More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_6355 on replicon NC_009622
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5243  cytochrome c oxidase, subunit I  67.7 
 
 		 637 aa  865    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.407043  normal  0.600413 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2990  cytochrome c oxidase, subunit I  75.68 
 
 		 638 aa  966    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.155569  normal  0.0328949 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0095  cytochrome c oxidase, subunit I  74.37 
 
 		 638 aa  968    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160377  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5827  cytochrome c oxidase, subunit I  65.44 
 
 		 635 aa  866    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1448  cytochrome-c oxidase  55.32 
 
 		 631 aa  714    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0923755 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0168  putative cytochrome c oxidase subunit I  59.87 
 
 		 877 aa  769    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.606404  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0696  cytochrome c oxidase, subunit I  64.76 
 
 		 662 aa  828    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2348  cytochrome c oxidase, subunit I  75.52 
 
 		 638 aa  965    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6355  cytochrome c oxidase subunit I type  100 
 
 		 635 aa  1263    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4793  cytochrome c oxidase, subunit I  61.67 
 
 		 874 aa  796    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.153175  normal  0.530231 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0459  cytochrome-c oxidase  48.43 
 
 		 671 aa  617  1e-175  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4762  cytochrome c oxidase subunit I type  52.24 
 
 		 840 aa  613  9.999999999999999e-175  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.28484 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2184  cytochrome-c oxidase  49.76 
 
 		 679 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0453262 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11180  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  49.69 
 
 		 835 aa  614  9.999999999999999e-175  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00773028  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3380  cytochrome c oxidase, subunit I  49.04 
 
 		 650 aa  606  9.999999999999999e-173  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3891  cytochrome c oxidase subunit I type  48.83 
 
 		 853 aa  607  9.999999999999999e-173  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.561544  normal  0.116226 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2027  cytochrome c oxidase, subunit I  48.66 
 
 		 678 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000053383 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5501  cytochrome c oxidase, subunit I  48.29 
 
 		 876 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0931338 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5490  cytochrome c oxidase, subunit I  47.06 
 
 		 669 aa  598  1e-170  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.164888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3850  cytochrome-c oxidase  49.11 
 
 		 840 aa  598  1e-170  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.550588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0080  putative cytochrome c oxidase subunit I  48.48 
 
 		 680 aa  599  1e-170  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.150485  hitchhiker  0.00336295 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6287  cytochrome c oxidase, subunit I  47.2 
 
 		 879 aa  597  1e-169  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.171761  normal  0.0477153 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01476  putative cytochrome c oxidase subunit I  49.58 
 
 		 835 aa  597  1e-169  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1293  cytochrome c oxidase, subunit I  47.78 
 
 		 879 aa  597  1e-169  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6538  cytochrome c oxidase, subunit I  47.78 
 
 		 879 aa  597  1e-169  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6145  cytochrome c oxidase, subunit I  47.3 
 
 		 1004 aa  592  1e-168  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.564835  normal  0.440203 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2267  cytochrome-c oxidase  47.57 
 
 		 843 aa  592  1e-168  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0715373  hitchhiker  0.007718 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6573  cytochrome c oxidase, subunit I  47.46 
 
 		 882 aa  594  1e-168  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0983225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0155  cytochrome-c oxidase  47.53 
 
 		 841 aa  581  1e-164  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.479577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0105  cytochrome c oxidase subunit I type  53.14 
 
 		 615 aa  578  1.0000000000000001e-163  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2791  cytochrome c oxidase, subunit I  51.55 
 
 		 845 aa  578  1.0000000000000001e-163  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0944  cytochrome C oxidase subunit I  47.22 
 
 		 950 aa  571  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.358792  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0770  cytochrome c oxidase, subunit I/subunit III  47.22 
 
 		 962 aa  571  1e-161  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0306921  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0782  cytochrome c oxidase, subunit III:cytochrome c oxidase, subunit I  47.06 
 
 		 974 aa  569  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1766  cytochrome c oxidase  47.69 
 
 		 853 aa  558  1e-158  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00671331  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2264  cytochrome-c oxidase  47.21 
 
 		 641 aa  556  1e-157  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3557  cytochrome c oxidase subunit I type  52.5 
 
 		 641 aa  558  1e-157  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0739643 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1992  cytochrome c oxidase, subunit I  47.91 
 
 		 844 aa  557  1e-157  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.394035  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2314  cytochrome c oxidase, subunit I  45.73 
 
 		 839 aa  544  1e-153  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.162476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3824  cytochrome-c oxidase  43.77 
 
 		 825 aa  532  1e-150  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.961299 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3097  QoxA, quinol oxidase subunit I  43.77 
 
 		 825 aa  531  1e-149  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.866737  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0117  cytochrome c oxidase, subunit I  43.94 
 
 		 857 aa  526  1e-148  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1753  cytochrome-c oxidase  44.36 
 
 		 857 aa  528  1e-148  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3669  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  44.66 
 
 		 825 aa  524  1e-147  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0157977  normal  0.798163 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1704  cytochrome c, monohaem  48.45 
 
 		 878 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0564  cytochrome c oxidase subunit I type  46.18 
 
 		 840 aa  518  1.0000000000000001e-145  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1909  cytochrome c oxidase, subunit I  47.57 
 
 		 566 aa  502  1e-141  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2071  cytochrome c oxidase, subunit I  44.56 
 
 		 661 aa  503  1e-141  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.619356 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1823  cytochrome c oxidase, subunit I  47.74 
 
 		 563 aa  488  1e-136  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3541  cytochrome c oxidase, subunit I  48.15 
 
 		 743 aa  484  1e-135  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0590  cytochrome aa3 quinol oxidase subunit I  43.71 
 
 		 644 aa  481  1e-134  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3522  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit I  45.37 
 
 		 648 aa  473  1e-132  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3958  cytochrome c oxidase, subunit I  42.58 
 
 		 620 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3990  cytochrome c oxidase, subunit I  42.58 
 
 		 611 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.819255  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4061  cytochrome c oxidase, subunit I  42.58 
 
 		 620 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3686  cytochrome c oxidase, subunit I  42.58 
 
 		 620 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3703  cytochrome c oxidase, subunit I  42.58 
 
 		 620 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0617  cytochrome aa3 quinol oxidase subunit I  40.17 
 
 		 644 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1194  cytochrome c oxidase, subunit I  43.17 
 
 		 620 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0895  cytochrome c oxidase subunit I type  44.66 
 
 		 561 aa  471  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.822333  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4045  cytochrome c oxidase, subunit I  43.17 
 
 		 620 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.505439  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0771  quinol oxidase, subunit I  42.59 
 
 		 644 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.314385  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0668  quinol oxidase subunit I  42.78 
 
 		 647 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3855  cytochrome c oxidase subunit I  42.4 
 
 		 620 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0612  quinol oxidase, subunit 1 (cytochrome c oxidase, subunit I)  42.78 
 
 		 647 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0613  quinol oxidase, subunit 1 (cytochrome c oxidase, subunit I)  42.78 
 
 		 647 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.666796  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0736  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit I  42.78 
 
 		 644 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.283518  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0829  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit I  42.78 
 
 		 644 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0757  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit I  42.78 
 
 		 644 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00253783 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2198  cytochrome c oxidase, subunit I  47.2 
 
 		 589 aa  465  9.999999999999999e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.552552  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4601  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit I  40 
 
 		 644 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.070169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0702  quinol oxidase subunit I  42.78 
 
 		 644 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4153  cytochrome c oxidase subunit I  42.4 
 
 		 611 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2645  cytochrome c oxidase subunit I type  44.57 
 
 		 620 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.260433  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0490  cytochrome-c oxidase  46.82 
 
 		 589 aa  462  1e-129  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.575526  normal  0.236102 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1212  cytochrome c oxidase, subunit I  47.91 
 
 		 587 aa  460  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0659  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit I  44 
 
 		 654 aa  461  9.999999999999999e-129  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2942  cytochrome c oxidase, subunit I  46.78 
 
 		 581 aa  456  1e-127  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3116  cytochrome-c oxidase  44.53 
 
 		 560 aa  457  1e-127  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.605031 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1856  cytochrome c oxidase, subunit I  43.29 
 
 		 623 aa  456  1e-127  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0989  cytochrome c oxidase, subunit I  44.78 
 
 		 596 aa  457  1e-127  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3769  cytochrome c oxidase subunit I type  44.77 
 
 		 620 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1517  cytochrome c oxidase subunit I  43.73 
 
 		 572 aa  453  1.0000000000000001e-126  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0873125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4072  cytochrome c oxidase, subunit I  47.41 
 
 		 560 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2493  cytochrome-c oxidase  44.72 
 
 		 605 aa  454  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.526922  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29310  cytochrome c oxidase, subunit I  45.09 
 
 		 594 aa  452  1.0000000000000001e-126  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.426648 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4865  cytochrome-c oxidase  45.47 
 
 		 567 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1094  cytochrome-c oxidase  46.33 
 
 		 644 aa  451  1e-125  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.284884 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3140  cytochrome-c oxidase  43.47 
 
 		 582 aa  451  1e-125  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03470  cytochrome c oxidase, subunit I  42.29 
 
 		 588 aa  448  1.0000000000000001e-124  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3574  cytochrome c oxidase subunit I  42.28 
 
 		 564 aa  446  1.0000000000000001e-124  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0983  cytochrome c oxidase subunit I type  45.81 
 
 		 585 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.615245  decreased coverage  0.000770913 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2603  cytochrome-c oxidase  45.87 
 
 		 541 aa  446  1.0000000000000001e-124  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.240231 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3821  cytochrome-c oxidase  43.54 
 
 		 609 aa  447  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00155592  normal  0.0385819 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1561  cytochrome c oxidase, subunit I  43.42 
 
 		 567 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0534328  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1802  cytochrome c oxidase subunit I type  45.51 
 
 		 568 aa  448  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.115752 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0984  cytochrome c oxidase, subunit I  42.42 
 
 		 619 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0568  cytochrome c oxidase, subunit I  46.81 
 
 		 555 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0585  cytochrome c oxidase, subunit I  46.81 
 
 		 555 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0529  cytochrome c oxidase, subunit I  41.82 
 
 		 575 aa  442  1e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>