More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3643 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002978  WD0301  cytochrome c oxidase, subunit I  62.88 
 
 		 516 aa  664    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.249737  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1238  cytochrome c oxidase, subunit I  72.76 
 
 		 554 aa  789    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.28366 
 
 
-
 
NC_004310  BR0468  cytochrome c oxidase, subunit I  71.4 
 
 		 552 aa  746    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3262  cytochrome c oxidase, subunit I  73.8 
 
 		 542 aa  769    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0582  cytochrome c oxidase subunit I type  70.49 
 
 		 552 aa  745    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.000068814  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0032  cytochrome c oxidase, subunit I  73.56 
 
 		 542 aa  768    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.616804 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0224  cytochrome c oxidase, subunit I  78.03 
 
 		 539 aa  808    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0762  cytochrome c oxidase, subunit I  78.03 
 
 		 539 aa  808    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.73829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4505  cytochrome c oxidase, subunit I  67.57 
 
 		 555 aa  712    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.651872 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0829  cytochrome c oxidase, subunit I  78.61 
 
 		 537 aa  850    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.12188  normal  0.348177 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0474  cytochrome c oxidase, subunit I  71.4 
 
 		 552 aa  766    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.186567  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1877  cytochrome c oxidase, aa3 type, subunit I  59.86 
 
 		 566 aa  649    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3876  cytochrome c oxidase, subunit I  67.46 
 
 		 562 aa  686    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.112326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0527  cytochrome-c oxidase  59.68 
 
 		 566 aa  648    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.164942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4647  cytochrome c oxidase subunit I type  75.38 
 
 		 540 aa  806    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.608702  normal  0.13111 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0729  cytochrome c oxidase, subunit I  69.58 
 
 		 555 aa  779    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.484854  normal  0.0785351 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0519  cytochrome c oxidase subunit I type  71.96 
 
 		 562 aa  748    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2166  cytochrome-c oxidase  64.43 
 
 		 532 aa  691    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.655768  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4587  cytochrome-c oxidase  79.77 
 
 		 541 aa  831    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0148874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0914  cytochrome-c oxidase  68.16 
 
 		 562 aa  697    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00560774  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1003  cytochrome c oxidase, subunit I  60.38 
 
 		 518 aa  642    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4788  cytochrome-c oxidase  80.04 
 
 		 540 aa  860    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0643  cytochrome c oxidase, subunit I  71.32 
 
 		 567 aa  757    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.365928 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0900  cytochrome c oxidase, subunit I  80.73 
 
 		 541 aa  853    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0552276  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2348  cytochrome c oxidase, subunit I  73.03 
 
 		 542 aa  780    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.056683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3586  cytochrome c oxidase, subunit I  73.8 
 
 		 542 aa  769    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.962782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0664  cytochrome-c oxidase  60.04 
 
 		 566 aa  650    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.182209  normal  0.0365903 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0815  cytochrome-c oxidase  79.38 
 
 		 541 aa  813    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0856305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0256  cytochrome-c oxidase  78.03 
 
 		 537 aa  803    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.262463  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3462  cytochrome-c oxidase  78.03 
 
 		 537 aa  803    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3643  cytochrome-c oxidase  100 
 
 		 534 aa  1066    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2291  cytochrome-c oxidase  59.93 
 
 		 552 aa  639    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.40554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1404  cytochrome-c oxidase  68.12 
 
 		 556 aa  688    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.29775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0670  cytochrome c oxidase subunit I type  76.54 
 
 		 535 aa  803    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.154602  normal  0.969161 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0742  cytochrome c oxidase, subunit I  72.05 
 
 		 550 aa  759    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0108973  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0261  cytochrome c oxidase, subunit I  72.85 
 
 		 542 aa  777    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.043486  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1041  cytochrome c oxidase subunit I  72.32 
 
 		 559 aa  780    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.286412  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3458  cytochrome c oxidase, subunit I  73.22 
 
 		 542 aa  763    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2233  cytochrome-c oxidase  69.72 
 
 		 544 aa  739    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.321922  hitchhiker  0.00969902 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0603  cytochrome c oxidase, subunit I  71.51 
 
 		 565 aa  758    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1938  cytochrome-c oxidase  61.71 
 
 		 558 aa  644    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.652657  normal  0.0264724 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3028  cytochrome-c oxidase  61.84 
 
 		 556 aa  640    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0622  cytochrome c oxidase, subunit I  57.77 
 
 		 519 aa  634  1e-180  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000132617  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2383  cytochrome c oxidase subunit 1  60 
 
 		 558 aa  631  1e-179  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0810  cytochrome-c oxidase  58.85 
 
 		 518 aa  620  1e-176  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0363  cytochrome C oxidase polypeptide I  58.82 
 
 		 534 aa  614  1e-175  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0238  cytochrome c oxidase, subunit I  58.65 
 
 		 534 aa  606  9.999999999999999e-173  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0213097 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0219  cytochrome c oxidase, subunit I  58.65 
 
 		 534 aa  606  9.999999999999999e-173  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.886427 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4391  cytochrome c oxidase, subunit I  57.33 
 
 		 543 aa  598  1e-170  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0427  cytochrome c oxidase, subunit I  56.8 
 
 		 535 aa  598  1e-170  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1246  cytochrome-c oxidase  57.98 
 
 		 544 aa  598  1e-170  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.871742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1423  cytochrome c oxidase, subunit I  56.98 
 
 		 535 aa  597  1e-169  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3196  cytochrome c oxidase, subunit I  56.98 
 
 		 535 aa  597  1e-169  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3536  cytochrome-c oxidase  58.43 
 
 		 544 aa  597  1e-169  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0508  cytochrome c oxidase, subunit I  56.98 
 
 		 535 aa  597  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2850  cytochrome c oxidase, subunit I  56.98 
 
 		 535 aa  597  1e-169  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1939  cytochrome-c oxidase  58.54 
 
 		 543 aa  597  1e-169  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0346979  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0673  cytochrome c oxidase polypeptide I  56.98 
 
 		 535 aa  597  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0425547  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2859  cytochrome c oxidase, subunit I  57.85 
 
 		 544 aa  596  1e-169  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.605233  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1681  cytochrome-c oxidase  56.23 
 
 		 539 aa  596  1e-169  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.793322  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0490  cytochrome c oxidase, subunit I  56.98 
 
 		 535 aa  597  1e-169  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.428765  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0457  cytochrome c oxidase, subunit I  56.61 
 
 		 535 aa  596  1e-169  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0326  cytochrome c oxidase subunit I  57.28 
 
 		 526 aa  592  1e-168  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.283481  normal  0.0134906 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0169  cytochrome c oxidase, subunit I  56.8 
 
 		 535 aa  594  1e-168  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.98257  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3819  cytochrome c oxidase, subunit I  58.19 
 
 		 544 aa  593  1e-168  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.247666 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1250  cytochrome-c oxidase  63.73 
 
 		 628 aa  593  1e-168  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.390629  normal  0.863457 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0277  cytochrome c oxidase, subunit I  57.25 
 
 		 537 aa  591  1e-168  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0879  cytochrome-c oxidase  57.9 
 
 		 544 aa  592  1e-168  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0137  cytochrome c oxidase, subunit I  55.64 
 
 		 531 aa  591  1e-167  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1644  cytochrome c oxidase, subunit I  56.61 
 
 		 535 aa  591  1e-167  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.336541  normal  0.908171 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1381  cytochrome-c oxidase  55.78 
 
 		 543 aa  588  1e-167  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.442131  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0545  cytochrome c oxidase, subunit I  57.44 
 
 		 537 aa  590  1e-167  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1593  cytochrome c oxidase polypeptide I  55.64 
 
 		 531 aa  591  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.195458  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0078  cytochrome-c oxidase  57.45 
 
 		 530 aa  588  1e-167  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3906  cytochrome-c oxidase  56.9 
 
 		 547 aa  589  1e-167  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.701239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4170  cytochrome-c oxidase  56.87 
 
 		 537 aa  588  1e-167  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.751334 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0112  cytochrome c oxidase, subunit I  56.17 
 
 		 524 aa  586  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1675  cytochrome c oxidase, subunit I  57.09 
 
 		 556 aa  588  1e-166  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0063  cytochrome-c oxidase  56.16 
 
 		 527 aa  587  1e-166  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0880  cytochrome c oxidase, subunit I  57.42 
 
 		 541 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2857  cytochrome c oxidase, subunit I  57.17 
 
 		 535 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.978045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0177  cytochrome c oxidase, subunit I  55.26 
 
 		 540 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0120  cytochrome c oxidase, subunit I  57.92 
 
 		 529 aa  581  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0262  cytochrome c oxidase subunit I  57.53 
 
 		 536 aa  584  1.0000000000000001e-165  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2763  cytochrome c oxidase, subunit I  57.36 
 
 		 535 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.281014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0118  cytochrome c oxidase, subunit I  58.11 
 
 		 529 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0122351 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2901  cytochrome-c oxidase  57.17 
 
 		 535 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2846  cytochrome-c oxidase  57.17 
 
 		 535 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.591708  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01010  cytochrome c oxidase, subunit I  56.36 
 
 		 530 aa  583  1.0000000000000001e-165  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.113343  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3557  cytochrome-c oxidase  56.06 
 
 		 569 aa  578  1e-164  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0159482  normal  0.969865 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0104  cytochrome c oxidase, subunit I  57.72 
 
 		 529 aa  581  1e-164  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0543399  normal  0.340951 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4607  cytochrome c oxidase, subunit I  55.39 
 
 		 530 aa  580  1e-164  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0181  cytochrome c oxidase subunit I  57.25 
 
 		 530 aa  581  1e-164  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4312  cytochrome c oxidase, subunit I  55.08 
 
 		 530 aa  578  1e-164  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6175  cytochrome-c oxidase  56.79 
 
 		 535 aa  580  1e-164  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0143  cytochrome-c oxidase  56.76 
 
 		 527 aa  580  1e-164  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4181  cytochrome c oxidase subunit I type  55.08 
 
 		 530 aa  578  1e-164  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2232  cytochrome-c oxidase  56.98 
 
 		 535 aa  581  1e-164  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3792  cytochrome-c oxidase  55.39 
 
 		 530 aa  578  1e-164  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01300  cytochrome c oxidase, subunit I  57.45 
 
 		 530 aa  580  1e-164  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.324911  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>