More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0143 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_3557  cytochrome-c oxidase  67.7 
 
 		 569 aa  706    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0159482  normal  0.969865 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0104  cytochrome c oxidase, subunit I  92.19 
 
 		 529 aa  955    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0543399  normal  0.340951 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0063  cytochrome-c oxidase  87.67 
 
 		 527 aa  946    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0880  cytochrome c oxidase, subunit I  73.54 
 
 		 541 aa  786    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2859  cytochrome c oxidase, subunit I  68.88 
 
 		 544 aa  727    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.605233  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0363  cytochrome C oxidase polypeptide I  69.79 
 
 		 534 aa  744    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0123  cytochrome c oxidase, subunit I  90.74 
 
 		 529 aa  956    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2850  cytochrome c oxidase, subunit I  71.81 
 
 		 535 aa  756    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0235  cytochrome c oxidase, subunit I  75.76 
 
 		 540 aa  835    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4607  cytochrome c oxidase, subunit I  78.85 
 
 		 530 aa  866    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0124  cytochrome-c oxidase  78.03 
 
 		 536 aa  855    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4312  cytochrome c oxidase, subunit I  79.23 
 
 		 530 aa  868    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3196  cytochrome c oxidase, subunit I  71.81 
 
 		 535 aa  756    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2961  cytochrome c oxidase, subunit I  71 
 
 		 538 aa  793    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2810  cytochrome c oxidase, subunit I  71 
 
 		 538 aa  793    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1470  cytochrome c oxidase, subunit I  59.55 
 
 		 531 aa  646    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3783  cytochrome-c oxidase  79.19 
 
 		 530 aa  867    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001446  cytochrome c oxidase polypeptide I  75.53 
 
 		 543 aa  814    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.523828  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0169  cytochrome c oxidase, subunit I  71.62 
 
 		 535 aa  753    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.98257  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4181  cytochrome c oxidase subunit I type  79.23 
 
 		 530 aa  868    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0315  cytochrome-c oxidase  68.82 
 
 		 534 aa  701    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0775832  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0545  cytochrome c oxidase, subunit I  70.91 
 
 		 537 aa  749    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0326  cytochrome c oxidase subunit I  71.46 
 
 		 526 aa  779    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.283481  normal  0.0134906 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4113  cytochrome c oxidase, subunit I  79.23 
 
 		 531 aa  869    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0238  cytochrome c oxidase, subunit I  69.98 
 
 		 534 aa  736    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0213097 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1381  cytochrome-c oxidase  68.72 
 
 		 543 aa  744    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.442131  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1675  cytochrome c oxidase, subunit I  69.47 
 
 		 556 aa  732    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0490  cytochrome c oxidase, subunit I  71.81 
 
 		 535 aa  756    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.428765  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0118  cytochrome c oxidase, subunit I  90.74 
 
 		 529 aa  957    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0122351 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0673  cytochrome c oxidase polypeptide I  71.81 
 
 		 535 aa  756    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0425547  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2716  cytochrome c oxidase, subunit I CyoB  74.08 
 
 		 534 aa  806    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.308543 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1593  cytochrome c oxidase polypeptide I  63.96 
 
 		 531 aa  707    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.195458  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3046  cytochrome c oxidase  66.23 
 
 		 532 aa  713    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000491174  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0078  cytochrome-c oxidase  92.19 
 
 		 530 aa  962    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0177  cytochrome c oxidase, subunit I  78.35 
 
 		 540 aa  860    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04020  cytochrome c oxidase, subunit I  71.07 
 
 		 534 aa  745    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6175  cytochrome-c oxidase  72.12 
 
 		 535 aa  741    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1644  cytochrome c oxidase, subunit I  66.73 
 
 		 535 aa  723    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.336541  normal  0.908171 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0120  cytochrome c oxidase, subunit I  92.38 
 
 		 529 aa  956    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1423  cytochrome c oxidase, subunit I  71.81 
 
 		 535 aa  756    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0197  cytochrome-c oxidase  79.14 
 
 		 534 aa  854    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4391  cytochrome c oxidase, subunit I  68.1 
 
 		 543 aa  735    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4000  cytochrome c oxidase subunit I type  79.53 
 
 		 534 aa  857    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0457  cytochrome c oxidase, subunit I  71.43 
 
 		 535 aa  752    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0184  cytochrome-c oxidase  72.75 
 
 		 526 aa  759    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.169622  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3484  cytochrome-c oxidase  79.96 
 
 		 531 aa  874    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.139839 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1776  cytochrome-c oxidase  72.45 
 
 		 529 aa  778    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.142128  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0427  cytochrome c oxidase, subunit I  71.62 
 
 		 535 aa  756    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3536  cytochrome-c oxidase  69.47 
 
 		 544 aa  729    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0508  cytochrome c oxidase, subunit I  71.81 
 
 		 535 aa  756    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0112  cytochrome c oxidase, subunit I  64.31 
 
 		 524 aa  703    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0153  cytochrome-c oxidase  79.23 
 
 		 530 aa  868    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3819  cytochrome c oxidase, subunit I  68.31 
 
 		 544 aa  718    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.247666 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1039  cytochrome c oxidase, subunit I  76.45 
 
 		 536 aa  811    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2405  cytochrome c oxidase, subunit I  65.28 
 
 		 550 aa  734    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1681  cytochrome-c oxidase  67.29 
 
 		 539 aa  728    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.793322  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0037  cytochrome-c oxidase  84.05 
 
 		 516 aa  884    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.857978 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1246  cytochrome-c oxidase  68.28 
 
 		 544 aa  721    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.871742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3906  cytochrome-c oxidase  69.34 
 
 		 547 aa  732    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.701239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4170  cytochrome-c oxidase  71.29 
 
 		 537 aa  750    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.751334 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1939  cytochrome-c oxidase  69.08 
 
 		 543 aa  726    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0346979  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0879  cytochrome-c oxidase  67.25 
 
 		 544 aa  708    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3518  cytochrome-c oxidase  77.46 
 
 		 535 aa  855    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04012  cytochrome c oxidase, subunit I  75.73 
 
 		 537 aa  809    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0311  cytochrome c oxidase, subunit I  71.73 
 
 		 535 aa  754    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.1094 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0262  cytochrome c oxidase subunit I  69.41 
 
 		 536 aa  721    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0181  cytochrome c oxidase subunit I  91.89 
 
 		 530 aa  961    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0219  cytochrome c oxidase, subunit I  69.98 
 
 		 534 aa  736    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.886427 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2763  cytochrome c oxidase, subunit I  72.32 
 
 		 535 aa  739    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.281014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2232  cytochrome-c oxidase  71.93 
 
 		 535 aa  736    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3180  cytochrome-c oxidase  71.06 
 
 		 539 aa  737    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.462772  normal  0.644585 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06271  cytochrome c oxidase, subunit I  75.91 
 
 		 546 aa  833    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4245  cytochrome-c oxidase  75.68 
 
 		 532 aa  805    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.780618  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3010  Cytochrome-c oxidase  62.62 
 
 		 533 aa  695    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.656418  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0277  cytochrome c oxidase, subunit I  71.86 
 
 		 537 aa  753    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2857  cytochrome c oxidase, subunit I  72.12 
 
 		 535 aa  738    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.978045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3792  cytochrome-c oxidase  78.85 
 
 		 530 aa  867    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3865  cytochrome-c oxidase  78.65 
 
 		 530 aa  865    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0294  cytochrome-c oxidase  75 
 
 		 526 aa  805    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00647712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0257  cytochrome-c oxidase  77.88 
 
 		 531 aa  857    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01010  cytochrome c oxidase, subunit I  91.7 
 
 		 530 aa  978    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.113343  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2901  cytochrome-c oxidase  72.12 
 
 		 535 aa  738    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01300  cytochrome c oxidase, subunit I  92.26 
 
 		 530 aa  964    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.324911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0143  cytochrome-c oxidase  100 
 
 		 527 aa  1053    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2846  cytochrome-c oxidase  72.12 
 
 		 535 aa  738    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.591708  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3992  cytochrome c oxidase, subunit I  78.65 
 
 		 530 aa  864    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0137  cytochrome c oxidase, subunit I  63.96 
 
 		 531 aa  707    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2166  cytochrome-c oxidase  54.78 
 
 		 532 aa  572  1.0000000000000001e-162  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.655768  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0729  cytochrome c oxidase, subunit I  53.96 
 
 		 555 aa  571  1.0000000000000001e-162  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.484854  normal  0.0785351 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4788  cytochrome-c oxidase  56.07 
 
 		 540 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3643  cytochrome-c oxidase  56.17 
 
 		 534 aa  571  1.0000000000000001e-162  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0829  cytochrome c oxidase, subunit I  56.55 
 
 		 537 aa  566  1e-160  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.12188  normal  0.348177 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0900  cytochrome c oxidase, subunit I  57.14 
 
 		 541 aa  566  1e-160  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0552276  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0670  cytochrome c oxidase subunit I type  56.45 
 
 		 535 aa  560  1e-158  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.154602  normal  0.969161 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0032  cytochrome c oxidase, subunit I  56.6 
 
 		 542 aa  556  1e-157  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.616804 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0261  cytochrome c oxidase, subunit I  55.43 
 
 		 542 aa  555  1e-157  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.043486  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2348  cytochrome c oxidase, subunit I  55.24 
 
 		 542 aa  553  1e-156  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.056683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4587  cytochrome-c oxidase  58.11 
 
 		 541 aa  554  1e-156  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0148874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0603  cytochrome c oxidase, subunit I  54.8 
 
 		 565 aa  550  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0519  cytochrome c oxidase subunit I type  53.93 
 
 		 562 aa  550  1e-155  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>