More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4179 on replicon NC_007959
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0223  cytochrome c oxidase, subunit I  75.51 
 
 		 563 aa  842    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.109955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6230  cytochrome c oxidase, subunit I  74.32 
 
 		 565 aa  831    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.33684  normal  0.0324677 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1587  cytochrome c oxidase, subunit I  63.48 
 
 		 548 aa  709    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4436  cytochrome-c oxidase  69.66 
 
 		 545 aa  749    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0196071  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0167  cytochrome c oxidase, subunit I  74.73 
 
 		 563 aa  841    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.357082  normal  0.0110936 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1245  cytochrome c oxidase  66.67 
 
 		 535 aa  738    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0827  cytochrome c oxidase, subunit I  64.56 
 
 		 540 aa  698    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.541437  normal  0.274424 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1037  cytochrome c oxidase, subunit I  62.09 
 
 		 558 aa  701    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.107378 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1521  cytochrome c oxidase, subunit I  64.9 
 
 		 552 aa  714    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.999426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4179  cytochrome c oxidase, subunit I  100 
 
 		 557 aa  1113    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.263418  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5816  cytochrome c oxidase, subunit I  75.5 
 
 		 558 aa  845    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.099341  hitchhiker  0.00453601 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2995  cytochrome-c oxidase  64.26 
 
 		 544 aa  720    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0459294 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6885  cytochrome c oxidase, subunit I  75.32 
 
 		 558 aa  854    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5947  cytochrome c oxidase, subunit I  67.5 
 
 		 554 aa  716    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0025  cytochrome c oxidase, subunit I  74.14 
 
 		 563 aa  837    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.785934 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3990  cytochrome c oxidase, subunit I  57.85 
 
 		 564 aa  605  9.999999999999999e-173  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.74194  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2420  cytochrome c oxidase, subunit I  53.75 
 
 		 556 aa  600  1e-170  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.040842  normal  0.534979 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0856  cytochrome c oxidase, subunit I  54.93 
 
 		 554 aa  582  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0852  cytochrome c oxidase, subunit I  54.93 
 
 		 554 aa  582  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.783048  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0849  cytochrome c oxidase subunit I type  55.39 
 
 		 555 aa  580  1e-164  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0804  cytochrome-c oxidase  55.31 
 
 		 554 aa  581  1e-164  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0230  cytochrome c oxidase, subunit I  55.39 
 
 		 565 aa  571  1.0000000000000001e-162  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.123434  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0408  cytochrome-c oxidase  53.42 
 
 		 542 aa  561  1.0000000000000001e-159  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0249  cytochrome c oxidase, subunit I  55.02 
 
 		 541 aa  558  1e-158  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0038308  hitchhiker  0.00422313 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2705  Cytochrome-c oxidase  56.3 
 
 		 528 aa  542  1e-153  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.388874 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0043  cytochrome c oxidase, subunit I  51.92 
 
 		 539 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0219  cytochrome c oxidase, subunit I  54.91 
 
 		 541 aa  536  1e-151  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0536  cytochrome c oxidase, subunit I  53.04 
 
 		 541 aa  537  1e-151  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.091525 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2526  caa3-type cytochrome c oxidase, subunit I  56.2 
 
 		 543 aa  535  1e-151  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000123308  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1345  cytochrome-c oxidase  54.44 
 
 		 541 aa  531  1e-150  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0187504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2274  cytochrome-c oxidase  53.82 
 
 		 554 aa  531  1e-149  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.413145  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1677  cytochrome c oxidase, subunit I  53.73 
 
 		 555 aa  522  1e-147  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1601  cytochrome c oxidase, subunit I  53.54 
 
 		 555 aa  521  1e-147  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.171665  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1541  cytochrome c oxidase, subunit I  51.43 
 
 		 539 aa  520  1e-146  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0042  cytochrome c oxidase, subunit I  52.87 
 
 		 542 aa  517  1.0000000000000001e-145  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00140919 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1823  cytochrome-c oxidase  52.59 
 
 		 543 aa  511  1e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0200006  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1778  cytochrome-c oxidase  44.64 
 
 		 590 aa  461  9.999999999999999e-129  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.307573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1212  cytochrome c oxidase, subunit I  44.86 
 
 		 587 aa  456  1e-127  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2603  cytochrome-c oxidase  44.27 
 
 		 541 aa  451  1e-125  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.240231 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1776  cytochrome c oxidase, subunit I  44.4 
 
 		 546 aa  447  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0447  cytochrome c oxidase, subunit I  44.38 
 
 		 559 aa  446  1.0000000000000001e-124  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.130684 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04991  cytochrome c oxidase, subunit I  44.4 
 
 		 546 aa  448  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.217716 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2640  cytochrome c oxidase subunit I  43.76 
 
 		 548 aa  443  1e-123  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04691  cytochrome c oxidase, subunit I  45.1 
 
 		 541 aa  442  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0529  cytochrome c oxidase, subunit I  43.73 
 
 		 575 aa  441  9.999999999999999e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3574  cytochrome c oxidase subunit I  43.59 
 
 		 564 aa  440  9.999999999999999e-123  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1755  cytochrome-c oxidase  44.97 
 
 		 556 aa  441  9.999999999999999e-123  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.900369  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0607  cytochrome-c oxidase  44.96 
 
 		 555 aa  440  9.999999999999999e-123  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05001  cytochrome c oxidase, subunit I  44.9 
 
 		 541 aa  441  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3957  cytochrome c oxidase, subunit I  44.51 
 
 		 553 aa  442  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4072  cytochrome c oxidase, subunit I  44.21 
 
 		 560 aa  441  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05071  cytochrome c oxidase, subunit I  44.38 
 
 		 539 aa  437  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0444  cytochrome c oxidase, subunit I  44.12 
 
 		 541 aa  436  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04421  cytochrome c oxidase, subunit I  43.74 
 
 		 552 aa  435  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06411  cytochrome c oxidase, subunit I  43.05 
 
 		 558 aa  437  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.113459 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0105  cytochrome c oxidase subunit I type  44.32 
 
 		 615 aa  434  1e-120  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0710  cytochrome c oxidase subunit I  45.45 
 
 		 806 aa  432  1e-120  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.153161  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0629  cytochrome c oxidase, subunit I  45.28 
 
 		 796 aa  431  1e-119  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.161655 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0585  cytochrome c oxidase, subunit I  42.91 
 
 		 555 aa  425  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0568  cytochrome c oxidase, subunit I  42.91 
 
 		 555 aa  425  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1909  cytochrome c oxidase, subunit I  45.7 
 
 		 566 aa  424  1e-117  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2264  cytochrome-c oxidase  42.1 
 
 		 641 aa  421  1e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3557  cytochrome c oxidase subunit I type  44.03 
 
 		 641 aa  419  1e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0739643 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1902  Cytochrome-c oxidase  43.02 
 
 		 638 aa  421  1e-116  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.96615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3576  cytochrome c oxidase, subunit I  41.51 
 
 		 553 aa  417  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0128043 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5317  cytochrome c oxidase  40.64 
 
 		 554 aa  417  9.999999999999999e-116  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1695  cytochrome-c oxidase  43.16 
 
 		 570 aa  410  1e-113  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.373959  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3659  cytochrome c oxidase  41.41 
 
 		 555 aa  409  1e-113  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1931  cytochrome c oxidase, subunit I  43.63 
 
 		 560 aa  409  1e-113  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.768884  normal  0.452055 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1960  cytochrome c oxidase, subunit I  43.38 
 
 		 561 aa  409  1e-113  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00322963  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4299  cytochrome c oxidase, subunit I  39.85 
 
 		 555 aa  405  1.0000000000000001e-112  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00437809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2015  cytochrome c oxidase, subunit I  43.22 
 
 		 574 aa  407  1.0000000000000001e-112  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.466392  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0277  cytochrome-c oxidase  41.41 
 
 		 562 aa  407  1.0000000000000001e-112  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0513618 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1016  cytochrome-c oxidase  43.28 
 
 		 563 aa  404  1e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3140  Cytochrome-c oxidase  40.07 
 
 		 565 aa  405  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0490  cytochrome-c oxidase  43.86 
 
 		 589 aa  403  1e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.575526  normal  0.236102 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3140  cytochrome-c oxidase  44.53 
 
 		 582 aa  402  1e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15640  cytochrome c oxidase, subunit I  43.23 
 
 		 595 aa  399  9.999999999999999e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.315417  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3149  cytochrome c oxidase, subunit I  41.07 
 
 		 558 aa  401  9.999999999999999e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0178  cytochrome c oxidase, subunit I  40.82 
 
 		 559 aa  399  9.999999999999999e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.942874  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0895  cytochrome c oxidase subunit I type  43.17 
 
 		 561 aa  400  9.999999999999999e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.822333  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1517  cytochrome c oxidase subunit I  43.36 
 
 		 572 aa  400  9.999999999999999e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0873125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3541  cytochrome c oxidase, subunit I  43.61 
 
 		 743 aa  401  9.999999999999999e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1823  cytochrome c oxidase, subunit I  43.66 
 
 		 563 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2081  cytochrome c oxidase, subunit I  43.22 
 
 		 607 aa  400  9.999999999999999e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4865  cytochrome-c oxidase  43.83 
 
 		 567 aa  399  9.999999999999999e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2198  cytochrome c oxidase, subunit I  43.19 
 
 		 589 aa  398  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.552552  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1452  cytochrome c oxidase, subunit I  42.04 
 
 		 583 aa  398  1e-109  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0835225  normal  0.133355 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0881  cytochrome-c oxidase  40.39 
 
 		 560 aa  397  1e-109  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2671  Cytochrome-c oxidase  42.81 
 
 		 554 aa  395  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.352805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0177  cytochrome c oxidase, subunit I  40.26 
 
 		 540 aa  397  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0197  cytochrome-c oxidase  41.25 
 
 		 534 aa  397  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2622  cytochrome c oxidase, subunit I  41.67 
 
 		 594 aa  395  1e-109  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2957  Cytochrome-c oxidase  37.94 
 
 		 585 aa  396  1e-109  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0124  cytochrome-c oxidase  41.06 
 
 		 536 aa  393  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1886  cytochrome c oxidase, subunit I  42.23 
 
 		 594 aa  395  1e-108  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00704167 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0989  cytochrome c oxidase, subunit I  42.72 
 
 		 596 aa  394  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29310  cytochrome c oxidase, subunit I  40.55 
 
 		 594 aa  394  1e-108  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.426648 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1290  cytochrome c oxidase, subunit I  42.8 
 
 		 564 aa  395  1e-108  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.372246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1681  cytochrome-c oxidase  40.94 
 
 		 539 aa  394  1e-108  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.793322  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>