More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3734 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2167  Cytochrome-c oxidase  98.48 
 
 		 657 aa  1305    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.760505 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5671  Cytochrome-c oxidase  84.09 
 
 		 627 aa  1069    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01280  Cytochrome-c oxidase  64.77 
 
 		 608 aa  773    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3734  Cytochrome-c oxidase  100 
 
 		 657 aa  1326    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3470  Cytochrome-c oxidase  80 
 
 		 627 aa  980    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.127917 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1641  cytochrome-c oxidase  66.67 
 
 		 600 aa  785    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  unclonable  0.00000000172632  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2206  cytochrome c oxidase, subunit I  75.95 
 
 		 609 aa  916    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000000515262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0522  Cytochrome-c oxidase  64.67 
 
 		 610 aa  773    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000527837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0295  Cytochrome-c oxidase  65.83 
 
 		 629 aa  823    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00055862  hitchhiker  0.00186796 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6950  Cytochrome-c oxidase  72.26 
 
 		 616 aa  878    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.910069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3633  cytochrome-c oxidase  50.51 
 
 		 585 aa  606  9.999999999999999e-173  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.769302  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1565  cytochrome C oxidase polypeptide I  51.83 
 
 		 586 aa  603  1.0000000000000001e-171  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3796  cytochrome c oxidase, subunit I  50.17 
 
 		 586 aa  603  1.0000000000000001e-171  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3956  cytochrome c oxidase subunit I  50.67 
 
 		 585 aa  602  1.0000000000000001e-171  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.134754 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4873  cytochrome c oxidase, subunit I  50.17 
 
 		 586 aa  603  1.0000000000000001e-171  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0999966 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7361  cytochrome-c oxidase  50.93 
 
 		 586 aa  593  1e-168  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0727  cytochrome-c oxidase  48.83 
 
 		 588 aa  593  1e-168  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6210  cytochrome-c oxidase  51.21 
 
 		 586 aa  594  1e-168  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5937  cytochrome c oxidase, subunit I  51.22 
 
 		 586 aa  591  1e-167  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3897  cytochrome c oxidase, subunit I  50.76 
 
 		 589 aa  590  1e-167  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2426  cytochrome c oxidase subunit I type  50.77 
 
 		 592 aa  592  1e-167  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.205306  normal  0.705056 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5129  cytochrome c oxidase, subunit I  48.83 
 
 		 590 aa  585  1e-166  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.828431  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2359  cytochrome c oxidase, subunit I  50.77 
 
 		 591 aa  587  1e-166  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.361035  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2267  cytochrome c oxidase, subunit I  49.41 
 
 		 589 aa  587  1e-166  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2344  cytochrome c oxidase, subunit I  52.71 
 
 		 584 aa  583  1.0000000000000001e-165  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.250818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0253  cytochrome c oxidase, subunit I  49.48 
 
 		 588 aa  584  1.0000000000000001e-165  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00642572 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2593  cytochrome c oxidase, subunit I  48.9 
 
 		 592 aa  584  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0650297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2475  cytochrome c oxidase, subunit I  49.24 
 
 		 591 aa  579  1e-164  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0438  cytochrome-c oxidase  46.19 
 
 		 595 aa  521  1e-146  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.118932 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2957  Cytochrome-c oxidase  45.66 
 
 		 585 aa  498  1e-139  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2861  cytochrome-c oxidase  45.55 
 
 		 596 aa  444  1e-123  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.480216  normal  0.0169225 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1212  cytochrome c oxidase, subunit I  40.8 
 
 		 587 aa  436  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2603  cytochrome-c oxidase  41.9 
 
 		 541 aa  431  1e-119  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.240231 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0585  cytochrome c oxidase, subunit I  41.58 
 
 		 555 aa  419  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0568  cytochrome c oxidase, subunit I  41.58 
 
 		 555 aa  419  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04421  cytochrome c oxidase, subunit I  41.68 
 
 		 552 aa  419  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2640  cytochrome c oxidase subunit I  42.02 
 
 		 548 aa  421  1e-116  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0301  cytochrome c oxidase, subunit I  42.78 
 
 		 516 aa  417  9.999999999999999e-116  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.249737  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4072  cytochrome c oxidase, subunit I  43.43 
 
 		 560 aa  416  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0363  cytochrome C oxidase polypeptide I  41.96 
 
 		 534 aa  412  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0277  cytochrome c oxidase, subunit I  41.84 
 
 		 537 aa  412  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0447  cytochrome c oxidase, subunit I  43.11 
 
 		 559 aa  412  1e-114  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.130684 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06411  cytochrome c oxidase, subunit I  41.43 
 
 		 558 aa  413  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.113459 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1381  cytochrome-c oxidase  41.46 
 
 		 543 aa  409  1e-113  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.442131  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3196  cytochrome c oxidase, subunit I  41.49 
 
 		 535 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2850  cytochrome c oxidase, subunit I  41.49 
 
 		 535 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0508  cytochrome c oxidase, subunit I  41.49 
 
 		 535 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0673  cytochrome c oxidase polypeptide I  41.49 
 
 		 535 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0425547  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0607  cytochrome-c oxidase  40.49 
 
 		 555 aa  409  1e-113  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0490  cytochrome c oxidase, subunit I  41.49 
 
 		 535 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.428765  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0169  cytochrome c oxidase, subunit I  41.49 
 
 		 535 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.98257  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1681  cytochrome-c oxidase  42.29 
 
 		 539 aa  410  1e-113  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.793322  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4170  cytochrome-c oxidase  41.31 
 
 		 537 aa  409  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.751334 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1423  cytochrome c oxidase, subunit I  41.49 
 
 		 535 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3957  cytochrome c oxidase, subunit I  41.44 
 
 		 553 aa  409  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0729  cytochrome c oxidase, subunit I  41.56 
 
 		 555 aa  407  1.0000000000000001e-112  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.484854  normal  0.0785351 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0238  cytochrome c oxidase, subunit I  42.32 
 
 		 534 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0213097 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0219  cytochrome c oxidase, subunit I  42.32 
 
 		 534 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.886427 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1755  cytochrome-c oxidase  40.46 
 
 		 556 aa  407  1.0000000000000001e-112  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.900369  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0444  cytochrome c oxidase, subunit I  40.18 
 
 		 541 aa  408  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0427  cytochrome c oxidase, subunit I  41.31 
 
 		 535 aa  409  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05001  cytochrome c oxidase, subunit I  40 
 
 		 541 aa  407  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04691  cytochrome c oxidase, subunit I  40.18 
 
 		 541 aa  407  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1778  cytochrome-c oxidase  38.42 
 
 		 590 aa  409  1.0000000000000001e-112  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.307573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05071  cytochrome c oxidase, subunit I  39.58 
 
 		 539 aa  404  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1939  cytochrome-c oxidase  43.53 
 
 		 543 aa  403  1e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0346979  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1776  cytochrome c oxidase, subunit I  39.19 
 
 		 546 aa  404  1e-111  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0529  cytochrome c oxidase, subunit I  40.59 
 
 		 575 aa  405  1e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1003  cytochrome c oxidase, subunit I  41.56 
 
 		 518 aa  402  1e-111  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0545  cytochrome c oxidase, subunit I  40.96 
 
 		 537 aa  405  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0457  cytochrome c oxidase, subunit I  41.49 
 
 		 535 aa  405  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1238  cytochrome c oxidase, subunit I  42.67 
 
 		 554 aa  404  1e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.28366 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1644  cytochrome c oxidase, subunit I  41.88 
 
 		 535 aa  403  1e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.336541  normal  0.908171 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2348  cytochrome c oxidase, subunit I  42.24 
 
 		 542 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.056683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2763  cytochrome c oxidase, subunit I  42.51 
 
 		 535 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.281014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04991  cytochrome c oxidase, subunit I  39.02 
 
 		 546 aa  402  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.217716 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2232  cytochrome-c oxidase  42.62 
 
 		 535 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0261  cytochrome c oxidase, subunit I  42.42 
 
 		 542 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.043486  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3557  cytochrome c oxidase subunit I type  40.83 
 
 		 641 aa  397  1e-109  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0739643 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1687  cytochrome c oxidase, subunit I  42.17 
 
 		 590 aa  397  1e-109  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.418885  normal  0.0786402 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3659  cytochrome c oxidase  38.3 
 
 		 555 aa  398  1e-109  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6175  cytochrome-c oxidase  42.43 
 
 		 535 aa  398  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2166  cytochrome-c oxidase  42.11 
 
 		 532 aa  397  1e-109  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.655768  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4391  cytochrome c oxidase, subunit I  40.96 
 
 		 543 aa  398  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0670  cytochrome c oxidase subunit I type  42.24 
 
 		 535 aa  396  1e-109  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.154602  normal  0.969161 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0408  cytochrome-c oxidase  38.84 
 
 		 542 aa  398  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0262  cytochrome c oxidase subunit I  43.05 
 
 		 536 aa  396  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0277  cytochrome-c oxidase  37.48 
 
 		 562 aa  397  1e-109  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0513618 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2857  cytochrome c oxidase, subunit I  42.62 
 
 		 535 aa  399  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.978045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2901  cytochrome-c oxidase  42.33 
 
 		 535 aa  399  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2846  cytochrome-c oxidase  42.62 
 
 		 535 aa  399  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.591708  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3906  cytochrome-c oxidase  42.21 
 
 		 547 aa  394  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.701239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0326  cytochrome c oxidase subunit I  40.07 
 
 		 526 aa  392  1e-108  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.283481  normal  0.0134906 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0900  cytochrome c oxidase, subunit I  39.61 
 
 		 541 aa  395  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0552276  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3574  cytochrome c oxidase subunit I  39.04 
 
 		 564 aa  395  1e-108  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0622  cytochrome c oxidase, subunit I  40.04 
 
 		 519 aa  395  1e-108  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000132617  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4788  cytochrome-c oxidase  40 
 
 		 540 aa  395  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2264  cytochrome-c oxidase  40.11 
 
 		 641 aa  395  1e-108  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3557  cytochrome-c oxidase  42.59 
 
 		 569 aa  394  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0159482  normal  0.969865 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1938  cytochrome-c oxidase  40.57 
 
 		 558 aa  393  1e-108  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.652657  normal  0.0264724 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>