More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1641 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0522  Cytochrome-c oxidase  63.15 
 
 		 610 aa  757    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000527837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6950  Cytochrome-c oxidase  61.42 
 
 		 616 aa  733    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.910069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1641  cytochrome-c oxidase  100 
 
 		 600 aa  1211    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  unclonable  0.00000000172632  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5671  Cytochrome-c oxidase  65.76 
 
 		 627 aa  812    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0295  Cytochrome-c oxidase  67.19 
 
 		 629 aa  828    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00055862  hitchhiker  0.00186796 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3734  Cytochrome-c oxidase  64.58 
 
 		 657 aa  792    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01280  Cytochrome-c oxidase  81.15 
 
 		 608 aa  977    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3470  Cytochrome-c oxidase  65.57 
 
 		 627 aa  780    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.127917 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2206  cytochrome c oxidase, subunit I  68.36 
 
 		 609 aa  817    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000000515262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2167  Cytochrome-c oxidase  64.75 
 
 		 657 aa  795    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.760505 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3633  cytochrome-c oxidase  48.46 
 
 		 585 aa  592  1e-168  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.769302  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3956  cytochrome c oxidase subunit I  48.12 
 
 		 585 aa  582  1.0000000000000001e-165  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.134754 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2344  cytochrome c oxidase, subunit I  49.83 
 
 		 584 aa  575  1.0000000000000001e-163  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.250818  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1565  cytochrome C oxidase polypeptide I  48.02 
 
 		 586 aa  574  1.0000000000000001e-162  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0727  cytochrome-c oxidase  46.23 
 
 		 588 aa  569  1e-161  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4873  cytochrome c oxidase, subunit I  48.02 
 
 		 586 aa  568  1e-161  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0999966 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3796  cytochrome c oxidase, subunit I  48.02 
 
 		 586 aa  568  1e-161  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3897  cytochrome c oxidase, subunit I  47.32 
 
 		 589 aa  566  1e-160  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6210  cytochrome-c oxidase  47.52 
 
 		 586 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2426  cytochrome c oxidase subunit I type  46.55 
 
 		 592 aa  559  1e-158  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.205306  normal  0.705056 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5129  cytochrome c oxidase, subunit I  46.6 
 
 		 590 aa  559  1e-158  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.828431  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2359  cytochrome c oxidase, subunit I  46.72 
 
 		 591 aa  561  1e-158  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.361035  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2267  cytochrome c oxidase, subunit I  47.09 
 
 		 589 aa  561  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2593  cytochrome c oxidase, subunit I  46.92 
 
 		 592 aa  559  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0650297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7361  cytochrome-c oxidase  47.86 
 
 		 586 aa  556  1e-157  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5937  cytochrome c oxidase, subunit I  47.83 
 
 		 586 aa  557  1e-157  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2475  cytochrome c oxidase, subunit I  46.64 
 
 		 591 aa  555  1e-157  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0253  cytochrome c oxidase, subunit I  45.38 
 
 		 588 aa  545  1e-154  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00642572 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2957  Cytochrome-c oxidase  47.29 
 
 		 585 aa  533  1e-150  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0438  cytochrome-c oxidase  46.01 
 
 		 595 aa  513  1e-144  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.118932 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2861  cytochrome-c oxidase  44.85 
 
 		 596 aa  447  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.480216  normal  0.0169225 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2603  cytochrome-c oxidase  41.17 
 
 		 541 aa  421  1e-116  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.240231 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1212  cytochrome c oxidase, subunit I  40.28 
 
 		 587 aa  421  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1755  cytochrome-c oxidase  40.72 
 
 		 556 aa  412  1e-114  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.900369  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0568  cytochrome c oxidase, subunit I  40.07 
 
 		 555 aa  409  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0585  cytochrome c oxidase, subunit I  40.07 
 
 		 555 aa  409  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2640  cytochrome c oxidase subunit I  39.72 
 
 		 548 aa  412  1e-113  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0363  cytochrome C oxidase polypeptide I  41.05 
 
 		 534 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4072  cytochrome c oxidase, subunit I  41.25 
 
 		 560 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04691  cytochrome c oxidase, subunit I  40.21 
 
 		 541 aa  408  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05071  cytochrome c oxidase, subunit I  40.21 
 
 		 539 aa  408  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3957  cytochrome c oxidase, subunit I  41.71 
 
 		 553 aa  408  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0607  cytochrome-c oxidase  39.65 
 
 		 555 aa  409  1.0000000000000001e-112  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0444  cytochrome c oxidase, subunit I  40.21 
 
 		 541 aa  407  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04991  cytochrome c oxidase, subunit I  38.7 
 
 		 546 aa  407  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.217716 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04421  cytochrome c oxidase, subunit I  39.4 
 
 		 552 aa  408  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1776  cytochrome c oxidase, subunit I  38.53 
 
 		 546 aa  405  1e-111  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06411  cytochrome c oxidase, subunit I  37.95 
 
 		 558 aa  404  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.113459 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4788  cytochrome-c oxidase  40.29 
 
 		 540 aa  403  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1778  cytochrome-c oxidase  38.6 
 
 		 590 aa  404  1e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.307573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05001  cytochrome c oxidase, subunit I  39.58 
 
 		 541 aa  404  1e-111  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0490  cytochrome c oxidase, subunit I  40.61 
 
 		 535 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.428765  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2850  cytochrome c oxidase, subunit I  40.61 
 
 		 535 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3196  cytochrome c oxidase, subunit I  40.61 
 
 		 535 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0508  cytochrome c oxidase, subunit I  40.61 
 
 		 535 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0529  cytochrome c oxidase, subunit I  38.76 
 
 		 575 aa  401  9.999999999999999e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0673  cytochrome c oxidase polypeptide I  40.61 
 
 		 535 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0425547  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0427  cytochrome c oxidase, subunit I  40.79 
 
 		 535 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0169  cytochrome c oxidase, subunit I  40.61 
 
 		 535 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.98257  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0729  cytochrome c oxidase, subunit I  40.69 
 
 		 555 aa  399  9.999999999999999e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.484854  normal  0.0785351 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0219  cytochrome c oxidase, subunit I  40.87 
 
 		 534 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.886427 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0277  cytochrome c oxidase, subunit I  41.37 
 
 		 537 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1423  cytochrome c oxidase, subunit I  40.61 
 
 		 535 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0238  cytochrome c oxidase, subunit I  40.69 
 
 		 534 aa  399  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0213097 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0447  cytochrome c oxidase, subunit I  40.71 
 
 		 559 aa  398  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.130684 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2166  cytochrome-c oxidase  40.29 
 
 		 532 aa  397  1e-109  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.655768  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1041  cytochrome c oxidase subunit I  40.07 
 
 		 559 aa  395  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.286412  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1681  cytochrome-c oxidase  41.94 
 
 		 539 aa  398  1e-109  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.793322  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1238  cytochrome c oxidase, subunit I  40.48 
 
 		 554 aa  395  1e-109  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.28366 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0457  cytochrome c oxidase, subunit I  40.43 
 
 		 535 aa  393  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0545  cytochrome c oxidase, subunit I  40.61 
 
 		 537 aa  393  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4391  cytochrome c oxidase, subunit I  42.12 
 
 		 543 aa  394  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4170  cytochrome-c oxidase  40.79 
 
 		 537 aa  395  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.751334 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1381  cytochrome-c oxidase  40.97 
 
 		 543 aa  394  1e-108  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.442131  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0301  cytochrome c oxidase, subunit I  40.26 
 
 		 516 aa  392  1e-107  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.249737  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3659  cytochrome c oxidase  37.85 
 
 		 555 aa  389  1e-107  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0670  cytochrome c oxidase subunit I type  40.23 
 
 		 535 aa  390  1e-107  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.154602  normal  0.969161 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4587  cytochrome-c oxidase  40.87 
 
 		 541 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0148874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0900  cytochrome c oxidase, subunit I  39.74 
 
 		 541 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0552276  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0326  cytochrome c oxidase subunit I  39.82 
 
 		 526 aa  387  1e-106  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.283481  normal  0.0134906 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1644  cytochrome c oxidase, subunit I  39.15 
 
 		 535 aa  388  1e-106  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.336541  normal  0.908171 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0829  cytochrome c oxidase, subunit I  38.96 
 
 		 537 aa  388  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.12188  normal  0.348177 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1776  cytochrome-c oxidase  41.24 
 
 		 529 aa  389  1e-106  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.142128  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0622  cytochrome c oxidase, subunit I  39.37 
 
 		 519 aa  388  1e-106  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000132617  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0153  cytochrome-c oxidase  39.23 
 
 		 530 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0880  cytochrome c oxidase, subunit I  39.81 
 
 		 541 aa  384  1e-105  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4312  cytochrome c oxidase, subunit I  39.23 
 
 		 530 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4607  cytochrome c oxidase, subunit I  39.23 
 
 		 530 aa  382  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4181  cytochrome c oxidase subunit I type  39.23 
 
 		 530 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0603  cytochrome c oxidase, subunit I  39.57 
 
 		 565 aa  383  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4113  cytochrome c oxidase, subunit I  39.23 
 
 		 531 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0536  cytochrome c oxidase, subunit I  38.21 
 
 		 541 aa  384  1e-105  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.091525 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0177  cytochrome c oxidase, subunit I  38.32 
 
 		 540 aa  384  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0261  cytochrome c oxidase, subunit I  39.57 
 
 		 542 aa  383  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.043486  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1003  cytochrome c oxidase, subunit I  40.37 
 
 		 518 aa  383  1e-105  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2763  cytochrome c oxidase, subunit I  41.09 
 
 		 535 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.281014  normal  1 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5317  cytochrome c oxidase  37.21 
 
 		 554 aa  384  1e-105  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0277  cytochrome-c oxidase  37.65 
 
 		 562 aa  382  1e-105  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0513618 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0643  cytochrome c oxidase, subunit I  39.93 
 
 		 567 aa  385  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.365928 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2348  cytochrome c oxidase, subunit I  39.71 
 
 		 542 aa  383  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.056683  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>