More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_1119 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_0659  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit I  56.2 
 
 
654 aa  689    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0645  quinol oxidase, subunit I  93.2 
 
 
662 aa  1279    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.162382  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0771  quinol oxidase, subunit I  60.22 
 
 
644 aa  760    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.314385  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0590  cytochrome aa3 quinol oxidase subunit I  60.69 
 
 
644 aa  785    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0668  quinol oxidase subunit I  60.37 
 
 
647 aa  761    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0612  quinol oxidase, subunit 1 (cytochrome c oxidase, subunit I)  60.37 
 
 
647 aa  761    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0613  quinol oxidase, subunit 1 (cytochrome c oxidase, subunit I)  60.37 
 
 
647 aa  761    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.666796  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0617  cytochrome aa3 quinol oxidase subunit I  60.53 
 
 
644 aa  767    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3522  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit I  60.8 
 
 
648 aa  792    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0702  quinol oxidase subunit I  60.37 
 
 
644 aa  761    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0829  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit I  60.37 
 
 
644 aa  761    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1119  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit I  100 
 
 
662 aa  1345    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.220145  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0736  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit I  60.53 
 
 
644 aa  761    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.283518  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1142  cytochrome aa3 quinol oxidase subunit I  100 
 
 
662 aa  1345    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0757  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit I  60.37 
 
 
644 aa  763    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00253783 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4601  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit I  60.53 
 
 
644 aa  765    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.070169  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0512  Cytochrome-c oxidase  54.38 
 
 
657 aa  686    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.881127  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00008  cytOchrome o ubiquinol oxidase, subunit I  52.6 
 
 
666 aa  629  1e-179  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0983  cytochrome-c oxidase  50.87 
 
 
657 aa  623  1e-177  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0766124  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3242  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  50.08 
 
 
663 aa  619  1e-176  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3099  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  50.08 
 
 
663 aa  619  1e-176  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.284302  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3061  cytochrome O ubiquinol oxidase subunit I  50.08 
 
 
663 aa  619  1e-176  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000288206  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00382  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit I  50.72 
 
 
663 aa  617  1e-175  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000524598  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3178  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  50.72 
 
 
663 aa  617  1e-175  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000236873  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2916  transmembrane cytochrome O ubiquinol oxidase subunit I  51.37 
 
 
659 aa  615  1e-175  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.374086  normal  0.149288 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3202  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  50.72 
 
 
663 aa  617  1e-175  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.154912  hitchhiker  0.000119789 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0471  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  50.72 
 
 
663 aa  617  1e-175  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000517017  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0515  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  50.72 
 
 
663 aa  617  1e-175  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0054228  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0655  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  49.3 
 
 
665 aa  618  1e-175  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0506  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit I  50.72 
 
 
663 aa  617  1e-175  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000135927  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0466  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit I  50.72 
 
 
663 aa  617  1e-175  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000180375  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00386  hypothetical protein  50.72 
 
 
663 aa  617  1e-175  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000104725  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0740  cytochrome-c oxidase  49.3 
 
 
665 aa  618  1e-175  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3270  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  50.08 
 
 
663 aa  614  9.999999999999999e-175  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2883  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  50.08 
 
 
663 aa  614  9.999999999999999e-175  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.653915  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0195  ubiquinol oxidase, subunit I  48.87 
 
 
668 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0992  ubiquinol oxidase, subunit I  48.71 
 
 
668 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.502961  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0480  ubiquinol oxidase, subunit I  48.71 
 
 
668 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.070383  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1567  ubiquinol oxidase, subunit I  48.87 
 
 
668 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3074  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  49.92 
 
 
663 aa  613  9.999999999999999e-175  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000742797  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0353  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  50.56 
 
 
663 aa  615  9.999999999999999e-175  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1370  ubiquinol oxidase, subunit I  48.87 
 
 
668 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.262769  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0949  cytochrome c oxidase subunit I  50.48 
 
 
657 aa  614  9.999999999999999e-175  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.979391  normal  0.982005 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2715  ubiquinol oxidase, subunit I  48.71 
 
 
668 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0985139  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0226  ubiquinol oxidase, subunit I  48.87 
 
 
668 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3969  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  50.62 
 
 
668 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.873179  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1042  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  49.92 
 
 
663 aa  609  1e-173  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.190095  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2813  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  51.05 
 
 
659 aa  608  1e-173  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.972928 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1142  cytochrome-c oxidase  49.22 
 
 
670 aa  611  1e-173  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.303035 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3162  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  51.21 
 
 
658 aa  608  1e-173  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000382924 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1210  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  48.86 
 
 
668 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.432825  normal  0.321935 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2571  ubiquinol oxidase, subunit I  48.42 
 
 
670 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1636  cytochrome-c oxidase  49.69 
 
 
662 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0551524  normal  0.0691179 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2089  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  49.1 
 
 
668 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.330323  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6007  cytochrome-c oxidase  49.1 
 
 
668 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.46766  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2070  cytochrome-c oxidase  49.1 
 
 
668 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.976192  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4072  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit I  48.3 
 
 
658 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.190323  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1326  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  49.77 
 
 
670 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1089  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit I  49.01 
 
 
663 aa  605  1.0000000000000001e-171  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000953618  hitchhiker  0.0000000467486 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1976  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  48.71 
 
 
668 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1141  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  48.84 
 
 
665 aa  605  1.0000000000000001e-171  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.115333  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2106  cytochrome-c oxidase  48.71 
 
 
668 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.416073  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47190  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit I  48.14 
 
 
658 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000419377  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0813  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  48.3 
 
 
672 aa  599  1e-170  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0189476  normal  0.73245 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0544  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit I  49.14 
 
 
663 aa  600  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.71096  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0500  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit I  49.14 
 
 
663 aa  600  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0037262  normal  0.500568 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5375  cytochrome-c oxidase  48.41 
 
 
668 aa  599  1e-170  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.686893 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0483  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  49.14 
 
 
663 aa  600  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0793094  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0432  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  48.59 
 
 
661 aa  599  1e-170  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.911971 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1294  cytochrome-c oxidase  47.84 
 
 
659 aa  600  1e-170  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0028015  hitchhiker  0.0019187 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0481  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  49.14 
 
 
663 aa  600  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000244305  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0898  cytochrome-c oxidase  49.84 
 
 
663 aa  601  1e-170  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00392168  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0489  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit I  49.14 
 
 
663 aa  600  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0274597  hitchhiker  0.00372711 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03911  Ubiquinol oxidase polypeptide I  49.45 
 
 
662 aa  598  1e-169  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3794  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  49.21 
 
 
658 aa  597  1e-169  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.622698  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4375  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  47.99 
 
 
672 aa  596  1e-169  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.962664 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0836  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  48.15 
 
 
672 aa  597  1e-169  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.630143  normal  0.997274 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5010  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  49.76 
 
 
662 aa  595  1e-169  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.035058 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0850  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  47.84 
 
 
672 aa  597  1e-169  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0295  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit I  50.48 
 
 
664 aa  594  1e-168  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0955  cytochrome-c oxidase  48.66 
 
 
659 aa  592  1e-168  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1291  cytochrome-c oxidase  48.17 
 
 
664 aa  594  1e-168  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0258  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  47.38 
 
 
664 aa  588  1e-167  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.111391  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1787  ubiquinol oxidase, subunit I  49.14 
 
 
670 aa  590  1e-167  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.572465  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3535  cytochrome c oxidase, subunit I  49.27 
 
 
676 aa  589  1e-167  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2715  ubiquinol oxidase, subunit I  50 
 
 
668 aa  589  1e-167  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.100274  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4047  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  48.96 
 
 
670 aa  590  1e-167  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.354742  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2773  ubiquinol oxidase, subunit I  50 
 
 
668 aa  589  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.668057  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3859  cytochrome-c oxidase  47.88 
 
 
659 aa  591  1e-167  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0367  cytochrome-c oxidase  48.04 
 
 
662 aa  591  1e-167  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0043  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  48.33 
 
 
659 aa  585  1e-166  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.438078  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0043  ubiquinol oxidase subunit I  48.33 
 
 
659 aa  585  1e-166  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0049  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit I  48.41 
 
 
659 aa  586  1e-166  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00345091  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2834  ubiquinol oxidase polypeptide I  49.84 
 
 
668 aa  586  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4061  cytochrome c oxidase, subunit I  50 
 
 
620 aa  585  1e-166  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3703  cytochrome c oxidase, subunit I  49.84 
 
 
620 aa  582  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5825  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  47.03 
 
 
666 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.800495  normal  0.329958 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4153  cytochrome c oxidase subunit I  50 
 
 
611 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1547  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  48.15 
 
 
667 aa  582  1.0000000000000001e-165  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.557113  normal  0.218021 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4219  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit I  47.72 
 
 
659 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>