More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_0617 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00382  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit I  53.22 
 
 
663 aa  668    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000524598  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3178  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  53.22 
 
 
663 aa  668    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000236873  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0813  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  51.42 
 
 
672 aa  655    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0189476  normal  0.73245 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0645  quinol oxidase, subunit I  58.81 
 
 
662 aa  771    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.162382  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05492  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  52.11 
 
 
678 aa  651    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3648  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  52.26 
 
 
670 aa  643    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.573028  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2916  transmembrane cytochrome O ubiquinol oxidase subunit I  53.14 
 
 
659 aa  678    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.374086  normal  0.149288 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0771  quinol oxidase, subunit I  96.58 
 
 
644 aa  1256    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.314385  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0512  Cytochrome-c oxidase  60.54 
 
 
657 aa  779    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.881127  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0515  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  53.22 
 
 
663 aa  668    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0054228  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2883  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  53.06 
 
 
663 aa  671    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.653915  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0736  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit I  96.89 
 
 
644 aa  1256    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.283518  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0668  quinol oxidase subunit I  96.58 
 
 
647 aa  1256    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3855  cytochrome c oxidase subunit I  52.31 
 
 
620 aa  635    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0612  quinol oxidase, subunit 1 (cytochrome c oxidase, subunit I)  96.58 
 
 
647 aa  1256    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3074  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  52.59 
 
 
663 aa  670    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000742797  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0613  quinol oxidase, subunit 1 (cytochrome c oxidase, subunit I)  96.58 
 
 
647 aa  1256    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.666796  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00386  hypothetical protein  53.22 
 
 
663 aa  668    Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000104725  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0432  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  52.43 
 
 
661 aa  671    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.911971 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0195  ubiquinol oxidase, subunit I  53.13 
 
 
668 aa  668    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0295  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit I  52.19 
 
 
664 aa  649    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0898  cytochrome-c oxidase  53.17 
 
 
663 aa  652    Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00392168  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3859  cytochrome-c oxidase  52.59 
 
 
659 aa  676    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1142  cytochrome-c oxidase  50.08 
 
 
670 aa  641    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.303035 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4601  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit I  97.67 
 
 
644 aa  1264    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.070169  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0367  cytochrome-c oxidase  52.66 
 
 
662 aa  677    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0617  cytochrome aa3 quinol oxidase subunit I  100 
 
 
644 aa  1304    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0983  cytochrome-c oxidase  55.66 
 
 
657 aa  687    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0766124  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2813  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  53.46 
 
 
659 aa  675    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.972928 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3794  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  53.46 
 
 
658 aa  679    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.622698  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4147  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  52.28 
 
 
659 aa  658    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3242  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  52.74 
 
 
663 aa  673    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2715  ubiquinol oxidase, subunit I  52.82 
 
 
668 aa  667    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0985139  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4375  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  51.42 
 
 
672 aa  655    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.962664 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2834  ubiquinol oxidase polypeptide I  52.04 
 
 
668 aa  643    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0992  ubiquinol oxidase, subunit I  52.98 
 
 
668 aa  668    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.502961  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0353  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  52.9 
 
 
663 aa  664    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5375  cytochrome-c oxidase  53.85 
 
 
668 aa  673    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.686893 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1567  ubiquinol oxidase, subunit I  53.13 
 
 
668 aa  668    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0702  quinol oxidase subunit I  96.74 
 
 
644 aa  1257    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1042  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  52.59 
 
 
663 aa  671    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.190095  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3522  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit I  74.69 
 
 
648 aa  1005    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0480  ubiquinol oxidase, subunit I  53.29 
 
 
668 aa  675    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.070383  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0659  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit I  63.59 
 
 
654 aa  855    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1141  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  51.85 
 
 
665 aa  654    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.115333  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0258  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  51.09 
 
 
664 aa  637    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.111391  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2089  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  54.32 
 
 
668 aa  674    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.330323  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1370  ubiquinol oxidase, subunit I  53.13 
 
 
668 aa  668    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.262769  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0757  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit I  96.74 
 
 
644 aa  1255    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00253783 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1294  cytochrome-c oxidase  52.43 
 
 
659 aa  675    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0028015  hitchhiker  0.0019187 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1119  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit I  60.53 
 
 
662 aa  779    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.220145  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0466  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit I  53.22 
 
 
663 aa  668    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000180375  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1743  cytochrome-c oxidase  51.1 
 
 
668 aa  644    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0545412  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1636  cytochrome-c oxidase  52.35 
 
 
662 aa  666    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0551524  normal  0.0691179 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1089  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit I  53.06 
 
 
663 aa  672    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000953618  hitchhiker  0.0000000467486 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0655  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  52.43 
 
 
665 aa  658    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3061  cytochrome O ubiquinol oxidase subunit I  52.74 
 
 
663 aa  673    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000288206  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3162  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  53.3 
 
 
658 aa  672    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000382924 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0955  cytochrome-c oxidase  51.49 
 
 
659 aa  652    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00008  cytOchrome o ubiquinol oxidase, subunit I  56.01 
 
 
666 aa  681    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0949  cytochrome c oxidase subunit I  55.5 
 
 
657 aa  690    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.979391  normal  0.982005 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0500  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit I  52.11 
 
 
663 aa  647    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0037262  normal  0.500568 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03911  Ubiquinol oxidase polypeptide I  52.67 
 
 
662 aa  677    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0481  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  52.11 
 
 
663 aa  647    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000244305  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3969  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  54.08 
 
 
668 aa  679    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.873179  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1976  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  53.92 
 
 
668 aa  672    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0471  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  53.22 
 
 
663 aa  668    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000517017  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2715  ubiquinol oxidase, subunit I  52.04 
 
 
668 aa  645    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.100274  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6007  cytochrome-c oxidase  54.32 
 
 
668 aa  674    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.46766  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0090  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit I  51.65 
 
 
659 aa  640    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.949394 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1210  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  54.63 
 
 
668 aa  678    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.432825  normal  0.321935 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1291  cytochrome-c oxidase  53.13 
 
 
664 aa  674    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3535  cytochrome c oxidase, subunit I  51.98 
 
 
676 aa  639    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0740  cytochrome-c oxidase  52.43 
 
 
665 aa  658    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3824  cytochrome-c oxidase  52.43 
 
 
659 aa  655    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0778781 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4351  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  52.28 
 
 
659 aa  658    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3915  cytochrome-c oxidase  52.59 
 
 
659 aa  657    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0836  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  51.42 
 
 
672 aa  654    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.630143  normal  0.997274 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0223  cytochrome-c oxidase  51.33 
 
 
660 aa  659    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0489  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit I  52.11 
 
 
663 aa  647    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0274597  hitchhiker  0.00372711 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2106  cytochrome-c oxidase  53.92 
 
 
668 aa  671    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.416073  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2773  ubiquinol oxidase, subunit I  52.04 
 
 
668 aa  645    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.668057  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5010  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  51.57 
 
 
662 aa  641    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.035058 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47190  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit I  52.52 
 
 
658 aa  673    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000419377  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0483  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  52.11 
 
 
663 aa  647    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0793094  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2070  cytochrome-c oxidase  54.32 
 
 
668 aa  674    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.976192  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2571  ubiquinol oxidase, subunit I  52.58 
 
 
670 aa  665    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0506  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit I  53.22 
 
 
663 aa  668    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000135927  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0226  ubiquinol oxidase, subunit I  53.13 
 
 
668 aa  668    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4032  cytochrome c oxidase, subunit I  52.75 
 
 
659 aa  660    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4219  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit I  52.28 
 
 
659 aa  658    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4072  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit I  52.52 
 
 
658 aa  672    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.190323  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4047  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  51.26 
 
 
670 aa  642    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.354742  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0850  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  52.04 
 
 
672 aa  659    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3099  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  52.74 
 
 
663 aa  673    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.284302  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3202  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  53.22 
 
 
663 aa  668    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.154912  hitchhiker  0.000119789 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0590  cytochrome aa3 quinol oxidase subunit I  90.37 
 
 
644 aa  1206    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1142  cytochrome aa3 quinol oxidase subunit I  60.53 
 
 
662 aa  779    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0544  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit I  52.11 
 
 
663 aa  647    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.71096  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0829  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit I  96.74 
 
 
644 aa  1257    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>