More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0043 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0219  cytochrome c oxidase, subunit I  76.62 
 
 		 541 aa  838    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0042  cytochrome c oxidase, subunit I  84.64 
 
 		 542 aa  886    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00140919 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1345  cytochrome-c oxidase  70.66 
 
 		 541 aa  733    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0187504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2526  caa3-type cytochrome c oxidase, subunit I  72.92 
 
 		 543 aa  744    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000123308  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0043  cytochrome c oxidase, subunit I  100 
 
 		 539 aa  1073    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0249  cytochrome c oxidase, subunit I  77.51 
 
 		 541 aa  857    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0038308  hitchhiker  0.00422313 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1823  cytochrome-c oxidase  68.04 
 
 		 543 aa  706    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0200006  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1541  cytochrome c oxidase, subunit I  67.76 
 
 		 539 aa  735    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0536  cytochrome c oxidase, subunit I  70.08 
 
 		 541 aa  761    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.091525 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0408  cytochrome-c oxidase  57.75 
 
 		 542 aa  632  1e-180  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0230  cytochrome c oxidase, subunit I  55.75 
 
 		 565 aa  592  1e-168  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.123434  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3990  cytochrome c oxidase, subunit I  58.32 
 
 		 564 aa  588  1e-167  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.74194  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1587  cytochrome c oxidase, subunit I  55.34 
 
 		 548 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1521  cytochrome c oxidase, subunit I  53.57 
 
 		 552 aa  575  1.0000000000000001e-163  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.999426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2420  cytochrome c oxidase, subunit I  54.01 
 
 		 556 aa  570  1e-161  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.040842  normal  0.534979 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2995  cytochrome-c oxidase  53.19 
 
 		 544 aa  567  1e-160  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0459294 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0025  cytochrome c oxidase, subunit I  51.54 
 
 		 563 aa  552  1e-156  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.785934 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4436  cytochrome-c oxidase  50.56 
 
 		 545 aa  554  1e-156  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0196071  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1245  cytochrome c oxidase  52.02 
 
 		 535 aa  549  1e-155  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0167  cytochrome c oxidase, subunit I  51.46 
 
 		 563 aa  548  1e-155  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.357082  normal  0.0110936 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0223  cytochrome c oxidase, subunit I  51.46 
 
 		 563 aa  547  1e-154  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.109955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0849  cytochrome c oxidase subunit I type  51.73 
 
 		 555 aa  547  1e-154  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5947  cytochrome c oxidase, subunit I  51.42 
 
 		 554 aa  545  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0856  cytochrome c oxidase, subunit I  50.84 
 
 		 554 aa  541  1e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0852  cytochrome c oxidase, subunit I  50.84 
 
 		 554 aa  541  1e-153  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.783048  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0827  cytochrome c oxidase, subunit I  51.51 
 
 		 540 aa  543  1e-153  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.541437  normal  0.274424 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0804  cytochrome-c oxidase  51.03 
 
 		 554 aa  540  9.999999999999999e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1037  cytochrome c oxidase, subunit I  51.06 
 
 		 558 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.107378 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6230  cytochrome c oxidase, subunit I  51.35 
 
 		 565 aa  535  1e-151  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.33684  normal  0.0324677 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6885  cytochrome c oxidase, subunit I  51.16 
 
 		 558 aa  529  1e-149  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4179  cytochrome c oxidase, subunit I  51.92 
 
 		 557 aa  526  1e-148  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.263418  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5816  cytochrome c oxidase, subunit I  49.08 
 
 		 558 aa  523  1e-147  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.099341  hitchhiker  0.00453601 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2274  cytochrome-c oxidase  54.05 
 
 		 554 aa  519  1e-146  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.413145  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1601  cytochrome c oxidase, subunit I  53.67 
 
 		 555 aa  505  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.171665  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1677  cytochrome c oxidase, subunit I  53.47 
 
 		 555 aa  503  1e-141  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2705  Cytochrome-c oxidase  49.23 
 
 		 528 aa  481  1e-135  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.388874 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1212  cytochrome c oxidase, subunit I  44.18 
 
 		 587 aa  478  1e-133  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0585  cytochrome c oxidase, subunit I  43.4 
 
 		 555 aa  459  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0568  cytochrome c oxidase, subunit I  43.4 
 
 		 555 aa  459  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0529  cytochrome c oxidase, subunit I  45.59 
 
 		 575 aa  454  1.0000000000000001e-126  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3574  cytochrome c oxidase subunit I  46.86 
 
 		 564 aa  453  1.0000000000000001e-126  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4072  cytochrome c oxidase, subunit I  44.04 
 
 		 560 aa  453  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2603  cytochrome-c oxidase  45.44 
 
 		 541 aa  451  1e-125  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.240231 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1902  Cytochrome-c oxidase  43.3 
 
 		 638 aa  448  1.0000000000000001e-124  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.96615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03470  cytochrome c oxidase, subunit I  45.01 
 
 		 588 aa  444  1e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0177  cytochrome c oxidase, subunit I  42.91 
 
 		 540 aa  443  1e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2198  cytochrome c oxidase, subunit I  45.58 
 
 		 589 aa  442  1e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.552552  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29310  cytochrome c oxidase, subunit I  45.02 
 
 		 594 aa  443  1e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.426648 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2640  cytochrome c oxidase subunit I  42.83 
 
 		 548 aa  439  9.999999999999999e-123  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2622  cytochrome c oxidase, subunit I  44.15 
 
 		 594 aa  441  9.999999999999999e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2071  cytochrome c oxidase, subunit I  44.42 
 
 		 661 aa  442  9.999999999999999e-123  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.619356 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1778  cytochrome-c oxidase  43.22 
 
 		 590 aa  441  9.999999999999999e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.307573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0124  cytochrome-c oxidase  42.72 
 
 		 536 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0363  cytochrome C oxidase polypeptide I  42.26 
 
 		 534 aa  436  1e-121  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0105  cytochrome c oxidase subunit I type  41.54 
 
 		 615 aa  437  1e-121  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3484  cytochrome-c oxidase  42.13 
 
 		 531 aa  436  1e-121  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.139839 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04991  cytochrome c oxidase, subunit I  41.65 
 
 		 546 aa  435  1e-121  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.217716 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1681  cytochrome-c oxidase  42.86 
 
 		 539 aa  436  1e-121  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.793322  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1452  cytochrome c oxidase, subunit I  45.11 
 
 		 583 aa  436  1e-121  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0835225  normal  0.133355 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3906  cytochrome-c oxidase  42.27 
 
 		 547 aa  436  1e-121  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.701239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0989  cytochrome c oxidase, subunit I  44.83 
 
 		 596 aa  438  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1016  cytochrome-c oxidase  44.23 
 
 		 563 aa  433  1e-120  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1776  cytochrome c oxidase, subunit I  41.65 
 
 		 546 aa  434  1e-120  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0447  cytochrome c oxidase, subunit I  42.91 
 
 		 559 aa  435  1e-120  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.130684 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15640  cytochrome c oxidase, subunit I  45.4 
 
 		 595 aa  433  1e-120  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.315417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06271  cytochrome c oxidase, subunit I  42.55 
 
 		 546 aa  435  1e-120  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3518  cytochrome-c oxidase  42.11 
 
 		 535 aa  433  1e-120  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0235  cytochrome c oxidase, subunit I  41.44 
 
 		 540 aa  429  1e-119  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0238  cytochrome c oxidase, subunit I  42.08 
 
 		 534 aa  429  1e-119  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0213097 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0063  cytochrome-c oxidase  42.66 
 
 		 527 aa  429  1e-119  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3196  cytochrome c oxidase, subunit I  42.52 
 
 		 535 aa  430  1e-119  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0490  cytochrome c oxidase, subunit I  42.52 
 
 		 535 aa  430  1e-119  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.428765  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3819  cytochrome c oxidase, subunit I  42.69 
 
 		 544 aa  429  1e-119  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.247666 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0673  cytochrome c oxidase polypeptide I  42.52 
 
 		 535 aa  430  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0425547  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4391  cytochrome c oxidase, subunit I  42.24 
 
 		 543 aa  429  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3659  cytochrome c oxidase  41.52 
 
 		 555 aa  429  1e-119  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0427  cytochrome c oxidase, subunit I  42.52 
 
 		 535 aa  431  1e-119  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2850  cytochrome c oxidase, subunit I  42.52 
 
 		 535 aa  430  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0197  cytochrome-c oxidase  42 
 
 		 534 aa  429  1e-119  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0508  cytochrome c oxidase, subunit I  42.52 
 
 		 535 aa  430  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3180  cytochrome-c oxidase  42.89 
 
 		 539 aa  429  1e-119  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.462772  normal  0.644585 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1423  cytochrome c oxidase, subunit I  42.52 
 
 		 535 aa  430  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1381  cytochrome-c oxidase  42.27 
 
 		 543 aa  429  1e-119  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.442131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1039  cytochrome c oxidase, subunit I  42.25 
 
 		 536 aa  429  1e-119  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2942  cytochrome c oxidase, subunit I  43.87 
 
 		 581 aa  429  1e-119  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2015  cytochrome c oxidase, subunit I  43.76 
 
 		 574 aa  431  1e-119  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.466392  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3792  cytochrome-c oxidase  41.48 
 
 		 530 aa  429  1e-119  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0880  cytochrome c oxidase, subunit I  41.45 
 
 		 541 aa  426  1e-118  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0153  cytochrome-c oxidase  41.37 
 
 		 530 aa  427  1e-118  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4113  cytochrome c oxidase, subunit I  41.37 
 
 		 531 aa  428  1e-118  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1675  cytochrome c oxidase, subunit I  42.27 
 
 		 556 aa  427  1e-118  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2859  cytochrome c oxidase, subunit I  42.07 
 
 		 544 aa  427  1e-118  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.605233  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4181  cytochrome c oxidase subunit I type  41.37 
 
 		 530 aa  427  1e-118  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0444  cytochrome c oxidase, subunit I  41.45 
 
 		 541 aa  426  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3557  cytochrome c oxidase subunit I type  42.02 
 
 		 641 aa  427  1e-118  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0739643 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3557  cytochrome-c oxidase  43.42 
 
 		 569 aa  426  1e-118  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0159482  normal  0.969865 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0257  cytochrome-c oxidase  42.35 
 
 		 531 aa  427  1e-118  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3992  cytochrome c oxidase, subunit I  41.29 
 
 		 530 aa  426  1e-118  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4312  cytochrome c oxidase, subunit I  41.37 
 
 		 530 aa  427  1e-118  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1196  cytochrome-c oxidase  45.58 
 
 		 592 aa  426  1e-118  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.843895  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>