More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2027 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010557  BamMC406_6287  cytochrome c oxidase, subunit I  70.91 
 
 
879 aa  947    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.171761  normal  0.0477153 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3380  cytochrome c oxidase, subunit I  67.15 
 
 
650 aa  878    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2027  cytochrome c oxidase, subunit I  100 
 
 
678 aa  1349    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000053383 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0944  cytochrome C oxidase subunit I  72.61 
 
 
950 aa  922    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.358792  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5490  cytochrome c oxidase, subunit I  80.33 
 
 
669 aa  1101    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.164888  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0459  cytochrome-c oxidase  73.67 
 
 
671 aa  997    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0782  cytochrome c oxidase, subunit III:cytochrome c oxidase, subunit I  72.39 
 
 
974 aa  922    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6145  cytochrome c oxidase, subunit I  72.09 
 
 
1004 aa  947    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.564835  normal  0.440203 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2184  cytochrome-c oxidase  90.75 
 
 
679 aa  1228    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0453262 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0080  putative cytochrome c oxidase subunit I  92.21 
 
 
680 aa  1251    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.150485  hitchhiker  0.00336295 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0770  cytochrome c oxidase, subunit I/subunit III  72.61 
 
 
962 aa  922    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0306921  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1293  cytochrome c oxidase, subunit I  72.71 
 
 
879 aa  953    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5501  cytochrome c oxidase, subunit I  72 
 
 
876 aa  948    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0931338 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6573  cytochrome c oxidase, subunit I  71.25 
 
 
882 aa  944    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0983225  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6538  cytochrome c oxidase, subunit I  72.71 
 
 
879 aa  953    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1448  cytochrome-c oxidase  49.68 
 
 
631 aa  627  1e-178  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0923755 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0696  cytochrome c oxidase, subunit I  48.97 
 
 
662 aa  616  1e-175  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5827  cytochrome c oxidase, subunit I  48.47 
 
 
635 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6355  cytochrome c oxidase subunit I type  48.66 
 
 
635 aa  607  9.999999999999999e-173  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0105  cytochrome c oxidase subunit I type  52.8 
 
 
615 aa  599  1e-170  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2990  cytochrome c oxidase, subunit I  49.37 
 
 
638 aa  598  1e-169  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.155569  normal  0.0328949 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5243  cytochrome c oxidase, subunit I  47.04 
 
 
637 aa  596  1e-169  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.407043  normal  0.600413 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2348  cytochrome c oxidase, subunit I  48.81 
 
 
638 aa  592  1e-168  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11180  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  47.46 
 
 
835 aa  589  1e-167  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00773028  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0095  cytochrome c oxidase, subunit I  49.12 
 
 
638 aa  590  1e-167  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160377  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0168  putative cytochrome c oxidase subunit I  45.67 
 
 
877 aa  578  1.0000000000000001e-163  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.606404  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2267  cytochrome-c oxidase  46.98 
 
 
843 aa  575  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0715373  hitchhiker  0.007718 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4793  cytochrome c oxidase, subunit I  47.5 
 
 
874 aa  572  1e-161  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.153175  normal  0.530231 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2264  cytochrome-c oxidase  50.61 
 
 
641 aa  571  1e-161  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3557  cytochrome c oxidase subunit I type  48.55 
 
 
641 aa  570  1e-161  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0739643 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01476  putative cytochrome c oxidase subunit I  44.5 
 
 
835 aa  543  1e-153  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3891  cytochrome c oxidase subunit I type  46.67 
 
 
853 aa  543  1e-153  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.561544  normal  0.116226 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3850  cytochrome-c oxidase  46.11 
 
 
840 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.550588  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1909  cytochrome c oxidase, subunit I  49.26 
 
 
566 aa  533  1e-150  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0155  cytochrome-c oxidase  44.34 
 
 
841 aa  533  1e-150  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.479577  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4762  cytochrome c oxidase subunit I type  43.66 
 
 
840 aa  529  1e-149  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.28484 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2071  cytochrome c oxidase, subunit I  47.05 
 
 
661 aa  518  1.0000000000000001e-145  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.619356 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2791  cytochrome c oxidase, subunit I  45.52 
 
 
845 aa  511  1e-143  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3824  cytochrome-c oxidase  42.19 
 
 
825 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.961299 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3097  QoxA, quinol oxidase subunit I  42.35 
 
 
825 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.866737  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1992  cytochrome c oxidase, subunit I  44.86 
 
 
844 aa  506  9.999999999999999e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.394035  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2314  cytochrome c oxidase, subunit I  44.1 
 
 
839 aa  502  1e-141  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.162476  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1766  cytochrome c oxidase  40.45 
 
 
853 aa  502  1e-140  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00671331  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3669  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  42.42 
 
 
825 aa  496  1e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0157977  normal  0.798163 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0117  cytochrome c oxidase, subunit I  42.09 
 
 
857 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1753  cytochrome-c oxidase  41.46 
 
 
857 aa  489  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3541  cytochrome c oxidase, subunit I  47.61 
 
 
743 aa  483  1e-135  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1704  cytochrome c, monohaem  44.47 
 
 
878 aa  481  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1212  cytochrome c oxidase, subunit I  45.98 
 
 
587 aa  478  1e-133  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2493  cytochrome-c oxidase  44.43 
 
 
605 aa  476  1e-133  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.526922  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0989  cytochrome c oxidase, subunit I  46.11 
 
 
596 aa  468  9.999999999999999e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1452  cytochrome c oxidase, subunit I  46.41 
 
 
583 aa  468  9.999999999999999e-131  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0835225  normal  0.133355 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0490  cytochrome-c oxidase  46.86 
 
 
589 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.575526  normal  0.236102 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2198  cytochrome c oxidase, subunit I  45.79 
 
 
589 aa  468  9.999999999999999e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.552552  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0895  cytochrome c oxidase subunit I type  44.19 
 
 
561 aa  464  1e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.822333  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2942  cytochrome c oxidase, subunit I  45.05 
 
 
581 aa  465  1e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12210  cytochrome c oxidase, subunit I  44.24 
 
 
551 aa  461  9.999999999999999e-129  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0161218  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3686  cytochrome c oxidase, subunit I  41.92 
 
 
620 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3703  cytochrome c oxidase, subunit I  41.92 
 
 
620 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0529  cytochrome c oxidase, subunit I  45.03 
 
 
575 aa  461  9.999999999999999e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1668  cytochrome c oxidase, subunit I  45.65 
 
 
580 aa  460  9.999999999999999e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.136706  normal  0.0936951 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3649  cytochrome c oxidase, subunit I  43.92 
 
 
582 aa  461  9.999999999999999e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000010381  normal  0.149508 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2622  cytochrome c oxidase, subunit I  43.42 
 
 
594 aa  459  9.999999999999999e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1856  cytochrome c oxidase, subunit I  42.28 
 
 
623 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0590  cytochrome aa3 quinol oxidase subunit I  42.31 
 
 
644 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3958  cytochrome c oxidase, subunit I  41.92 
 
 
620 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29310  cytochrome c oxidase, subunit I  43.34 
 
 
594 aa  458  1e-127  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.426648 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3990  cytochrome c oxidase, subunit I  41.74 
 
 
611 aa  457  1e-127  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.819255  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3855  cytochrome c oxidase subunit I  41.74 
 
 
620 aa  458  1e-127  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3574  cytochrome c oxidase subunit I  44.28 
 
 
564 aa  456  1e-127  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4061  cytochrome c oxidase, subunit I  41.74 
 
 
620 aa  458  1e-127  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2645  cytochrome c oxidase subunit I type  44.08 
 
 
620 aa  456  1e-127  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.260433  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4045  cytochrome c oxidase, subunit I  41.92 
 
 
620 aa  457  1e-127  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.505439  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4153  cytochrome c oxidase subunit I  41.74 
 
 
611 aa  457  1e-127  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3821  cytochrome-c oxidase  43.84 
 
 
609 aa  456  1e-127  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00155592  normal  0.0385819 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2015  cytochrome c oxidase, subunit I  43.97 
 
 
574 aa  456  1e-127  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.466392  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0564  cytochrome c oxidase subunit I type  42.39 
 
 
840 aa  458  1e-127  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1823  cytochrome c oxidase, subunit I  43.31 
 
 
563 aa  457  1e-127  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1194  cytochrome c oxidase, subunit I  41.92 
 
 
620 aa  457  1e-127  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1802  cytochrome c oxidase subunit I type  44.75 
 
 
568 aa  455  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.115752 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2603  cytochrome-c oxidase  44.49 
 
 
541 aa  454  1.0000000000000001e-126  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.240231 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0617  cytochrome aa3 quinol oxidase subunit I  39.77 
 
 
644 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6353  Cytochrome-c oxidase  44.63 
 
 
557 aa  453  1.0000000000000001e-126  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0569681  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4601  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit I  42.13 
 
 
644 aa  452  1e-125  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.070169  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0659  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit I  39.47 
 
 
654 aa  452  1e-125  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0771  quinol oxidase, subunit I  41.94 
 
 
644 aa  451  1e-125  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.314385  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0668  quinol oxidase subunit I  42.13 
 
 
647 aa  452  1e-125  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0612  quinol oxidase, subunit 1 (cytochrome c oxidase, subunit I)  42.13 
 
 
647 aa  452  1e-125  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0613  quinol oxidase, subunit 1 (cytochrome c oxidase, subunit I)  42.13 
 
 
647 aa  452  1e-125  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.666796  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15640  cytochrome c oxidase, subunit I  41.58 
 
 
595 aa  451  1e-125  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.315417  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3522  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit I  40.24 
 
 
648 aa  449  1e-125  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0702  quinol oxidase subunit I  42.13 
 
 
644 aa  452  1e-125  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0736  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit I  42.13 
 
 
644 aa  451  1e-125  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.283518  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0957  cytochrome-c oxidase  45.59 
 
 
570 aa  451  1e-125  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.594307  normal  0.169668 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4072  cytochrome c oxidase, subunit I  44.19 
 
 
560 aa  450  1e-125  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3116  cytochrome-c oxidase  43.11 
 
 
560 aa  451  1e-125  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.605031 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0512  Cytochrome-c oxidase  42.05 
 
 
657 aa  451  1e-125  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.881127  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0829  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit I  42.13 
 
 
644 aa  452  1e-125  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0757  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit I  42.13 
 
 
644 aa  452  1e-125  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00253783 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1196  cytochrome-c oxidase  45.05 
 
 
592 aa  452  1e-125  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.843895  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>