More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6885 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_1587  cytochrome c oxidase, subunit I  60.73 
 
 
548 aa  677    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0827  cytochrome c oxidase, subunit I  62.45 
 
 
540 aa  680    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.541437  normal  0.274424 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5816  cytochrome c oxidase, subunit I  93.36 
 
 
558 aa  1031    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.099341  hitchhiker  0.00453601 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4436  cytochrome-c oxidase  68.32 
 
 
545 aa  746    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0196071  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5947  cytochrome c oxidase, subunit I  61.93 
 
 
554 aa  681    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1245  cytochrome c oxidase  65.9 
 
 
535 aa  712    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6230  cytochrome c oxidase, subunit I  72.26 
 
 
565 aa  811    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.33684  normal  0.0324677 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6885  cytochrome c oxidase, subunit I  100 
 
 
558 aa  1116    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4179  cytochrome c oxidase, subunit I  75.32 
 
 
557 aa  853    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.263418  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2995  cytochrome-c oxidase  61.36 
 
 
544 aa  694    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0459294 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0025  cytochrome c oxidase, subunit I  74.49 
 
 
563 aa  833    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.785934 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0223  cytochrome c oxidase, subunit I  73.36 
 
 
563 aa  832    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.109955  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0167  cytochrome c oxidase, subunit I  72.53 
 
 
563 aa  832    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.357082  normal  0.0110936 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1037  cytochrome c oxidase, subunit I  60.45 
 
 
558 aa  683    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.107378 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1521  cytochrome c oxidase, subunit I  60.96 
 
 
552 aa  689    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.999426  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3990  cytochrome c oxidase, subunit I  53.75 
 
 
564 aa  592  1e-168  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.74194  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2420  cytochrome c oxidase, subunit I  53.13 
 
 
556 aa  565  1e-160  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.040842  normal  0.534979 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0230  cytochrome c oxidase, subunit I  52.9 
 
 
565 aa  550  1e-155  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.123434  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0852  cytochrome c oxidase, subunit I  50.36 
 
 
554 aa  549  1e-155  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.783048  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0856  cytochrome c oxidase, subunit I  50.36 
 
 
554 aa  549  1e-155  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0849  cytochrome c oxidase subunit I type  49.28 
 
 
555 aa  550  1e-155  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0408  cytochrome-c oxidase  52.38 
 
 
542 aa  550  1e-155  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0804  cytochrome-c oxidase  50.36 
 
 
554 aa  547  1e-154  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0249  cytochrome c oxidase, subunit I  52.7 
 
 
541 aa  536  1e-151  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0038308  hitchhiker  0.00422313 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0043  cytochrome c oxidase, subunit I  51.16 
 
 
539 aa  537  1e-151  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0536  cytochrome c oxidase, subunit I  52.14 
 
 
541 aa  528  1e-148  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.091525 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0219  cytochrome c oxidase, subunit I  52.79 
 
 
541 aa  523  1e-147  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1345  cytochrome-c oxidase  51.93 
 
 
541 aa  522  1e-147  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0187504  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2526  caa3-type cytochrome c oxidase, subunit I  53.58 
 
 
543 aa  521  1e-146  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000123308  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2274  cytochrome-c oxidase  51.89 
 
 
554 aa  520  1e-146  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.413145  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1541  cytochrome c oxidase, subunit I  49.42 
 
 
539 aa  513  1e-144  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2705  Cytochrome-c oxidase  51.91 
 
 
528 aa  509  1e-143  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.388874 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1823  cytochrome-c oxidase  51.61 
 
 
543 aa  509  1e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0200006  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1677  cytochrome c oxidase, subunit I  51.62 
 
 
555 aa  506  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1601  cytochrome c oxidase, subunit I  51.8 
 
 
555 aa  506  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.171665  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0042  cytochrome c oxidase, subunit I  50 
 
 
542 aa  504  1e-141  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00140919 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1212  cytochrome c oxidase, subunit I  44.02 
 
 
587 aa  456  1e-127  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1778  cytochrome-c oxidase  43.06 
 
 
590 aa  447  1.0000000000000001e-124  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.307573  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2603  cytochrome-c oxidase  43.48 
 
 
541 aa  441  9.999999999999999e-123  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.240231 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0105  cytochrome c oxidase subunit I type  43.88 
 
 
615 aa  438  1e-121  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0529  cytochrome c oxidase, subunit I  43.02 
 
 
575 aa  435  1e-120  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3574  cytochrome c oxidase subunit I  42.17 
 
 
564 aa  431  1e-119  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4072  cytochrome c oxidase, subunit I  42.29 
 
 
560 aa  429  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1776  cytochrome c oxidase, subunit I  42.03 
 
 
546 aa  426  1e-118  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04991  cytochrome c oxidase, subunit I  42.43 
 
 
546 aa  427  1e-118  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.217716 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2640  cytochrome c oxidase subunit I  41.83 
 
 
548 aa  426  1e-118  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1755  cytochrome-c oxidase  43.59 
 
 
556 aa  423  1e-117  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.900369  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04421  cytochrome c oxidase, subunit I  41.79 
 
 
552 aa  424  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0710  cytochrome c oxidase subunit I  43.4 
 
 
806 aa  424  1e-117  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.153161  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3957  cytochrome c oxidase, subunit I  42.07 
 
 
553 aa  421  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0447  cytochrome c oxidase, subunit I  42.55 
 
 
559 aa  421  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.130684 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0607  cytochrome-c oxidase  42.5 
 
 
555 aa  420  1e-116  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04691  cytochrome c oxidase, subunit I  43.14 
 
 
541 aa  419  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2264  cytochrome-c oxidase  43.08 
 
 
641 aa  420  1e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05001  cytochrome c oxidase, subunit I  42.94 
 
 
541 aa  419  1e-116  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3557  cytochrome c oxidase subunit I type  43.27 
 
 
641 aa  418  9.999999999999999e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0739643 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0444  cytochrome c oxidase, subunit I  43.14 
 
 
541 aa  418  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05071  cytochrome c oxidase, subunit I  43 
 
 
539 aa  416  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0629  cytochrome c oxidase, subunit I  42.45 
 
 
796 aa  416  9.999999999999999e-116  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.161655 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06411  cytochrome c oxidase, subunit I  43.08 
 
 
558 aa  418  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.113459 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5317  cytochrome c oxidase  39.55 
 
 
554 aa  414  1e-114  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1909  cytochrome c oxidase, subunit I  41.79 
 
 
566 aa  412  1e-114  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0585  cytochrome c oxidase, subunit I  40.94 
 
 
555 aa  414  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0568  cytochrome c oxidase, subunit I  40.94 
 
 
555 aa  414  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0490  cytochrome-c oxidase  44.94 
 
 
589 aa  414  1e-114  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.575526  normal  0.236102 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3576  cytochrome c oxidase, subunit I  39.92 
 
 
553 aa  411  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0128043 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1960  cytochrome c oxidase, subunit I  44.32 
 
 
561 aa  410  1e-113  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00322963  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1902  Cytochrome-c oxidase  42.08 
 
 
638 aa  409  1e-113  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.96615  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0197  cytochrome-c oxidase  41.76 
 
 
534 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2348  cytochrome c oxidase, subunit I  41.3 
 
 
638 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0177  cytochrome c oxidase, subunit I  41.34 
 
 
540 aa  404  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0095  cytochrome c oxidase, subunit I  40.42 
 
 
638 aa  404  1e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160377  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4000  cytochrome c oxidase subunit I type  41.18 
 
 
534 aa  402  1e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1016  cytochrome-c oxidase  43.3 
 
 
563 aa  402  9.999999999999999e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0984  cytochrome c oxidase, subunit I  40.23 
 
 
619 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0124  cytochrome-c oxidase  40.94 
 
 
536 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1823  cytochrome c oxidase, subunit I  41.48 
 
 
563 aa  401  9.999999999999999e-111  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0989  cytochrome c oxidase, subunit I  42.03 
 
 
596 aa  401  9.999999999999999e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1517  cytochrome c oxidase subunit I  42.96 
 
 
572 aa  399  9.999999999999999e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0873125  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0235  cytochrome c oxidase, subunit I  40.83 
 
 
540 aa  399  1e-109  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29310  cytochrome c oxidase, subunit I  41.2 
 
 
594 aa  398  1e-109  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.426648 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3541  cytochrome c oxidase, subunit I  42.77 
 
 
743 aa  395  1e-109  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2957  Cytochrome-c oxidase  38.71 
 
 
585 aa  398  1e-109  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1561  cytochrome c oxidase, subunit I  42.51 
 
 
567 aa  396  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0534328  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0078  cytochrome-c oxidase  41.88 
 
 
530 aa  395  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1931  cytochrome c oxidase, subunit I  43.15 
 
 
560 aa  397  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.768884  normal  0.452055 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1452  cytochrome c oxidase, subunit I  43.01 
 
 
583 aa  397  1e-109  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0835225  normal  0.133355 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01010  cytochrome c oxidase, subunit I  43.05 
 
 
530 aa  397  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.113343  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0181  cytochrome c oxidase subunit I  42.47 
 
 
530 aa  395  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3518  cytochrome-c oxidase  40.49 
 
 
535 aa  397  1e-109  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3865  cytochrome-c oxidase  40.78 
 
 
530 aa  397  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3140  Cytochrome-c oxidase  39.29 
 
 
565 aa  396  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3992  cytochrome c oxidase, subunit I  40.59 
 
 
530 aa  395  1e-109  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0178  cytochrome c oxidase, subunit I  39.25 
 
 
559 aa  393  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.942874  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4299  cytochrome c oxidase, subunit I  39.65 
 
 
555 aa  394  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00437809  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2990  cytochrome c oxidase, subunit I  41.49 
 
 
638 aa  393  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.155569  normal  0.0328949 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0120  cytochrome c oxidase, subunit I  41.88 
 
 
529 aa  393  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1681  cytochrome-c oxidase  41.22 
 
 
539 aa  395  1e-108  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.793322  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0143  cytochrome-c oxidase  41.88 
 
 
527 aa  394  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0782  cytochrome c oxidase, subunit III:cytochrome c oxidase, subunit I  39.66 
 
 
974 aa  393  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>