
539 aa  746    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05001  cytochrome c oxidase, subunit I  66.73 
 
 
541 aa  758    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1776  cytochrome c oxidase, subunit I  65.06 
 
 
546 aa  744    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04691  cytochrome c oxidase, subunit I  66.73 
 
 
541 aa  758    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0447  cytochrome c oxidase, subunit I  64.17 
 
 
559 aa  722    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.130684 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0529  cytochrome c oxidase, subunit I  70.07 
 
 
575 aa  780    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3957  cytochrome c oxidase, subunit I  64.79 
 
 
553 aa  700    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1755  cytochrome-c oxidase  67.85 
 
 
556 aa  753    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.900369  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0607  cytochrome-c oxidase  68.63 
 
 
555 aa  753    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0444  cytochrome c oxidase, subunit I  66.54 
 
 
541 aa  755    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2603  cytochrome-c oxidase  100 
 
 
541 aa  1078    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.240231 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2640  cytochrome c oxidase subunit I  64.78 
 
 
548 aa  725    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3574  cytochrome c oxidase subunit I  69.93 
 
 
564 aa  776    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4072  cytochrome c oxidase, subunit I  67.41 
 
 
560 aa  745    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1212  cytochrome c oxidase, subunit I  72.12 
 
 
587 aa  808    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0568  cytochrome c oxidase, subunit I  69.45 
 
 
555 aa  748    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04421  cytochrome c oxidase, subunit I  66.42 
 
 
552 aa  754    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04991  cytochrome c oxidase, subunit I  65.06 
 
 
546 aa  745    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.217716 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0585  cytochrome c oxidase, subunit I  69.45 
 
 
555 aa  748    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1778  cytochrome-c oxidase  63.53 
 
 
590 aa  731    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.307573  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4299  cytochrome c oxidase, subunit I  56.8 
 
 
555 aa  630  1e-179  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00437809  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3140  Cytochrome-c oxidase  55.7 
 
 
565 aa  624  1e-177  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0277  cytochrome-c oxidase  55.04 
 
 
562 aa  621  1e-176  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0513618 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3659  cytochrome c oxidase  55.31 
 
 
555 aa  619  1e-176  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5317  cytochrome c oxidase  55.35 
 
 
554 aa  611  9.999999999999999e-175  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0178  cytochrome c oxidase, subunit I  54.66 
 
 
559 aa  614  9.999999999999999e-175  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.942874  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3576  cytochrome c oxidase, subunit I  55.27 
 
 
553 aa  597  1e-169  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0128043 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0980  cytochrome-c oxidase  54.78 
 
 
562 aa  582  1.0000000000000001e-165  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0678468  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1902  Cytochrome-c oxidase  52.57 
 
 
638 aa  552  1e-156  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.96615  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12641  cytochrome c oxidase subunit I  55.28 
 
 
563 aa  551  1e-155  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1909  cytochrome c oxidase, subunit I  50.19 
 
 
566 aa  518  1e-146  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0105  cytochrome c oxidase subunit I type  48.36 
 
 
615 aa  509  1e-143  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0408  cytochrome-c oxidase  46.76 
 
 
542 aa  492  9.999999999999999e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3557  cytochrome c oxidase subunit I type  50.19 
 
 
641 aa  491  1e-137  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0739643 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0363  cytochrome C oxidase polypeptide I  49.22 
 
 
534 aa  488  1e-136  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0235  cytochrome c oxidase, subunit I  48.09 
 
 
540 aa  483  1e-135  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4647  cytochrome c oxidase subunit I type  49.32 
 
 
540 aa  483  1e-135  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.608702  normal  0.13111 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1823  cytochrome c oxidase, subunit I  48.51 
 
 
563 aa  482  1e-135  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1246  cytochrome-c oxidase  48.36 
 
 
544 aa  482  1e-135  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.871742  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4170  cytochrome-c oxidase  49.03 
 
 
537 aa  482  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.751334 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3643  cytochrome-c oxidase  50.68 
 
 
534 aa  483  1e-135  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2264  cytochrome-c oxidase  50.19 
 
 
641 aa  485  1e-135  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0277  cytochrome c oxidase, subunit I  49.23 
 
 
537 aa  484  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04020  cytochrome c oxidase, subunit I  49.24 
 
 
534 aa  482  1e-135  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4391  cytochrome c oxidase, subunit I  47.56 
 
 
543 aa  481  1e-134  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0545  cytochrome c oxidase, subunit I  48.65 
 
 
537 aa  480  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3196  cytochrome c oxidase, subunit I  48.26 
 
 
535 aa  481  1e-134  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0326  cytochrome c oxidase subunit I  48.71 
 
 
526 aa  481  1e-134  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.283481  normal  0.0134906 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2850  cytochrome c oxidase, subunit I  48.26 
 
 
535 aa  481  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0673  cytochrome c oxidase polypeptide I  48.26 
 
 
535 aa  481  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0425547  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0427  cytochrome c oxidase, subunit I  48.07 
 
 
535 aa  481  1e-134  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1423  cytochrome c oxidase, subunit I  48.26 
 
 
535 aa  481  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0169  cytochrome c oxidase, subunit I  48.26 
 
 
535 aa  481  1e-134  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.98257  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4788  cytochrome-c oxidase  50 
 
 
540 aa  480  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0670  cytochrome c oxidase subunit I type  50.58 
 
 
535 aa  480  1e-134  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.154602  normal  0.969161 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0508  cytochrome c oxidase, subunit I  48.26 
 
 
535 aa  481  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0490  cytochrome c oxidase, subunit I  48.26 
 
 
535 aa  481  1e-134  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.428765  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0177  cytochrome c oxidase, subunit I  46.64 
 
 
540 aa  481  1e-134  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1939  cytochrome-c oxidase  49.4 
 
 
543 aa  475  1e-133  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0346979  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0900  cytochrome c oxidase, subunit I  50.1 
 
 
541 aa  476  1e-133  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0552276  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2763  cytochrome c oxidase, subunit I  48.32 
 
 
535 aa  476  1e-133  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.281014  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2957  Cytochrome-c oxidase  44.7 
 
 
585 aa  477  1e-133  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0457  cytochrome c oxidase, subunit I  47.68 
 
 
535 aa  476  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3906  cytochrome-c oxidase  47.53 
 
 
547 aa  473  1e-132  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.701239  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2198  cytochrome c oxidase, subunit I  50 
 
 
589 aa  472  1e-132  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.552552  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0879  cytochrome-c oxidase  47.97 
 
 
544 aa  473  1e-132  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1644  cytochrome c oxidase, subunit I  47.22 
 
 
535 aa  474  1e-132  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.336541  normal  0.908171 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0124  cytochrome-c oxidase  46.89 
 
 
536 aa  474  1e-132  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6175  cytochrome-c oxidase  48.13 
 
 
535 aa  474  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1381  cytochrome-c oxidase  47.25 
 
 
543 aa  474  1e-132  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.442131  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2857  cytochrome c oxidase, subunit I  48.13 
 
 
535 aa  474  1e-132  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.978045  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0197  cytochrome-c oxidase  48.17 
 
 
534 aa  472  1e-132  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0262  cytochrome c oxidase subunit I  48.24 
 
 
536 aa  474  1e-132  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2232  cytochrome-c oxidase  47.93 
 
 
535 aa  473  1e-132  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0143  cytochrome-c oxidase  47.58 
 
 
527 aa  474  1e-132  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0294  cytochrome-c oxidase  49.5 
 
 
526 aa  472  1e-132  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00647712  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2901  cytochrome-c oxidase  48.13 
 
 
535 aa  474  1e-132  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2622  cytochrome c oxidase, subunit I  47.91 
 
 
594 aa  474  1e-132  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2846  cytochrome-c oxidase  48.13 
 
 
535 aa  474  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.591708  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0311  cytochrome c oxidase, subunit I  49.8 
 
 
535 aa  474  1e-132  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.1094 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0880  cytochrome c oxidase, subunit I  48.1 
 
 
541 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0729  cytochrome c oxidase, subunit I  45.34 
 
 
555 aa  468  1.0000000000000001e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.484854  normal  0.0785351 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1675  cytochrome c oxidase, subunit I  47.15 
 
 
556 aa  471  1.0000000000000001e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0219  cytochrome c oxidase, subunit I  48.18 
 
 
534 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.886427 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0989  cytochrome c oxidase, subunit I  48.63 
 
 
596 aa  469  1.0000000000000001e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0063  cytochrome-c oxidase  46.15 
 
 
527 aa  471  1.0000000000000001e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4181  cytochrome c oxidase subunit I type  47.88 
 
 
530 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1776  cytochrome-c oxidase  49.15 
 
 
529 aa  471  1.0000000000000001e-131  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.142128  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3484  cytochrome-c oxidase  46.18 
 
 
531 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.139839 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3180  cytochrome-c oxidase  47.86 
 
 
539 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.462772  normal  0.644585 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1681  cytochrome-c oxidase  47.09 
 
 
539 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.793322  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0829  cytochrome c oxidase, subunit I  48.4 
 
 
537 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.12188  normal  0.348177 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0238  cytochrome c oxidase, subunit I  48.18 
 
 
534 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0213097 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0153  cytochrome-c oxidase  47.88 
 
 
530 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4113  cytochrome c oxidase, subunit I  47.88 
 
 
531 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0261  cytochrome c oxidase, subunit I  46.1 
 
 
542 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.043486  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3792  cytochrome-c oxidase  47.68 
 
 
530 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0257  cytochrome-c oxidase  47.47 
 
 
531 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4312  cytochrome c oxidase, subunit I  47.88 
 
 
530 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>