More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0645 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP0645  quinol oxidase, subunit I  100 
 
 
662 aa  1346    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.162382  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0771  quinol oxidase, subunit I  58.66 
 
 
644 aa  754    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.314385  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3522  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit I  60.03 
 
 
648 aa  795    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0668  quinol oxidase subunit I  58.81 
 
 
647 aa  755    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0612  quinol oxidase, subunit 1 (cytochrome c oxidase, subunit I)  58.81 
 
 
647 aa  755    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0613  quinol oxidase, subunit 1 (cytochrome c oxidase, subunit I)  58.81 
 
 
647 aa  755    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.666796  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4601  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit I  58.97 
 
 
644 aa  759    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.070169  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0829  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit I  58.81 
 
 
644 aa  755    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0617  cytochrome aa3 quinol oxidase subunit I  58.81 
 
 
644 aa  759    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0702  quinol oxidase subunit I  58.81 
 
 
644 aa  755    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0736  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit I  58.97 
 
 
644 aa  756    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.283518  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0590  cytochrome aa3 quinol oxidase subunit I  59.75 
 
 
644 aa  786    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0757  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit I  58.97 
 
 
644 aa  758    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00253783 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1142  cytochrome aa3 quinol oxidase subunit I  93.2 
 
 
662 aa  1279    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0512  Cytochrome-c oxidase  54.38 
 
 
657 aa  685    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.881127  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0659  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit I  55.23 
 
 
654 aa  689    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1119  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit I  93.2 
 
 
662 aa  1279    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.220145  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00008  cytOchrome o ubiquinol oxidase, subunit I  51.54 
 
 
666 aa  627  1e-178  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0983  cytochrome-c oxidase  49.92 
 
 
657 aa  619  1e-176  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0766124  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00382  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit I  50.08 
 
 
663 aa  618  1e-175  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000524598  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3178  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  50.08 
 
 
663 aa  618  1e-175  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000236873  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0466  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit I  50.08 
 
 
663 aa  618  1e-175  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000180375  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00386  hypothetical protein  50.08 
 
 
663 aa  618  1e-175  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000104725  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0515  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  50.08 
 
 
663 aa  618  1e-175  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0054228  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0195  ubiquinol oxidase, subunit I  47.81 
 
 
668 aa  617  1e-175  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3270  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  49.61 
 
 
663 aa  615  1e-175  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1370  ubiquinol oxidase, subunit I  47.81 
 
 
668 aa  617  1e-175  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.262769  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0992  ubiquinol oxidase, subunit I  47.96 
 
 
668 aa  617  1e-175  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.502961  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1567  ubiquinol oxidase, subunit I  47.81 
 
 
668 aa  617  1e-175  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0740  cytochrome-c oxidase  48.55 
 
 
665 aa  615  1e-175  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0480  ubiquinol oxidase, subunit I  47.81 
 
 
668 aa  617  1e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.070383  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3202  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  50.08 
 
 
663 aa  618  1e-175  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.154912  hitchhiker  0.000119789 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2715  ubiquinol oxidase, subunit I  47.96 
 
 
668 aa  618  1e-175  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0985139  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0655  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  48.55 
 
 
665 aa  615  1e-175  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0471  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  50.08 
 
 
663 aa  618  1e-175  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000517017  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0506  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit I  50.08 
 
 
663 aa  618  1e-175  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000135927  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0226  ubiquinol oxidase, subunit I  47.81 
 
 
668 aa  617  1e-175  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2916  transmembrane cytochrome O ubiquinol oxidase subunit I  50.65 
 
 
659 aa  613  9.999999999999999e-175  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.374086  normal  0.149288 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3099  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  48.78 
 
 
663 aa  613  9.999999999999999e-175  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.284302  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3061  cytochrome O ubiquinol oxidase subunit I  48.78 
 
 
663 aa  613  9.999999999999999e-175  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000288206  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0353  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  49.92 
 
 
663 aa  615  9.999999999999999e-175  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0949  cytochrome c oxidase subunit I  50.24 
 
 
657 aa  615  9.999999999999999e-175  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.979391  normal  0.982005 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3242  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  48.78 
 
 
663 aa  613  9.999999999999999e-175  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1042  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  49.22 
 
 
663 aa  611  1e-173  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.190095  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3969  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  50.39 
 
 
668 aa  610  1e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.873179  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2883  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  48.83 
 
 
663 aa  608  1e-173  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.653915  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2571  ubiquinol oxidase, subunit I  47.82 
 
 
670 aa  611  1e-173  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1210  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  47.96 
 
 
668 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.432825  normal  0.321935 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3074  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  48.15 
 
 
663 aa  606  9.999999999999999e-173  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000742797  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1142  cytochrome-c oxidase  49.13 
 
 
670 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.303035 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2089  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  48.05 
 
 
668 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.330323  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6007  cytochrome-c oxidase  48.05 
 
 
668 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.46766  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2070  cytochrome-c oxidase  48.05 
 
 
668 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.976192  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0432  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  48.73 
 
 
661 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.911971 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0481  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  48.88 
 
 
663 aa  602  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000244305  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0489  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit I  48.88 
 
 
663 aa  602  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0274597  hitchhiker  0.00372711 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2813  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  50.16 
 
 
659 aa  602  1.0000000000000001e-171  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.972928 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0500  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit I  48.88 
 
 
663 aa  602  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0037262  normal  0.500568 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1636  cytochrome-c oxidase  48.52 
 
 
662 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0551524  normal  0.0691179 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1976  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  47.66 
 
 
668 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0544  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit I  48.88 
 
 
663 aa  602  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.71096  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0483  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  48.88 
 
 
663 aa  602  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0793094  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0898  cytochrome-c oxidase  49.51 
 
 
663 aa  604  1.0000000000000001e-171  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00392168  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1089  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit I  48.01 
 
 
663 aa  602  1.0000000000000001e-171  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000953618  hitchhiker  0.0000000467486 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1326  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  49.52 
 
 
670 aa  600  1e-170  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5375  cytochrome-c oxidase  47.81 
 
 
668 aa  599  1e-170  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.686893 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3162  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  50.32 
 
 
658 aa  601  1e-170  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000382924 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2106  cytochrome-c oxidase  47.66 
 
 
668 aa  602  1e-170  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.416073  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0813  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  48.19 
 
 
672 aa  597  1e-169  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0189476  normal  0.73245 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1141  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  46.71 
 
 
665 aa  595  1e-169  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.115333  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0850  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  47.72 
 
 
672 aa  595  1e-169  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0367  cytochrome-c oxidase  48.1 
 
 
662 aa  593  1e-168  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0836  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  48.03 
 
 
672 aa  595  1e-168  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.630143  normal  0.997274 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4375  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  47.87 
 
 
672 aa  593  1e-168  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.962664 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1294  cytochrome-c oxidase  46.46 
 
 
659 aa  592  1e-168  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0028015  hitchhiker  0.0019187 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0955  cytochrome-c oxidase  47.53 
 
 
659 aa  593  1e-168  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2715  ubiquinol oxidase, subunit I  48.07 
 
 
668 aa  589  1e-167  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.100274  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1787  ubiquinol oxidase, subunit I  48.43 
 
 
670 aa  590  1e-167  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.572465  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5010  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  47.83 
 
 
662 aa  590  1e-167  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.035058 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2773  ubiquinol oxidase, subunit I  48.07 
 
 
668 aa  589  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.668057  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1291  cytochrome-c oxidase  47.83 
 
 
664 aa  590  1e-167  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3859  cytochrome-c oxidase  47.85 
 
 
659 aa  592  1e-167  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03911  Ubiquinol oxidase polypeptide I  48.6 
 
 
662 aa  590  1e-167  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1876  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  47.43 
 
 
667 aa  587  1e-166  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.178769  normal  0.179376 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2834  ubiquinol oxidase polypeptide I  47.85 
 
 
668 aa  586  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1547  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  47.27 
 
 
667 aa  585  1e-166  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.557113  normal  0.218021 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4072  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit I  46.93 
 
 
658 aa  587  1e-166  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.190323  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3915  cytochrome-c oxidase  48.17 
 
 
659 aa  586  1e-166  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4147  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  47.69 
 
 
659 aa  584  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0295  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit I  49.12 
 
 
664 aa  583  1.0000000000000001e-165  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4351  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  47.69 
 
 
659 aa  584  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3824  cytochrome-c oxidase  48.01 
 
 
659 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0778781 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0223  cytochrome-c oxidase  47.47 
 
 
660 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4219  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit I  47.69 
 
 
659 aa  584  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47190  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit I  46.77 
 
 
658 aa  585  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000419377  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4032  cytochrome c oxidase, subunit I  48.01 
 
 
659 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3794  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  47.33 
 
 
658 aa  585  1.0000000000000001e-165  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.622698  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4047  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  47.52 
 
 
670 aa  580  1e-164  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.354742  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3535  cytochrome c oxidase, subunit I  47.46 
 
 
676 aa  578  1e-164  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0090  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit I  47.9 
 
 
659 aa  580  1e-164  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.949394 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>