More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1541 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU0219  cytochrome c oxidase, subunit I  69.56 
 
 
541 aa  727    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1345  cytochrome-c oxidase  74.3 
 
 
541 aa  781    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0187504  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0043  cytochrome c oxidase, subunit I  67.76 
 
 
539 aa  735    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1541  cytochrome c oxidase, subunit I  100 
 
 
539 aa  1071    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2526  caa3-type cytochrome c oxidase, subunit I  68.75 
 
 
543 aa  711    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000123308  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0249  cytochrome c oxidase, subunit I  70.33 
 
 
541 aa  755    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0038308  hitchhiker  0.00422313 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1823  cytochrome-c oxidase  75.19 
 
 
543 aa  756    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0200006  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0042  cytochrome c oxidase, subunit I  66.41 
 
 
542 aa  686    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00140919 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0536  cytochrome c oxidase, subunit I  77.36 
 
 
541 aa  810    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.091525 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0408  cytochrome-c oxidase  56.08 
 
 
542 aa  608  1e-173  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0230  cytochrome c oxidase, subunit I  55.6 
 
 
565 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.123434  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2420  cytochrome c oxidase, subunit I  53.8 
 
 
556 aa  573  1.0000000000000001e-162  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.040842  normal  0.534979 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3990  cytochrome c oxidase, subunit I  54.92 
 
 
564 aa  570  1e-161  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.74194  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1521  cytochrome c oxidase, subunit I  54.81 
 
 
552 aa  567  1e-160  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.999426  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1587  cytochrome c oxidase, subunit I  54.42 
 
 
548 aa  562  1.0000000000000001e-159  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2995  cytochrome-c oxidase  52.49 
 
 
544 aa  561  1e-158  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0459294 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5947  cytochrome c oxidase, subunit I  53.67 
 
 
554 aa  543  1e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0025  cytochrome c oxidase, subunit I  52.71 
 
 
563 aa  537  1e-151  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.785934 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0849  cytochrome c oxidase subunit I type  52.42 
 
 
555 aa  537  1e-151  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4436  cytochrome-c oxidase  51.82 
 
 
545 aa  538  1e-151  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0196071  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0223  cytochrome c oxidase, subunit I  52.33 
 
 
563 aa  535  1e-151  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.109955  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0167  cytochrome c oxidase, subunit I  52.13 
 
 
563 aa  535  1e-151  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.357082  normal  0.0110936 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1037  cytochrome c oxidase, subunit I  50.46 
 
 
558 aa  533  1e-150  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.107378 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1245  cytochrome c oxidase  50.48 
 
 
535 aa  527  1e-148  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0856  cytochrome c oxidase, subunit I  51.25 
 
 
554 aa  524  1e-147  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0852  cytochrome c oxidase, subunit I  51.25 
 
 
554 aa  524  1e-147  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.783048  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0804  cytochrome-c oxidase  51.25 
 
 
554 aa  521  1e-146  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2274  cytochrome-c oxidase  52.79 
 
 
554 aa  517  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.413145  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6230  cytochrome c oxidase, subunit I  51.75 
 
 
565 aa  514  1e-144  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.33684  normal  0.0324677 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0827  cytochrome c oxidase, subunit I  50.76 
 
 
540 aa  513  1e-144  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.541437  normal  0.274424 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4179  cytochrome c oxidase, subunit I  51.84 
 
 
557 aa  508  1e-143  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.263418  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6885  cytochrome c oxidase, subunit I  49.42 
 
 
558 aa  505  9.999999999999999e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1601  cytochrome c oxidase, subunit I  52.97 
 
 
555 aa  502  1e-141  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.171665  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5816  cytochrome c oxidase, subunit I  49.51 
 
 
558 aa  505  1e-141  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.099341  hitchhiker  0.00453601 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1677  cytochrome c oxidase, subunit I  52.97 
 
 
555 aa  501  1e-140  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2705  Cytochrome-c oxidase  50.87 
 
 
528 aa  490  1e-137  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.388874 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1212  cytochrome c oxidase, subunit I  44.61 
 
 
587 aa  462  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0124  cytochrome-c oxidase  42.64 
 
 
536 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0105  cytochrome c oxidase subunit I type  42.64 
 
 
615 aa  439  9.999999999999999e-123  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0143  cytochrome-c oxidase  43.14 
 
 
527 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0104  cytochrome c oxidase, subunit I  43.53 
 
 
529 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0543399  normal  0.340951 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06271  cytochrome c oxidase, subunit I  42.64 
 
 
546 aa  438  1e-121  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0120  cytochrome c oxidase, subunit I  43.53 
 
 
529 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3484  cytochrome-c oxidase  42.55 
 
 
531 aa  436  1e-121  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.139839 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0118  cytochrome c oxidase, subunit I  43.53 
 
 
529 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0122351 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0177  cytochrome c oxidase, subunit I  42.55 
 
 
540 aa  437  1e-121  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01010  cytochrome c oxidase, subunit I  42.67 
 
 
530 aa  437  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.113343  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2603  cytochrome-c oxidase  44.01 
 
 
541 aa  435  1e-121  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.240231 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0197  cytochrome-c oxidase  42.55 
 
 
534 aa  436  1e-121  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0123  cytochrome c oxidase, subunit I  43.53 
 
 
529 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2071  cytochrome c oxidase, subunit I  43.38 
 
 
661 aa  436  1e-121  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.619356 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3906  cytochrome-c oxidase  41.72 
 
 
547 aa  432  1e-120  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.701239  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0585  cytochrome c oxidase, subunit I  43.32 
 
 
555 aa  432  1e-120  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0568  cytochrome c oxidase, subunit I  43.32 
 
 
555 aa  432  1e-120  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4607  cytochrome c oxidase, subunit I  41.96 
 
 
530 aa  430  1e-119  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4000  cytochrome c oxidase subunit I type  42.16 
 
 
534 aa  429  1e-119  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3783  cytochrome-c oxidase  41.96 
 
 
530 aa  430  1e-119  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1039  cytochrome c oxidase, subunit I  43.33 
 
 
536 aa  429  1e-119  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0529  cytochrome c oxidase, subunit I  44.51 
 
 
575 aa  431  1e-119  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2763  cytochrome c oxidase, subunit I  43.77 
 
 
535 aa  429  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.281014  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4072  cytochrome c oxidase, subunit I  44.06 
 
 
560 aa  432  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0078  cytochrome-c oxidase  42.94 
 
 
530 aa  432  1e-119  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001446  cytochrome c oxidase polypeptide I  42.75 
 
 
543 aa  431  1e-119  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.523828  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6175  cytochrome-c oxidase  43.58 
 
 
535 aa  429  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0181  cytochrome c oxidase subunit I  42.75 
 
 
530 aa  429  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3574  cytochrome c oxidase subunit I  44.38 
 
 
564 aa  430  1e-119  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2166  cytochrome-c oxidase  44.49 
 
 
532 aa  429  1e-119  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.655768  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4113  cytochrome c oxidase, subunit I  41.76 
 
 
531 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1381  cytochrome-c oxidase  42.11 
 
 
543 aa  429  1e-119  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.442131  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4312  cytochrome c oxidase, subunit I  41.76 
 
 
530 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1681  cytochrome-c oxidase  41.75 
 
 
539 aa  429  1e-119  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.793322  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3518  cytochrome-c oxidase  41.96 
 
 
535 aa  430  1e-119  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0153  cytochrome-c oxidase  41.76 
 
 
530 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2232  cytochrome-c oxidase  43.58 
 
 
535 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4181  cytochrome c oxidase subunit I type  41.76 
 
 
530 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3865  cytochrome-c oxidase  41.57 
 
 
530 aa  429  1e-119  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01300  cytochrome c oxidase, subunit I  42.94 
 
 
530 aa  430  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.324911  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3992  cytochrome c oxidase, subunit I  41.57 
 
 
530 aa  429  1e-119  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4391  cytochrome c oxidase, subunit I  40.81 
 
 
543 aa  427  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0363  cytochrome C oxidase polypeptide I  43.25 
 
 
534 aa  428  1e-118  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0063  cytochrome-c oxidase  42.75 
 
 
527 aa  426  1e-118  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2850  cytochrome c oxidase, subunit I  43.55 
 
 
535 aa  427  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3557  cytochrome-c oxidase  43.6 
 
 
569 aa  428  1e-118  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0159482  normal  0.969865 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0508  cytochrome c oxidase, subunit I  43.55 
 
 
535 aa  427  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3196  cytochrome c oxidase, subunit I  43.55 
 
 
535 aa  427  1e-118  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0457  cytochrome c oxidase, subunit I  43.36 
 
 
535 aa  427  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0673  cytochrome c oxidase polypeptide I  43.55 
 
 
535 aa  427  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0425547  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0427  cytochrome c oxidase, subunit I  43.36 
 
 
535 aa  426  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2857  cytochrome c oxidase, subunit I  43.58 
 
 
535 aa  428  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.978045  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0037  cytochrome-c oxidase  42.16 
 
 
516 aa  426  1e-118  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.857978 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0527  cytochrome-c oxidase  43.24 
 
 
566 aa  426  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.164942  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0262  cytochrome c oxidase subunit I  42.86 
 
 
536 aa  428  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0490  cytochrome c oxidase, subunit I  43.55 
 
 
535 aa  427  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.428765  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3792  cytochrome-c oxidase  41.57 
 
 
530 aa  427  1e-118  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0257  cytochrome-c oxidase  41.18 
 
 
531 aa  427  1e-118  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2901  cytochrome-c oxidase  43.58 
 
 
535 aa  428  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2846  cytochrome-c oxidase  43.58 
 
 
535 aa  428  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.591708  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1423  cytochrome c oxidase, subunit I  43.55 
 
 
535 aa  427  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0277  cytochrome c oxidase, subunit I  43.58 
 
 
537 aa  424  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2716  cytochrome c oxidase, subunit I CyoB  42.02 
 
 
534 aa  424  1e-117  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.308543 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>