More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5129 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RSp1565  cytochrome C oxidase polypeptide I  81.39 
 
 		 586 aa  929    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2593  cytochrome c oxidase, subunit I  74.83 
 
 		 592 aa  867    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0650297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5937  cytochrome c oxidase, subunit I  81.13 
 
 		 586 aa  907    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0253  cytochrome c oxidase, subunit I  84.08 
 
 		 588 aa  983    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00642572 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3633  cytochrome-c oxidase  83.13 
 
 		 585 aa  993    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.769302  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2267  cytochrome c oxidase, subunit I  74.05 
 
 		 589 aa  863    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7361  cytochrome-c oxidase  80.28 
 
 		 586 aa  901    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2426  cytochrome c oxidase subunit I type  74.15 
 
 		 592 aa  847    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.205306  normal  0.705056 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0727  cytochrome-c oxidase  88.64 
 
 		 588 aa  1031    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4873  cytochrome c oxidase, subunit I  80.65 
 
 		 586 aa  933    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0999966 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2344  cytochrome c oxidase, subunit I  69.93 
 
 		 584 aa  756    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.250818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3956  cytochrome c oxidase subunit I  82.11 
 
 		 585 aa  978    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.134754 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3897  cytochrome c oxidase, subunit I  74.78 
 
 		 589 aa  865    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2475  cytochrome c oxidase, subunit I  74.69 
 
 		 591 aa  843    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2359  cytochrome c oxidase, subunit I  75.17 
 
 		 591 aa  870    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.361035  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6210  cytochrome-c oxidase  79.69 
 
 		 586 aa  911    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3796  cytochrome c oxidase, subunit I  80.65 
 
 		 586 aa  933    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5129  cytochrome c oxidase, subunit I  100 
 
 		 590 aa  1178    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.828431  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3734  Cytochrome-c oxidase  48.83 
 
 		 657 aa  593  1e-168  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5671  Cytochrome-c oxidase  48.23 
 
 		 627 aa  591  1e-167  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2206  cytochrome c oxidase, subunit I  51.2 
 
 		 609 aa  590  1e-167  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000000515262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2167  Cytochrome-c oxidase  49.41 
 
 		 657 aa  590  1e-167  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.760505 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0295  Cytochrome-c oxidase  47.85 
 
 		 629 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00055862  hitchhiker  0.00186796 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1641  cytochrome-c oxidase  47.3 
 
 		 600 aa  565  1.0000000000000001e-159  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  unclonable  0.00000000172632  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3470  Cytochrome-c oxidase  48.63 
 
 		 627 aa  561  1.0000000000000001e-159  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.127917 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6950  Cytochrome-c oxidase  48.9 
 
 		 616 aa  552  1e-156  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.910069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0522  Cytochrome-c oxidase  48.29 
 
 		 610 aa  552  1e-156  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000527837  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01280  Cytochrome-c oxidase  45.66 
 
 		 608 aa  547  1e-154  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0438  cytochrome-c oxidase  43.86 
 
 		 595 aa  473  1e-132  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.118932 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2957  Cytochrome-c oxidase  42.66 
 
 		 585 aa  455  1.0000000000000001e-126  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2861  cytochrome-c oxidase  43.66 
 
 		 596 aa  435  1e-120  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.480216  normal  0.0169225 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4299  cytochrome c oxidase, subunit I  42.78 
 
 		 555 aa  426  1e-118  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00437809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4788  cytochrome-c oxidase  42.83 
 
 		 540 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0178  cytochrome c oxidase, subunit I  43.14 
 
 		 559 aa  422  1e-117  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.942874  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3140  Cytochrome-c oxidase  41.94 
 
 		 565 aa  425  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3659  cytochrome c oxidase  41.64 
 
 		 555 aa  422  1e-117  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0585  cytochrome c oxidase, subunit I  41.88 
 
 		 555 aa  421  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0568  cytochrome c oxidase, subunit I  41.88 
 
 		 555 aa  421  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4072  cytochrome c oxidase, subunit I  44.06 
 
 		 560 aa  422  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0277  cytochrome-c oxidase  41.37 
 
 		 562 aa  420  1e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0513618 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1902  Cytochrome-c oxidase  40.96 
 
 		 638 aa  416  9.999999999999999e-116  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.96615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1212  cytochrome c oxidase, subunit I  40.38 
 
 		 587 aa  416  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0900  cytochrome c oxidase, subunit I  43.24 
 
 		 541 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0552276  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06411  cytochrome c oxidase, subunit I  41.5 
 
 		 558 aa  412  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.113459 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1687  cytochrome c oxidase, subunit I  41.9 
 
 		 590 aa  415  1e-114  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.418885  normal  0.0786402 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04421  cytochrome c oxidase, subunit I  41.35 
 
 		 552 aa  412  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4587  cytochrome-c oxidase  43.54 
 
 		 541 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0148874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3643  cytochrome-c oxidase  43.01 
 
 		 534 aa  415  1e-114  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4647  cytochrome c oxidase subunit I type  43.54 
 
 		 540 aa  411  1e-113  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.608702  normal  0.13111 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2348  cytochrome c oxidase, subunit I  42.1 
 
 		 542 aa  409  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.056683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0829  cytochrome c oxidase, subunit I  42.57 
 
 		 537 aa  412  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.12188  normal  0.348177 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0670  cytochrome c oxidase subunit I type  44.21 
 
 		 535 aa  409  1e-113  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.154602  normal  0.969161 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0261  cytochrome c oxidase, subunit I  42.28 
 
 		 542 aa  411  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.043486  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2166  cytochrome-c oxidase  42.75 
 
 		 532 aa  409  1e-113  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.655768  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0729  cytochrome c oxidase, subunit I  41.18 
 
 		 555 aa  412  1e-113  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.484854  normal  0.0785351 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04991  cytochrome c oxidase, subunit I  41.61 
 
 		 546 aa  406  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.217716 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0105  cytochrome c oxidase subunit I type  40.71 
 
 		 615 aa  407  1.0000000000000001e-112  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1776  cytochrome c oxidase, subunit I  41.42 
 
 		 546 aa  406  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0529  cytochrome c oxidase, subunit I  40 
 
 		 575 aa  406  1.0000000000000001e-112  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0895  cytochrome c oxidase subunit I type  42.44 
 
 		 561 aa  405  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.822333  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0444  cytochrome c oxidase, subunit I  40.32 
 
 		 541 aa  408  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04691  cytochrome c oxidase, subunit I  40.76 
 
 		 541 aa  407  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05001  cytochrome c oxidase, subunit I  40.58 
 
 		 541 aa  406  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3574  cytochrome c oxidase subunit I  40.38 
 
 		 564 aa  407  1.0000000000000001e-112  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0032  cytochrome c oxidase, subunit I  42.24 
 
 		 542 aa  403  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.616804 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2640  cytochrome c oxidase subunit I  40.93 
 
 		 548 aa  405  1e-111  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3586  cytochrome c oxidase, subunit I  42.34 
 
 		 542 aa  404  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.962782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29310  cytochrome c oxidase, subunit I  42.8 
 
 		 594 aa  402  1e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.426648 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3649  cytochrome c oxidase, subunit I  44.36 
 
 		 582 aa  404  1e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000010381  normal  0.149508 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3957  cytochrome c oxidase, subunit I  40.89 
 
 		 553 aa  403  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1755  cytochrome-c oxidase  41.34 
 
 		 556 aa  404  1e-111  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.900369  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0607  cytochrome-c oxidase  41.52 
 
 		 555 aa  405  1e-111  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0980  cytochrome-c oxidase  42.34 
 
 		 562 aa  404  1e-111  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0678468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3458  cytochrome c oxidase, subunit I  42.34 
 
 		 542 aa  405  1e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0256  cytochrome-c oxidase  43.16 
 
 		 537 aa  403  1e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.262463  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3462  cytochrome-c oxidase  43.16 
 
 		 537 aa  403  1e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1778  cytochrome-c oxidase  40.11 
 
 		 590 aa  404  1e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.307573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3262  cytochrome c oxidase, subunit I  42.34 
 
 		 542 aa  404  1e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05071  cytochrome c oxidase, subunit I  40.18 
 
 		 539 aa  405  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2622  cytochrome c oxidase, subunit I  41.65 
 
 		 594 aa  403  1e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1381  cytochrome-c oxidase  42.46 
 
 		 543 aa  399  9.999999999999999e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.442131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2603  cytochrome-c oxidase  40.11 
 
 		 541 aa  401  9.999999999999999e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.240231 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0622  cytochrome c oxidase, subunit I  41.9 
 
 		 519 aa  402  9.999999999999999e-111  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000132617  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0815  cytochrome-c oxidase  43.54 
 
 		 541 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0856305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1517  cytochrome c oxidase subunit I  41.73 
 
 		 572 aa  401  9.999999999999999e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0873125  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2081  cytochrome c oxidase, subunit I  42.16 
 
 		 607 aa  399  1e-109  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0224  cytochrome c oxidase, subunit I  42.31 
 
 		 539 aa  398  1e-109  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0762  cytochrome c oxidase, subunit I  42.31 
 
 		 539 aa  398  1e-109  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.73829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0447  cytochrome c oxidase, subunit I  41.79 
 
 		 559 aa  398  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.130684 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3821  cytochrome-c oxidase  40.53 
 
 		 609 aa  396  1e-109  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00155592  normal  0.0385819 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1404  cytochrome-c oxidase  43.45 
 
 		 556 aa  397  1e-109  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.29775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2015  cytochrome c oxidase, subunit I  41.93 
 
 		 574 aa  396  1e-109  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.466392  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0301  cytochrome c oxidase, subunit I  40.84 
 
 		 516 aa  395  1e-108  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.249737  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2942  cytochrome c oxidase, subunit I  41.62 
 
 		 581 aa  393  1e-108  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1041  cytochrome c oxidase subunit I  41.58 
 
 		 559 aa  393  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.286412  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0989  cytochrome c oxidase, subunit I  42.38 
 
 		 596 aa  394  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1349  cytochrome c oxidase, subunit I  40.85 
 
 		 585 aa  395  1e-108  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.183517  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1003  cytochrome c oxidase, subunit I  40.41 
 
 		 518 aa  392  1e-108  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0408  cytochrome-c oxidase  38.49 
 
 		 542 aa  393  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0326  cytochrome c oxidase subunit I  40.97 
 
 		 526 aa  391  1e-107  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.283481  normal  0.0134906 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>