More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2071 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_2071  cytochrome c oxidase, subunit I  100 
 
 
661 aa  1331    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.619356 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3990  cytochrome c oxidase, subunit I  53.38 
 
 
611 aa  639    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.819255  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1194  cytochrome c oxidase, subunit I  52.77 
 
 
620 aa  635    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3855  cytochrome c oxidase subunit I  53.26 
 
 
620 aa  639    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3686  cytochrome c oxidase, subunit I  53.09 
 
 
620 aa  638    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3703  cytochrome c oxidase, subunit I  53.09 
 
 
620 aa  638    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2645  cytochrome c oxidase subunit I type  53.05 
 
 
620 aa  635    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.260433  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4061  cytochrome c oxidase, subunit I  53.26 
 
 
620 aa  639    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4153  cytochrome c oxidase subunit I  53.38 
 
 
611 aa  639    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3958  cytochrome c oxidase, subunit I  53.09 
 
 
620 aa  638    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4045  cytochrome c oxidase, subunit I  52.77 
 
 
620 aa  635    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.505439  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2264  cytochrome-c oxidase  52.01 
 
 
641 aa  625  1e-178  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3769  cytochrome c oxidase subunit I type  53.38 
 
 
620 aa  624  1e-177  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0105  cytochrome c oxidase subunit I type  51.94 
 
 
615 aa  620  1e-176  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3557  cytochrome c oxidase subunit I type  50.89 
 
 
641 aa  618  1e-175  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0739643 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1856  cytochrome c oxidase, subunit I  54.1 
 
 
623 aa  617  1e-175  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0984  cytochrome c oxidase, subunit I  51.36 
 
 
619 aa  609  1e-173  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3522  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit I  47.37 
 
 
648 aa  557  1e-157  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0512  Cytochrome-c oxidase  46.94 
 
 
657 aa  543  1e-153  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.881127  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0590  cytochrome aa3 quinol oxidase subunit I  45.56 
 
 
644 aa  539  9.999999999999999e-153  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5490  cytochrome c oxidase, subunit I  45.88 
 
 
669 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.164888  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0459  cytochrome-c oxidase  46.25 
 
 
671 aa  532  1e-150  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2184  cytochrome-c oxidase  46.3 
 
 
679 aa  534  1e-150  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0453262 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2027  cytochrome c oxidase, subunit I  47.05 
 
 
678 aa  533  1e-150  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000053383 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0944  cytochrome C oxidase subunit I  47.81 
 
 
950 aa  530  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.358792  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0770  cytochrome c oxidase, subunit I/subunit III  47.81 
 
 
962 aa  530  1e-149  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0306921  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0782  cytochrome c oxidase, subunit III:cytochrome c oxidase, subunit I  47.63 
 
 
974 aa  529  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3541  cytochrome c oxidase, subunit I  50.58 
 
 
743 aa  530  1e-149  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0771  quinol oxidase, subunit I  45.23 
 
 
644 aa  526  1e-148  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.314385  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0757  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit I  45.23 
 
 
644 aa  525  1e-148  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00253783 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0080  putative cytochrome c oxidase subunit I  46.61 
 
 
680 aa  528  1e-148  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.150485  hitchhiker  0.00336295 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0617  cytochrome aa3 quinol oxidase subunit I  44.9 
 
 
644 aa  525  1e-148  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6573  cytochrome c oxidase, subunit I  42.34 
 
 
882 aa  528  1e-148  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0983225  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4601  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit I  45.23 
 
 
644 aa  528  1e-148  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.070169  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0668  quinol oxidase subunit I  45.23 
 
 
647 aa  525  1e-147  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0612  quinol oxidase, subunit 1 (cytochrome c oxidase, subunit I)  45.23 
 
 
647 aa  525  1e-147  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0613  quinol oxidase, subunit 1 (cytochrome c oxidase, subunit I)  45.23 
 
 
647 aa  525  1e-147  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.666796  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0702  quinol oxidase subunit I  45.23 
 
 
644 aa  525  1e-147  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0829  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit I  45.23 
 
 
644 aa  525  1e-147  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1293  cytochrome c oxidase, subunit I  43.7 
 
 
879 aa  523  1e-147  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0736  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit I  45.23 
 
 
644 aa  525  1e-147  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.283518  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6287  cytochrome c oxidase, subunit I  43.54 
 
 
879 aa  525  1e-147  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.171761  normal  0.0477153 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6538  cytochrome c oxidase, subunit I  43.7 
 
 
879 aa  523  1e-147  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6355  cytochrome c oxidase subunit I type  44.56 
 
 
635 aa  521  1e-146  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6145  cytochrome c oxidase, subunit I  43.37 
 
 
1004 aa  521  1e-146  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.564835  normal  0.440203 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1909  cytochrome c oxidase, subunit I  48.52 
 
 
566 aa  518  1.0000000000000001e-145  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5501  cytochrome c oxidase, subunit I  42.35 
 
 
876 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0931338 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5243  cytochrome c oxidase, subunit I  43.28 
 
 
637 aa  509  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.407043  normal  0.600413 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0645  quinol oxidase, subunit I  41.49 
 
 
662 aa  506  9.999999999999999e-143  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.162382  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3380  cytochrome c oxidase, subunit I  42.69 
 
 
650 aa  503  1e-141  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0659  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit I  43.68 
 
 
654 aa  500  1e-140  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2622  cytochrome c oxidase, subunit I  48.04 
 
 
594 aa  500  1e-140  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0989  cytochrome c oxidase, subunit I  47.39 
 
 
596 aa  496  1e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0095  cytochrome c oxidase, subunit I  43.55 
 
 
638 aa  497  1e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160377  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0895  cytochrome c oxidase subunit I type  46.8 
 
 
561 aa  492  9.999999999999999e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.822333  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29310  cytochrome c oxidase, subunit I  47.4 
 
 
594 aa  493  9.999999999999999e-139  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.426648 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1142  cytochrome aa3 quinol oxidase subunit I  41.4 
 
 
662 aa  494  9.999999999999999e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1119  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit I  41.4 
 
 
662 aa  494  9.999999999999999e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.220145  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3281  cytochrome c oxidase, subunit I  46.81 
 
 
593 aa  491  1e-137  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2198  cytochrome c oxidase, subunit I  48.02 
 
 
589 aa  490  1e-137  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.552552  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6353  Cytochrome-c oxidase  47.81 
 
 
557 aa  489  1e-137  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0569681  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2990  cytochrome c oxidase, subunit I  43.21 
 
 
638 aa  491  1e-137  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.155569  normal  0.0328949 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2942  cytochrome c oxidase, subunit I  47.25 
 
 
581 aa  488  1e-136  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2348  cytochrome c oxidase, subunit I  43.06 
 
 
638 aa  488  1e-136  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2015  cytochrome c oxidase, subunit I  47.23 
 
 
574 aa  488  1e-136  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.466392  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0696  cytochrome c oxidase, subunit I  40.73 
 
 
662 aa  488  1e-136  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5827  cytochrome c oxidase, subunit I  43.11 
 
 
635 aa  486  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1448  cytochrome-c oxidase  44.98 
 
 
631 aa  485  1e-135  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0923755 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3891  cytochrome c oxidase subunit I type  41.44 
 
 
853 aa  480  1e-134  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.561544  normal  0.116226 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1668  cytochrome c oxidase, subunit I  45.54 
 
 
580 aa  480  1e-134  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.136706  normal  0.0936951 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1823  cytochrome c oxidase, subunit I  45.84 
 
 
563 aa  479  1e-134  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5610  cytochrome-c oxidase  46.35 
 
 
584 aa  476  1e-133  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.546277 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0078  cytochrome-c oxidase  48.93 
 
 
530 aa  479  1e-133  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1901  cytochrome c oxidase, subunit I  48.99 
 
 
559 aa  476  1e-133  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0984776  normal  0.277007 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03470  cytochrome c oxidase, subunit I  48.69 
 
 
588 aa  478  1e-133  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4277  cytochrome-c oxidase  48.15 
 
 
580 aa  478  1e-133  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.415183  normal  0.622872 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3116  cytochrome-c oxidase  46.96 
 
 
560 aa  476  1e-133  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.605031 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3821  cytochrome-c oxidase  46.62 
 
 
609 aa  477  1e-133  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00155592  normal  0.0385819 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3258  Cytochrome c oxidase subunit I type  48.98 
 
 
588 aa  476  1e-133  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.170322 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16240  cytochrome c oxidase, subunit I  45.38 
 
 
603 aa  477  1e-133  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.0056616  normal  0.613337 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1452  cytochrome c oxidase, subunit I  47.61 
 
 
583 aa  478  1e-133  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0835225  normal  0.133355 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2082  cytochrome-c oxidase  47.59 
 
 
581 aa  474  1e-132  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.460505  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5377  cytochrome-c oxidase  48.33 
 
 
581 aa  475  1e-132  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2818  cytochrome-c oxidase  48.33 
 
 
581 aa  475  1e-132  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1886  cytochrome c oxidase, subunit I  46.68 
 
 
594 aa  474  1e-132  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00704167 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4391  cytochrome c oxidase, subunit I  48.36 
 
 
543 aa  475  1e-132  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0181  cytochrome c oxidase subunit I  48.54 
 
 
530 aa  474  1e-132  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12210  cytochrome c oxidase, subunit I  46.85 
 
 
551 aa  473  1e-132  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0161218  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3724  cytochrome c oxidase, subunit I  47.05 
 
 
602 aa  472  1e-132  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.189938  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13059  cytochrome C oxidase subunit I ctaD  46.77 
 
 
573 aa  472  1e-132  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0726164 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1381  cytochrome-c oxidase  47.88 
 
 
543 aa  473  1e-132  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.442131  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01300  cytochrome c oxidase, subunit I  48.34 
 
 
530 aa  473  1e-132  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.324911  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0490  cytochrome-c oxidase  48.04 
 
 
589 aa  475  1e-132  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.575526  normal  0.236102 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3140  cytochrome-c oxidase  47.07 
 
 
582 aa  474  1e-132  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0104  cytochrome c oxidase, subunit I  48.34 
 
 
529 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0543399  normal  0.340951 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0363  cytochrome C oxidase polypeptide I  48.73 
 
 
534 aa  472  1.0000000000000001e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0118  cytochrome c oxidase, subunit I  48.15 
 
 
529 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0122351 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1196  cytochrome-c oxidase  47.41 
 
 
592 aa  469  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.843895  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4865  cytochrome-c oxidase  47.37 
 
 
567 aa  471  1.0000000000000001e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5670  cytochrome-c oxidase  48.33 
 
 
581 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>