More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_0984 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_3990  cytochrome c oxidase, subunit I  76.71 
 
 
611 aa  949    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.819255  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0984  cytochrome c oxidase, subunit I  100 
 
 
619 aa  1230    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3855  cytochrome c oxidase subunit I  75.52 
 
 
620 aa  950    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3686  cytochrome c oxidase, subunit I  75.36 
 
 
620 aa  947    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3703  cytochrome c oxidase, subunit I  75.36 
 
 
620 aa  947    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4061  cytochrome c oxidase, subunit I  75.84 
 
 
620 aa  953    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3769  cytochrome c oxidase subunit I type  75.52 
 
 
620 aa  914    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4153  cytochrome c oxidase subunit I  76.38 
 
 
611 aa  947    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4045  cytochrome c oxidase, subunit I  75.52 
 
 
620 aa  950    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.505439  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1194  cytochrome c oxidase, subunit I  75.36 
 
 
620 aa  949    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3958  cytochrome c oxidase, subunit I  75.36 
 
 
620 aa  947    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3522  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit I  52.26 
 
 
648 aa  645    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2645  cytochrome c oxidase subunit I type  75.84 
 
 
620 aa  949    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.260433  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1856  cytochrome c oxidase, subunit I  80.74 
 
 
623 aa  1017    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0512  Cytochrome-c oxidase  51.24 
 
 
657 aa  627  1e-178  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.881127  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0590  cytochrome aa3 quinol oxidase subunit I  49.27 
 
 
644 aa  605  9.999999999999999e-173  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0617  cytochrome aa3 quinol oxidase subunit I  49.27 
 
 
644 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2071  cytochrome c oxidase, subunit I  51.36 
 
 
661 aa  604  1.0000000000000001e-171  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.619356 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4601  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit I  48.94 
 
 
644 aa  604  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.070169  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0771  quinol oxidase, subunit I  48.78 
 
 
644 aa  601  1e-170  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.314385  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0668  quinol oxidase subunit I  48.78 
 
 
647 aa  600  1e-170  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0612  quinol oxidase, subunit 1 (cytochrome c oxidase, subunit I)  48.78 
 
 
647 aa  600  1e-170  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0613  quinol oxidase, subunit 1 (cytochrome c oxidase, subunit I)  48.78 
 
 
647 aa  600  1e-170  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.666796  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0829  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit I  48.78 
 
 
644 aa  600  1e-170  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0757  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit I  48.78 
 
 
644 aa  601  1e-170  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00253783 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0702  quinol oxidase subunit I  48.78 
 
 
644 aa  600  1e-170  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0736  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit I  48.78 
 
 
644 aa  600  1e-170  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.283518  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0659  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit I  50.97 
 
 
654 aa  596  1e-169  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1119  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit I  48.38 
 
 
662 aa  577  1.0000000000000001e-163  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.220145  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1142  cytochrome aa3 quinol oxidase subunit I  48.38 
 
 
662 aa  577  1.0000000000000001e-163  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2264  cytochrome-c oxidase  50.09 
 
 
641 aa  568  1e-161  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3557  cytochrome c oxidase subunit I type  50.42 
 
 
641 aa  570  1e-161  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0739643 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0645  quinol oxidase, subunit I  46.59 
 
 
662 aa  565  1e-160  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.162382  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0105  cytochrome c oxidase subunit I type  48.99 
 
 
615 aa  562  1.0000000000000001e-159  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2266  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  45.32 
 
 
668 aa  520  1e-146  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0983  cytochrome-c oxidase  44.73 
 
 
657 aa  519  1e-146  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0766124  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4058  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  46.31 
 
 
645 aa  518  1.0000000000000001e-145  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.197273  normal  0.152019 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0949  cytochrome c oxidase subunit I  45.26 
 
 
657 aa  515  1.0000000000000001e-145  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.979391  normal  0.982005 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1547  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  45.08 
 
 
667 aa  518  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.557113  normal  0.218021 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1876  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  44.92 
 
 
667 aa  517  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.178769  normal  0.179376 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2776  cytochrome-c oxidase  44.41 
 
 
646 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.842999  normal  0.700604 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2916  transmembrane cytochrome O ubiquinol oxidase subunit I  45.18 
 
 
659 aa  512  1e-144  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.374086  normal  0.149288 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0295  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit I  44.71 
 
 
664 aa  513  1e-144  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1743  cytochrome-c oxidase  45.12 
 
 
668 aa  513  1e-144  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0545412  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1294  cytochrome-c oxidase  44.16 
 
 
659 aa  513  1e-144  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0028015  hitchhiker  0.0019187 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2813  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  45.18 
 
 
659 aa  510  1e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.972928 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3541  cytochrome c oxidase, subunit I  52.62 
 
 
743 aa  506  9.999999999999999e-143  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0241  cytochrome-c oxidase  44.66 
 
 
669 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.515417  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3162  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  45.18 
 
 
658 aa  505  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000382924 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2222  cytochrome-c oxidase  44.92 
 
 
667 aa  508  9.999999999999999e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.153273  normal  0.0859348 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00008  cytOchrome o ubiquinol oxidase, subunit I  45.5 
 
 
666 aa  503  1e-141  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3794  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  44.23 
 
 
658 aa  504  1e-141  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.622698  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5609  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit I  46.62 
 
 
667 aa  503  1e-141  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1210  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  45.88 
 
 
668 aa  504  1e-141  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.432825  normal  0.321935 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1274  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  42.77 
 
 
672 aa  503  1e-141  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000601159  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2031  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  43.86 
 
 
669 aa  502  1e-140  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0504466  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4047  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  43.97 
 
 
670 aa  499  1e-140  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.354742  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5375  cytochrome-c oxidase  45.4 
 
 
668 aa  501  1e-140  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.686893 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3171  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  43.18 
 
 
666 aa  501  1e-140  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.404396  normal  0.0592526 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6007  cytochrome-c oxidase  45.07 
 
 
668 aa  498  1e-140  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.46766  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2089  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  45.07 
 
 
668 aa  498  1e-140  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.330323  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2106  cytochrome-c oxidase  45.1 
 
 
668 aa  501  1e-140  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.416073  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2070  cytochrome-c oxidase  45.07 
 
 
668 aa  498  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.976192  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1976  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  45.1 
 
 
668 aa  502  1e-140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0043  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  43.52 
 
 
659 aa  499  1e-140  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.438078  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4853  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  43.74 
 
 
667 aa  495  1e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0043  ubiquinol oxidase subunit I  43.52 
 
 
659 aa  498  1e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1002  cytochrome c oxidase polypeptide I  43.63 
 
 
668 aa  498  1e-139  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4578  cytochrome-c oxidase  43.96 
 
 
659 aa  496  1e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4891  cytochrome-c oxidase  44.62 
 
 
667 aa  497  1e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.271265  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0049  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit I  44.21 
 
 
659 aa  495  1e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00345091  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1636  cytochrome-c oxidase  43.75 
 
 
662 aa  496  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0551524  normal  0.0691179 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0898  cytochrome-c oxidase  44.98 
 
 
663 aa  497  1e-139  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00392168  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0955  cytochrome-c oxidase  43.86 
 
 
659 aa  497  1e-139  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0900  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  43.63 
 
 
668 aa  498  1e-139  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00382  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit I  44.5 
 
 
663 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000524598  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3178  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  44.5 
 
 
663 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000236873  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0515  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  44.5 
 
 
663 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0054228  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4072  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit I  43.98 
 
 
658 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.190323  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3202  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  44.5 
 
 
663 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.154912  hitchhiker  0.000119789 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00386  hypothetical protein  44.5 
 
 
663 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000104725  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0466  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit I  44.5 
 
 
663 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000180375  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0655  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  43.89 
 
 
665 aa  492  9.999999999999999e-139  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2622  cytochrome c oxidase, subunit I  49.32 
 
 
594 aa  494  9.999999999999999e-139  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0471  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  44.5 
 
 
663 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000517017  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7136  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  45.2 
 
 
667 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.437812 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1909  cytochrome c oxidase, subunit I  45.94 
 
 
566 aa  494  9.999999999999999e-139  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47190  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit I  43.82 
 
 
658 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000419377  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0740  cytochrome-c oxidase  43.89 
 
 
665 aa  492  9.999999999999999e-139  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3140  cytochrome-c oxidase  48.89 
 
 
582 aa  493  9.999999999999999e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0506  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit I  44.5 
 
 
663 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000135927  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3969  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  44.61 
 
 
668 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.873179  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1452  cytochrome c oxidase, subunit I  48.62 
 
 
583 aa  493  9.999999999999999e-139  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0835225  normal  0.133355 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3242  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  43.2 
 
 
663 aa  491  1e-137  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1042  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  43.11 
 
 
663 aa  491  1e-137  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.190095  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3099  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  43.2 
 
 
663 aa  491  1e-137  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.284302  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6215  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit I  45.09 
 
 
667 aa  489  1e-137  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.1112  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5825  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  43.09 
 
 
666 aa  489  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.800495  normal  0.329958 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5986  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  45.68 
 
 
667 aa  492  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4865  cytochrome-c oxidase  49.44 
 
 
567 aa  489  1e-137  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>