More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3541 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3541  cytochrome c oxidase, subunit I  100 
 
 		 743 aa  1478    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0105  cytochrome c oxidase subunit I type  55.51 
 
 		 615 aa  617  1e-175  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2264  cytochrome-c oxidase  58.19 
 
 		 641 aa  601  1e-170  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3557  cytochrome c oxidase subunit I type  58.19 
 
 		 641 aa  599  1e-170  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0739643 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1909  cytochrome c oxidase, subunit I  52.04 
 
 		 566 aa  557  1e-157  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2071  cytochrome c oxidase, subunit I  50.58 
 
 		 661 aa  530  1e-149  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.619356 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6287  cytochrome c oxidase, subunit I  44.88 
 
 		 879 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.171761  normal  0.0477153 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5501  cytochrome c oxidase, subunit I  45.62 
 
 		 876 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0931338 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6573  cytochrome c oxidase, subunit I  45.56 
 
 		 882 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0983225  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3855  cytochrome c oxidase subunit I  48.14 
 
 		 620 aa  514  1e-144  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3686  cytochrome c oxidase, subunit I  48.33 
 
 		 620 aa  515  1e-144  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3703  cytochrome c oxidase, subunit I  48.33 
 
 		 620 aa  515  1e-144  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4061  cytochrome c oxidase, subunit I  47.96 
 
 		 620 aa  512  1e-144  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4045  cytochrome c oxidase, subunit I  48.33 
 
 		 620 aa  514  1e-144  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.505439  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4153  cytochrome c oxidase subunit I  48.14 
 
 		 611 aa  513  1e-144  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0459  cytochrome-c oxidase  47.42 
 
 		 671 aa  513  1e-144  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1293  cytochrome c oxidase, subunit I  45.23 
 
 		 879 aa  514  1e-144  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1194  cytochrome c oxidase, subunit I  48.33 
 
 		 620 aa  514  1e-144  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0984  cytochrome c oxidase, subunit I  52.62 
 
 		 619 aa  515  1e-144  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3958  cytochrome c oxidase, subunit I  48.33 
 
 		 620 aa  515  1e-144  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6538  cytochrome c oxidase, subunit I  45.23 
 
 		 879 aa  514  1e-144  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6145  cytochrome c oxidase, subunit I  45.07 
 
 		 1004 aa  509  1e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.564835  normal  0.440203 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3990  cytochrome c oxidase, subunit I  47.96 
 
 		 611 aa  512  1e-143  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.819255  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2645  cytochrome c oxidase subunit I type  47.58 
 
 		 620 aa  510  1e-143  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.260433  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1856  cytochrome c oxidase, subunit I  51.56 
 
 		 623 aa  509  1e-143  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1823  cytochrome c oxidase, subunit I  49.53 
 
 		 563 aa  508  9.999999999999999e-143  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0590  cytochrome aa3 quinol oxidase subunit I  46.21 
 
 		 644 aa  508  9.999999999999999e-143  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0944  cytochrome C oxidase subunit I  46.91 
 
 		 950 aa  503  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.358792  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0770  cytochrome c oxidase, subunit I/subunit III  46.91 
 
 		 962 aa  503  1e-141  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0306921  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0771  quinol oxidase, subunit I  47.27 
 
 		 644 aa  501  1e-140  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.314385  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0668  quinol oxidase subunit I  47.08 
 
 		 647 aa  499  1e-140  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0612  quinol oxidase, subunit 1 (cytochrome c oxidase, subunit I)  47.08 
 
 		 647 aa  499  1e-140  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0613  quinol oxidase, subunit 1 (cytochrome c oxidase, subunit I)  47.08 
 
 		 647 aa  499  1e-140  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.666796  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0782  cytochrome c oxidase, subunit III:cytochrome c oxidase, subunit I  46.73 
 
 		 974 aa  501  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0757  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit I  47.08 
 
 		 644 aa  499  1e-140  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00253783 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0702  quinol oxidase subunit I  47.08 
 
 		 644 aa  499  1e-140  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0829  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit I  47.08 
 
 		 644 aa  499  1e-140  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2184  cytochrome-c oxidase  43.67 
 
 		 679 aa  501  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0453262 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4601  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit I  47.08 
 
 		 644 aa  499  1e-140  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.070169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2027  cytochrome c oxidase, subunit I  47.61 
 
 		 678 aa  500  1e-140  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000053383 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0736  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit I  47.08 
 
 		 644 aa  498  1e-139  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.283518  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3769  cytochrome c oxidase subunit I type  48.14 
 
 		 620 aa  496  1e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6355  cytochrome c oxidase subunit I type  48.15 
 
 		 635 aa  497  1e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0080  putative cytochrome c oxidase subunit I  46.89 
 
 		 680 aa  498  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.150485  hitchhiker  0.00336295 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0696  cytochrome c oxidase, subunit I  44.7 
 
 		 662 aa  499  1e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5490  cytochrome c oxidase, subunit I  44.01 
 
 		 669 aa  498  1e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.164888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0617  cytochrome aa3 quinol oxidase subunit I  47.05 
 
 		 644 aa  495  9.999999999999999e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5243  cytochrome c oxidase, subunit I  43.94 
 
 		 637 aa  490  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.407043  normal  0.600413 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2990  cytochrome c oxidase, subunit I  48.44 
 
 		 638 aa  489  1e-137  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.155569  normal  0.0328949 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0512  Cytochrome-c oxidase  45.96 
 
 		 657 aa  490  1e-137  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.881127  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2348  cytochrome c oxidase, subunit I  45.32 
 
 		 638 aa  490  1e-137  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3522  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit I  48.83 
 
 		 648 aa  491  1e-137  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0095  cytochrome c oxidase, subunit I  47.96 
 
 		 638 aa  487  1e-136  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160377  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5827  cytochrome c oxidase, subunit I  44.03 
 
 		 635 aa  486  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0659  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit I  49.13 
 
 		 654 aa  486  1e-136  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3380  cytochrome c oxidase, subunit I  45.45 
 
 		 650 aa  488  1e-136  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1290  cytochrome c oxidase, subunit I  47.85 
 
 		 564 aa  484  1e-135  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.372246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01476  putative cytochrome c oxidase subunit I  43.8 
 
 		 835 aa  481  1e-134  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2198  cytochrome c oxidase, subunit I  45.5 
 
 		 589 aa  481  1e-134  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.552552  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4793  cytochrome c oxidase, subunit I  42.49 
 
 		 874 aa  476  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.153175  normal  0.530231 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0989  cytochrome c oxidase, subunit I  45.13 
 
 		 596 aa  477  1e-133  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0895  cytochrome c oxidase subunit I type  45.5 
 
 		 561 aa  478  1e-133  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.822333  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29310  cytochrome c oxidase, subunit I  45.85 
 
 		 594 aa  476  1e-133  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.426648 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2942  cytochrome c oxidase, subunit I  46.22 
 
 		 581 aa  473  1e-132  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11180  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  45.45 
 
 		 835 aa  473  1e-132  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00773028  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1452  cytochrome c oxidase, subunit I  47.53 
 
 		 583 aa  471  1.0000000000000001e-131  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0835225  normal  0.133355 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1517  cytochrome c oxidase subunit I  44.11 
 
 		 572 aa  472  1.0000000000000001e-131  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0873125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1802  cytochrome c oxidase subunit I type  48.07 
 
 		 568 aa  471  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.115752 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1561  cytochrome c oxidase, subunit I  46.68 
 
 		 567 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0534328  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2015  cytochrome c oxidase, subunit I  46.65 
 
 		 574 aa  472  1.0000000000000001e-131  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.466392  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1212  cytochrome c oxidase, subunit I  44.31 
 
 		 587 aa  472  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1448  cytochrome-c oxidase  43.73 
 
 		 631 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0923755 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3140  cytochrome-c oxidase  45.82 
 
 		 582 aa  468  9.999999999999999e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3724  cytochrome c oxidase, subunit I  46.47 
 
 		 602 aa  464  1e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.189938  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0645  quinol oxidase, subunit I  40.69 
 
 		 662 aa  464  1e-129  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.162382  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2267  cytochrome-c oxidase  42.73 
 
 		 843 aa  464  1e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0715373  hitchhiker  0.007718 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1119  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit I  43.4 
 
 		 662 aa  466  1e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.220145  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6353  Cytochrome-c oxidase  47.11 
 
 		 557 aa  464  1e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0569681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3281  cytochrome c oxidase, subunit I  46.54 
 
 		 593 aa  465  1e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3149  cytochrome c oxidase, subunit I  44.64 
 
 		 558 aa  465  1e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0168  putative cytochrome c oxidase subunit I  43.65 
 
 		 877 aa  465  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.606404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1142  cytochrome aa3 quinol oxidase subunit I  43.4 
 
 		 662 aa  466  1e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15640  cytochrome c oxidase, subunit I  46.28 
 
 		 595 aa  462  1e-129  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.315417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03470  cytochrome c oxidase, subunit I  45.54 
 
 		 588 aa  462  1e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1687  cytochrome c oxidase, subunit I  47.34 
 
 		 590 aa  463  1e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.418885  normal  0.0786402 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2622  cytochrome c oxidase, subunit I  44.63 
 
 		 594 aa  464  1e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1094  cytochrome-c oxidase  47.02 
 
 		 644 aa  461  9.999999999999999e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.284884 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1886  cytochrome c oxidase, subunit I  44.89 
 
 		 594 aa  459  9.999999999999999e-129  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00704167 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1196  cytochrome-c oxidase  47.69 
 
 		 592 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.843895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2671  Cytochrome-c oxidase  46.88 
 
 		 554 aa  461  9.999999999999999e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.352805  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0629  cytochrome c oxidase, subunit I  36.22 
 
 		 796 aa  459  9.999999999999999e-129  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.161655 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0983  cytochrome c oxidase subunit I type  47.22 
 
 		 585 aa  462  9.999999999999999e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.615245  decreased coverage  0.000770913 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3891  cytochrome c oxidase subunit I type  41.61 
 
 		 853 aa  460  9.999999999999999e-129  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.561544  normal  0.116226 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0490  cytochrome-c oxidase  45.31 
 
 		 589 aa  461  9.999999999999999e-129  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.575526  normal  0.236102 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4865  cytochrome-c oxidase  47.12 
 
 		 567 aa  459  9.999999999999999e-129  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1931  cytochrome c oxidase, subunit I  46.18 
 
 		 560 aa  461  9.999999999999999e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.768884  normal  0.452055 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0326  cytochrome c oxidase subunit I  48.14 
 
 		 526 aa  457  1e-127  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.283481  normal  0.0134906 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1953  cytochrome c oxidase, subunit I  47.04 
 
 		 575 aa  456  1e-127  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000175318 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0529  cytochrome c oxidase, subunit I  43.54 
 
 		 575 aa  457  1e-127  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3850  cytochrome-c oxidase  43.86 
 
 		 840 aa  458  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.550588  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>